BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-236A14
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,728,180 - 22,843,453
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp503, 1700112E06Rik
Upstream geneVcl, Ap3m1, Adk, Myst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1
Downstream geneEG665075, EG435392, LOC665068
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-236A14.bB6Ng01-236A14.g
ACCGA047358GA047359
length1,166970
definitionB6Ng01-236A14.b B6Ng01-236A14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,842,285 - 22,843,453)(22,728,180 - 22,729,031)
sequence
gaattccacagtcctctcaacataacacagtatcatgatagaacctggat
aagttctgagttgtaaataagcacttcccaatgtagggaccatagagtcc
ttaccctcaggacagtggcttctagggcctttctaatgtgttgtcagtca
ccagattgagattccctgggacacacacacactgccaccacaccatccct
accccctccaccccccacctctgtctgtcaccaggttagtgactctcacc
agaagcactgtcccaggtccattttgagcgccagtgttgctatctactag
ctgtttccttggatttgtcacagtgacctggaacctgttctcttttgttt
tcttcaatcagagagttacatgtatctcaggctagcctagagttcactat
gtacccgaggataaccttcagcttctgctcctcctgcctgggtcaaaccc
ggggccttgtgcatgctaggcaggtgctggaccaactgagtgactctcag
cctctgcttccccttttttgaacttatcaagtacagtcatcaactaccac
caagagcagttacaatagcacagtaacactgaataaatgctaaccctgag
cagtccggttctctgtcacatcctcaagaaacagcctttgggagcagtcg
gtgtcatccccattgtacttgtataacaggaccagaatagcatatgaaaa
gcactcgcccaatcagtagctgttgttcagatcattagccccatggaggg
gactggctattttcattctctcctgagcctaacattttctgagcccaaat
tttaagtttgtgtttatgtctgtgattgtatacatgccacaaacggtagc
tgtcacccgttaatggaaaaagggagggtgttatgttgattataaatgaa
gcattcaagccaagaaaagccaaatgaggtcaggccccacgatgaataaa
aagatttaacagagaaaagggatgggaccgcatcaactgtcccacttgca
tgccagccatcagctcatggaggccccaggagcaccaatatagcatcaaa
cagtatcacttaccctctcttaaattttttattgagatctttccttggca
ttgaatcatcctttattaggaatattcttttctctaagtactgaaaaggt
acaccattcattctgg
gaattctgtttatttctttttagataattttggctgggcagttgtggtgc
ctacctttaatcctcacttgggaggaagaagcaagtaagatctatgggga
ctttgaggccaatttggtctacaaagctagttcctggacagccaggggtc
ctggaattaaagaaccagggctacacaaagaaatcctatcttgaaaaaga
acaacaacaagaacaacagaaagagagagagagagagagagagagagaga
gagagagagagagaggaagaaagaaaaaagaatgaaggaaagaattttgg
ataaaaaaatttctcagcatgaacttccttcatacttctaaaaaaccatt
tttttatatgttttgagattataatgtaattacatcatttctccctaact
tttcttctgtctggttcctcccctgtacccatcctttctctatttcaaat
ccatggccatttcccccccctaaaaacaacaacaacaacaacaacaacaa
caaactaaagcaaactaaacaataagcacatgcacacacacttctaaata
tatcaatagaagcttcttagtctatataatgttacttatacatacatttt
caggactgaccatttgatattagataaccagctggtgtattctttcttga
taaggctatttctcctgctctcagcatgtaaaagttgtttgtttttgaga
cagggtcttatatgtagctctggctgttctggaactcactgtgtagacct
ggctgacctgaaactcacagagatccacctacctctgcctcccgagtgct
gggcctgaagcccactatgtctggctagcctgctgttctttgtgtagggt
tgagtctgcgtgagctttccttcatccatgttagaatgtccattggtgtc
atctttgttcaggttcttttttagggagccacactggtgagcctgtatgt
gatgagcatctctgatgttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22842285_22843453
seq2: B6Ng01-236A14.b_31_1196 (reverse)

seq1  CCAGAATGAAATTGGTTGTAACTTTTTCAGTACTTAGAGAA---GATATC  47
      ||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||    |||| 
seq2  CCAGAATGAA--TGG-TGT-ACCTTTTCAGTACTTAGAGAAAAGAATATT  46

seq1  CTAAATAAAGGGATGATTTAAATGCAAGGGAAAGATCTCAATAAAAATTT  97
      |  |||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| ||
seq2  CCTAATAAA-GGATGA-TTCAATGCCAAGGAAAGATCTCAATAAAAAATT  94

seq1  TAAGAGAGGGTTAGTGATACTTGTTTGATGCTATATTGGTGCTCCTGGGG  147
      ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGAGGGTAAGTGATAC-TGTTTGATGCTATATTGGTGCTCCTGGGG  143

seq1  CCTCCATGAGCTGATGGCTGGCATGCAAGTGGGACAGTTGATGCGGTCCC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCATGAGCTGATGGCTGGCATGCAAGTGGGACAGTTGATGCGGTCCC  193

seq1  ATCCCTTTTCTCTGTTAAATCTTTTTATTCATCGT-GGGCCTGACCTCAT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATCCCTTTTCTCTGTTAAATCTTTTTATTCATCGTGGGGCCTGACCTCAT  243

seq1  TTGGCTTTTCTTGGCTTGAATGCTTCATTTATAATCAACATAACACCCTC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTTTTCTTGGCTTGAATGCTTCATTTATAATCAACATAACACCCTC  293

seq1  CCTTTTTCCATTAACGGGTGACAGCTACCGTTTGTGGCATGTATACAATC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTTCCATTAACGGGTGACAGCTACCGTTTGTGGCATGTATACAATC  343

seq1  ACAGACATAAACACAAACTTAAAATTTGGGCTCAGAAAATGTTAGGCTCA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACATAAACACAAACTTAAAATTTGGGCTCAGAAAATGTTAGGCTCA  393

seq1  GGAGAGAATGAAAATAGCCAGTCCCCTCCATGGGGCTAATGATCTGAACA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGAATGAAAATAGCCAGTCCCCTCCATGGGGCTAATGATCTGAACA  443

seq1  ACAGCTACTGATTGGGCGAGTGCTTTTCATATGCTATTCTGGTCCTGTTA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTACTGATTGGGCGAGTGCTTTTCATATGCTATTCTGGTCCTGTTA  493

seq1  TACAAGTACAATGGGGATGACACCGACTGCTCCCAAAGGCTGTTTCTTGA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGTACAATGGGGATGACACCGACTGCTCCCAAAGGCTGTTTCTTGA  543

seq1  GGATGTGACAGAGAACCGGACTGCTCAGGGTTAGCATTTATTCAGTGTTA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTGACAGAGAACCGGACTGCTCAGGGTTAGCATTTATTCAGTGTTA  593

seq1  CTGTGCTATTGTAACTGCTCTTGGTGGTAGTTGATGACTGTACTTGATAA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCTATTGTAACTGCTCTTGGTGGTAGTTGATGACTGTACTTGATAA  643

seq1  GTTCAAAAAAGGGGAAGCAGAGGCTGAGAGTCACTCAGTTGGTCCAGCAC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAAAAAGGGGAAGCAGAGGCTGAGAGTCACTCAGTTGGTCCAGCAC  693

seq1  CTGCCTAGCATGCACAAGGCCCCGGGTTTGACCCAGGCAGGAGGAGCAGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTAGCATGCACAAGGCCCCGGGTTTGACCCAGGCAGGAGGAGCAGA  743

seq1  AGCTGAAGGTTATCCTCGGGTACATAGTGAACTCTAGGCTAGCCTGAGAT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAAGGTTATCCTCGGGTACATAGTGAACTCTAGGCTAGCCTGAGAT  793

seq1  ACATGTAACTCTCTGATTGAAGAAAACAAAAGAGAACAGGTTCCAGGTCA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTAACTCTCTGATTGAAGAAAACAAAAGAGAACAGGTTCCAGGTCA  843

seq1  CTGTGACAAATCCAAGGAAACAGCTAGTAGATAGCAACACTGGCGCTCAA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGACAAATCCAAGGAAACAGCTAGTAGATAGCAACACTGGCGCTCAA  893

seq1  AATGGACCTGGGACAGTGCTTCTGGTGAGAGTCACTAACCTGGTGACAGA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGACCTGGGACAGTGCTTCTGGTGAGAGTCACTAACCTGGTGACAGA  943

seq1  CAGAGGTGGGGGGTGGAGGGGGTAGGGATGGTGTGGTGGCAGTGTGTGTG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGTGGGGGGTGGAGGGGGTAGGGATGGTGTGGTGGCAGTGTGTGTG  993

seq1  TGTCCCAGGGAATCTCAATCTGGTGACTGACAACACATTAGAAAGGCCCT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCAGGGAATCTCAATCTGGTGACTGACAACACATTAGAAAGGCCCT  1043

seq1  AGAAGCCACTGTCCTGAGGGTAAGGACTCTATGGTCCCTACATTGGGAAG  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCCACTGTCCTGAGGGTAAGGACTCTATGGTCCCTACATTGGGAAG  1093

seq1  TGCTTATTTACAACTCAGAACTTATCCAGGTTCTATCATGATACTGTGTT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTATTTACAACTCAGAACTTATCCAGGTTCTATCATGATACTGTGTT  1143

seq1  ATGTTGAGAGGACTGTGGAATTC  1169
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGAGAGGACTGTGGAATTC  1166

seq1: chr14_22728180_22729031
seq2: B6Ng01-236A14.g_66_915

seq1  GAATTCTGTTTATTTCTTTTTAGATAATTTTGGCTGGGCAGTTGTGGTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTTTATTTCTTTTTAGATAATTTTGGCTGGGCAGTTGTGGTGC  50

seq1  CTACCTTTAATCCTCACTTGGGAGGAAGAAGCAAGTAAGATCTATGGGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTTTAATCCTCACTTGGGAGGAAGAAGCAAGTAAGATCTATGGGGA  100

seq1  CTTTGAGGCCAATTTGGTCTACAAAGCTAGTTCCTGGACAGCCAGGGGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAGGCCAATTTGGTCTACAAAGCTAGTTCCTGGACAGCCAGGGGTC  150

seq1  CTGGAATTAAAGAACCAGGGCTACACAAAGAAATCCTATCTTGAAAAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAATTAAAGAACCAGGGCTACACAAAGAAATCCTATCTTGAAAAAGA  200

seq1  ACAACAACAAGAACAACAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  250
      |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAACAAGAACAACAGAA--AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  248

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGGAAGAAAGAAAAAAGAATGAAGGAAAGAATTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGGAAGAAAGAAAAAAGAATGAAGGAAAGAATTTT  298

seq1  GGATAAAAAAATTTCTCAGCATGAACTTCCTTCATACTTCTAAAAAACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAAAAAAATTTCTCAGCATGAACTTCCTTCATACTTCTAAAAAACCA  348

seq1  TTTTTTTATATGTTTTGAGATTATAATGTAATTACATCATTTCTCCCTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTATATGTTTTGAGATTATAATGTAATTACATCATTTCTCCCTAA  398

seq1  CTTTTCTTCTGTCTGGTTCCTCCCCTGTACCCATCCTTTCTCTATTTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCTTCTGTCTGGTTCCTCCCCTGTACCCATCCTTTCTCTATTTCAA  448

seq1  ATCCATGGCCATTTCCCCCCCCTAAAAACAACAACAACAACAACAACAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATGGCCATTTCCCCCCCCTAAAAACAACAACAACAACAACAACAAC  498

seq1  AACAAACTAAAGCAAACTAAACAATAAGCACATGCACACACACTTCTAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACTAAAGCAAACTAAACAATAAGCACATGCACACACACTTCTAAA  548

seq1  TATATCAATAGAAGCTTCTTAGTCTATATAATGTTACTTATACATACATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCAATAGAAGCTTCTTAGTCTATATAATGTTACTTATACATACATT  598

seq1  TTCAGGACTGACCATTTGATATTAGATAACCAGCTGGTGTATTCTTTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGACTGACCATTTGATATTAGATAACCAGCTGGTGTATTCTTTCTT  648

seq1  GATAAGGCTATTTCTCCTGCTCTCAGCATGTAAAAGTTGTTTGTTTTTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGGCTATTTCTCCTGCTCTCAGCATGTAAAAGTTGTTTGTTTTTGA  698

seq1  GACAGGGTCTTATATGTAGCTCTGGCTGTTCTGGAACTCACTGTGTAGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGGTCTTATATGTAGCTCTGGCTGTTCTGGAACTCACTGTGTAGAC  748

seq1  CTGGCTGACCTGAAACTCACAGAGATCCACCTACCTCTGCCTCCCGAGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGACCTGAAACTCACAGAGATCCACCTACCTCTGCCTCCCGAGTG  798

seq1  CTGGGCCTGAAGCCCACTATGTCTGGCTAGCCTGCTGTTCTTTGTGTAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCCTGAAGCCCACTATGTCTGGCTAGCCTGCTGTTCTTTGTGTAGG  848

seq1  GT  852
      ||
seq2  GT  850