BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264D16
Chromosome14 (Build37)
Map Location 28,986,472 - 29,134,141
singlet/doubletdoublet
Overlap geneErc2
Upstream geneLOC665333, Arhgef3, LOC100040147, Ccdc66, LOC665370
Downstream geneLOC100040206, Wnt5a, LOC100040218, Cacna2d3, Lrtm1, Ppia-ps15
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264D16.bB6Ng01-264D16.g
ACCGA068186GA068187
length1,0561,102
definitionB6Ng01-264D16.b B6Ng01-264D16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(29,133,097 - 29,134,141)(28,986,472 - 28,987,586)
sequence
gaattccactgacctttgcactctgcttcagtgtgtaaaaccctctgcct
atgtttgaacgttttatctgtggatcatgtcacacagctccaattcttca
tttgtatcaaaatatatttactagcataatgatcccacaccagaaattac
atccatatttgtatcaatcaagtcataagtttacatatgctttcaacaaa
gaaaggtattcctttctaatgatttgagaagtaaatgcctgctcaattat
aagataacaggagctcaatcaactcaaagcaaatgtggcaatagatctca
gggaaccttaacttggtctcctactgtcccatctccttgagtgttcacag
acaaagagtactacgtaagatccttaaaaaagcacccttatcaatagaga
tgaagagttatttgttcatccctaaggctgacacaccagggggtttttcc
ctaaggaaagcaatatagaatggaacagctgccctttctgattttgtgaa
atagggagatgatagagttcaggttcttgcacacatttgcacacttaaaa
gtacatgtgttgagggggatagtcaaggacaattattgcaaacacacacc
acaggattgcccatgaggacaacttgctgggaaggcatccccccccaggt
agatcctatgcataaggaaatagggttgctctaccaactggtgtgaggtg
gggagagcaaggaagcacagagttgcaaccactcagagggggcagaaatc
catgctgagtcatgctgccctgactatggagtttgtgggactcactgcaa
aatggatctgtacaatcccctcgttggagggatgttaagcatttcacagt
actgacatcagacgtttagctaccagtggatccagtccttcaaagtacca
aggtcaccgactgataaatccagtcttggccatgaggatttaaacgtcgg
agctacggtttatttctatgagacgactgaatctccttataaaggcgaaa
cttccccagtccactttgctatcataaaatgaccactcgttgggaatgat
tcatgg
gaattcttttttctagtgttttccctgtagttggtatacatggttaaata
aaacctatgactaaatcattgtaaatagttgtagagaagtgccgttctct
gtggaaaagttcatggaagaaaagttggattataaagtctggaaggatgg
ggctggagagatggctcagctgttaagagcactgactggtctttcagagg
tcctgggttcaattcccagcaaacacattatggctcacaaccatctgtaa
tggagtctgatgccctcctctggtgtgtctgaagacagctatcgtgtact
catataacaaacaaacaaacctttaaaaacaaaagtgaagcctggacttt
gggatgcagagcagaagcatctcccagaagcagcacctgctgccttcttg
ccatgcgtgtcccagttcactgcccgcctccatcactgctttacaaataa
atacattatttattttttttccctcagcaattgaagctgggcttcttcct
aacaccagaacttttccaagaatgtgcctgaagcccagacagtctctgaa
tttcaaacaaagtctggtggggtctggattctgagcccgggcttctgtct
ggctgtccgttgtgttgatgtgatccagtcttgctcatgtctgtcatcag
atacacattataggggaggacagcctagaagctgagatgatggcagctag
ccaccgaagacacagaagaggaaacctcaggcttcagtcatcctcctagc
ctctcttcgctcctcccctctgctctgttctccctccttttctttcctca
tatctgcttcttaaaaagaccctgctaaagggaaggtgtggagaaagttc
tagaactaagatgacaagaggccttgttctgagtaccacctggaaccagt
ggttgggtgaacatatagaacacaaagttctgtaggaaagagctctgtag
ttgacagttgacaatctacactcacctggaaatggcccttagcataatgt
gggaaattatctgataccttcatcagcatcctgccactgtgagtgacaca
tcttgagcagccatccttactctctgttctggatataggtgtgctcagct
ct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_29133097_29134141
seq2: B6Ng01-264D16.b_41_1096 (reverse)

seq1  CCATG-ATCAT--CCAA-GAGTGGT-ATTTTATGAGAGCAAAGTGGACTG  45
      ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||
seq2  CCATGAATCATTCCCAACGAGTGGTCATTTTATGATAGCAAAGTGGACTG  50

seq1  GGGAAGTTT-GCTTTTCTAAGGAGTTTCAGTGGTCTC-TAGAATTAA--C  91
      ||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||  |
seq2  GGGAAGTTTCGCCTTTATAAGGAGATTCAGTCGTCTCATAGAAATAAACC  100

seq1  CTTGCTCC-ACCTTT-AATCCTCATGGCCAGGCTTGGTTTTATCAGGCGG  139
       | ||||| || ||| |||||||||||||| |  ||| |||||||| |||
seq2  GTAGCTCCGACGTTTAAATCCTCATGGCCAAGACTGGATTTATCAGTCGG  150

seq1  TGACCTT-GTACTTTGAAGGACTGGATCCACTCTTAGTTTAAAGGTCTGA  188
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||
seq2  TGACCTTGGTACTTTGAAGGACTGGATCCACTGGTAG-CTAAACGTCTGA  199

seq1  TGTCAGTACAGTGAAATGCTTAAGATTCC-CCAATGAGGGGATTCTACGG  237
      ||||||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||| |
seq2  TGTCAGTACTGTGAAATGCTTAACATCCCTCCAACGAGGGGATTGTACAG  249

seq1  ATCCATTTTGCAGTGAGTCCCACAAACTCCATAGTCAGGGCAGCATGACT  287
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATTTTGCAGTGAGTCCCACAAACTCCATAGTCAGGGCAGCATGACT  299

seq1  CAGCATGGATTTCTGCCCCCTCTGACTGGTTGCAACTCTGTGCTTCCTTG  337
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATGGATTTCTGCCCCCTCTGAGTGGTTGCAACTCTGTGCTTCCTTG  349

seq1  CTCTCCCCACCTCACACCAGTTGGTAGAGCAACCCTATTTCCTTATGCCT  387
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTCTCCCCACCTCACACCAGTTGGTAGAGCAACCCTATTTCCTTATGCAT  399

seq1  AGGATCTACCTGGGGGGGGATGCCTTCCCAGCAAGTTGTCCTCATGGGCA  437
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTACCTGGGGGGGGATGCCTTCCCAGCAAGTTGTCCTCATGGGCA  449

seq1  ATCCTGTGGTGTGTGTTTGCAATAATTGTCCTTGACTATCCCCCTCAACA  487
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGTGGTGTGTGTTTGCAATAATTGTCCTTGACTATCCCCCTCAACA  499

seq1  CATGTACTTTTAAGTGTGCAAATGTGTGCAAGAACCTGAACTCTATCATC  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTACTTTTAAGTGTGCAAATGTGTGCAAGAACCTGAACTCTATCATC  549

seq1  TCCCTATTTCACAAAATCAGAAAGGGCAGCTGTTCCATTCTATATTGCTT  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTATTTCACAAAATCAGAAAGGGCAGCTGTTCCATTCTATATTGCTT  599

seq1  TCCTTAGGGAAAAACCCCCTGGTGTGTCAGCCTTAGGGATGAACAAATAA  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAGGGAAAAACCCCCTGGTGTGTCAGCCTTAGGGATGAACAAATAA  649

seq1  CTCTTCATCTCTATTGATAAGGGTGCTTTTTTAAGGATCTTATGTAGTAC  687
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTCTTCATCTCTATTGATAAGGGTGCTTTTTTAAGGATCTTACGTAGTAC  699

seq1  TCTTTGTCTGTGAACACTCAAGGAGATGGGACAGTAGGAGACCAAGTTAA  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTCTGTGAACACTCAAGGAGATGGGACAGTAGGAGACCAAGTTAA  749

seq1  GGTTCCCTGAGATCTATTGCCACATTTGCTTTGAGTTGATTGAGCTCCTG  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCCCTGAGATCTATTGCCACATTTGCTTTGAGTTGATTGAGCTCCTG  799

seq1  TTATCTTATAATTGAGCAGGCATTTACTTCTCAAATCATTAGAAAGGAAT  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTTATAATTGAGCAGGCATTTACTTCTCAAATCATTAGAAAGGAAT  849

seq1  ACCTTTCTCTGTTGAAAGCATATGTAAACTTATGACCTGATTGATACAAA  887
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACCTTTCTTTGTTGAAAGCATATGTAAACTTATGACTTGATTGATACAAA  899

seq1  TATGGATGTAATTTCTGGTGTGGGATCATTATGCTAGTAAATATATTTTG  937
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGATGTAATTTCTGGTGTGGGATCATTATGCTAGTAAATATATTTTG  949

seq1  ATACAAATGAAGAATTGGAGCTGTGTGACATGATCCACAGATAAAACGTT  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAATGAAGAATTGGAGCTGTGTGACATGATCCACAGATAAAACGTT  999

seq1  CAAACATAGGCAGAGGGTTTTACACACTGAAGCAGTTGTGCAAAGGTCAG  1037
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
seq2  CAAACATAGGCAGAGGGTTTTACACACTGAAGCAG-AGTGCAAAGGTCAG  1048

seq1  TGGAATTC  1045
      ||||||||
seq2  TGGAATTC  1056

seq1: chr14_28986472_28987586
seq2: B6Ng01-264D16.g_65_1166

seq1  GAATTCTTTTTTCTAGTGTTTTCCCTGTAGTTGGTATACATGGTTAAATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTTTCTAGTGTTTTCCCTGTAGTTGGTATACATGGTTAAATA  50

seq1  AAACCTATGACTAAATCATTGTAAATAGTTGTAGAGAAGTGCCGTTCTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTATGACTAAATCATTGTAAATAGTTGTAGAGAAGTGCCGTTCTCT  100

seq1  GTGGAAAAGTTCATGGAAGAAAAGTTGGATTATAAAGTCTGGAAGGATGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAAAGTTCATGGAAGAAAAGTTGGATTATAAAGTCTGGAAGGATGG  150

seq1  GGCTGGAGAGATGGCTCAGCTGTTAAGAGCACTGACTGGTCTTTCAGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGAGAGATGGCTCAGCTGTTAAGAGCACTGACTGGTCTTTCAGAGG  200

seq1  TCCTGGGTTCAATTCCCAGCAAACACATTATGGCTCACAACCATCTGTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGGTTCAATTCCCAGCAAACACATTATGGCTCACAACCATCTGTAA  250

seq1  TGGAGTCTGATGCCCTCCTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTATCGTGTACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTCTGATGCCCTCCTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTATCGTGTACT  300

seq1  CATATAACAAACAAACAAACCTTTAAAAACAAAAGTGAAGCCTGGACTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATAACAAACAAACAAACCTTTAAAAACAAAAGTGAAGCCTGGACTTT  350

seq1  GGGATGCAGAGCAGAAGCATCTCCCAGAAGCAGCACCTGCTGCCTTCTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGCAGAGCAGAAGCATCTCCCAGAAGCAGCACCTGCTGCCTTCTTG  400

seq1  CCATGCGTGTCCCAGTTCACTGCCCGCCTCCATCACTGCTTTACAAATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCGTGTCCCAGTTCACTGCCCGCCTCCATCACTGCTTTACAAATAA  450

seq1  ATTCATTATTTATTTTTTTTCCCTCAGCAATTGAAGCTGGGCTTCTTCCT  500
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATTATTTATTTTTTTTCCCTCAGCAATTGAAGCTGGGCTTCTTCCT  500

seq1  AACACCAGAACTTTTCCAAGAATGTGCCTGAAGCCCAGACAGTCTCTGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCAGAACTTTTCCAAGAATGTGCCTGAAGCCCAGACAGTCTCTGAA  550

seq1  TTTCAAACAAAGTCTGGTGGGGTCTGGATTCTGAGCCCGGGCTTCTGTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAACAAAGTCTGGTGGGGTCTGGATTCTGAGCCCGGGCTTCTGTCT  600

seq1  GGCTGTCCGTTGTGTTGATGTGATCCAGTCTTGCTCATGTCTGTCATCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTCCGTTGTGTTGATGTGATCCAGTCTTGCTCATGTCTGTCATCAG  650

seq1  ATACACATTATAGGGGAGGACAGCCTAGAAGCTGAGATGATGGCAGCTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACATTATAGGGGAGGACAGCCTAGAAGCTGAGATGATGGCAGCTAG  700

seq1  CCACCGAAGACACAGAAGAGGAAACCTCAGGCTTCAGTCATCCTCCTAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCGAAGACACAGAAGAGGAAACCTCAGGCTTCAGTCATCCTCCTAGC  750

seq1  CTCTCTTCGCTCCTCCCCTCTGCTCTGTTCTCCCTCCTTTTCTTTCCTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTCGCTCCTCCCCTCTGCTCTGTTCTCCCTCCTTTTCTTTCCTCA  800

seq1  TATCTGCTTCTTAAAAAGACCCTGCTAAA-GGAAGGTGTGGAGAAAGTTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGCTTCTTAAAAAGACCCTGCTAAAGGGAAGGTGTGGAGAAAGTTC  850

seq1  TAGAACTAAGATGACAAAGAGGCCTTGTTCTGAGTACCACCTGGAACCAG  899
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACTAAGATGAC-AAGAGGCCTTGTTCTGAGTACCACCTGGAACCAG  899

seq1  TGGTT-GGTGAACATATAGAACACAAAGTTCTGTAGGAAAGAGCTCTGTA  948
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGGGTGAACATATAGAACACAAAGTTCTGTAGGAAAGAGCTCTGTA  949

seq1  GTTGACAGTTGACAAAATCTACACTCACCTGGAAAATGGGCCTTAGCATA  998
      |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| 
seq2  GTTGACAGTTGAC--AATCTACACTCACCTGG-AAATGGCCCTTAGCAT-  995

seq1  AATGTGGGAAATTATCTTGATTACCTTCATCAGCATCCTGCCCACTGTGA  1048
      |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AATGTGGGAAATTATC-TGA-TACCTTCATCAGCATCCTG-CCACTGTGA  1042

seq1  GTGACACCAATCTTTGAGCAGGGCATCCTTACTCTCTGTTCTGGATTATA  1098
      |||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GTGACAC--ATC-TTGAGCA-GCCATCCTTACTCTCTGTTCTGGA-TATA  1087

seq1  GGTGTGCCTCAAGCTCT  1115
      |||||| ||| ||||||
seq2  GGTGTG-CTC-AGCTCT  1102