BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-252D24
Chromosome14 (Build37)
Map Location 91,264,460 - 91,402,922
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG328451, LOC100043336
Downstream geneEG639558
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-252D24.bB6Ng01-252D24.g
ACCGA059295GA059296
length830295
definitionB6Ng01-252D24.b B6Ng01-252D24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,402,095 - 91,402,922)(91,264,460 - 91,264,733)
sequence
gaattcaatcaacaatgttattttaataagttatatttagaataattgat
ctctagaaggaattaacagttatgtatcagcaagtaatatttctgtgcag
aactatgagattgaacatgtgcaaaaaaattaaacttctttttttctgtt
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aaaattttgtgttttatacatatatgtgtatatatgtgtgtgtatatgca
tatatgtatacatatacacatacatatgtatgtatgtatatatatatata
tatatatatatatatatatagagagatatatatatatatatatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_91402095_91402922
seq2: B6Ng01-252D24.b_47_876 (reverse)

seq1  GGTA-CCAATGTGTAATTGGTACCTTTACC-GATATACCAATATATTTTG  48
      |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGTACCCAATGTGTAATTGATACCTTTACCGGATATACCAATATATTTTG  50

seq1  ATAAAACAATAAATGATTCATTATTTTGATACTACTGGTAAT-AAAATTA  97
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATAAAACAATAAATGATTCA-TATTTTGATACTACTGGTAATAAAAATTA  99

seq1  TTTTCTTTTTCTTGCTTCTTCTCCCTCCTCCTCCTCCTCTTTCTCCTCCT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTTTCTTGCTTCTTCTCCCTCCTCCTCCTCCTCTTTCTCCTCCT  149

seq1  CTACTTATTAATTGTTGTTGATTTTTTTTCTGCTGTGTAGTCCCTGGCTT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTATTAATTGTTGTTGATTTTTTTTCTGCTGTGTAGTCCCTGGCTT  199

seq1  TACTGAAACATTCTCTGAAGATAAGATTGATGTCCACTTGAGAATTAGAG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGAAACATTCTCTGAAGATAAGATTGATGTCCACTTGAGAATTAGAG  249

seq1  GCTTATGTAACCACCATCTGGCATAAACTATTTAAATTCATATTTCCATG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATGTAACCACCATCTGGCATAAACTATTTAAATTCATATTTCCATG  299

seq1  ATAAGTTTTAGTTTGTAGAATTATATCTTTTTGCTACTGAGTGTGCTATG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTTTTAGTTTGTAGAATTATATCTTTTTGCTACTGAGTGTGCTATG  349

seq1  CCATTTTAGATTTACAGACAATGAGTGTGCTGAAGAGTTGCACTTGCATC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTTAGATTTACAGACAATGAGTGTGCTGAAGAGTTGCACTTGCATC  399

seq1  TTCTCACTGGAGTCTAATCCTTTTCAAAAGATGCAGCAAAAAGAATAAAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCACTGGAGTCTAATCCTTTTCAAAAGATGCAGCAAAAAGAATAAAG  449

seq1  ACAATTTCTGATCTATCTAAACTTTTAACCTTTCCTAAGAATATAATAAA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTTCTGATCTATCTAAACTTTTAACCTTTCCTAAGAATATAATAAA  499

seq1  TTTCTATATCTTACATTAAAATGCATTGGTATATACATTCAGTTTATTAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTATATCTTACATTAAAATGCATTGGTATATACATTCAGTTTATTAA  549

seq1  CACTGAAAACAACAATAAAATTGCTTTTGTAAACATTAGTTTTACTTTTA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAAAACAACAATAAAATTGCTTTTGTAAACATTAGTTTTACTTTTA  599

seq1  AAAACCTGTTACTGTTGTCTCATCTTTATATTTTGCTTTACTTTTTATTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCTGTTACTGTTGTCTCATCTTTATATTTTGCTTTACTTTTTATTT  649

seq1  CTAAAAATATCCATTTGGTCTAAATATATTAAACAGAAAAAAAGAAGTTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAATATCCATTTGGTCTAAATATATTAAACAGAAAAAAAGAAGTTT  699

seq1  AATTTTTTTGCACATGTTCAATCTCATAGTTCTGCACAGAAATATTACTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTTTTGCACATGTTCAATCTCATAGTTCTGCACAGAAATATTACTT  749

seq1  GCTGATACATAACTGTTAATTCCTTCTAGAGATCAATTATTCTAAATATA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATACATAACTGTTAATTCCTTCTAGAGATCAATTATTCTAAATATA  799

seq1  ACTTATTAAAATAACATTGTTGATTGAATTC  828
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATTAAAATAACATTGTTGATTGAATTC  830


seq1: chr14_91264460_91264733
seq2: B6Ng01-252D24.g_67_342

seq1  GAATTCTTCATAGCTCCTATAGATAGGATATGAATGACATCCTCATGTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCATAGCTCCTATAGATAGGATATGAATGACATCCTCATGTTT  50

seq1  GATATTTTTAAATGCCCCATAATATTTCTTTGTAACTAGTTTTAATGGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTTTTAAATGCCCCATAATATTTCTTTGTAACTAGTTTTAATGGTT  100

seq1  TTTATTTTACAAGATTGATAACAATTCAAAATTTGTAAAAAATGTAATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTTACAAGATTGATAACAATTCAAAATTTGTAAAAAATGTAATGT  150

seq1  AAAATTTTGTGTTTTATACATATATGTGTATATATGTGTGTGTATATGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTTTGTGTTTTATACATATATGTGTATATATGTGTGTGTATATGCA  200

seq1  TATATGTATACATATACACATACATATGTATGTATGTATATATATATATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTATACATATACACATACATATGTATGTATGTATATATATATATA  250

seq1  TATATATATATATATATAGAGAGA--  274
      |||||||||||||||||| |||||  
seq2  TATATATATATATATATATAGAGAGA  276


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