BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-224F09
Chromosome14 (Build37)
Map Location 81,635,606 - 81,636,768
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC672828
Downstream geneLOC639207
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-224F09.b
ACCGA038823
length1,162
definitionB6Ng01-224F09.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcaaatgagagattagtttttaagggggccaggaacaacaaatttc
taatacatttgctggaattacttatgaaatcaacagttgctttatctaaa
tacttataatcattcttgggactagtcagttttatgttaaatagagtcaa
gctactgatcatgggaccaactatgatatatattatgattttcaagatgt
gagcattctattgtttcaataaaataaagaaaattgtatcttttcagttt
tgatattgtccatgttccttattttacttgttaaaatatagttttacaat
gtgtttgaatgatctaatgtgtttggatataaaggtgaatgagaaggtct
acaatactgttttgagcatggcatcggggatatcttataatatggatttt
attgattatatgatatgatattataaatggtgaacatgctaattctaaat
tgtatgtattttctctggcttcttgaaacagagcctggggacatgttcca
gttgaggctgaacagtcaagccttgaggctagcattgatggagaatctga
tctcatgacactatgaccaaggatttatctttgttgctaaggaagcaaga
gtcaattctgttggatctagcacagcagacatcagtgccaatggagtcag
taacatgtcctagtgactggcaataaaggatagtatcagtatactcagca
gacggatcatgtacaaagcttacatagttgaataaaattctacaacaatc
atggcatttttttcccgtgggttcacaactgattcatctacctataaaag
actgatataaatttgcatttttgtgcctgttaacagtaaaacttaaacaa
gcactgagacaaccattgtatataatgcatgttcaatagaacacatccct
tcgtacttatatattaaaatttatttattttgggtttattgtatttatgt
atatcaatgttctacttgcaagtttgttggtgggaattgaatgtggtctt
ctgcaagacaaccagtactcataacccttgagcaatttaccacaacacta
tatttaatatattaagtttgaataaaatgatttcatgttgaatttattcc
agtgactctaaaatcggtattgtctttaagtcctaggggttataagataa
atgatcaaagag
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_81635606_81636768
seq2: B6Ng01-224F09.b_47_1208

seq1  GAATTCAAATGAGAGATTAGTTTTTAAGGGGGCCAGGAACAACAAATTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATGAGAGATTAGTTTTTAAGGGGGCCAGGAACAACAAATTTC  50

seq1  TAATACATTTGCTGGAATTACTTATGAAATCAACAGTTGCTTTATCTAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATACATTTGCTGGAATTACTTATGAAATCAACAGTTGCTTTATCTAAA  100

seq1  TACTTATAATCATTCTTGGGACTAGTCAGTTTTATGTTAAATAGAGTCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTATAATCATTCTTGGGACTAGTCAGTTTTATGTTAAATAGAGTCAA  150

seq1  GCTACTGATCATGGGACCAACTATGATATATATTATGATTTTCAAGATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTGATCATGGGACCAACTATGATATATATTATGATTTTCAAGATGT  200

seq1  GAGCATTCTATTGTTTCAATAAAATAAAGAAAATTGTATCTTTTCAGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATTCTATTGTTTCAATAAAATAAAGAAAATTGTATCTTTTCAGTTT  250

seq1  TGATATTGTCCATGTTCCTTATTTTACTTGTTAAAATATAGTTTTACAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATTGTCCATGTTCCTTATTTTACTTGTTAAAATATAGTTTTACAAT  300

seq1  GTGTTTGAATGATCTAATGTGTTTGGATATAAAGGTGAATGAGAAGGTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTGAATGATCTAATGTGTTTGGATATAAAGGTGAATGAGAAGGTCT  350

seq1  ACAATACTGTTTTGAGCATGGCATCGGGGATATCTTATAATATGGATTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATACTGTTTTGAGCATGGCATCGGGGATATCTTATAATATGGATTTT  400

seq1  ATTGATTATATGATATGATATTATAAATGGTGAACATGCTAATTCTAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTATATGATATGATATTATAAATGGTGAACATGCTAATTCTAAAT  450

seq1  TGTATGTATTTTCTCTGGCTTCTTGAAACAGAGCCTGGGGACATGTTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTATTTTCTCTGGCTTCTTGAAACAGAGCCTGGGGACATGTTCCA  500

seq1  GTTGAGGCTGAACAGTCAAGCCTTGAGGCTAGCATTGATGGAGAATCTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGGCTGAACAGTCAAGCCTTGAGGCTAGCATTGATGGAGAATCTGA  550

seq1  TCTCATGACACTATGACCAAGGATTTATCTTTGTTGCTAAGGAAGCAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATGACACTATGACCAAGGATTTATCTTTGTTGCTAAGGAAGCAAGA  600

seq1  GTCAATTCTGTTGGATCTAGCACAGCAGACATCAGTGCCAATGGAGTCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATTCTGTTGGATCTAGCACAGCAGACATCAGTGCCAATGGAGTCAG  650

seq1  TAACATGTCCTAGTGACTGGCAATAAAGGATAGTATCAGTATACTCAGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATGTCCTAGTGACTGGCAATAAAGGATAGTATCAGTATACTCAGCA  700

seq1  GACGGATCATGTACAAAGCTTACATAGTTGAATAAAATTCTACAACAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGGATCATGTACAAAGCTTACATAGTTGAATAAAATTCTACAACAATC  750

seq1  ATGGCATTTTTTTCCCGTGGGTTCACAACTGATTCATCTACCTATAAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCATTTTTTTCCCGTGGGTTCACAACTGATTCATCTACCTATAAAAG  800

seq1  ACTGATATAAATTTGCATTTTTGTGCCTGTTAACAGTAAAACTTAAACAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATATAAATTTGCATTTTTGTGCCTGTTAACAGTAAAACTTAAACAA  850

seq1  GCACTGAGACCAACCATTGTATATAATGCATGTTCAATAGAACACATCCC  900
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGAGA-CAACCATTGTATATAATGCATGTTCAATAGAACACATCCC  899

seq1  TTCGTACTTATATATTAAAATTTATTTATTTTTGGTTTATTGTATTTTAT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
seq2  TTCGTACTTATATATTAAAATTTATTTATTTTGGGTTTATTGTA-TTTAT  948

seq1  GTATATCAATGTTCTACTTGCAAGTTTGTTGGTGGGAATTGAATGTGGGT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GTATATCAATGTTCTACTTGCAAGTTTGTTGGTGGGAATTGAATGT-GGT  997

seq1  CTTCTGCAAGAACAACCAGTACTCATAACCCTTGAGCAATTTA-CACAAC  1049
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTTCTGCAAG-ACAACCAGTACTCATAACCCTTGAGCAATTTACCACAAC  1046

seq1  ACTTATATTT-ATATATTAAGTTTTGATAAAAATGATTTTCATGTTG-AT  1097
      || ||||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||
seq2  AC-TATATTTAATATATTAAG-TTTGAATAAAATGA-TTTCATGTTGAAT  1093

seq1  TTATT-CAGTGACTCAAACATC-GTATTGTCTTTAAGTTCTAGGGGGTAT  1145
      ||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||
seq2  TTATTCCAGTGACTCTAAAATCGGTATTGTCTTTAAGTCCTAGGGGTTAT  1143

seq1  AAG-TAATAGATCAAAGAG  1163
      ||| |||  ||||||||||
seq2  AAGATAAATGATCAAAGAG  1162