BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-219C15
Chromosome14 (Build37)
Map Location 23,316,012 - 23,398,034
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700112E06Rik, EG435392
Upstream geneMyst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, EG665075
Downstream geneLOC665068, Kcnma1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-219C15.bB6Ng01-219C15.g
ACCGA035090GA035091
length1,1391,147
definitionB6Ng01-219C15.b B6Ng01-219C15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,396,900 - 23,398,034)(23,316,012 - 23,317,145)
sequence
gaattctacctaggccggattgtccataggaaggttccagaaatccctcc
ctcgtggagctgctatcctagtgcctggtaacctagagcactaacaaatg
gagatgctgtgtaccttatgctattagagaagtcttctgatttatcctta
ctgtagcagccagggcatttagtccctaattctcaccccaggctgggtac
tcaccgacccaaaagaggtcataacccaccatggttatcctaggcctctg
atcacacctagagctgcatacaaggggagtacagggcctgaccttcacac
ttctctgtacacctcagctctctcccttcttgatatccagaactgtttcc
ccagcctacaccaaaagcattccagaagtctacaaggactaagtcaactt
agcggcattacccacagcttgccaccagaggtcgccctcccacacaagcc
caggcaaacagaagcagcttttcctcccaggcacccgtgacattattttc
tttctctatttttatctattaaaaagatttcctcgcagccataacttaga
tctctacactaaaatggagcaacaggaagatataacggtgcatttcattt
atgaatgacctataataaattactctgaagtgtcccgagtgccagaagac
agaacgctttgtctgcccaccgactgtatttcacatactttaatttagct
gacacataaaactcatttgacattttgcaggtatttttgaggagaagggt
atggggtggcagaatgggaccctcgtagagctgggcggcaagtgggctac
tgcggggacttgacgtcctgggtgccagaaaaggatatttggttcttgtt
gagggttaaaggtgtgcaagtggggtaaccctggcaacacgaggtcgtct
ccgagcagattgttgtctaaatgagctcctccaggctcctgaatgcactc
agtccttccagtgacctgcaatgacaaaggcaaggggggggaaagatcct
gcagtaaatcagagaggccattatgagccgaaataaatatttaaccttcc
ctttcagaactgggaatagtttggcttgggtgcctgttcagcagagtgaa
tgacagaattagtagccaaggagaccctgggggtggggg
gaattctctgggcagctccctaaggtagcaagcctactgctacctggtgt
gcacagagagggctaggttatgacttggtgtgccttactttatagaagac
tagtcatcatgcaaggaagtcgggcaagcatgttcagcctgacatagcat
gggcaaagtcagagctactagacttacttagctatggtgactttgccctt
ggtaaatctgcttcggtgtgttggccctccacctaaaaccaagcacatct
gtacacccccttgcatgtaattcaaggggagtttgttggactccttacca
agtcaaatactcaactaagtgattatgaaaggttattgtgtgagatgaca
tatacaggtgtgcacatatatgcacacacatctatttatatgcatgccta
tgcatatacattatatgtatttgcttacatatacaaaatgactacggaca
ttcaacttatcttcaactgagtaataactcagtagcattcagtatcaaag
gagtcctgagaccctatctgctttgagcacctaatttgtgagtcatttga
tttaaaggctttggctgctctgcttacccagaagtgtattcaccacagac
tcctggggacattatcctctcataagaaagggtaagagactttaggctat
tttacccagtggaactgagccccagagttgtttttactgtctctgctttc
ttcccatccctcattctctcccctctattggctgtgattctgtttaccta
catgtcaaaggctcccatgctagacagtaccttctctccacaatatgcac
acgtgttgcctcctcttcattcagaactcaaatccttcagtttagtagtc
taagctcgggatgaaatggaaaatagggctctggaggcatttcacactaa
ctgtggatacacttaaagtttcttctgaatggtcttatttagaaaaccca
ttccaatctcagccggtttccagctgctgaaatttggggccacttttggc
aatagaagaagagaaaaataaattaaataaaacttgggtacagaaaagaa
agcagctggaaaagacaaagatgataaaattttcagtatttttttttttt
atgtaagagacagctttgccaaggatctgaagccggaattccagcac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_23396900_23398034
seq2: B6Ng01-219C15.b_43_1181 (reverse)

seq1  CCCCCACCCC----GGCTCCCT-GCTACTAATTCTTGTCATTCACTCTGC  45
      ||||||||||    | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CCCCCACCCCCAGGGTCTCCTTGGCTACTAATTC-TGTCATTCACTCTGC  49

seq1  TG-ACAGGCACCAAGCCCAAACTATTCCCAGTTCTGAAAGGGAAGGTTAA  94
      || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGAACAGGCACCCAAGCCAAACTATTCCCAGTTCTGAAAGGGAAGGTT-A  98

seq1  AATATTTATTTCGGCTCATAATGGCCTCTCTGATTTACTGCAGGATCTTT  144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTTATTTCGGCTCATAATGGCCTCTCTGATTTACTGCAGGATCTTT  148

seq1  CCCCCCCCTTGCCTTTGTCATTGCAGGTCACTGGAAGGACTGAGTGCATT  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCTTGCCTTTGTCATTGCAGGTCACTGGAAGGACTGAGTGCATT  198

seq1  CAGGAGCCTGGAGGAGCTCATTTTAGACAACAATCTGCTCGGAGACGACC  244
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGCCTGGAGGAGCTCA-TTTAGACAACAATCTGCTCGGAGACGACC  247

seq1  TCGTGTTGCCAGGGTTACCCCACTTGCACACC-TTAACCCTCAACAAGAA  293
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCGTGTTGCCAGGGTTACCCCACTTGCACACCTTTAACCCTCAACAAGAA  297

seq1  CCAAATATCCTTTTCTGGCACCCAGGACGTCAAGTCCCCGCAGTAGCCCA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATATCCTTTTCTGGCACCCAGGACGTCAAGTCCCCGCAGTAGCCCA  347

seq1  CTTGCCGCCCAGCTCTACGAGGGTCCCATTCTGCCACCCCATACCCTTCT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCCGCCCAGCTCTACGAGGGTCCCATTCTGCCACCCCATACCCTTCT  397

seq1  CCTCAAAAATACCTGCAAAATGTCAAATGAGTTTTATGTGTCAGCTAAAT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAAAAATACCTGCAAAATGTCAAATGAGTTTTATGTGTCAGCTAAAT  447

seq1  TAAAGTATGTGAAATACAGTCGGTGGGCAGACAAAGCGTTCTGTCTTCTG  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTATGTGAAATACAGTCGGTGGGCAGACAAAGCGTTCTGTCTTCTG  497

seq1  GCACTCGGGACACTTCAGAGTAATTTATTATAGGTCATTCATAAATGAAA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCGGGACACTTCAGAGTAATTTATTATAGGTCATTCATAAATGAAA  547

seq1  TGCACCGTTATATCTTCCTGTTGCTCCATTTTAGTGTAGAGATCTAAGTT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACCGTTATATCTTCCTGTTGCTCCATTTTAGTGTAGAGATCTAAGTT  597

seq1  ATGGCTGCGAGGAAATCTTTTTAATAGATAAAAATAGAGAAAGAAAATAA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTGCGAGGAAATCTTTTTAATAGATAAAAATAGAGAAAGAAAATAA  647

seq1  TGTCACGGGTGCCTGGGAGGAAAAGCTGCTTCTGTTTGCCTGGGCTTGTG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACGGGTGCCTGGGAGGAAAAGCTGCTTCTGTTTGCCTGGGCTTGTG  697

seq1  TGGGAGGGCGACCTCTGGTGGCAAGCTGTGGGTAATGCCGCTAAGTTGAC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGGGCGACCTCTGGTGGCAAGCTGTGGGTAATGCCGCTAAGTTGAC  747

seq1  TTAGTCCTTGTAGACTTCTGGAATGCTTTTGGTGTAGGCTGGGGAAACAG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCCTTGTAGACTTCTGGAATGCTTTTGGTGTAGGCTGGGGAAACAG  797

seq1  TTCTGGATATCAAGAAGGGAGAGAGCTGAGGTGTACAGAGAAGTGTGAAG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGATATCAAGAAGGGAGAGAGCTGAGGTGTACAGAGAAGTGTGAAG  847

seq1  GTCAGGCCCTGTACTCCCCTTGTATGCAGCTCTAGGTGTGATCAGAGGCC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGCCCTGTACTCCCCTTGTATGCAGCTCTAGGTGTGATCAGAGGCC  897

seq1  TAGGATAACCATGGTGGGTTATGACCTCTTTTGGGTCGGTGAGTACCCAG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATAACCATGGTGGGTTATGACCTCTTTTGGGTCGGTGAGTACCCAG  947

seq1  CCTGGGGTGAGAATTAGGGACTAAATGCCCTGGCTGCTACAGTAAGGATA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGGTGAGAATTAGGGACTAAATGCCCTGGCTGCTACAGTAAGGATA  997

seq1  AATCAGAAGACTTCTCTAATAGCATAAGGTACACAGCATCTCCATTTGTT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGAAGACTTCTCTAATAGCATAAGGTACACAGCATCTCCATTTGTT  1047

seq1  AGTGCTCTAGGTTACCAGGCACTAGGATAGCAGCTCCACGAGGGAGGGAT  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTCTAGGTTACCAGGCACTAGGATAGCAGCTCCACGAGGGAGGGAT  1097

seq1  TTCTGGAACCTTCCTATGGACAATCCGGCCTAGGTAGAATTC  1135
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGAACCTTCCTATGGACAATCCGGCCTAGGTAGAATTC  1139

seq1: chr14_23316012_23317145
seq2: B6Ng01-219C15.g_68_1214

seq1  GAATTCTCTGGGCAGCTCCCTAAGGTAGCAAGCCTACTGCTACCTGGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGGGCAGCTCCCTAAGGTAGCAAGCCTACTGCTACCTGGTGT  50

seq1  GCACAGAGAGGGCTAGGTTATGACTTGGTGTGCCTTACTTTATAGAAGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGAGAGGGCTAGGTTATGACTTGGTGTGCCTTACTTTATAGAAGAC  100

seq1  TAGTCATCATGCAAGGAAGTCGGGCAAGCATGTTCAGCCTGACATAGCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCATCATGCAAGGAAGTCGGGCAAGCATGTTCAGCCTGACATAGCAT  150

seq1  GGGCAAAGTCAGAGCTACTAGACTTACTTAGCTATGGTGACTTTGCCCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAAGTCAGAGCTACTAGACTTACTTAGCTATGGTGACTTTGCCCTT  200

seq1  GGTAAATCTGCTTCGGTGTGTTGGCCCTCCACCTAAAACCAAGCACATCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAATCTGCTTCGGTGTGTTGGCCCTCCACCTAAAACCAAGCACATCT  250

seq1  GTACACCCCCTTGCATGTAATTCAAGGGGAGTTTGTTGGACTCCTTACCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACACCCCCTTGCATGTAATTCAAGGGGAGTTTGTTGGACTCCTTACCA  300

seq1  AGTCAAATACTCAACTAAGTGATTATGAAAGGTTATTGTGTGAGATGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAAATACTCAACTAAGTGATTATGAAAGGTTATTGTGTGAGATGACA  350

seq1  TATACAGGTGTGCACATATATGCACACACATCTATTTATATGCATGCCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAGGTGTGCACATATATGCACACACATCTATTTATATGCATGCCTA  400

seq1  TGCATATACATTATATGTATTTGCTTACATATACAAAATGACTACGGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATATACATTATATGTATTTGCTTACATATACAAAATGACTACGGACA  450

seq1  TTCAACTTATCTTCAACTGAGTAATAACTCAGTAGCATTCAGTATCAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTTATCTTCAACTGAGTAATAACTCAGTAGCATTCAGTATCAAAG  500

seq1  GAGTCCTGAGACCCTATCTGCTTTGAGCACCTAATTTGTGAGTCATTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCTGAGACCCTATCTGCTTTGAGCACCTAATTTGTGAGTCATTTGA  550

seq1  TTTAAAGGCTTTGGCTGCTCTGCTTACCCAGAAGTGTATTCACCACAGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAGGCTTTGGCTGCTCTGCTTACCCAGAAGTGTATTCACCACAGAC  600

seq1  TCCTGGGGACATTATCCTCTCATAAGAAAGGGTAAGAGACTTTAGGCTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGGGACATTATCCTCTCATAAGAAAGGGTAAGAGACTTTAGGCTAT  650

seq1  TTTACCCAGTGGAACTGAGCCCCAGAGTTGTTTTTACTGTCTCTGCTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCCAGTGGAACTGAGCCCCAGAGTTGTTTTTACTGTCTCTGCTTTC  700

seq1  TTCCCATCCCTCATTCTCTCCCCTCTATTGGCTGTGATTCTGTTTACCTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCATCCCTCATTCTCTCCCCTCTATTGGCTGTGATTCTGTTTACCTA  750

seq1  CATGTCAAAGGCTCCCATGCTAGACAGTACCTTCTCTCCACAATATGCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCAAAGGCTCCCATGCTAGACAGTACCTTCTCTCCACAATATGCAC  800

seq1  ACGTGTTGCCTCCTCTTCATTCAGAACTCAAATCCTTCAGTTTAGTAGTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGTTGCCTCCTCTTCATTCAGAACTCAAATCCTTCAGTTTAGTAGTC  850

seq1  TAAGCTCGGGATGAAATGGAAAATAGGGCTCTGGAGGCATTTCACACTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCTCGGGATGAAATGGAAAATAGGGCTCTGGAGGCATTTCACACTAA  900

seq1  CTGTGGATACACTTAAAGTTTCTTCTGAATGGTCTTATTTAGAAAACCCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGATACACTTAAAGTTTCTTCTGAATGGTCTTATTTAGAAAACCCA  950

seq1  TTCCAATCTCAGCCGGTTTCCAGCTGCTG-AATTTGGG--CAC-TTTGGC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||
seq2  TTCCAATCTCAGCCGGTTTCCAGCTGCTGAAATTTGGGGCCACTTTTGGC  1000

seq1  AATAGAAGAAGAAGAAAAAATAAATAAATAAAAC-TGGTTACAGAAAAGA  1045
      ||||||||||| |||||||  || |||||||||| ||| |||||||||||
seq2  AATAGAAGAAG-AGAAAAATAAATTAAATAAAACTTGGGTACAGAAAAGA  1049

seq1  AAGCAGCT-GAAAAGACAAAGGATGATAAA--TTTCAGTA---TTTTTTT  1089
      |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||   |||||||
seq2  AAGCAGCTGGAAAAGACAAA-GATGATAAAATTTTCAGTATTTTTTTTTT  1098

seq1  TTATGTAAGAG-CAGCTT--GCAAAGATCTGAAGGCGGAA-TCCAGCAC  1134
      ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||| ||||| ||||||||
seq2  TTATGTAAGAGACAGCTTTGCCAAGGATCTGAAGCCGGAATTCCAGCAC  1147