BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-246H17
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,883,246 - 23,019,908
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700112E06Rik
Upstream geneAdk, Myst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, EG665075
Downstream geneEG435392, LOC665068
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-246H17.bB6Ng01-246H17.g
ACCGA055086GA055087
length1,1701,120
definitionB6Ng01-246H17.b B6Ng01-246H17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,883,246 - 22,884,418)(23,018,801 - 23,019,908)
sequence
gaattccagtccttacaaatacacagcaagtgcttaacccactcggttcc
ctccccacccttccactcaaaatctcaaagcaaaagaaatgttattcaga
tccttggctaataatctccttatctgtttagatgcgtctgacattcattg
ttctccactattagcgataagagtattttcatggatcatttttgtattaa
aaacagaagtcaggcatttaagatctgcttgtgatttcagagtacatttt
ggccaatttgacaagacaaaaacattcatgaaagttgatgtttctttctt
ttttttgacattttaaattagatattttattcatttacatttcaaatgct
atcccaaaagtcccctataccttctccccaccctactcccctacccactc
actcctacttcttggccctggctttcccctgtactgggacatataaagtt
tgctagaccaaggggcctctcttcccaatgatggccgactaggccatctt
ctgctacatatgcagctagagacatgagctctgggggtactggttagttc
atattgttgttccacctatagcgttgcagaccccttcagctcttgggtac
tttctctagctcttacactgggggccctgtgtttttttcttaaatgggcc
cccaccccctgaagtctcttaaggagtgaactagagctcagaggtagaag
gcactccctgcttgtcactgcctctatgaccccagtgtccctgaaccttc
tgagaattatttctgcacttacagcgtgagttcccatctctgtgtgagga
gcctgacaaaaactttgcaagtggactgcacttaacaaagattattgata
gttaatgttaatccctttttctttcaaaacacttgagaagttttattgaa
attaataaaatagatatcttctagaagtcttctagtagcatgcttctggc
cactattaaacaaaaacaaaccagttccagattccagacagcacaggact
caatccttactctgtttccctgcagtctaaccctgctgctcatcacagct
ctgacttagactctgcgctttcgacaatgggcaacagtgttctatctaca
ataacaccagtggaagaaactggttttatgctctacatatttgtagcaaa
atgtaattaagcttagcagc
gaattcaataaatcctagttacctgctcctttcctggaataatgctttct
gttcccaacttggagaagtgaaacatttctttcataattgtcagctttac
tgggaggtaattggcagcttcctttggttttaggattgctctggatgtct
tgcatagggaatctccagcgcctttgtagaccttgatggccagataatga
gactgtatttctgctcacatccccacacaggctgggactgaggccatgtg
gccgtgtatttgcatatgtggaacaacagaaacctgaatggaaataaata
aatttaagagtccccagcattggctcttcttaaagagaccaagtaaggac
agaggcaggaatatttttgtctggatgttctttgactggctttctttgat
attcaagcagttaactccactccatggaccagcctgagccaagagaagcg
ctctatcaccctatgtgcaggcagtagccagatgagaagtatctacctca
gagacagagagccttgatgagggactccagggtgagttgtctgatgtttg
gtgcccaatcatcatctatgaaataaggaaggcaactctgcccaacagag
tggccatggagacagagctaatgtatatccttacagaactgtggccagag
taaccaggtaccacaatctagacatcaactggatccttattccacccctt
aatctcagcaagagagctggccaaagtcgaatttccttcataagagacta
ttaagacagggcatggggtgctatcattttagcaccccatctttcaggta
aacaccatctgtgagccccagggactttacataaaatttccctagttctc
aggaagtggtgggagaagaaaataaatgagaaaaaaaagggggatgagaa
cagagagagggagactaacagattaggaagaccagtcagcttaaatctat
ttcctagtctggtacccaacacactaggagaactggttacacatctgatc
ttggttccatgagacatctcagtgtaagttaagaaatccctccaatttgt
gttaagttatattgccaacgtcaatagaatactaaccaagaacactgaac
ccttaagtcatagctgtccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22883246_22884418
seq2: B6Ng01-246H17.b_45_1214

seq1  GAATTCCAGTCCTTACAAATACACAGCAAGTGCTTAACCCACTCGGTTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTCCTTACAAATACACAGCAAGTGCTTAACCCACTCGGTTCC  50

seq1  CTCCCCACCCTTCCACTCAAAATCTCAAAGCAAAAGAAATGTTATTCAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCACCCTTCCACTCAAAATCTCAAAGCAAAAGAAATGTTATTCAGA  100

seq1  TCCTTGGCTAATAATCTCCTTATCTGTTTAGATGCGTCTGACATTCATTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGGCTAATAATCTCCTTATCTGTTTAGATGCGTCTGACATTCATTG  150

seq1  TTCTCCACTATTAGCGATAAGAGTATTTTCATGGATCATTTTTGTATTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCACTATTAGCGATAAGAGTATTTTCATGGATCATTTTTGTATTAA  200

seq1  AAACAGAAGTCAGGCATTTAAGATCTGCTTGTGATTTCAGAGTACATTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGAAGTCAGGCATTTAAGATCTGCTTGTGATTTCAGAGTACATTTT  250

seq1  GGCCAATTTGACAAGACAAAAACATTCATGAAAGTTGATGTTTCTTTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAATTTGACAAGACAAAAACATTCATGAAAGTTGATGTTTCTTTCTT  300

seq1  TTTTTTGACATTTTAAATTAGATATTTTATTCATTTACATTTCAAATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTGACATTTTAAATTAGATATTTTATTCATTTACATTTCAAATGCT  350

seq1  ATCCCAAAAGTCCCCTATACCTTCTCCCCACCCTACTCCCCTACCCACTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAAAAGTCCCCTATACCTTCTCCCCACCCTACTCCCCTACCCACTC  400

seq1  ACTCCTACTTCTTGGCCCTGGCTTTCCCCTGTACTGGGACATATAAAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTACTTCTTGGCCCTGGCTTTCCCCTGTACTGGGACATATAAAGTT  450

seq1  TGCTAGACCAAGGGGCCTCTCTTCCCAATGATGGCCGACTAGGCCATCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAGACCAAGGGGCCTCTCTTCCCAATGATGGCCGACTAGGCCATCTT  500

seq1  CTGCTACATATGCAGCTAGAGACATGAGCTCTGGGGGTACTGGTTAGTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTACATATGCAGCTAGAGACATGAGCTCTGGGGGTACTGGTTAGTTC  550

seq1  ATATTGTTGTTCCACCTATAGCGTTGCAGACCCCTTCAGCTCTTGGGTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGTTGTTCCACCTATAGCGTTGCAGACCCCTTCAGCTCTTGGGTAC  600

seq1  TTTCTCTAGCTCTTACACTGGGGGCCCTGTGTTTTTTTCTTAAATGGGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTAGCTCTTACACTGGGGGCCCTGTGTTTTTTTCTTAAATGGGCC  650

seq1  CCCACCCCCTGAAGTCTCTTAAGGAGTGAACTAGAGCTCAGAGGTAGAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCCCCTGAAGTCTCTTAAGGAGTGAACTAGAGCTCAGAGGTAGAAG  700

seq1  GCACTCCCTGCTTGTCACTGCCTCTATGACCCCAGTGTCCCTGAACCTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCCCTGCTTGTCACTGCCTCTATGACCCCAGTGTCCCTGAACCTTC  750

seq1  TGAGAATTATTTCTGCACTTACAGCGTGAGTTCCCATCTCTGTGTGAGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAATTATTTCTGCACTTACAGCGTGAGTTCCCATCTCTGTGTGAGGA  800

seq1  GCCTGACAAAAACTTTGCAAGTGGACTGCACTTAACAAAGATTATTGATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGACAAAAACTTTGCAAGTGGACTGCACTTAACAAAGATTATTGATA  850

seq1  GTTAATGTTAAT-CCTTTTTCTTTCAAAACACTTGAGAAGTTTTATTGAA  899
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATGTTAATCCCTTTTTCTTTCAAAACACTTGAGAAGTTTTATTGAA  900

seq1  ATTAATAAAATAGATATCTTCTAGAAGTCTTCTAGTAGCATGCTTCTGGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATAAAATAGATATCTTCTAGAAGTCTTCTAGTAGCATGCTTCTGGC  950

seq1  CACTATTAAAC-AAAACAAACCAGGTTCCAGATTCCAGACAGCACAGGGA  998
      ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
seq2  CACTATTAAACAAAAACAAACCA-GTTCCAGATTCCAGACAGCACA-GGA  998

seq1  CTCAATCCTTACTCTG-TTCCCTGCAGTTCTAACCCTGCTGCTCATCACA  1047
      |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATCCTTACTCTGTTTCCCTGCAG-TCTAACCCTGCTGCTCATCACA  1047

seq1  GCTCTTGACTTTAGACTTCTGCGCTTTCGACAATGGGCAACAGTGTTCTA  1097
      |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GCTC-TGAC-TTAGAC-TCTGCGCTTTCGACAATGGGCAACAGTGTTCT-  1093

seq1  ATCTAACAT-ACACCAGTG--AG-AACTGGGTTTATGCTCTACATATTTG  1143
      |||||  || |||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||
seq2  ATCTACAATAACACCAGTGGAAGAAACTGGTTTTATGCTCTACATATTTG  1143

seq1  GAGCAAAAATGTTAATTTTAAGC-TAGCAGC  1173
       ||| ||||||| |   |||||| |||||||
seq2  TAGC-AAAATGTAA---TTAAGCTTAGCAGC  1170

seq1: chr14_23018801_23019908
seq2: B6Ng01-246H17.g_68_1187 (reverse)

seq1  GGGACAGCTGTG-CTTTAGGGTTC-GTG-TCTTGG-TAGTATTCTTATTG  46
      ||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||
seq2  GGGACAGCTATGACTTAAGGGTTCAGTGTTCTTGGTTAGTATTC-TATTG  49

seq1  ACGTTTGCCAATATAACTTAAAACACAAATGGAGGG-TTTC-TAAC-TAC  93
      ||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||||| |||| |||| |||
seq2  ACG-TTGGCAATATAACTTAACACA-AATTGGAGGGATTTCTTAACTTAC  97

seq1  ACTGAGATGTCTCATGGAACCAAGATCAGATGTGTAACCAGTTCTCCTAG  143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGATGTCTCATGGAACCAAGATCAGATGTGTAACCAGTTCTCCTAG  147

seq1  TGTG-TGGGTACCAGACTAGGAAATAGA-TTAAGCTGACTGGTC-TCCTA  190
      |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  TGTGTTGGGTACCAGACTAGGAAATAGATTTAAGCTGACTGGTCTTCCTA  197

seq1  ATCTGTTAGTCTCCCTCTCTCTGTTCTCATCCCCCTTTTTTTTCTCATTT  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTTAGTCTCCCTCTCTCTGTTCTCATCCCCCTTTTTTTTCTCATTT  247

seq1  ATTTTCTTCT-CCACCACTTCCTGAGAACTAGGG-AATTTTATGT-AAGT  287
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  ATTTTCTTCTCCCACCACTTCCTGAGAACTAGGGAAATTTTATGTAAAGT  297

seq1  -CCTGGGGCTCACAGATGGTGTTTACCTG-AAGATGGGGTGCTAAAATGA  335
       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGGCTCACAGATGGTGTTTACCTGAAAGATGGGGTGCTAAAATGA  347

seq1  TAGCACCCCATGCCCTGTCTTAATAGTCTCTTATGAAGGAAATTCGACTT  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACCCCATGCCCTGTCTTAATAGTCTCTTATGAAGGAAATTCGACTT  397

seq1  TGGCCAGCTCTCTTGCTGAGATTAAGGGGTGGAATAAGGATCCAGTTGAT  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCAGCTCTCTTGCTGAGATTAAGGGGTGGAATAAGGATCCAGTTGAT  447

seq1  GTCTAGATTGTGGTACCTGGTTACTCTGGCCACAGTTCTGTAAGGATATA  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAGATTGTGGTACCTGGTTACTCTGGCCACAGTTCTGTAAGGATATA  497

seq1  CATTAGCTCTGTCTCCATGGCCACTCTGTTGGGCAGAGTTGCCTTCCTTA  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAGCTCTGTCTCCATGGCCACTCTGTTGGGCAGAGTTGCCTTCCTTA  547

seq1  TTTCATAGATGATGATTGGGCACCAAACATCAGACAACTCACCCTGGAGT  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATAGATGATGATTGGGCACCAAACATCAGACAACTCACCCTGGAGT  597

seq1  CCCTCATCAAGGCTCTCTGTCTCTGAGGTAGATACTTCTCATCTGGCTAC  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCATCAAGGCTCTCTGTCTCTGAGGTAGATACTTCTCATCTGGCTAC  647

seq1  TGCCTGCACATAGGGTGATAGAGCGCTTCTCTTGGCTCAGGCTGGTCCAT  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGCACATAGGGTGATAGAGCGCTTCTCTTGGCTCAGGCTGGTCCAT  697

seq1  GGAGTGGAGTTAACTGCTTGAATATCAAAGAAAGCCAGTCAAAGAACATC  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGGAGTTAACTGCTTGAATATCAAAGAAAGCCAGTCAAAGAACATC  747

seq1  CAGACAAAAATATTCCTGCCTCTGTCCTTACTTGGTCTCTTTAAGAAGAG  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACAAAAATATTCCTGCCTCTGTCCTTACTTGGTCTCTTTAAGAAGAG  797

seq1  CCAATGCTGGGGACTCTTAAATTTATTTATTTCCATTCAGGTTTCTGTTG  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGCTGGGGACTCTTAAATTTATTTATTTCCATTCAGGTTTCTGTTG  847

seq1  TTCCACATATGCAAATACACGGCCACATGGCCTCAGTCCCAGCCTGTGTG  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACATATGCAAATACACGGCCACATGGCCTCAGTCCCAGCCTGTGTG  897

seq1  GGGATGTGAGCAGAAATACAGTCTCATTATCTGGCCATCAAGGTCTACAA  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGTGAGCAGAAATACAGTCTCATTATCTGGCCATCAAGGTCTACAA  947

seq1  AGGCGCTGGAGATTCCCTATGCAAGACATCCAGAGCAATCCTAAAACCAA  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGCTGGAGATTCCCTATGCAAGACATCCAGAGCAATCCTAAAACCAA  997

seq1  AGGAAGCTGCCAATTACCTCCCAGTAAAGCTGACAATTATGAAAGAAATG  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGCTGCCAATTACCTCCCAGTAAAGCTGACAATTATGAAAGAAATG  1047

seq1  TTTCACTTCTCCAAGTTGGGAACAGAAAGCATTATTCCAGGAAAGGAGCA  1085
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACTTCTCCAAGTTGGGAACAGAAAGCATTATTCCAGGAAAGGAGCA  1097

seq1  GGTAACTAGGATTTATTGAATTC  1108
      |||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACTAGGATTTATTGAATTC  1120