BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-256F13
Chromosome14 (Build37)
Map Location 61,268,926 - 61,382,190
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpata13
Upstream geneAtp8a2, LOC668162, LOC628768, Nupl1, Mtmr6, 2600011E07Rik, Ppia-ps14_696.1, EG628836
Downstream geneC1qtnf9, Mipep, LOC100043586, Tnfrsf19, Sacs, Sgcg, Arl11, EG432864, Ebpl, Kpna3, LOC100042933, EG432865, 6330409N04Rik, LOC100042941, Trim13, Kcnrg, LOC668253
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-256F13.bB6Ng01-256F13.g
ACCGA062328GA062329
length1,1721,055
definitionB6Ng01-256F13.b B6Ng01-256F13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,381,040 - 61,382,190)(61,268,926 - 61,269,984)
sequence
gaattcatcaacattttaaatcaccaatattatttggcccattgagggag
agggaggggatgttcgtgagccgtctgggcaggaggttctttgttgtttc
tatttccttccaaagtagagcacatgccttacatcaaaaaggaagtttgg
cgaactgaaaataaaaactactaaaggtcctccacattctgtatttggta
ataaaatgcatactgacatacagagttttacaaagtcaaaggctattaca
tcttttaaaaacacattagttttcaaaatcacccagaaatcccaagtaag
tcacctgggtcagactttatttgatcaagcacttctcaggctgtataaaa
tcacccggggccagcccaggtcttgaatgtgactcaatataaacacgtcc
tgatatccgggattgttagggggctctgtggaggtggtgggaactggaag
ttagggcagctgggaattctattaggaccggtcacaaacatagccttctt
cactgtcgtcagctgtaacagcaaatggagcctgcagcgggtctgactca
agaggaatccgcagtgaaaatgaacaggaccaaagactattcacttcttt
aaagcaattttcatattaacaatacaactgtgagaattgctgcacacaca
cactggagcacagaaaagtacccaaagtatggtttctaaaaatatatcct
gacattctattagaaaacaaacaagaaaccaaccaaccaaccaaacctgt
cagttatataaatgcagtgaagttgaggcctccgtctccctccctgccac
cctcttacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac
acggcgcatgctctgtacacctgaaccacttcatagcacacagacacacc
tgcgggggatggggggcactgactacagtcctcagcagtgctgcctataa
gtgaccatgccaaggtgcacagcagggttgaaggttgatcccaggcccag
ggtcaagttataagcttgtgatgtgacttgttttcagcaataagaattgt
gaagaaccacggtgaaactggtgcctgacggaccaatacccttcattctc
ttgaacactgccgaacttgctatccctcaagccgaagagcctgatgaagg
cgagaagacccttgcacgaaaa
gaattccttccatcctttattgctctctcaataaaatgtgtcttgctggg
ggtgtggcctcctcttgtgttgctgccgcatcccttgtgaagcagtgagt
gcttcagactgacagtcatgacgtctccatctttgcatctctgctttaga
tggacatgcctcttggggccatgctgggcagaggaattactagcttgcat
tgacactgtttgcagagtcaggcctccgctaaagctcttgggagacatgt
ggacacagtggggtgctgtatggtagccacatcctgcttctctccctgag
tgccatgcaagatgacattggggacattatgagagtttcaaaggaagcaa
tgtagacagccagaaactctagtatcatgttcacgaggcagtatggtcta
gtgttacaagagaataccgatttctttttttagagggcgggagggagaga
gaatatgtgtttgtgtgtgctgagacacatgtatgtgtggtacatgtgtg
tgcttgtgcatgaggaggtcagagatcaacctaagctgtcattcatcagg
agccatccacatttcttttaggagcttattttatttattattatgcatat
gcatgcatgatgtgtgcatgggcacgcatatgtcacggtgctcaaattga
ggttagaggtcggcttacagtagttgattttctccttccaccatgtgggt
cctggagaccagactcgggttgctaggcttagtagtgatgcctttatctt
ctgagccacttcattggctccaccatctaccattctagatataaggtagg
gtctcttactggcctgaaaccctccaaataggctaggctggctggctggc
tgaaggactccctgtccccgcctcatcagtggtgagttcacaagcatgtg
ccaccacggctgaggtgtgtgtatggttgggaagaatgtctgagctcaaa
tttcggccatcatgctagagggcaaggactttactttcagatttttagtt
gaattctgtagatataaggaaataattctgggttttcaattcccctcagt
ggacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_61381040_61382190
seq2: B6Ng01-256F13.b_46_1217 (reverse)

seq1  -TTTTGTGCAAGG---TTCTCGCCTCTCATCA-GCTCT--CGCTTGAGGA  43
       ||| ||||||||   ||||||||| |||||| |||||   |||||||| 
seq2  TTTTCGTGCAAGGGTCTTCTCGCCT-TCATCAGGCTCTTCGGCTTGAGGG  49

seq1  TAAGCAAG-TCCGCAGTGT--CAGAG-ATGAA-GGTATTGGTCCGTCA-G  87
        |||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||||||| |
seq2  ATAGCAAGTTCGGCAGTGTTCAAGAGAATGAAGGGTATTGGTCCGTCAGG  99

seq1  CA-CAG-TTCACCGTG--TCTCCACA--TC-TATGCCTG-AAACAAGTCA  129
      || ||| |||||||||  ||| ||||  || |||  ||| ||||||||||
seq2  CACCAGTTTCACCGTGGTTCTTCACAATTCTTATTGCTGAAAACAAGTCA  149

seq1  CATCAC-AGCTAATAACCTTGACCCTGGGCCTGGGATCAACC-TCAACCC  177
      |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CATCACAAGCTTATAA-CTTGACCCTGGGCCTGGGATCAACCTTCAACCC  198

seq1  TGCTGTGCACCTTGGCATGGTCACTTATAGGCAGCACTGCTGAGGACTGT  227
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGCACCTTGGCATGGTCACTTATAGGCAGCACTGCTGAGGACTGT  248

seq1  AGTCAGTGCCCCCCATCCCCCGCAGGTGTGTCTGTGTGCTATGAAGTGGT  277
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGTGCCCCCCATCCCCCGCAGGTGTGTCTGTGTGCTATGAAGTGGT  298

seq1  TCAGGTGTACAGAGCATGCGCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  327
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGTGTACAGAGCATGCGCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  348

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGAGGGTGGCAGGGAGGGAGACGGAGGCCTC  377
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGAGGGTGGCAGGGAGGGAGACGGAGGCCTC  398

seq1  AACTTCACTGCATTTATATAACTGACAGGTTTGGTTGGTTGGTTGGTTTC  427
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCACTGCATTTATATAACTGACAGGTTTGGTTGGTTGGTTGGTTTC  448

seq1  TTGTTTGTTTTCTAATAGAATGTCAGGATATATTTTTAGAAACCATACTT  477
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTGTTTTCTAATAGAATGTCAGGATATATTTTTAGAAACCATACTT  498

seq1  TGGGTACTTTTCTGTGCTCCAGTGTGTGTGTGCAGCAATTCTCACAGTTG  527
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTACTTTTCTGTGCTCCAGTGTGTGTGTGCAGCAATTCTCACAGTTG  548

seq1  TATTGTTAATATGAAAATTGCTTTAAAGAAGTGAATAGTCTTTGGTCCTG  577
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTTAATATGAAAATTGCTTTAAAGAAGTGAATAGTCTTTGGTCCTG  598

seq1  TTCATTTTCACTGCGGATTCCTCTTGAGTCAGACCCGCTGCAGGCTCCAT  627
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTTTCACTGCGGATTCCTCTTGAGTCAGACCCGCTGCAGGCTCCAT  648

seq1  TTGCTGTTACAGCTGACGACAGTGAAGAAGGCTATGTTTGTGACCGGTCC  677
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTTACAGCTGACGACAGTGAAGAAGGCTATGTTTGTGACCGGTCC  698

seq1  TAATAGAATTCCCAGCTGCCCTAACTTCCAGTTCCCACCACCTCCACAGA  727
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGAATTCCCAGCTGCCCTAACTTCCAGTTCCCACCACCTCCACAGA  748

seq1  GCCCCCTAACAATCCCGGATATCAGGACGTGTTTATATTGAGTCACATTC  777
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCTAACAATCCCGGATATCAGGACGTGTTTATATTGAGTCACATTC  798

seq1  AAGACCTGGGCTGGCCCCGGGTGATTTTATACAGCCTGAGAAGTGCTTGA  827
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCTGGGCTGGCCCCGGGTGATTTTATACAGCCTGAGAAGTGCTTGA  848

seq1  TCAAATAAAGTCTGACCCAGGTGACTTACTTGGGATTTCTGGGTGATTTT  877
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATAAAGTCTGACCCAGGTGACTTACTTGGGATTTCTGGGTGATTTT  898

seq1  GAAAACTAATGTGTTTTTAAAAGATGTAATAGCCTTTGACTTTGTAAAAC  927
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACTAATGTGTTTTTAAAAGATGTAATAGCCTTTGACTTTGTAAAAC  948

seq1  TCTGTATGTCAGTATGCATTTTATTACCAAATACAGAATGTGGAGGACCT  977
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTATGTCAGTATGCATTTTATTACCAAATACAGAATGTGGAGGACCT  998

seq1  TTAGTAGTTTTTATTTTCAGTTCGCCAAACTTCCTTTTTGATGTAAGGCA  1027
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAGTTTTTATTTTCAGTTCGCCAAACTTCCTTTTTGATGTAAGGCA  1048

seq1  TGTGCTCTACTTTGGAAGGAAATAGAAACAACAAAGAACCTCCTGCCCAG  1077
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTCTACTTTGGAAGGAAATAGAAACAACAAAGAACCTCCTGCCCAG  1098

seq1  ACGGCTCACGAACATCCCCTCCCTCTCCCTCAATGGGCCAAATAATATTG  1127
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGCTCACGAACATCCCCTCCCTCTCCCTCAATGGGCCAAATAATATTG  1148

seq1  GTGATTTAAAATGTTGATGAATTC  1151
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTTAAAATGTTGATGAATTC  1172

seq1: chr14_61268926_61269984
seq2: B6Ng01-256F13.g_62_1116

seq1  GAATTCCTTCCATCCTTTATTGCTCTCTCAATAAAATGTGTCTTGCTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCCATCCTTTATTGCTCTCTCAATAAAATGTGTCTTGCTGGG  50

seq1  GGTGTGGCCTCCTCTTGTGTTGCTGCCGCATCCCTTGTGAAGCAGTGAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGGCCTCCTCTTGTGTTGCTGCCGCATCCCTTGTGAAGCAGTGAGT  100

seq1  GCTTCAGACTGACAGTCATGACGTCTCCATCTTTGCATCTCTGCTTTAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAGACTGACAGTCATGACGTCTCCATCTTTGCATCTCTGCTTTAGA  150

seq1  TGGACATGCCTCTTGGGGCCATGCTGGGCAGAGGAATTACTAGCTTGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACATGCCTCTTGGGGCCATGCTGGGCAGAGGAATTACTAGCTTGCAT  200

seq1  TGACACTGTTTGCAGAGTCAGGCCTCCGCTAAAGCTCTTGGGAGACATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACTGTTTGCAGAGTCAGGCCTCCGCTAAAGCTCTTGGGAGACATGT  250

seq1  GGACACAGTGGGGTGCTGTATGGTAGCCACATCCTGCTTCTCTCCCTGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACAGTGGGGTGCTGTATGGTAGCCACATCCTGCTTCTCTCCCTGAG  300

seq1  TGCCATGCAAGATGACATTGGGGACATTATGAGAGTTTCAAAGGAAGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGCAAGATGACATTGGGGACATTATGAGAGTTTCAAAGGAAGCAA  350

seq1  TGTAGACAGCCAGAAACTCTAGTATCATGTTCACGAGGCAGTATGGTCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGACAGCCAGAAACTCTAGTATCATGTTCACGAGGCAGTATGGTCTA  400

seq1  GTGTTACAAGAGAATACCGATTTCTTTTTTTAGAGGGCGGGAGGGAGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTACAAGAGAATACCGATTTCTTTTTTTAGAGGGCGGGAGGGAGAGA  450

seq1  GAATATGTGTTTGTGTGTGCTGAGACACATGTATGTGTGGTACATGTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATGTGTTTGTGTGTGCTGAGACACATGTATGTGTGGTACATGTGTG  500

seq1  TGCTTGTGCATGAGGAGGTCAGAGATCAACCTAAGCTGTCATTCATCAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGTGCATGAGGAGGTCAGAGATCAACCTAAGCTGTCATTCATCAGG  550

seq1  AGCCATCCACATTTCTTTTAGGAGCTTATTTTATTTATTATTATGCATAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATCCACATTTCTTTTAGGAGCTTATTTTATTTATTATTATGCATAT  600

seq1  GCATGCATGATGTGTGCATGGGCACGCATATGTCACGGTGCTCAAATTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCATGATGTGTGCATGGGCACGCATATGTCACGGTGCTCAAATTGA  650

seq1  GGTTAGAGGTCGGCTTACAGTAGTTGATTTTCTCCTTCCACCATGTGGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGAGGTCGGCTTACAGTAGTTGATTTTCTCCTTCCACCATGTGGGT  700

seq1  CCTGGAGACCAGACTCGGGTTGCTAGGCTTAGTAGTGATGCCTTTATCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAGACCAGACTCGGGTTGCTAGGCTTAGTAGTGATGCCTTTATCTT  750

seq1  CTGAGCCACTTCATTGGCTCCACCATCTACCATTCTAGATATAAGGTAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCCACTTCATTGGCTCCACCATCTACCATTCTAGATATAAGGTAGG  800

seq1  GTCTCTTACTGGCCTGAAACCCTCCAAATAGGCTAGGCTGGCTGGCTGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTTACTGGCCTGAAACCCTCCAAATAGGCTAGGCTGGCTGGCTGGC  850

seq1  TGAAGGACTCCCTGTCCCCGCCTCATCAGTGGTGAGTTCACAAGCATGTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGACTCCCTGTCCCCGCCTCATCAGTGGTGAGTTCACAAGCATGTG  900

seq1  CCACCACGGCTGAGGTGTGTGTATGG-TGGGAAGAATGTCTGGAGCTCAA  949
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  CCACCACGGCTGAGGTGTGTGTATGGTTGGGAAGAATGTCT-GAGCTCAA  949

seq1  ATTCGGGCCATCATGCTTAGAGGGCAAGGACTTTACTTTCAGATTTTTAA  999
      |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATTTCGGCCATCATGC-TAGAGGGCAAGGACTTTACTTTCAGATTTTTAG  998

seq1  GTGAAATTTCTGTTAGATAT-AGGAAATAAATTCTGGGTTTTCAAATTCC  1048
       ||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||
seq2  TTGAA--TTCTG-TAGATATAAGGAAAT-AATTCTGGGTTTTCAATTCCC  1044

seq1  CTCAGTGGACC  1059
      |||||||||||
seq2  CTCAGTGGACC  1055