BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264G11
Chromosome14 (Build37)
Map Location 68,815,439 - 68,966,840
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEbf2, EG628416, LOC100043046, LOC100043056, Cdca2, Kctd9, Gnrh1, Dock5, Nefl, Nefm, LOC100043072
Downstream geneAdam7, Adamdec1, Adam28, LOC641033, LOC100043082, Stc1, EG545808, Nkx2-6, Nkx3-1, Slc25a37, D930020E02Rik, Entpd4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264G11.bB6Ng01-264G11.g
ACCGA068318GA068319
length1,0831,085
definitionB6Ng01-264G11.b B6Ng01-264G11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,815,439 - 68,816,527)(68,965,753 - 68,966,840)
sequence
gaattcctgatgctctcttgtagttcaaaaccaatctcactctttgttat
gttgttacagcaacaacaacaacccccaaccccccccccccccccaaaaa
aaaaccagggctgcggagatgactcagtgagtgggtaagagagcttgtgg
ctcaagtctgagggcctgagttccgaggcgcagcactcagcccttgtggc
tgtgcgcttctataacacccctccccctacgctggggccacggaaggcac
tggagactcgagcttgccagttagccagcctccctgaaagaatgatgagc
tcgggttcagtgaggtaaccggtctccagaggctgagggaagtgctacct
cctccatgtgtgagcatgcacgcgcgcgcaaacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacacacaccccgccccctgct
ctagatgatgaatctaaagagaatttgcacttatcccccattagcagaac
agccctatctcaggtcccaggagggatgtttctttgtcttctctttagtg
tcccactttccctctaacttaggtccttcatgctttcaggaggcagagag
gattctcatgtaggacaaaggagagaaacagcttagcatcaacatttagg
gatgtggtgtcagtcgtaggtaatttggtccacagtgagatgacaggaca
aagggctcttcctgcagggttaggagtatcccttagtggtgaagcacttg
gctagtaagcccaaggccccttgttcaagctccagggatggcagcagcac
cccccccccacacacacactcacacacacacatagagaaacataataaaa
ttatcacgtggatatctcttaggattcagaaattcataggtcagtttatg
attttaaagttatgcaaagtgtaaacatttgcatatttttactttcaggc
cgggaattctgtacagtaatccttactggtacctctactttgtttaagga
tggtaggttgtcgagtcccctactgctcccactgcagttccaacccactt
tatacactttacatcgtaggtcactcaaatatt
gaattctcagtactgacttaccagagctgcaggttcacacttaagagcac
acggaatctcttaaagatagatggtccatatatacctgagaattattaaa
gtagtactacattctgtcacttccatggtatattctactcagggaatttt
tttttaattcatggaataaatcccagtgtggtgtccatgacaccgaggct
ggtcttttcaatttgatctatcatggagagttaaatgtagttcaaccaac
catgcctcaccatagtttacacaccttgtttggcatatgcacaagcatgt
gtgtagtatgaggtgtgtcaaagagcgaacagcatcagaagttggagaga
gaaaacacagactagaaacatccttgaatactcacactcatgctatagta
ttgtgtaatctgagactgccatcccaatatgccttgaaagcagatatgaa
tgctgttttcaggttgaaacacaaaatcccagaaatgggaagtggaactc
tcatgaacagaagaactgaagacattttgaaatttacagtcagtgcctac
tttatcttagcctgccagtagccattatggcttcgataaggatatttctc
ccattcatttttcttaagttgaaaacattaattgtacgttttcagttttg
ctgctcactcacctcagtctcttgttgatggagacctgagtcacatgtaa
atatagtaccatcgcagaatggcaaccatcccttgtgtcttcaatctgtt
atgtcctgcctccacatttcaaggatattgcagcaaatcttaaaagcaga
agttcctctccagctgtcttttatccaaccttgacaggcttctaagagat
caataacctatagagcctctcttaatgcatgcatcagctatgctgacaat
aatgaagtgcttggccattgcttttatgttcatacataactgcatatata
cagcaggaatttttgatgggaaactgacatcccaagaagtctacacagag
tgtgacatcacgtgatttgagcacctcctctcacacgtgagccaggtctc
tacatatgagcccaaatttctcaattttatgtttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_68815439_68816527
seq2: B6Ng01-264G11.b_46_1128

seq1  GAATTCCTGATGCTCTCTTGTAGTTCAAAACCAATCTCACTCTTTGTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGATGCTCTCTTGTAGTTCAAAACCAATCTCACTCTTTGTTAT  50

seq1  GTTGTTACAGCAACAACAACAACCCCCAACCCCCCCCCCCCCCCCAAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTACAGCAACAACAACAACCCCCAACCCCCCCCCCCCCCCCAAAAA  100

seq1  AAAACCAGGGCTGCGGAGATGACTCAGTGAGTGGGTAAGAGAGCTTGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCAGGGCTGCGGAGATGACTCAGTGAGTGGGTAAGAGAGCTTGTGG  150

seq1  CTCAAGTCTGAGGGCCTGAGTTCCGAGGCGCAGCACTCAGCCCTTGTGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGTCTGAGGGCCTGAGTTCCGAGGCGCAGCACTCAGCCCTTGTGGC  200

seq1  TGTGCGCTTCTATAACACCCCTCCCCCTACGCTGGGGCCACGGAAGGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCGCTTCTATAACACCCCTCCCCCTACGCTGGGGCCACGGAAGGCAC  250

seq1  TGGAGACTCGAGCTTGCCAGTTAGCCAGCCTCCCTGAAAGAATGATGAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGACTCGAGCTTGCCAGTTAGCCAGCCTCCCTGAAAGAATGATGAGC  300

seq1  TCGGGTTCAGTGAGGTAACCGGTCTCCAGAGGCTGAGGGAAGTGCTACCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGGTTCAGTGAGGTAACCGGTCTCCAGAGGCTGAGGGAAGTGCTACCT  350

seq1  CCTCCATGTGTGAGCATGCACGCGCGCGCAAACACACACACACACACACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCATGTGTGAGCATGCACGCGCGCGCAAACACACACACACACACACA  400

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCGCCCCCTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACACACACACACCCCGCCCCCTGCT  450

seq1  CTAGATGATGAATCTAAAGAGAATTTGCACTTATCCCCCATTAGCAGAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATGATGAATCTAAAGAGAATTTGCACTTATCCCCCATTAGCAGAAC  500

seq1  AGCCCTATCTCAGGTCCCAGGAGGGATGTTTCTTTGTCTTCTCTTTAGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTATCTCAGGTCCCAGGAGGGATGTTTCTTTGTCTTCTCTTTAGTG  550

seq1  TCCCACTTTCCCTCTAACTTAGGTCCTTCATGCTTTCAGGAGGCAGAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACTTTCCCTCTAACTTAGGTCCTTCATGCTTTCAGGAGGCAGAGAG  600

seq1  GATTCTCATGTAGGACAAAGGAGAGAAACAGCTTAGCATCAACATTTAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTCATGTAGGACAAAGGAGAGAAACAGCTTAGCATCAACATTTAGG  650

seq1  GATGTGGTGTCAGTCGTAGGTAATTTGGTCCACAGTGAGATGACAGGACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGGTGTCAGTCGTAGGTAATTTGGTCCACAGTGAGATGACAGGACA  700

seq1  AAGGGCTCTTCCTGCAGGGTTAGGAGTATCCCTTAGTGGTGAAGCACTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCTCTTCCTGCAGGGTTAGGAGTATCCCTTAGTGGTGAAGCACTTG  750

seq1  GCTAGTAAGCCCAAGGCCCCTTGTTCAAGCTCCAGGGATGGCAGCAGCA-  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GCTAGTAAGCCCAAGGCCCCTTGTTCAAGCTCCAGGGATGGCAGCAGCAC  800

seq1  CCCCCCCCCACACACACACTCACACACACACATAGAGAAACATAATAAAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCCACACACACACTCACACACACACATAGAGAAACATAATAAAA  850

seq1  TTATCACGTGGATATCTCTTTAGGATTCAGAAATTCATAGGTCAGTTTAT  899
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCACGTGGATATCTC-TTAGGATTCAGAAATTCATAGGTCAGTTTAT  899

seq1  GATTTTAAAGTTATGCAAAGGTGTAAACATTTGCATA-TTTTACTTTCAA  948
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
seq2  GATTTTAAAGTTATGCAAA-GTGTAAACATTTGCATATTTTTACTTTC-A  947

seq1  GGCCGGGAATTCTGTACAGTAATCCTTACTGGTACCTCTACTTTGGTTTA  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGCCGGGAATTCTGTACAGTAATCCTTACTGGTACCTCTACTTT-GTTTA  996

seq1  AGGGATGGTAGG-TGTCGAAGTCCCCTACTGCT-CCACTGCAGTTCAAAC  1046
      | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  A-GGATGGTAGGTTGTCG-AGTCCCCTACTGCTCCCACTGCAGTTCCAAC  1044

seq1  CCACCTTTATACACTTTAACATCGTTAGTCAACTCAAAATATT  1089
      ||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||
seq2  CCA-CTTTATACACTTT-ACATCGTAGGTC-ACTC-AAATATT  1083

seq1: chr14_68965753_68966840
seq2: B6Ng01-264G11.g_61_1145 (reverse)

seq1  CAAACATAAAATTTGAGAAATTTGGGCTCATATGTAGAGACCTGGGCTCA  50
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CAAACATAAAA-TTGAGAAATTTGGGCTCATATGTAGAGACCT-GGCTCA  48

seq1  CGTGTGAGAGGA-GTGCTCAAATCACGTGATGTCACCAACTCTGTGTAGA  99
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
seq2  CGTGTGAGAGGAGGTGCTCAAATCACGTGATGTCAC--ACTCTGTGTAGA  96

seq1  CTTCTTGGGATGTCAGTTTCCCATCAAAAATCCCTGCTGTATATATGCAG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTGGGATGTCAGTTTCCCATCAAAAATTCCTGCTGTATATATGCAG  146

seq1  TTATGTATGAACATAAAAGCAATGGCCAAGCACTTCATTATTGTCAGCAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTATGAACATAAAAGCAATGGCCAAGCACTTCATTATTGTCAGCAT  196

seq1  AGCTGATGCATGCATTAAGAGAGGCTCTATAGGTTATTGATCTCTTAGAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGATGCATGCATTAAGAGAGGCTCTATAGGTTATTGATCTCTTAGAA  246

seq1  GCCTGTCAAGGTTGGATAAAAGACAGCTGGAGAGGAACTTCTGCTTTTAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTCAAGGTTGGATAAAAGACAGCTGGAGAGGAACTTCTGCTTTTAA  296

seq1  GATTTGCTGCAATATCCTTGAAATGTGGAGGCAGGACATAACAGATTGAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGCTGCAATATCCTTGAAATGTGGAGGCAGGACATAACAGATTGAA  346

seq1  GACACAAGGGATGGTTGCCATTCTGCGATGGTACTATATTTACATGTGAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACAAGGGATGGTTGCCATTCTGCGATGGTACTATATTTACATGTGAC  396

seq1  TCAGGTCTCCATCAACAAGAGACTGAGGTGAGTGAGCAGCAAAACTGAAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGTCTCCATCAACAAGAGACTGAGGTGAGTGAGCAGCAAAACTGAAA  446

seq1  ACGTACAATTAATGTTTTCAACTTAAGAAAAATGAATGGGAGAAATATCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTACAATTAATGTTTTCAACTTAAGAAAAATGAATGGGAGAAATATCC  496

seq1  TTATCGAAGCCATAATGGCTACTGGCAGGCTAAGATAAAGTAGGCACTGA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCGAAGCCATAATGGCTACTGGCAGGCTAAGATAAAGTAGGCACTGA  546

seq1  CTGTAAATTTCAAAATGTCTTCAGTTCTTCTGTTCATGAGAGTTCCACTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAAATTTCAAAATGTCTTCAGTTCTTCTGTTCATGAGAGTTCCACTT  596

seq1  CCCATTTCTGGGATTTTGTGTTTCAACCTGAAAACAGCATTCATATCTGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTTCTGGGATTTTGTGTTTCAACCTGAAAACAGCATTCATATCTGC  646

seq1  TTTCAAGGCATATTGGGATGGCAGTCTCAGATTACACAATACTATAGCAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAGGCATATTGGGATGGCAGTCTCAGATTACACAATACTATAGCAT  696

seq1  GAGTGTGAGTATTCAAGGATGTTTCTAGTCTGTGTTTTCTCTCTCCAACT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTGAGTATTCAAGGATGTTTCTAGTCTGTGTTTTCTCTCTCCAACT  746

seq1  TCTGATGCTGTTCGCTCTTTGACACACCTCATACTACACACATGCTTGTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATGCTGTTCGCTCTTTGACACACCTCATACTACACACATGCTTGTG  796

seq1  CATATGCCAAACAAGGTGTGTAAACTATGGTGAGGCATGGTTGGTTGAAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGCCAAACAAGGTGTGTAAACTATGGTGAGGCATGGTTGGTTGAAC  846

seq1  TACATTTAACTCTCCATGATAGATCAAATTGAAAAGACCAGCCTCGGTGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTTAACTCTCCATGATAGATCAAATTGAAAAGACCAGCCTCGGTGT  896

seq1  CATGGACACCACACTGGGATTTATTCCATGAATTAAAAAAAAATTCCCTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGACACCACACTGGGATTTATTCCATGAATTAAAAAAAAATTCCCTG  946

seq1  AGTAGAATATACCATGGAAGTGACAGAATGTAGTACTACTTTAATAATTC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGAATATACCATGGAAGTGACAGAATGTAGTACTACTTTAATAATTC  996

seq1  TCAGGTATATATGGACCATCTATCTTTAAGAGATTCCGTGTGCTCTTAAG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGTATATATGGACCATCTATCTTTAAGAGATTCCGTGTGCTCTTAAG  1046

seq1  TGTGAACCTGCAGCTCTGGTAAGTCAGTACTGAGAATTC  1088
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAACCTGCAGCTCTGGTAAGTCAGTACTGAGAATTC  1085