BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-259G11
Chromosome14 (Build37)
Map Location 61,074,421 - 61,189,800
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCab39l, Cdadc1, Tmem46, Atp8a2, LOC668162, LOC628768, Nupl1, Mtmr6, 2600011E07Rik, Ppia-ps14_696.1
Downstream geneEG628836, Spata13, C1qtnf9, Mipep, LOC100043586, Tnfrsf19, Sacs, Sgcg, Arl11, EG432864, Ebpl, Kpna3, LOC100042933, EG432865, 6330409N04Rik, LOC100042941
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-259G11.bB6Ng01-259G11.g
ACCGA064592GA064593
length1,0941,038
definitionB6Ng01-259G11.b B6Ng01-259G11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,188,695 - 61,189,800)(61,074,421 - 61,075,450)
sequence
gaattcagctacagtgaacttatgtataataattatatatataaagaaca
gacagaaatatctacagctctggatccagggggatctggaatcatcttta
actctgtcataaagaacaacaggaagtcacactttacattaaaatgcacc
gaagctagagagaaactaaaggttgctcccatttcattgttgaaagagaa
ttagaccgttgcaaagtgaatgcttcagacacgtggggcctgtagcaact
atttactacttagtctgggctagaggttaattttgttttcagaagttgtg
ataagaagttgcttctgaagaggacaggagttccatgaaacccttggttg
gtgactctcaggctgtagagagcctaaagttctgggagagaaaagattaa
aagttgtatcccaaatccaacatttcaggttaggaggacagagaaagatc
caggcaaatgcattttccagatatattctagaaggttctagtctcaagtt
ctaggcttgaacatcaatgtctttttgactacagcctggctccttcctca
aatctatattgtattttacagttagaaccttgccttgattcataaagcac
ttaggccttccttaaagctgtaacatgaaaccaaccaaacacattgacaa
tatattaaaagtttaaaatttgcattttgtaaaatgtggggaaagtagat
atttaaaataagccgatgtagtttttgctcaggtcactgactggaaggct
attttcccacctggtgagctcctcccacaagtgctgcctttagtggagaa
gtaaaaccgagcatatttcaatgaggattttcaggcaaatgcccctggcc
tttgttagactgcattcaaactgtgtggaacactgtgtctgtggacccac
tggaaccattgaactgaatgctcctgcctatggcttaactcagtttcagg
aagttgcttactttaagaaaacctggatcagtgccacttgaggtctcttg
agtatgtgtggtgctgctggcagggagtgatgtatttcctgactcatcaa
cacaggagaatggtgagcctagtagccaaagaaagcattggctc
gaattctggacataaaaatggatgcctcctaatcagagagtgtgttctgt
ctggagaaggagggggtgtaatacggacttccagcgaccttctgattgtg
ccaagcacagctggtcagactgtaacctgagccagctccaaggaaaatag
tggcatcatctgtccaaactcaaacactttattttttgattgagttcttc
tattcctggatatgtagtcgatgaatgtttctgcacattcaaaattgttt
ctgtgcagaatttctactgcagcattgtaaggaaaagcaaaccctccaga
cggaaaactgggaacaactcttcaagtacccaatgagggctggtggggtg
aatcctactaggagtgtggcacagtgcagtattttataacctaagcaaat
accaaggctctgttgtgtgcactgatgctccacaatgttaagtggagata
gcaaggctctggagatggtgtagataaagagagaaaagggaggactatat
agttacagtacatgtgagtaaagagggctgttcaaagcataggcaagaaa
tcaatgacaactagacatcttatgacacaaagggaaacctccaggagtag
gttacatctcattgtgtagttgaccaaagggccccaatgaaaaaatcctt
aaataccttagatcattgccaagtgtattggttgttttctacaagctgat
ggtaaggtcctattgctgaaacaacaacaacacacacacacacacacaca
cagagagacacacacacacatagttgaagaattttgagctggtgcctaac
tagagccttcactcctactgactagtagtgtttatggcacttgaaaggta
agttgcacagtgctagacaaaaacctaccaacccagctatgaatcccaag
gtttagagtggtgactgccttgtatgataccctggtacaatagtggcaca
accacccaccacccacaactcttaataaaagtttgctggaaatttgacct
ttggaagagcagtcagtggcctaacctctggagtcatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_61188695_61189800
seq2: B6Ng01-259G11.b_45_1138 (reverse)

seq1  GAGCCAATGCCTTTCTTTGGGCTACCTTAGGCTCACCATTCTCCTGTGTT  50
      ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAATG-CTTTCTTT-GGCTAC--TAGGCTCACCATTCTCCTGTGTT  46

seq1  GATGAGTCAGGAAATACCATCACTCCCTTGCCAGCAGCCACCACACATAA  100
      |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| 
seq2  GATGAGTCAGGAAATA-CATCACTCCC-TGCCAGCAG-CACCACACATA-  92

seq1  CCTCAAGAGACCTCAAGTGGCACCTGATCCAGGTTTTCTTAAAGTTAAAG  150
       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||
seq2  -CTCAAGAGACCTCAAGTGGCA-CTGATCCAGGTTTTCTTAAAGT--AAG  138

seq1  CAACTTCCTGAAACTGAGTTAAGCCATAGGCAGGAGCATTCAGTTCAATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTCCTGAAACTGAGTTAAGCCATAGGCAGGAGCATTCAGTTCAATG  188

seq1  GTTCCAGTGGGTCCACAGACACAGTGTTCCACACAGTTTGAATGCAGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCAGTGGGTCCACAGACACAGTGTTCCACACAGTTTGAATGCAGTCT  238

seq1  AACAAAGGCCAGGGGCATTTGCCTGAAAATCCTCATTGAAATATGCTCGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGGCCAGGGGCATTTGCCTGAAAATCCTCATTGAAATATGCTCGG  288

seq1  TTTTACTTCTCCACTAAAGGCAGCACTTGTGGGAGGAGCTCACCAGGTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACTTCTCCACTAAAGGCAGCACTTGTGGGAGGAGCTCACCAGGTGG  338

seq1  GAAAATAGCCTTCCAGTCAGTGACCTGAGCAAAAACTACATCGGCTTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATAGCCTTCCAGTCAGTGACCTGAGCAAAAACTACATCGGCTTATT  388

seq1  TTAAATATCTACTTTCCCCACATTTTACAAAATGCAAATTTTAAACTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATATCTACTTTCCCCACATTTTACAAAATGCAAATTTTAAACTTTT  438

seq1  AATATATTGTCAATGTGTTTGGTTGGTTTCATGTTACAGCTTTAAGGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATTGTCAATGTGTTTGGTTGGTTTCATGTTACAGCTTTAAGGAAG  488

seq1  GCCTAAGTGCTTTATGAATCAAGGCAAGGTTCTAACTGTAAAATACAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAAGTGCTTTATGAATCAAGGCAAGGTTCTAACTGTAAAATACAATA  538

seq1  TAGATTTGAGGAAGGAGCCAGGCTGTAGTCAAAAAGACATTGATGTTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTTGAGGAAGGAGCCAGGCTGTAGTCAAAAAGACATTGATGTTCAA  588

seq1  GCCTAGAACTTGAGACTAGAACCTTCTAGAATATATCTGGAAAATGCATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAGAACTTGAGACTAGAACCTTCTAGAATATATCTGGAAAATGCATT  638

seq1  TGCCTGGATCTTTCTCTGTCCTCCTAACCTGAAATGTTGGATTTGGGATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGGATCTTTCTCTGTCCTCCTAACCTGAAATGTTGGATTTGGGATA  688

seq1  CAACTTTTAATCTTTTCTCTCCCAGAACTTTAGGCTCTCTACAGCCTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTTTAATCTTTTCTCTCCCAGAACTTTAGGCTCTCTACAGCCTGAG  738

seq1  AGTCACCAACCAAGGGTTTCATGGAACTCCTGTCCTCTTCAGAAGCAACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACCAACCAAGGGTTTCATGGAACTCCTGTCCTCTTCAGAAGCAACT  788

seq1  TCTTATCACAACTTCTGAAAACAAAATTAACCTCTAGCCCAGACTAAGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATCACAACTTCTGAAAACAAAATTAACCTCTAGCCCAGACTAAGTA  838

seq1  GTAAATAGTTGCTACAGGCCCCACGTGTCTGAAGCATTCACTTTGCAACG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATAGTTGCTACAGGCCCCACGTGTCTGAAGCATTCACTTTGCAACG  888

seq1  GTCTAATTCTCTTTCAACAATGAAATGGGAGCAACCTTTAGTTTCTCTCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAATTCTCTTTCAACAATGAAATGGGAGCAACCTTTAGTTTCTCTCT  938

seq1  AGCTTCGGTGCATTTTAATGTAAAGTGTGACTTCCTGTTGTTCTTTATGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCGGTGCATTTTAATGTAAAGTGTGACTTCCTGTTGTTCTTTATGA  988

seq1  CAGAGTTAAAGATGATTCCAGATCCCCCTGGATCCAGAGCTGTAGATATT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTAAAGATGATTCCAGATCCCCCTGGATCCAGAGCTGTAGATATT  1038

seq1  TCTGTCTGTTCTTTATATATATAATTATTATACATAAGTTCACTGTAGCT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTGTTCTTTATATATATAATTATTATACATAAGTTCACTGTAGCT  1088

seq1  GAATTC  1106
      ||||||
seq2  GAATTC  1094

seq1: chr14_61074421_61075450
seq2: B6Ng01-259G11.g_67_1104

seq1  GAATTCTGGACATAAAAATGGATGCCTCCTAATCAGAGAGTGTGTTCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGACATAAAAATGGATGCCTCCTAATCAGAGAGTGTGTTCTGT  50

seq1  CTGGAGAAGGAGGGGGTGTAATACGGACTTCCAGCGACCTTCTGATTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGAAGGAGGGGGTGTAATACGGACTTCCAGCGACCTTCTGATTGTG  100

seq1  CCAAGCACAGCTGGTCAGACTGTAACCTGAGCCAGCTCCAAGGAAAATAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCACAGCTGGTCAGACTGTAACCTGAGCCAGCTCCAAGGAAAATAG  150

seq1  TGGCATCATCTGTCCAAACTCAAACACTTTATTTTTTGATTGAGTTCTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATCATCTGTCCAAACTCAAACACTTTATTTTTTGATTGAGTTCTTC  200

seq1  TATTCCTGGATATGTAGTCGATGAATGTTTCTGCACATTCAAAATTGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCCTGGATATGTAGTCGATGAATGTTTCTGCACATTCAAAATTGTTT  250

seq1  CTGTGCAGAATTTCTACTGCAGCATTGTAAGGAAAAGCAAACCCTCCAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCAGAATTTCTACTGCAGCATTGTAAGGAAAAGCAAACCCTCCAGA  300

seq1  CGGAAAACTGGGAACAACTCTTCAAGTACCCAATGAGGGCTGGTGGGGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAAAACTGGGAACAACTCTTCAAGTACCCAATGAGGGCTGGTGGGGTG  350

seq1  AATCCTACTAGGAGTGTGGCACAGTGCAGTATTTTATAACCTAAGCAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTACTAGGAGTGTGGCACAGTGCAGTATTTTATAACCTAAGCAAAT  400

seq1  ACCAAGGCTCTGTTGTGTGCACTGATGCTCCACAATGTTAAGTGGAGATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGGCTCTGTTGTGTGCACTGATGCTCCACAATGTTAAGTGGAGATA  450

seq1  GCAAGGCTCTGGAGATGGTGTAGATAAAGAGAGAAAAGGGAGGACTATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGCTCTGGAGATGGTGTAGATAAAGAGAGAAAAGGGAGGACTATAT  500

seq1  AGTTACAGTACATGTGAGTAAAGAGGGCTGTTCAAAGCATAGGCAAGAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACAGTACATGTGAGTAAAGAGGGCTGTTCAAAGCATAGGCAAGAAA  550

seq1  TCAATGACAACTAGACATCTTATGACACAAAGGGAAACCTCCAGGAGTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGACAACTAGACATCTTATGACACAAAGGGAAACCTCCAGGAGTAG  600

seq1  GTTACATCTCATTGTGTAGTTGACCAAAGGGCCCCAATGAAAAAATCCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACATCTCATTGTGTAGTTGACCAAAGGGCCCCAATGAAAAAATCCTT  650

seq1  AAATACCTTAGATCATTGCCAAGTGTATTGGTTGTTTTCTACAAGCTGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACCTTAGATCATTGCCAAGTGTATTGGTTGTTTTCTACAAGCTGAT  700

seq1  GGTAAGGTCCTATTGCTGAAACAACAACAACACACACACACACACACACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGGTCCTATTGCTGAAACAACAACAACACACACACACACACACACA  750

seq1  CAGAGAGACACACACACACATAGTTGAAGAATTTTGAGCTGGTGCCTAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGACACACACACACATAGTTGAAGAATTTTGAGCTGGTGCCTAAC  800

seq1  TAGAGCCTTCACTCCTACTGACTAGTAGTGTTTATGGCACTTG-AAGGTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TAGAGCCTTCACTCCTACTGACTAGTAGTGTTTATGGCACTTGAAAGGTA  850

seq1  AGTTGCACAGTGCTAGAC-AAAACCTACCAACCCAGCTATGAATCCCAAG  898
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCACAGTGCTAGACAAAAACCTACCAACCCAGCTATGAATCCCAAG  900

seq1  GTTTAGAGTGGTGACTGCC-TGTATGATACCCTGGTACAATAGTGGCACA  947
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGAGTGGTGACTGCCTTGTATGATACCCTGGTACAATAGTGGCACA  950

seq1  A-CACCCACCA-CCACAACTCTTA--TAAAGGTTGCTGGAAA-TTGACCT  992
      | ||||||||| ||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||
seq2  ACCACCCACCACCCACAACTCTTAATAAAAGTTTGCTGGAAATTTGACCT  1000

seq1  TTGGAAGAGCAGTCAGTGGCCTTAACCTCT-GAGTCATC  1030
      ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
seq2  TTGGAAGAGCAGTCAGTGGCC-TAACCTCTGGAGTCATC  1038