BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-226G04
Chromosome14 (Build37)
Map Location 71,168,792 - 71,286,209
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDok2
Upstream geneTnfrsf10b, Rhobtb2, LOC100043701, 1700081D17Rik, LOC668397, Egr3, Bin3, 2610301G19Rik, 9930012K11Rik, Pdlim2, Sorbs3, Ppp3cc, LOC100043115, Slc39a14, EG668450, Piwil2, Polr3d, Phyhip, Bmp1, Sftpc, Lgi3, Reep4, Hr, Nudt18, Rai16, Epb4.9, Fgf17, Npm2, Xpo7, LOC668443
Downstream geneGfra2, LOC100043132, LOC100043136, LOC668477
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-226G04.bB6Ng01-226G04.g
ACCGA040340GA040341
length927650
definitionB6Ng01-226G04.b B6Ng01-226G04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,285,298 - 71,286,209)(71,168,792 - 71,169,441)
sequence
gaattccctctggagactcgaacagatttggctaaggacattttggacat
gggggttatgtgggagactactgtgataaggaagaactgagacacccagt
cactgagaggaaccaagggcataagtggaagaagcccctgtgggaggaga
tctaatagatccaattggcagatatggaagaggaccaaataccccaggct
ttagacctgagccccctgggaggcactaaagggctgagcaggtaggtgac
atcataattttagtgatactgatatgacaagtgtatggaagatggagacc
agttgggaggcagttgtgacagtcttggcctgaggtaataagggtctcta
acaggagatggcagtgggcaaggacaggagatggctgtcagagacagtgt
actctaagatgaatcagcaggatgttgctaacagcttggactgtggtgga
ggggaggaggggaattcccatctacccaagaatcgccaggctggaataaa
gacaacagctctcattttgtgggctctgttgtgggaagaaaaaaaaaaaa
gaaattagtagttaacttgatggcgcgatacaacttaacactctgttaat
tcttatgataaatccatgggtcaggctcgtggcttaactcatgcaaagtc
ctatacagagtgggataaagtcaggcagctaggatctagggtcctgcatt
aattcaatccgggtttagcatatgaataaacaaaatgacagcagtctctg
ggtctgtagattctgttgcctgcattaaggacattctgagataatccttt
tctcctctgccctggtctggaaaaaaaaaatcatgagaatgaaaatcctt
tttttgttatttattacctttggacttgttctggctttctcccttggaac
atggaggctaagaagggaccctgtcca
gaattctagtttatgaaaccatggatataggaggaccatttacatactta
atggggaaagggtaaatagcaatgagattagggatgtatactgtccgacc
ctctacagtcaggaacctttgaagctgaggatggcaggcaccacagctgt
cctcatcctgtcctttgcccagtccatctttctcatgtccacatctctct
gcccattttaaacctttctcttgtctgcccagagctgcccattgggtatc
tctcttcacctagaagatctttcggagttagctaatccctgagtgaggaa
gccgggagccagctgaaaccccaactgtcctcagtacgggctatgggaat
ttgttgacacctttgcttcctaacactggcgcctggagacccagaagtcc
tctaagtctctgcacctcggttgtgtctggggacagtgcagcacaagatc
ctgctcttgtggctccccagaggccaagcagaaggtcactgtggttattg
caggattcccatagcgggatccctaccccagctgggtgaagttcagcttg
atggaagacgtattcttagtagattctagctccttttagactatggctat
gagaaaagtattcagcttccacaggccagggatgggattgggggtggggg

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_71285298_71286209
seq2: B6Ng01-226G04.b_44_970 (reverse)

seq1  TGGACA-GGTCCC-TCCTAGCCT-CACGCTCCAA-GGATGAAGCCAG-AC  45
      |||||| |||||| || |||||| || | ||||| |||  ||||||| ||
seq2  TGGACAGGGTCCCTTCTTAGCCTCCATGTTCCAAGGGAGAAAGCCAGAAC  50

seq1  AAGTCCAAAG--TATAAATAAC-AAAAAAGGATTTTCATTCTCATGATTC  92
      ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AAGTCCAAAGGTAATAAATAACAAAAAAAGGATTTTCATTCTCATGATTT  100

seq1  TTTTTTTCCAGA-CAGGGCAGA-GAGAAAAGGATTATCTCAG-ATGTCCT  139
      |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTTTTTTCCAGACCAGGGCAGAGGAGAAAAGGATTATCTCAGAATGTCCT  150

seq1  TAATGCAGGC-ACAGAATCTACAGACCCAGAG-CTGCTGTCATTTTGTTT  187
      |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TAATGCAGGCAACAGAATCTACAGACCCAGAGACTGCTGTCATTTTGTTT  200

seq1  ATTCATATGCT-AACCCGGATTG-ACTAATGCAGGACCCTAGATCCTAGC  235
      ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATATGCTAAACCCGGATTGAATTAATGCAGGACCCTAGATCCTAGC  250

seq1  TGCCTGACTTTATCCCACTCTGTATAGGACTTTGCATGAGTTAAGCCACG  285
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGACTTTATCCCACTCTGTATAGGACTTTGCATGAGTTAAGCCACG  300

seq1  AGCCTGACCCATGGATTTATCATAAGAATTAACAGAGTGTTAAGTTGTAT  335
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGACCCATGGATTTATCATAAGAATTAACAGAGTGTTAAGTTGTAT  350

seq1  CGCGCCATCAAGTTAACTACTAATTTCTTTTTTTTTTTTCTTCCCACAAC  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCGCCATCAAGTTAACTACTAATTTCTTTTTTTTTTTTCTTCCCACAAC  400

seq1  AGAGCCCACAAAATGAGAGCTGTTGTCTTTATTCCAGCCTGGCGATTCTT  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCCACAAAATGAGAGCTGTTGTCTTTATTCCAGCCTGGCGATTCTT  450

seq1  GGGTAGATGGGAATTCCCCTCCTCCCCTCCACCACAGTCCAAGCTGTTAG  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGATGGGAATTCCCCTCCTCCCCTCCACCACAGTCCAAGCTGTTAG  500

seq1  CAACATCCTGCTGATTCATCTTAGAGTACACTGTCTCTGACAGCCATCTC  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATCCTGCTGATTCATCTTAGAGTACACTGTCTCTGACAGCCATCTC  550

seq1  CTGTCCTTGCCCACTGCCATCTCCTGTTAGAGACCCTTATTACCTCAGGC  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTTGCCCACTGCCATCTCCTGTTAGAGACCCTTATTACCTCAGGC  600

seq1  CAAGACTGTCACAACTGCCTCCCAACTGGTCTCCATCTTCCATACACTTG  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACTGTCACAACTGCCTCCCAACTGGTCTCCATCTTCCATACACTTG  650

seq1  TCATATCAGTATCACTAAAATTATGATGTCACCTACCTGCTCAGCCCTTT  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATCAGTATCACTAAAATTATGATGTCACCTACCTGCTCAGCCCTTT  700

seq1  AGTGCCTCCCAGGGGGCTCAGGTCTAAAGCCTGGGGTATTTGGTCCTCTT  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCTCCCAGGGGGCTCAGGTCTAAAGCCTGGGGTATTTGGTCCTCTT  750

seq1  CCATATCTGCCAATTGGATCTATTAGATCTCCTCCCACAGGGGCTTCTTC  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATCTGCCAATTGGATCTATTAGATCTCCTCCCACAGGGGCTTCTTC  800

seq1  CACTTATGCCCTTGGTTCCTCTCAGTGACTGGGTGTCTCAGTTCTTCCTT  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTATGCCCTTGGTTCCTCTCAGTGACTGGGTGTCTCAGTTCTTCCTT  850

seq1  ATCACAGTAGTCTCCCACATAACCCCCATGTCCAAAATGTCCTTAGCCAA  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAGTAGTCTCCCACATAACCCCCATGTCCAAAATGTCCTTAGCCAA  900

seq1  ATCTGTTCGAGTCTCCAGAGGGAATTC  912
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTTCGAGTCTCCAGAGGGAATTC  927

seq1: chr14_71168792_71169441
seq2: B6Ng01-226G04.g_62_711

seq1  GAATTCTAGTTTATGAAACCATGGATATAGGAGGACCATTTACATACTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGTTTATGAAACCATGGATATAGGAGGACCATTTACATACTTA  50

seq1  ATGGGGAAAGGGTAAATAGCAATGAGATTAGGGATGTATACTGTCCGACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGAAAGGGTAAATAGCAATGAGATTAGGGATGTATACTGTCCGACC  100

seq1  CTCTACAGTCAGGAACCTTTGAAGCTGAGGATGGCAGGCACCACAGCTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACAGTCAGGAACCTTTGAAGCTGAGGATGGCAGGCACCACAGCTGT  150

seq1  CCTCATCCTGTCCTTTGCCCAGTCCATCTTTCTCATGTCCACATCTCTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATCCTGTCCTTTGCCCAGTCCATCTTTCTCATGTCCACATCTCTCT  200

seq1  GCCCATTTTAAACCTTTCTCTTGTCTGCCCAGAGCTGCCCATTGGGTATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCATTTTAAACCTTTCTCTTGTCTGCCCAGAGCTGCCCATTGGGTATC  250

seq1  TCTCTTCACCTAGAAGATCTTTCGGAGTTAGCTAATCCCTGAGTGAGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTCACCTAGAAGATCTTTCGGAGTTAGCTAATCCCTGAGTGAGGAA  300

seq1  GCCGGGAGCCAGCTGAAACCCCAACTGTCCTCAGTACGGGCTATGGGAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGGAGCCAGCTGAAACCCCAACTGTCCTCAGTACGGGCTATGGGAAT  350

seq1  TTGTTGACACCTTTGCTTCCTAACACTGGCGCCTGGAGACCCAGAAGTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGACACCTTTGCTTCCTAACACTGGCGCCTGGAGACCCAGAAGTCC  400

seq1  TCTAAGTCTCTGCACCTCGGTTGTGTCTGGGGACAGTGCAGCACAAGATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGTCTCTGCACCTCGGTTGTGTCTGGGGACAGTGCAGCACAAGATC  450

seq1  CTGCTCTTGTGGCTCCCCAGAGGCCAAGCAGAAGGTCACTGTGGTTATTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCTTGTGGCTCCCCAGAGGCCAAGCAGAAGGTCACTGTGGTTATTG  500

seq1  CAGGATTCCCATAGCGGGATCCCTACCCCAGCTGGGTGAAGTTCAGCTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATTCCCATAGCGGGATCCCTACCCCAGCTGGGTGAAGTTCAGCTTG  550

seq1  ATGGAAGACGTATTCTTAGTAGATTCTAGCTCCTTTTAGACTATGGCTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAGACGTATTCTTAGTAGATTCTAGCTCCTTTTAGACTATGGCTAT  600

seq1  GAGAAAAGTATTCAGCTTCCACAGGCCAGGGATGGGATTGGGGGTGGGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAAGTATTCAGCTTCCACAGGCCAGGGATGGGATTGGGGGTGGGGG  650