BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-252G11
Chromosome14 (Build37)
Map Location 100,065,966 - 100,196,497
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC619716, LOC100043787, 2410129H14Rik, 6720463M24Rik, Dis3, D14Ertd581e, LOC100043395, LOC100043397, Klf5, LOC100043400, LOC100043789, LOC668671, LOC668672
Downstream geneEG546623, Klf12, LOC100043413, EG668683, EG668684
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-252G11.bB6Ng01-252G11.g
ACCGA059408GA059409
length9441,098
definitionB6Ng01-252G11.b B6Ng01-252G11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,065,966 - 100,066,906)(100,195,385 - 100,196,497)
sequence
gaattctcaggtcttgagagaacagttttgggaacaatgtagggataaaa
gtcagagatagtaagattaagaattatgtcggtaatctgtgaattcatgt
ttattagtgaccagcatcaggtcatactctaatgagtccgtatctaagga
aaaccctacataggtcattaacgatactattaaattaaagatactatagg
tcattaaagatactaaagatattaaatatgcacatgagaattagaccatt
gtggataagttatgaatttcatagcaaagattttcatagcaaactttcca
cactcgcctggtttgggccacttcatttcagattccctgcttgaatctgt
acattcagaggaaacctcagttgacccatgagcaaatagctggatatagg
cggcaacattttttagtatagatctcttagggaagtgggagagtacgaat
cagtaactacagtgaggctgggaagtttatctctgtttgattgatagaga
tttagcaaatactttataagaagaactagtatgtgtgaccttgttgttgg
agtgctatggggagcttgaggtttcaaatgcccatgttaggctcagcttc
aagcagagaatctcaaaagaagtggcccaaaccaggtgagtgtggaaaat
ttgcaaaatcttttctttgctatgaaatttgtaacttagtcattgtggtc
taattccccatgctaatctttaattatctctctctcctctcccctgcaga
ttaggatgcgatattccccagctactgcttcagtgctatgcctgtctcct
ttctgccatgatgatcatggaagagtctctaagactgtcatgagcttcca
gctaagtacttttctgttccaagagttgccttggtcaggtgtctctcctc
acaggcagtttagcagtgattcacacaataccaccaggtatagt
gaattcaaccacatcatcagggtggagaatttattgtgggggcgattaaa
aattacatcagagaaataatgatccgtcctttaatgactctcctttgtag
tgagcttagatcaatatcaactgtttgttttatttgagctcttcgatttt
tccctcttaaagaagatattgcgtgaccatgcaagctcaagaactagggg
aaactcacaagtgtttggcaggaaaggggaaagtagggataaaattgtgc
cacacgtttggtccttgcaaagaaagacttgcaatgcaaaccacccaacc
aaccaccaagaatggaaactgaaatcagattctcctttgtctaattctta
caaaagcatggtaaactcatagaaagaggcaaaggaaatagaaaagcttg
aggttgtgaacagattgtgttaaatgaatttccttagcgtcccttttgag
ggcagccattcagtgaagtgacttaattagtaccacttttaatcttcccc
tgagttctcaatggtcagtgccagtatttttactattactgttgtttaat
tttttgccaaagaaaatgaggaagtgagtattggtttttaaaaacaaagg
atgctcctggagcagaactcaagtttccgcctcatgccaagtcggaaaga
acttgtagaagagaaagaaaacatcttttgagggtggctctgcagaggac
acaccctgtgatctgctggggacagtctactcgtttcccaacactgcaac
tactgcattcccaacaatgcagcaaataatattacacacctttgagtgtg
gctacttctgaggtaagggttctgatgtgaagccttttgagtgcaaagca
ttccacatttgaatgtgtttacacacttagaccctagctgtggtttaagc
caagtagaattttgtggaattttaggatgtggaaaaagtggtcgctggca
tgggctgtggaggtttaaacctggctctgtttttttttttaagacacaac
ctgttcatcaagaacatgaaggagtatgccactgtgcacacttctgctag
atgaggctctgctatctgccttctctctgtcaatgtcttctccactta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_100065966_100066906
seq2: B6Ng01-252G11.b_44_987

seq1  GAATTCTCAGGTCTTGAGAGAACAGTTTTGGGAACAATGTAGGGATAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGGTCTTGAGAGAACAGTTTTGGGAACAATGTAGGGATAAAA  50

seq1  GTCAGAGATAGTAAGATTAAGAATTATGTCGGTAATCTGTGAATTCATGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGAGATAGTAAGATTAAGAATTATGTCGGTAATCTGTGAATTCATGT  100

seq1  TTATTAGTGACCAGCATCAGGTCATACTCTAATGAGTCCGTATCTAAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAGTGACCAGCATCAGGTCATACTCTAATGAGTCCGTATCTAAGGA  150

seq1  AAACCCTACATAGGTCATTAACGATACTATTAAATTAAAGATACTATAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCTACATAGGTCATTAACGATACTATTAAATTAAAGATACTATAGG  200

seq1  TCATTAAAGATACTAAAGATATTAAATATGCACATGAGAATTAGACCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTAAAGATACTAAAGATATTAAATATGCACATGAGAATTAGACCATT  250

seq1  GTGGATAAGTTATGAATTTCATAGCAAAGATTTTCATAGCAAACTTTCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATAAGTTATGAATTTCATAGCAAAGATTTTCATAGCAAACTTTCCA  300

seq1  CACTCGCCTGGTTTGGGCCACTTCATTTCAGATTCCCTGCTTGAATCTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCGCCTGGTTTGGGCCACTTCATTTCAGATTCCCTGCTTGAATCTGT  350

seq1  ACATTCAGAGGAAACCTCAGTTGACCCATGAGCAAATAGCTGGATATAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCAGAGGAAACCTCAGTTGACCCATGAGCAAATAGCTGGATATAGG  400

seq1  CGGCAACATTTTTTAGTATAGATCTCTTAGGGAAGTGGGAGAGTACGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCAACATTTTTTAGTATAGATCTCTTAGGGAAGTGGGAGAGTACGAAT  450

seq1  CAGTAACTACAGTGAGGCTGGGAAGTTTATCTCTGTTTGATTGATAGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAACTACAGTGAGGCTGGGAAGTTTATCTCTGTTTGATTGATAGAGA  500

seq1  TTTAGCAAATACTTTATAAGAAGAACTAGTATGTGTGACCTTGTTGTTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCAAATACTTTATAAGAAGAACTAGTATGTGTGACCTTGTTGTTGG  550

seq1  AGTGCTATGGGGAGCTTGAGGTTTCAAATGCCCATGTTAGGCTCAGCTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTATGGGGAGCTTGAGGTTTCAAATGCCCATGTTAGGCTCAGCTTC  600

seq1  AAGCAGAGAATCTCAAAAGAAGTGGCCCAAACCAGGTGAGTGTGGAAAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGAGAATCTCAAAAGAAGTGGCCCAAACCAGGTGAGTGTGGAAAAT  650

seq1  TTGCAAAATCTTTTCTTTGCTATGAAATTTGTAACTTAGTCATTGTGGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAAAATCTTTTCTTTGCTATGAAATTTGTAACTTAGTCATTGTGGTC  700

seq1  TAATTCCCCATGCTAATCTTTAATTATCTCTCTCT-CTCT-CCCTGCAGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
seq2  TAATTCCCCATGCTAATCTTTAATTATCTCTCTCTCCTCTCCCCTGCAGA  750

seq1  TTAGGATGCGATATT-CCCAGCTACTGCTTCAGTGCTATGCCTGTCTCCT  797
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGATGCGATATTCCCCAGCTACTGCTTCAGTGCTATGCCTGTCTCCT  800

seq1  TTCTGCCATGATGATCATGGAAGAGTCTCTAAGACTGTCAATGAGCTTCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TTCTGCCATGATGATCATGGAAGAGTCTCTAAGACTGTC-ATGAGCTTCC  849

seq1  AGCTAAGTAC-TTTCTGTTCTAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTCTCC  896
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGCTAAGTACTTTTCTGTTCCAAGAGTTGCCTTGGTCA-GGTGTCTCTCC  898

seq1  TCACA-GCAGTTTAGCAGTGATTAAGACAATACAACCAGGTATAGT  941
      ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||
seq2  TCACAGGCAGTTTAGCAGTGATTCACACAATACCACCAGGTATAGT  944

seq1: chr14_100195385_100196497
seq2: B6Ng01-252G11.g_67_1164 (reverse)

seq1  TAAGTGGAGAAAGACA-TGACAGAGAGAACGCAAGATAGCAGGGAGCTTC  49
      ||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||  |||| ||
seq2  TAAGTGGAG-AAGACATTGACAGAGAGAAGGC-AGATAGCA--GAGCCTC  46

seq1  ATCTTAGCAGAAGTGTGCCACAGTGGCATACTCC-TCATG-TCTTGATGG  97
      ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |
seq2  ATC-TAGCAGAAGTGTG-CACAGTGGCATACTCCTTCATGTTCTTGAT-G  93

seq1  AACAGGTTGTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGCCAGGTTTTA  147
      |||||||||||||||         ||||||||||| ||||||||| ||||
seq2  AACAGGTTGTGTCTT---------AAAAAAAAAAACAGAGCCAGG-TTTA  133

seq1  AACCTCCACAGCCCATGCCAGCGACCACTTTTTCCACATCCTAAAATTCC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCCACAGCCCATGCCAGCGACCACTTTTTCCACATCCTAAAATTCC  183

seq1  ACAAAATTCTACTTGGCTTAAACCACAGCTAGGGTCTAAGTGTGTAAACA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAATTCTACTTGGCTTAAACCACAGCTAGGGTCTAAGTGTGTAAACA  233

seq1  CATTCAAATGTGGAATGCTTTGCACTCAAAAGGCTTCACATCAGAACCCT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCAAATGTGGAATGCTTTGCACTCAAAAGGCTTCACATCAGAACCCT  283

seq1  TACCTCAGAAGTAGCCACACTCAAAGGTGTGTAATATTATTTGCCTGCAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TACCTCAGAAGTAGCCACACTCAAAGGTGTGTAATATTATTTG-CTGCAT  332

seq1  TGTTGGGAATGCAGTAGTTGCAGTGTTGGGAAACGAGTAGACTGTCCCCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGGAATGCAGTAGTTGCAGTGTTGGGAAACGAGTAGACTGTCCCCA  382

seq1  GCAGATCACAGGGTGTGTCCTCTGCAGAGCCACCCTCAAAAGATGTTTTC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATCACAGGGTGTGTCCTCTGCAGAGCCACCCTCAAAAGATGTTTTC  432

seq1  TTTCTCTTCTACAAGTTCTTTCCGACTTGGCATGAGGCGGAAACTTGAGT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTTCTACAAGTTCTTTCCGACTTGGCATGAGGCGGAAACTTGAGT  482

seq1  TCTGCTCCAGGAGCATCCTTTGTTTTTAAAAACCAATACTCACTTCCTCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCCAGGAGCATCCTTTGTTTTTAAAAACCAATACTCACTTCCTCA  532

seq1  TTTTCTTTGGCAAAAAATTAAACAACAGTAATAGTAAAAATACTGGCACT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTGGCAAAAAATTAAACAACAGTAATAGTAAAAATACTGGCACT  582

seq1  GACCATTGAGAACTCAGGGGAAGATTAAAAGTGGTACTAATTAAGTCACT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCATTGAGAACTCAGGGGAAGATTAAAAGTGGTACTAATTAAGTCACT  632

seq1  TCACTGAATGGCTGCCCTCAAAAGGGACGCTAAGGAAATTCATTTAACAC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGAATGGCTGCCCTCAAAAGGGACGCTAAGGAAATTCATTTAACAC  682

seq1  AATCTGTTCACAACCTCAAGCTTTTCTATTTCCTTTGCCTCTTTCTATGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGTTCACAACCTCAAGCTTTTCTATTTCCTTTGCCTCTTTCTATGA  732

seq1  GTTTACCATGCTTTTGTAAGAATTAGACAAAGGAGAATCTGATTTCAGTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTACCATGCTTTTGTAAGAATTAGACAAAGGAGAATCTGATTTCAGTT  782

seq1  TCCATTCTTGGTGGTTGGTTGGGTGGTTTGCATTGCAAGTCTTTCTTTGC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTCTTGGTGGTTGGTTGGGTGGTTTGCATTGCAAGTCTTTCTTTGC  832

seq1  AAGGACCAAACGTGTGGCACAATTTTATCCCTACTTTCCCCTTTCCTGCC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGACCAAACGTGTGGCACAATTTTATCCCTACTTTCCCCTTTCCTGCC  882

seq1  AAACACTTGTGAGTTTCCCCTAGTTCTTGAGCTTGCATGGTCACGCAATA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTTGTGAGTTTCCCCTAGTTCTTGAGCTTGCATGGTCACGCAATA  932

seq1  TCTTCTTTAAGAGGGAAAAATCGAAGAGCTCAAATAAAACAAACAGTTGA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTTAAGAGGGAAAAATCGAAGAGCTCAAATAAAACAAACAGTTGA  982

seq1  TATTGATCTAAGCTCACTACAAAGGAGAGTCATTAAAGGACGGATCATTA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGATCTAAGCTCACTACAAAGGAGAGTCATTAAAGGACGGATCATTA  1032

seq1  TTTCTCTGATGTAATTTTTAATCGCCCCCACAATAAATTCTCCACCCTGA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTGATGTAATTTTTAATCGCCCCCACAATAAATTCTCCACCCTGA  1082

seq1  TGATGTGGTTGAATTC  1113
      ||||||||||||||||
seq2  TGATGTGGTTGAATTC  1098