BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-249C14
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,315,591 - 22,476,233
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyst4
Upstream geneZmynd17, Ppp3cb, Usp54, Myoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g, Plau, EG620119, Vcl, Ap3m1, Adk
Downstream geneEG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, 1700112E06Rik, EG665075, EG435392
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-249C14.bB6Ng01-249C14.g
ACCGA057052GA057053
length1,0981,090
definitionB6Ng01-249C14.b B6Ng01-249C14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,315,591 - 22,316,676)(22,475,143 - 22,476,233)
sequence
gaattcctcacagcctcggtcctggataagaaagttcaaggtctttatgt
ctgctgcttccttacccactttcccccaaatcagtgtgagtgtacctgga
actttttttttgttttttgagacagggtttctctgtgtagccctggctgt
catggaactcactttgtagaccaggctggcctcttcttatctgacttgtc
ttagagcaagtaaacaagccccaaagatcaaaactcctgtagttcccttt
ggctccttccccacctactctgccctttttttgttttgttgttgttaaag
ctcaaggacacatgggtcacacctcggaatcattccagtcctaattctgg
ctaagaaaatcatggaattatttctgttgagggggaagaattcagcctag
gctaacagttctcaaattcaaaaaactgagaatttcaatacaagtcttga
gctaacagttgtagatctggcaacccattccagagctactgaatcagaag
gtgggttgggccaaggatgctatctgggaagcatcccagatcattccgat
tccagtgatctgtggactgcactaaacagcacaaatagctgtcaatagtt
ctggcagaggctagctgttttccggtggtggtgaacaggtgagataagat
gctggtttatgatggtgcagaatgtgtgctatgcttggttttcaattctc
gctattcctaggttaacttaattgagctatttcactcagcagagacttga
gataccacagataagaaagaggtttaagagggagcagtgagtatctatct
ggctgcgtctctgttatcctctcagtcctacttatctgaagaggcagatt
tatcaaggacaagtaacccttccaggggaatagcagtgggaaaactgttc
cccttttcttgcccacacccgttggataattttgttaggaaaagacaatt
aacactatatttctgctttccgagttttcctacttccaaccaaagattta
gacaaatgtcaatctattttgtttgcctgtcttcccttgctctcaggatg
cctggggactgaaccaatgagcattaagtcaggttctataaagagtct
gaattcaaagctttcagttgctttaggggagataatctccaaggattata
tacctttcaccaacacctgctgagctcagcagacgccaatggaagaccca
caacagaacacagcctgggctttgcaggcctggggattgacaccagccat
gggctcatgttaacttaggaggtaagccaatgcctttagccatggagttc
cttggaggtggcagttcactgggccatgtggtctgttattcgtttcctgg
gctagcagcactgtgaccatgtagacggttagcagtttcattaccagagt
ggatttgaggggccgtcttttgtttaaattcagtgctgatcctgaagtta
gtatctttaagagagccctgttccaaatgacctgtgatgtgtctgaaaga
tgaccttaccaaaagattgagaatgtctctcaaagtagacattttgaaac
agactggatttgaaactggaagtttgagacactctttaccataattcttt
gggcccagtgtaattacatagcaactagactaatcgccgagcaacctgca
ctctcacagaccctaaaggtgactcaaggtcagggcccttgaggacctgc
tctggagctgctaggcaaacaggcttgtgtgggagagacactgaatgtac
aatgggataagtcaggtcccatcagttccttactgggagagaatagaata
gatggatttcctaaagccctatcaggctatgtgggttagctagagtcaat
gagtggctgattgctctgttctatgcctggatgtcactacaaaagaattc
tggctacaacatgaatttacaacttagaaggtagagagaggcctgagagc
atgcatctctaaccagggctcatgtcactatacctgctgagatacactgg
tggggttctaagacatcttggcttcagaactttgtagtttaaacacttat
tttaagactccaaagagcttttgttataaagctgtaatctgtgaattttt
tacagagaagttgacatttgattatttgaaacagcacgaactagtgttac
tctattttcgataatttaaaaaaagcctttcctgcatttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22315591_22316676
seq2: B6Ng01-249C14.b_45_1142

seq1  GAATTCCTCACAGCCTCGGTCCTGGATAAGAAAGTTCAAGGTCTTTATGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCACAGCCTCGGTCCTGGATAAGAAAGTTCAAGGTCTTTATGT  50

seq1  CTGCTGCTTCCTTACCCACTTTCCCCCAAATCAGTGTGAGTGTACCTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGCTTCCTTACCCACTTTCCCCCAAATCAGTGTGAGTGTACCTGGA  100

seq1  ACTTTTTTTTTGTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTTTTTTGTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGT  150

seq1  CATGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCTTCTTATCTGACTTGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCTTCTTATCTGACTTGTC  200

seq1  TTAGAGCAAGTAAACAAGCCCCAAAGATCAAAACTCCTGTAGTTCCCTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGCAAGTAAACAAGCCCCAAAGATCAAAACTCCTGTAGTTCCCTTT  250

seq1  GGCTCCTTCCCCACCTACTCTGCCCTTTTTTTGTTTTGTTGTTGTTAAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCTTCCCCACCTACTCTGCCCTTTTTTTGTTTTGTTGTTGTTAAAG  300

seq1  CTCAAGGACACATGGGTCACACCTCGGAATCATTCCAGTCCTAATTCTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGGACACATGGGTCACACCTCGGAATCATTCCAGTCCTAATTCTGG  350

seq1  CTAAGAAAATCATGGAATTATTTCTGTTGAGGGGGAAGAATTCAGCCTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGAAAATCATGGAATTATTTCTGTTGAGGGGGAAGAATTCAGCCTAG  400

seq1  GCTAACAGTTCTCAAATTCAAAAAACTGAGAATTTCAATACAAGTCTTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACAGTTCTCAAATTCAAAAAACTGAGAATTTCAATACAAGTCTTGA  450

seq1  GCTAACAGTTGTAGATCTGGCAACCCATTCCAGAGCTACTGAATCAGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACAGTTGTAGATCTGGCAACCCATTCCAGAGCTACTGAATCAGAAG  500

seq1  GTGGGTTGGGCCAAGGATGCTATCTGGGAAGCATCCCAGATCATTCCGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTTGGGCCAAGGATGCTATCTGGGAAGCATCCCAGATCATTCCGAT  550

seq1  TCCAGTGATCTGTGGACTGCACTAAACAGCACAAATAGCTGTCAATAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTGATCTGTGGACTGCACTAAACAGCACAAATAGCTGTCAATAGTT  600

seq1  CTGGCAGAGGCTAGCTGTTTTCCGGTGGTGGTGAACAGGTGAGATAAGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAGAGGCTAGCTGTTTTCCGGTGGTGGTGAACAGGTGAGATAAGAT  650

seq1  GCTGGTTTATGATGGTGCAGAATGTGTGCTATGCTTGGTTTTCAATTCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTTTATGATGGTGCAGAATGTGTGCTATGCTTGGTTTTCAATTCTC  700

seq1  GCTATTCCTAGGTTAACTTAATTGAGCTATTTCACTCAGCAGAGACTTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTCCTAGGTTAACTTAATTGAGCTATTTCACTCAGCAGAGACTTGA  750

seq1  GATACCACAGATAAGAAAGAGGTTTAAGAGGGAGCAGTGAGTATCTATCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACCACAGATAAGAAAGAGGTTTAAGAGGGAGCAGTGAGTATCTATCT  800

seq1  GGCTGCGTCTCTGTTATCCTCTCAGTCCTACTTATCTGAAGAGGCAGATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGCGTCTCTGTTATCCTCTCAGTCCTACTTATCTGAAGAGGCAGATT  850

seq1  TATCAAAGGACAAGTAACCC-TCCAGGGGAATAGCAGTGGGAAAACTGTT  899
      |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATC-AAGGACAAGTAACCCTTCCAGGGGAATAGCAGTGGGAAAACTGTT  899

seq1  CCCC-TTTCTTG-CCACACCCGTTGGATAATTTTGTTAGGAAAAGACA--  945
      |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  CCCCTTTTCTTGCCCACACCCGTTGGATAATTTTGTTAGGAAAAGACAAT  949

seq1  TTACACTATATTTCTGCTTTCCGAGTTTT-CTACATC--AACAAAGATTT  992
      | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||
seq2  TAACACTATATTTCTGCTTTCCGAGTTTTCCTACTTCCAACCAAAGATTT  999

seq1  AGACAAATGTCAATCTATTTT-TTTG-CTGTC-TCCCTTGCTCTCAGGGT  1039
      ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |
seq2  AGACAAATGTCAATCTATTTTGTTTGCCTGTCTTCCCTTGCTCTCAGGAT  1049

seq1  GGCTGGGGCTTGAACC-ATGAGCATTAAG-CAAGTTCTTTAAAGAGTCT  1086
      | ||||||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||
seq2  GCCTGGGGACTGAACCAATGAGCATTAAGTCAGGTTCTATAAAGAGTCT  1098

seq1: chr14_22475143_22476233
seq2: B6Ng01-249C14.g_68_1157 (reverse)

seq1  AAAATGCAGGGAAGGCTTTTTTTAAATTATCGAAAATTAGAGTAACACTA  50
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AAAATGCAGGAAAGGCTTTTTTTAAATTATCGAAAA-TAGAGTAACACTA  49

seq1  GGTTCGTTGCTGTTTTAAAATTAATC-AATGTC-ACTTCTCTGT-AAAAA  97
       ||||| |||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||| |||||
seq2  -GTTCG-TGCTGTTTCAAA--TAATCAAATGTCAACTTCTCTGTAAAAAA  95

seq1  TCAACAGA-TACAGCCTTTATAAACAAAAGCTCTTTGGAGTCTT-AAATA  145
      |  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTCACAGATTACAG-CTTTAT-AACAAAAGCTCTTTGGAGTCTTAAAATA  143

seq1  AGTGTTTAAACTACAAAGTTCTGAAGCCAAGATGTCTTAGAACCCCACCA  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTAAACTACAAAGTTCTGAAGCCAAGATGTCTTAGAACCCCACCA  193

seq1  GTGTATCTCAGCAGGTATAGTGACATGAGCCCTGGTTAGAGATGCATGCT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATCTCAGCAGGTATAGTGACATGAGCCCTGGTTAGAGATGCATGCT  243

seq1  CTCAGGCCTCTCTCTACCTTCTAAGTTGT-AATTCATGTTGTAGCCAGAA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGCCTCTCTCTACCTTCTAAGTTGTAAATTCATGTTGTAGCCAGAA  293

seq1  TTCTTTTGTAGTGACATCCAGGCATAGAACAGAGCAATCAGCCACTCATT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTGTAGTGACATCCAGGCATAGAACAGAGCAATCAGCCACTCATT  343

seq1  GACTCTAGCTAACCCACATAGCCTGATAGGGCTTTAGGAAATCCATCTAT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTAGCTAACCCACATAGCCTGATAGGGCTTTAGGAAATCCATCTAT  393

seq1  TCTATTCTCTCCCAGTAAGGAACTGATGGGACCTGACTTATCCCATTGTA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTCTCTCCCAGTAAGGAACTGATGGGACCTGACTTATCCCATTGTA  443

seq1  CATTCAGTGTCTCTCCCACACAAGCCTGTTTGCCTAGCAGCTCCAGAGCA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCAGTGTCTCTCCCACACAAGCCTGTTTGCCTAGCAGCTCCAGAGCA  493

seq1  GGTCCTCAAGGGCCCTGACCTTGAGTCACCTTTAGGGTCTGTGAGAGTGC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTCAAGGGCCCTGACCTTGAGTCACCTTTAGGGTCTGTGAGAGTGC  543

seq1  AGGTTGCTCGGCGATTAGTCTAGTTGCTATGTAATTACACTGGGCCCAAA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGCTCGGCGATTAGTCTAGTTGCTATGTAATTACACTGGGCCCAAA  593

seq1  GAATTATGGTAAAGAGTGTCTCAAACTTCCAGTTTCAAATCCAGTCTGTT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTATGGTAAAGAGTGTCTCAAACTTCCAGTTTCAAATCCAGTCTGTT  643

seq1  TCAAAATGTCTACTTTGAGAGACATTCTCAATCTTTTGGTAAGGTCATCT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAATGTCTACTTTGAGAGACATTCTCAATCTTTTGGTAAGGTCATCT  693

seq1  TTCAGACACATCACAGGTCATTTGGAACAGGGCTCTCTTAAAGATACTAA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGACACATCACAGGTCATTTGGAACAGGGCTCTCTTAAAGATACTAA  743

seq1  CTTCAGGATCAGCACTGAATTTAAACAAAAGACGGCCCCTCAAATCCACT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGGATCAGCACTGAATTTAAACAAAAGACGGCCCCTCAAATCCACT  793

seq1  CTGGTAATGAAACTGCTAACCGTCTACATGGTCACAGTGCTGCTAGCCCA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAATGAAACTGCTAACCGTCTACATGGTCACAGTGCTGCTAGCCCA  843

seq1  GGAAACGAATAACAGACCACATGGCCCAGTGAACTGCCACCTCCAAGGAA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACGAATAACAGACCACATGGCCCAGTGAACTGCCACCTCCAAGGAA  893

seq1  CTCCATGGCTAAAGGCATTGGCTTACCTCCTAAGTTAACATGAGCCCATG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATGGCTAAAGGCATTGGCTTACCTCCTAAGTTAACATGAGCCCATG  943

seq1  GCTGGTGTCAATCCCCAGGCCTGCAAAGCCCAGGCTGTGTTCTGTTGTGG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTGTCAATCCCCAGGCCTGCAAAGCCCAGGCTGTGTTCTGTTGTGG  993

seq1  GTCTTCCATTGGCGTCTGCTGAGCTCAGCAGGTGTTGGTGAAAGGTATAT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCCATTGGCGTCTGCTGAGCTCAGCAGGTGTTGGTGAAAGGTATAT  1043

seq1  AATCCTTGGAGATTATCTCCCCTAAAGCAACTGAAAGCTTTGAATTC  1091
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTTGGAGATTATCTCCCCTAAAGCAACTGAAAGCTTTGAATTC  1090