BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264K01
Chromosome14 (Build37)
Map Location 99,470,723 - 99,510,766
singlet/doubletdoublet
Overlap gene6720463M24Rik, Dis3, D14Ertd581e
Upstream geneDach1, LOC635593, LOC619716, LOC100043787, 2410129H14Rik
Downstream geneLOC100043395, LOC100043397, Klf5, LOC100043400, LOC100043789, LOC668671, LOC668672, EG546623, Klf12
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264K01.bB6Ng01-264K01.g
ACCGA068480GA068481
length7711,139
definitionB6Ng01-264K01.b B6Ng01-264K01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,509,997 - 99,510,766)(99,470,723 - 99,471,886)
sequence
gaattctcaaataaaacgtatttgcatagtaatattaagtattatcttgt
tcaatttaattctcattctctcattctctatacaatttatgacgacactg
ggacttttaaagcaaatagatgttgtatctaattgtgtattttatttgtt
tttagtggaggtcttgcttcattgctgaagctgcctccttgaatgtttgg
gttcaagagatcctcctgcctcagtctgttcagtagctgggacaagcacg
gttagaataccagcacacccagccttgtttgtgcttaatctgtttcctta
acgtttaatttccaatactacaagtgttaatggatatgcccataaaaaca
aacgctctgtaggctagaagggattgctgacttgagactcaaaccaaaga
ttaagcctaagtacaagtttgtttgagaaaactagattctgaactaatgt
ataccaagattctcccccattggtaccccttgctaaccataaacatccca
ctctcacccactagccctaattaattccagacaatcctaatctggctcat
cctcagagcccccccccccttttttttttttaaagtttttcgagtcaggt
ttctctgtgtagccctggctgtcctggaactcactttgtagaccaggctg
gcctcgaactcagaaatatgcctgcctctgctgggattaaaggcgtgtgc
cacctcacctggttggatcttcttttttttcttcaaagtttccctttact
gaatgttatacaccactataa
gaattcttccttgaagtggaaaagcagtcctaaattattttgagaacatg
ccctgtaacttttttttttttttttaagatttatttatttattatatgta
agtacactgtagctgtcttcagacgcaccagaagagggcatcagatctca
ttacgggtggttgtgagccaccatgtggttgctgggatttgaacttcgga
cctttggaagagcagtcgggtgctcttacccactgagccatctcaccagc
ccatgccctgtaacttttataagcattcttttaatgtggacacagtggca
catgccttcaatcccagcactctggagtctaaggcaaaatttacagccaa
acaggattagtgttaaacaaatatgctatagctggtctgctcttaatctt
gaacttttactgtgtctaatttgtaagctaaatcttatcacagtatgtgt
aggtaagaaaaacataatagacatagtttttgtttggtaatatctgtagt
ttcaggcagcctggagtgtctttgaagggaccctccatggtaagtgggaa
aaatgtactaacttaaaagcgtacaaatctcttctcctttggggcaaggc
cgtatgttttaaaatataacaattttttataatgtaccactatgaagaat
tcgatgagtattattcaggcttcctttatttttatatgacttttgaatac
tccaaacagtatttagaaacggtacaagcaagccattagagacaagctgg
ggtggtagaccagctggatggggaaactgatggcagcgtttattgtcgcg
ttggacaaactcctgaagagcacaaaggaagagcacttggtaacttgtct
gctgacgctggagagttcacagttccttgcgggaaatgtttcgtaaagta
ttaaagtgaacagccctttatgattacatatgaagtattcacaatgatca
ctatattatattgtcagatatagcgattatactatatgctcacttagcct
tacgtttctaacgatttcaatgtaaacagaaaatgaatgtgagtttgcaa
tcggtatgatagtgtttggttccatttcttccgatgaatagtgactatac
ccagactggtagtaaatcactatattgtggacagaaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_99509997_99510766
seq2: B6Ng01-264K01.b_43_813 (reverse)

seq1  TTATAGTGGTGTATAACATTCTGTAAAGGGAAACTCTGAAGAAAAAAAAA  50
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| 
seq2  TTATAGTGGTGTATAACATTCAGTAAAGGGAAACTTTGAAGAAAAAAAAG  50

seq1  AAGATCC-ACCAGGTGTGGTGGCACACGCCTTTAATCCCAGCAGAGGCAG  99
      ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCCAACCAGGTGAGGTGGCACACGCCTTTAATCCCAGCAGAGGCAG  100

seq1  GCATATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGA  150

seq1  CAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCTGACTCGAAAAACTTTAAAAAAAAAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCTGACTCGAAAAACTTTAAAAAAAAAA  200

seq1  AAGGGGGGGGGGGCTCTGAGGATGAGCCAGATTAGGATTGTCTGGAATTA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGGGGGGGGCTCTGAGGATGAGCCAGATTAGGATTGTCTGGAATTA  250

seq1  ATTAGGGCTAGTGGGTGAGAGTGGGATGTTTATGGTTAGCAAGGGGTACC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGGCTAGTGGGTGAGAGTGGGATGTTTATGGTTAGCAAGGGGTACC  300

seq1  AATGGGGGAGAATCTTGGTATACATTAGTTCAGAATCTAGTTTTCTCAAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGGGAGAATCTTGGTATACATTAGTTCAGAATCTAGTTTTCTCAAA  350

seq1  CAAACTTGTACTTAGGCTTAATCTTTGGTTTGAGTCTCAAGTCAGCAATC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTTGTACTTAGGCTTAATCTTTGGTTTGAGTCTCAAGTCAGCAATC  400

seq1  CCTTCTAGCCTACAGAGCGTTTGTTTTTATGGGCATATCCATTAACACTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTAGCCTACAGAGCGTTTGTTTTTATGGGCATATCCATTAACACTT  450

seq1  GTAGTATTGGAAATTAAACGTTAAGGAAACAGATTAAGCACAAACAAGGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTATTGGAAATTAAACGTTAAGGAAACAGATTAAGCACAAACAAGGC  500

seq1  TGGGTGTGCTGGTATTCTAACCGTGCTTGTCCCAGCTACTGAACAGACTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGTGCTGGTATTCTAACCGTGCTTGTCCCAGCTACTGAACAGACTG  550

seq1  AGGCAGGAGGATCTCTTGAACCCAAACATTCAAGGAGGCAGCTTCAGCAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGGAGGATCTCTTGAACCCAAACATTCAAGGAGGCAGCTTCAGCAA  600

seq1  TGAAGCAAGACCTCCACTAAAAACAAATAAAATACACAATTAGATACAAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCAAGACCTCCACTAAAAACAAATAAAATACACAATTAGATACAAC  650

seq1  ATCTATTTGCTTTAAAAGTCCCAGTGTCGTCATAAATTGTATAGAGAATG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATTTGCTTTAAAAGTCCCAGTGTCGTCATAAATTGTATAGAGAATG  700

seq1  AGAGAATGAGAATTAAATTGAACAAGATAATACTTAATATTACTATGCAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAATGAGAATTAAATTGAACAAGATAATACTTAATATTACTATGCAA  750

seq1  ATACGTTTTATTTGAGAATTC  770
      |||||||||||||||||||||
seq2  ATACGTTTTATTTGAGAATTC  771

seq1: chr14_99470723_99471886
seq2: B6Ng01-264K01.g_69_1207

seq1  GAATTCTTCCTTGAAGTGGAAAAGCAGTCCTAAATTATTTTGAGAACATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCTTGAAGTGGAAAAGCAGTCCTAAATTATTTTGAGAACATG  50

seq1  CCCTGTAACTTTTTTTTTTTTTTTTAAGATTTATTTATTTATTATATGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTAACTTTTTTTTTTTTTTTTAAGATTTATTTATTTATTATATGTA  100

seq1  AGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACGCACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACGCACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCA  150

seq1  TTACGGGTGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTTCGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGGGTGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTTCGGA  200

seq1  CCTTTGGAAGAGCAGTCGGGTGCTCTTACCCACTGAGCCATCTCACCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGGAAGAGCAGTCGGGTGCTCTTACCCACTGAGCCATCTCACCAGC  250

seq1  CCATGCCCTGTAACTTTTATAAGCATTCTTTTAATGTGGACACAGTGGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCCCTGTAACTTTTATAAGCATTCTTTTAATGTGGACACAGTGGCA  300

seq1  CATGCCTTCAATCCCAGCACTCTGGAGTCTAAGGCAAAATTTACAGCCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCTTCAATCCCAGCACTCTGGAGTCTAAGGCAAAATTTACAGCCAA  350

seq1  ACAGGATTAGTGTTAAACAAATATGCTATAGCTGGTCTGCTCTTAATCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGATTAGTGTTAAACAAATATGCTATAGCTGGTCTGCTCTTAATCTT  400

seq1  GAACTTTTACTGTGTCTAATTTGTAAGCTAAATCTTATCACAGTATGTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTTTACTGTGTCTAATTTGTAAGCTAAATCTTATCACAGTATGTGT  450

seq1  AGGTAAGAAAAACATAATAGACATAGTTTTTGTTTGGTAATATCTGTAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAGAAAAACATAATAGACATAGTTTTTGTTTGGTAATATCTGTAGT  500

seq1  TTCAGGCAGCCTGGAGTGTCTTTGAAGGGACCCTCCATGGTAAGTGGGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGCAGCCTGGAGTGTCTTTGAAGGGACCCTCCATGGTAAGTGGGAA  550

seq1  AAATGTACTAACTTAAAAGCGTACAAATCTCTTCTCCTTTGGGGCAAGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTACTAACTTAAAAGCGTACAAATCTCTTCTCCTTTGGGGCAAGGC  600

seq1  CGTATGTTTTAAAATATAACAATTTTTTATAATGTACCACTATGAAGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTATGTTTTAAAATATAACAATTTTTTATAATGTACCACTATGAAGAAT  650

seq1  TCGATGAGTATTATTCAGGCTTCCTTTATTTTTATATGACTTTTGAATAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGATGAGTATTATTCAGGCTTCCTTTATTTTTATATGACTTTTGAATAC  700

seq1  TCCAAACAGTATTTAGAAACGGTACAAGCAAGCCATTAGAGACAAGCTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAACAGTATTTAGAAACGGTACAAGCAAGCCATTAGAGACAAGCTGG  750

seq1  GGTGGTAGACCAGCTGGATGGGGAAACTGATGGCAGCGTTTATTGTCGCG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTAGACCAGCTGGATGGGGAAACTGATGGCAGCGTTTATTGTCGCG  800

seq1  TTGGACAAACTCCTGAAGAGCACAAAGGAAGAGCACTTGGTAACTTGTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACAAACTCCTGAAGAGCACAAAGGAAGAGCACTTGGTAACTTGTCT  850

seq1  GCTGACGCTGGAGAGTTCACAGTTCCTTGCGGGAAATGTTTCGTAAAGTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACGCTGGAGAGTTCACAGTTCCTTGCGGGAAATGTTTCGTAAAGTA  900

seq1  TTAAAGTGAACAG-CCTTTATGATTACAATATTAAAGTTATTCACAATGA  949
      ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||
seq2  TTAAAGTGAACAGCCCTTTATGATTAC-ATATGAA--GTATTCACAATGA  947

seq1  TCACTATTAATTATATTGTTCAGATATAGCGAATTATACTATATGCTCAC  999
      |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCACTAT--ATTATATTG-TCAGATATAGCG-ATTATACTATATGCTCAC  993

seq1  TTAGCCTTTACGTTTCTTAAACGATTTC-ATGTAAACCAGAAAAATGAAT  1048
      |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||
seq2  TTAGCC-TTACGTTTCT--AACGATTTCAATGTAAA-CAG-AAAATGAAT  1038

seq1  GTGAGTTTGCAATC-GTATGATTAGGTGTTTTGTTTTTCATTTCCTTCCA  1097
      |||||||||||||| |||||||   |||||| |  || ||||| ||||| 
seq2  GTGAGTTTGCAATCGGTATGAT--AGTGTTTGG--TTCCATTT-CTTCC-  1082

seq1  GATGAATAGTGACTATAACACACAGACTTGTGTAAGTAATATCACTGATA  1147
      ||||||||||||||||   || |||||| ||   ||||| |||||| |||
seq2  GATGAATAGTGACTAT---ACCCAGACTGGT---AGTAA-ATCACT-ATA  1124

seq1  TTGTTGGGACAGAAAGA  1164
      ||||  |||||||||||
seq2  TTGT--GGACAGAAAGA  1139