BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-231O22
Chromosome14 (Build37)
Map Location 120,743,277 - 120,925,515
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMbnl2, Rap2a
Upstream geneHs6st3, EG621324, LOC100043830, Oxgr1, Gabarapl2-ps, LOC100043831
Downstream geneLOC668835, LOC668837, Ranbp5, Farp1, LOC100043837, Stk24, Slc15a1, LOC100043577
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-231O22.bB6Ng01-231O22.g
ACCGA044397GA044398
length1,003381
definitionB6Ng01-231O22.b B6Ng01-231O22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,924,526 - 120,925,515)(120,743,277 - 120,743,657)
sequence
gaattcatgagctaccctgcctggcccaattctgggtctaagtcacacta
cttgaagaatataattcatagcaagttttaaaattaagcaacattttaaa
aattcagtaaggtttaaaaagtatttcaaatgtgtgggtaatttatgttt
cgtatcttaaagaatttattttgtgaatgaaatgtctcagtagcctgccc
caaattgataactctagaagtataggtaggtactacaatataaatcgaag
atgcttgagcaactgaggagttaactttgtttcaatgaatgtatagagag
atagcaggagagtgtggtaaggaagagcccaggaaccaggcttaaatccg
gatgtggcaaccagctcattttgttcaacagtaaccatatttcatgctga
ctgcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacttagcaggacctatttcctg
tctctaagagtcttactaacagaagggatggcagtcacaatggagataag
ggtagtcgcacccttcccctggtggctacactgaaagaaaagtctttgtt
caaggtattgaaagatgtttaaaaagttaccatagaaacaagagaggaac
atttttaatttgtgtatgagggggctgaatggacacatgcagatatagag
acataaaagaaagtgtctccccaaactgcagttgaaggttagcagagtgc
agaggggccaagcaaatgattggactaaagctgaaacagggacaaaggtc
agaataaccaaccttgatctaacttattctgtatgtataatgcagtggga
cttcagactctgccttgccctaggaggctctagtttttaaaattcatcta
cccatccacccacccatccacccacctatccacccactatccattccatt
cacctacccatccatccatccacccacccatccatcatccatccaccaca
atctatgcatttcacccacccatctatcatcatcactcagccatccattc
cac
gaattcaacagggacatagacatcttaggaggttgcttgccctcagtcac
cccacgttttgcctcccgtctcttgcatgtctccctgttccatctttcac
ttaaaggagtaacaccggtgaggactttccttggcccatcatgcagcagt
acaaatgggacactgcttaatggatgtgctgtggtttatagaggagacag
agcttccattcccctgctgaggcttgcttcccatttccaagaaactgtgg
ctctgtatgtttcccccccaagaagctgtagagcttagaaccacatgaaa
agaaaatgctaaactgaccacaaagtcacagaaatgatagctagaaaggt
aggtaggtaggtaggtaggtaggtaggtagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_120924526_120925515
seq2: B6Ng01-231O22.b_46_1048 (reverse)

seq1  GTGG-ATGGATG-------------GATAGATGGGTGGGTG-AATGGATA  35
      |||| |||||||             |||||||||||||||| |||| |||
seq2  GTGGAATGGATGGCTGAGTGATGATGATAGATGGGTGGGTGAAATGCATA  50

seq1  GATTGGTGGGTGGATGGATGATGGATGGGTGGGTGGATGGATGGATGGGT  85
      |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTG--TGGTGGATGGATGATGGATGGGTGGGTGGATGGATGGATGGGT  98

seq1  AGGTGAATGG-ATGGATAGGTGGGTGGATAGGTGGGTGGATGGGTGGGTG  134
      |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAATGGAATGGATA-GTGGGTGGATAGGTGGGTGGATGGGTGGGTG  147

seq1  GATGGGTAGATGAATTTTAAAAACTAGAGCCTCCTAGGGCAAGGCAGAGT  184
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGTAGATGAATTTTAAAAACTAGAGCCTCCTAGGGCAAGGCAGAGT  197

seq1  CTGAAGTCCCACTGCATTATACATACAGAATAAGTTAGATCAAGGTTGGT  234
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGTCCCACTGCATTATACATACAGAATAAGTTAGATCAAGGTTGGT  247

seq1  TATTCTGACCTTTGTCCCTGTTTCAGCTTTAGTCCAATCATTTGCTTGGC  284
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTGACCTTTGTCCCTGTTTCAGCTTTAGTCCAATCATTTGCTTGGC  297

seq1  CCCTCTGCACTCTGCTAACCTTCAACTGCAGTTTGGGGAGACACTTTCTT  334
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGCACTCTGCTAACCTTCAACTGCAGTTTGGGGAGACACTTTCTT  347

seq1  TTATGTCTCTATATCTGCATGTGTCCATTCAGCCCCCTCATACACAAATT  384
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTCTCTATATCTGCATGTGTCCATTCAGCCCCCTCATACACAAATT  397

seq1  AAAAATGTTCCTCTCTTGTTTCTATGGTAACTTTTTAAACATCTTTCAAT  434
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATGTTCCTCTCTTGTTTCTATGGTAACTTTTTAAACATCTTTCAAT  447

seq1  ACCTTGAACAAAGACTTTTCTTTCAGTGTAGCCACCAGGGGAAGGGTGCG  484
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGAACAAAGACTTTTCTTTCAGTGTAGCCACCAGGGGAAGGGTGCG  497

seq1  ACTACCCTTATCTCCATTGTGACTGCCATCCCTTCTGTTAGTAAGACTCT  534
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACCCTTATCTCCATTGTGACTGCCATCCCTTCTGTTAGTAAGACTCT  547

seq1  TAGAGACAGGAAATAGGTCCTGCTAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT  584
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGACAGGAAATAGGTCCTGCTAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT  597

seq1  TTGCAGTCAGCATGAAATATGGTTACTGTTGAACAAAATGAGCTGGTTGC  634
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGTCAGCATGAAATATGGTTACTGTTGAACAAAATGAGCTGGTTGC  647

seq1  CACATCCGGATTTAAGCCTGGTTCCTGGGCTCTTCCTTACCACACTCTCC  684
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCCGGATTTAAGCCTGGTTCCTGGGCTCTTCCTTACCACACTCTCC  697

seq1  TGCTATCTCTCTATACATTCATTGAAACAAAGTTAACTCCTCAGTTGCTC  734
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATCTCTCTATACATTCATTGAAACAAAGTTAACTCCTCAGTTGCTC  747

seq1  AAGCATCTTCGATTTATATTGTAGTACCTACCTATACTTCTAGAGTTATC  784
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATCTTCGATTTATATTGTAGTACCTACCTATACTTCTAGAGTTATC  797

seq1  AATTTGGGGCAGGCTACTGAGACATTTCATTCACAAAATAAATTCTTTAA  834
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGGGGCAGGCTACTGAGACATTTCATTCACAAAATAAATTCTTTAA  847

seq1  GATACGAAACATAAATTACCCACACATTTGAAATACTTTTTAAACCTTAC  884
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACGAAACATAAATTACCCACACATTTGAAATACTTTTTAAACCTTAC  897

seq1  TGAATTTTTAAAATGTTGCTTAATTTTAAAACTTGCTATGAATTATATTC  934
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTTTTAAAATGTTGCTTAATTTTAAAACTTGCTATGAATTATATTC  947

seq1  TTCAAGTAGTGTGACTTAGACCCAGAATTGGGCCAGGCAGGGTAGCTCAT  984
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGTAGTGTGACTTAGACCCAGAATTGGGCCAGGCAGGGTAGCTCAT  997

seq1  GAATTC  990
      ||||||
seq2  GAATTC  1003

seq1: chr14_120743277_120743657
seq2: B6Ng01-231O22.g_72_452

seq1  GAATTCAACAGGGACATAGACATCTTAGGAGGTTGCTTGCCCTCAGTCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACAGGGACATAGACATCTTAGGAGGTTGCTTGCCCTCAGTCAC  50

seq1  CCCACGTTTTGCCTCCCGTCTCTTGCATGTCTCCCTGTTCCATCTTTCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACGTTTTGCCTCCCGTCTCTTGCATGTCTCCCTGTTCCATCTTTCAC  100

seq1  TTAAAGGAGTAACACCGGTGAGGACTTTCCTTGGCCCATCATGCAGCAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGGAGTAACACCGGTGAGGACTTTCCTTGGCCCATCATGCAGCAGT  150

seq1  ACAAATGGGACACTGCTTAATGGATGTGCTGTGGTTTATAGAGGAGACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGGGACACTGCTTAATGGATGTGCTGTGGTTTATAGAGGAGACAG  200

seq1  AGCTTCCATTCCCCTGCTGAGGCTTGCTTCCCATTTCCAAGAAACTGTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCATTCCCCTGCTGAGGCTTGCTTCCCATTTCCAAGAAACTGTGG  250

seq1  CTCTGTATGTTTCCCCCCCAAGAAGCTGTAGAGCTTAGAACCACATGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTATGTTTCCCCCCCAAGAAGCTGTAGAGCTTAGAACCACATGAAA  300

seq1  AGAAAATGCTAAACTGACCACAAAGTCACAGAAATGATAGCTAGAAAGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATGCTAAACTGACCACAAAGTCACAGAAATGATAGCTAGAAAGGT  350

seq1  AGGTAGGTAGGTAGGTAGGTAGGTAGGTAGG  381
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGGTAGGTAGGTAGGTAGGTAGGTAGG  381