BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-219H08
Chromosome14 (Build37)
Map Location 99,488,935 - 99,667,886
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDis3, D14Ertd581e
Upstream geneDach1, LOC635593, LOC619716, LOC100043787, 2410129H14Rik, 6720463M24Rik
Downstream geneLOC100043395, LOC100043397, Klf5, LOC100043400, LOC100043789, LOC668671, LOC668672, EG546623, Klf12
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-219H08.bB6Ng01-219H08.g
ACCGA035290GA035291
length1,178331
definitionB6Ng01-219H08.b B6Ng01-219H08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,488,935 - 99,490,111)(99,667,556 - 99,667,886)
sequence
gaattctcttatcagcgggtgtaaagagatgtcttcttgactagagaaaa
ttaaaaagaagaattacagtcctgggccaatcacaggttctagcacatgc
tcttcaagtgcactctcactgagttacagccctcactgaggaaaaccaat
ttatagtcacagcaaagctggaaaaagggcaaagggagagctgtggagtc
tagtcagacattatcacttttcaacactgatagcaagtgctttgcttacc
tccttaatatcagacttggaaagcatgccacaatacggtctccagttcct
ttttattatccccacaactcgacctgtaggccgtaacattttttcactta
cagcagtcttaagctgaaatataaaaacaagaatctttagttatatgtct
tctaagtaaaatgaagtcatttttcttccaaattagaatatgcatatgga
tactaacacattcaagtagcacacaatgacatggaattcagaacctttat
gcttcaaagttctagacacaagcaaacctctgaacaatgctaattgttcc
atgataataaagcactctatgaatgatgccaagatgcacatagctgagtg
aatgtgtcagagctcagggctttcaaacttaatgtgatggtctactgaca
aaacacactgtctaagaattatgagactaagatttaataccagtttagac
taactagatatatgtagttaataattagttcactatgtagttatggtgaa
gagcatgttatgttgtatgaaacccattacaaagtaaatatatctttaac
agttctatcttaccccaagttaaaagtcaaataaaaaatgttaaccacta
aaaacagaccctataatattagacctctaacaattccggaggattgtatt
atgcaagagtaatgttacagtcagacttcaggaaactgactgtaactaaa
gaggtacacatgctagacctgtgctatcctcataaatgggtaaataggtc
atctctggaagacttagttatgcataagaaaataacttcacttcttccaa
taagtatattagtagaaacaggttactaagcatgttctaaatacaaagat
ccagaaatacatgtttcttaaaacatttacacctgcaaaaatgttcaaga
aactcacatttcttatttacctaaactg
aaggtcagcctggtctacatatggacttctagaacagccagggctacaca
atagagagacccccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggcg
atccgggcgtggtggagcacgcctttaatcccggcactcgggaggcagag
gcaggtggatttctgagttcgaggccagcctggtttacagagtgtgttcc
aggacagccagggctatacagagaaactctgtctccaaaaacaaaaacaa
aacaaacaaacacaaaaggcaattatatattaatcaaaagaatttttttt
gaacattacaaaggcaaagagggggcggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_99488935_99490111
seq2: B6Ng01-219H08.b_45_1222

seq1  GAATTCTCTTATCAGCGGGTGTAAAGAGATGTCTTCTTGACTAGAGAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTATCAGCGGGTGTAAAGAGATGTCTTCTTGACTAGAGAAAA  50

seq1  TTAAAAAGAAGAATTACAGTCCTGGGCCAATCACAGGTTCTAGCACATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAGAAGAATTACAGTCCTGGGCCAATCACAGGTTCTAGCACATGC  100

seq1  TCTTCAAGTGCACTCTCACTGAGTTACAGCCCTCACTGAGGAAAACCAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAAGTGCACTCTCACTGAGTTACAGCCCTCACTGAGGAAAACCAAT  150

seq1  TTATAGTCACAGCAAAGCTGGAAAAAGGGCAAAGGGAGAGCTGTGGAGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGTCACAGCAAAGCTGGAAAAAGGGCAAAGGGAGAGCTGTGGAGTC  200

seq1  TAGTCAGACATTATCACTTTTCAACACTGATAGCAAGTGCTTTGCTTACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCAGACATTATCACTTTTCAACACTGATAGCAAGTGCTTTGCTTACC  250

seq1  TCCTTAATATCAGACTTGGAAAGCATGCCACAATACGGTCTCCAGTTCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAATATCAGACTTGGAAAGCATGCCACAATACGGTCTCCAGTTCCT  300

seq1  TTTTATTATCCCCACAACTCGACCTGTAGGCCGTAACATTTTTTCACTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTATCCCCACAACTCGACCTGTAGGCCGTAACATTTTTTCACTTA  350

seq1  CAGCAGTCTTAAGCTGAAATATAAAAACAAGAATCTTTAGTTATATGTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGTCTTAAGCTGAAATATAAAAACAAGAATCTTTAGTTATATGTCT  400

seq1  TCTAAGTAAAATGAAGTCATTTTTCTTCCAAATTAGAATATGCATATGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGTAAAATGAAGTCATTTTTCTTCCAAATTAGAATATGCATATGGA  450

seq1  TACTAACACATTCAAGTAGCACACAATGACATGGAATTCAGAACCTTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAACACATTCAAGTAGCACACAATGACATGGAATTCAGAACCTTTAT  500

seq1  GCTTCAAAGTTCTAGACACAAGCAAACCTCTGAACAATGCTAATTGTTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAAAGTTCTAGACACAAGCAAACCTCTGAACAATGCTAATTGTTCC  550

seq1  ATGATAATAAAGCACTCTATGAATGATGCCAAGATGCACATAGCTGAGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATAATAAAGCACTCTATGAATGATGCCAAGATGCACATAGCTGAGTG  600

seq1  AATGTGTCAGAGCTCAGGGCTTTCAAACTTAATGTGATGGTCTACTGACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTCAGAGCTCAGGGCTTTCAAACTTAATGTGATGGTCTACTGACA  650

seq1  AAACACACTGTCTAAGAATTATGAGACTAAGATTTAATACCAGTTTAGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACACTGTCTAAGAATTATGAGACTAAGATTTAATACCAGTTTAGAC  700

seq1  TAACTAGATATATGTAGTTAATAATTAGTTCACTATGTAGTTATGGTGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAGATATATGTAGTTAATAATTAGTTCACTATGTAGTTATGGTGAA  750

seq1  GAGCATGTTATGTTGTATGAAACCCATTACAAAGTAAATATATCTTTAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATGTTATGTTGTATGAAACCCATTACAAAGTAAATATATCTTTAAC  800

seq1  AGTTCTATCTTACCCCAAGTTAAAAGTCAAATAAAAAATGTTAACCACTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTATCTTACCCCAAGTTAAAAGTCAAATAAAAAATGTTAACCACTA  850

seq1  AAAACAGACCCTATAATATTAGACCTCTAACAATTCCGGAGGATTGTATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGACCCTATAATATTAGACCTCTAACAATTCCGGAGGATTGTATT  900

seq1  ATGCAAGAGTAATGTTACAGTCAGACTTCAGGAAACTGACTGTAACTAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAGAGTAATGTTACAGTCAGACTTCAGGAAACTGACTGTAACTAAA  950

seq1  GAGGTACACATGCTAGACCTGTGCTATCCTCATAAAATGGGTAAATAGGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GAGGTACACATGCTAGACCTGTGCTATCCTCAT-AAATGGGTAAATAGGT  999

seq1  CATCTCTGGAAGACTTAGTAATGCATAAG-AAATAAC-TCAC-TCTTCCA  1047
      ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||
seq2  CATCTCTGGAAGACTTAGTTATGCATAAGAAAATAACTTCACTTCTTCCA  1049

seq1  ATAAGTATATTAGTAGAAACAGGTTAACTAAGCATG-TCTAAATACAAAG  1096
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  ATAAGTATATTAGTAGAAACAGGTT-ACTAAGCATGTTCTAAATACAAAG  1098

seq1  ATCCAGAAATACATGTT--CTAAAACAATTTTAACACTGCAAAAAATGTT  1144
      |||||||||||||||||   |||||||  ||||   |||| |||||||||
seq2  ATCCAGAAATACATGTTTCTTAAAACA--TTTACACCTGC-AAAAATGTT  1145

seq1  CAGGAATTTCAACATTTC-TATTTACTTAAACTG  1177
      || |||  || ||||||| ||||||| |||||||
seq2  CAAGAAACTC-ACATTTCTTATTTACCTAAACTG  1178

seq1: chr14_99667556_99667886
seq2: B6Ng01-219H08.g_69_399 (reverse)

seq1  CCCCCGCCCCCTCTTTGCCTTTGTAATGTTCAAAAAAAATTCTTTTGATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCGCCCCCTCTTTGCCTTTGTAATGTTCAAAAAAAATTCTTTTGATT  50

seq1  AATATATAATTGCCTTTTGTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTGGAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATAATTGCCTTTTGTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTGGAGA  100

seq1  CAGAGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACACACTCTGTAAACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACACACTCTGTAAACC  150

seq1  AGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCCG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCCG  200

seq1  GGATTAAAGGCGTGCTCCACCACGCCCGGATCGCCTTTTTTTTTTTTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTAAAGGCGTGCTCCACCACGCCCGGATCGCCTTTTTTTTTTTTTTT  250

seq1  TTTTTTTTTTTTGAGATGGGGGTCTCTCTATTGTGTAGCCCTGGCTGTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTTTGAGATGGGGGTCTCTCTATTGTGTAGCCCTGGCTGTTC  300

seq1  TAGAAGTCCATATGTAGACCAGGCTGACCTT  331
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGTCCATATGTAGACCAGGCTGACCTT  331