BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-271H04
Chromosome14 (Build37)
Map Location 73,719,718 - 73,874,245
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRb1, Itm2b, LOC100043152
Upstream geneLOC668482, LOC675957, Fndc3a, LOC100043721, LOC100043723, LOC668487, LOC668489, Cysltr2, LOC100043149, Rcbtb2, P2ry5
Downstream geneMed4, Nudt15, Sucla2, LOC100043734, EG629578, LOC629583
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-271H04.bB6Ng01-271H04.g
ACCGA073526GA073527
length1,1731,092
definitionB6Ng01-271H04.b B6Ng01-271H04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,719,718 - 73,720,908)(73,873,156 - 73,874,245)
sequence
gaattctttggacacagctatggcaagctgccttgactgccttaattgct
ggggaaagaccccacccaatcttttcattgaaatgggaagacctagcctg
agagtaggcaacaccattctagggtttttgcctctgaactatataaattt
tcatagagaaaattctatgagtactgggcatgcatgcacttatccctgcc
tgctctttattgtaggtgtgatgtgactagttgttttaagttcttgcctc
tttgacttccctattatgatagactataacctggaattgtgatttaaaat
aaacctttctcttgtaagttgttttttgtcaggatattttatcacaatag
aaatgaaactaatatgaggtgacaaaacattctgagtaacaaaagcaata
ctaagcaagtgtcagaatagttgatttcaaagtatactgtaaaaccatag
taacaaaactgtatgatattggcataaaaatacatggaccaacaaagaga
attcagaattaaacctatacatttatagccacctagttgttgacactggg
ggaaaaaatcctcttcaaataatgctgaggtaattgggcatctacctgct
gtagatgtttaactcaatcaatatcttttgcccaatatcaggccagtgag
atactttaatgggtaaaggcaattgttaagcctgataacctgtattcaat
tctagaacccatacggcagaaaaactgactcctgaaagatgccctctgac
cacgacacatgcagtgcatgagagcatgtatgcacacacattaaacagac
agacagtcagacagagagacagattgtgattaaacataacacagggctga
gtgtggtggggcacaccttcaataccagcatgtattgaaactgataaaga
acctcaaattttaaatattattaaagcaaatcattcactcaaatacaggt
taatgaacccaactaaacacagttctcagaaaagatatacataggagcac
taaaaatttgaaatggggaaatgcacttaaactgcttgagattcattctg
cccagtcagcatgctacatcaaacacaaatgtagctgccaatggtgggaa
aggaaggcttatatacctgtggtagtagggtaagtaggtcactccaatgc
cagtcagtgtgagtacataaaac
gaattctgatggaaactgatttacagctgaaaagtgttgatgcctcttga
gaaaccagaaaagtctagaagttaccagcaagattctgacagcttccaga
gtcagctggggagactgtctcagtccattaatataccaagtttagaaagc
caggccctggaaaggtgcccaggggagatgccccagggagctggcttgag
ttggccaaatgctttcttttgaaaaaaggagactttgttctattgagaaa
tttgggatattaggtcacttgcccaacaaatgcagacttcaagtcaatga
ggagtttctctctctctctctctctctctctctctctctctctctcttaa
tgtatttgtttatatttgtttatttattggcagtactgcagagtaaacca
ggggttctgtgtaaaccaggcaaacactttaccccaagctacatcttttt
aatttcctttttagctttgggactgtctggttaagtcacacagtactctg
cagttcctgcctctgtctcccgagtctctggtattacaggccaacagcag
cacagccctgacatctgaactgtgtgtgtgctgtgcacgtacacacactc
atgtaagtgaatgtagataagagagtgtcatgacacacacactggaggtc
agaagacaacttcctgggtcagtgtgtcttcacctttcaccttgtttgaa
acaggaactctccagcttcgagggagtcctctgtctccacctcccatttt
cctgtgggaacaccaggatttcaactgctcctactacctgtctggacttt
aatatgagtgctggggatttgaacttgggtccccagacttgcatagtgaa
catttctacacattgagccatctcctaaggcccagaaaattttttatttt
gtttgttattgttgttttaaattcacttatattccatttcatttattcca
tttttaattttatgagcatgggtattttgcttactaatggttgtgcactg
tatggtatttgggctttcctggaattgggttgtagaataagctggtgaac
acgcttggggttcttggtcctctaaaaaaagcagttatgaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_73719718_73720908
seq2: B6Ng01-271H04.b_44_1216

seq1  GAATTCTTTGGACACAGCTATGGCAAGCTGCCTTGACTGCCTTAATTGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGGACACAGCTATGGCAAGCTGCCTTGACTGCCTTAATTGCT  50

seq1  GGGGAAAGACCCCACCCAATCTTTTCATTGAAATGGGAAGACCTAGCCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAAGACCCCACCCAATCTTTTCATTGAAATGGGAAGACCTAGCCTG  100

seq1  AGAGTAGGCAACACCATTCTAGGGTTTTTGCCTCTGAACTATATAAATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTAGGCAACACCATTCTAGGGTTTTTGCCTCTGAACTATATAAATTT  150

seq1  TCATAGAGAAAATTCTATGAGTACTGGGCATGCATGCACTTATCCCTGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGAGAAAATTCTATGAGTACTGGGCATGCATGCACTTATCCCTGCC  200

seq1  TGCTCTTTATTGTAGGTGTGATGTGACTAGTTGTTTTAAGTTCTTGCCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTTATTGTAGGTGTGATGTGACTAGTTGTTTTAAGTTCTTGCCTC  250

seq1  TTTGACTTCCCTATTATGATAGACTATAACCTGGAATTGTGATTTAAAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACTTCCCTATTATGATAGACTATAACCTGGAATTGTGATTTAAAAT  300

seq1  AAACCTTTCTCTTGTAAGTTGTTTTTTGTCAGGATATTTTATCACAATAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTTTCTCTTGTAAGTTGTTTTTTGTCAGGATATTTTATCACAATAG  350

seq1  AAATGAAACTAATATGAGGTGACAAAACATTCTGAGTAACAAAAGCAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAAACTAATATGAGGTGACAAAACATTCTGAGTAACAAAAGCAATA  400

seq1  CTAAGCAAGTGTCAGAATAGTTGATTTCAAAGTATACTGTAAAACCATAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGCAAGTGTCAGAATAGTTGATTTCAAAGTATACTGTAAAACCATAG  450

seq1  TAACAAAACTGTATGATATTGGCATAAAAATACATGGACCAACAAAGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAAAACTGTATGATATTGGCATAAAAATACATGGACCAACAAAGAGA  500

seq1  ATTCAGAATTAAACCTATACATTTATAGCCACCTAGTTGTTGACACTGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGAATTAAACCTATACATTTATAGCCACCTAGTTGTTGACACTGGG  550

seq1  GGAAAAAATCCTCTTCAAATAATGCTGAGGTAATTGGGCATCTACCTGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAAATCCTCTTCAAATAATGCTGAGGTAATTGGGCATCTACCTGCT  600

seq1  GTAGATGTTTAACTCAATCAATATCTTTTGCCCAATATCAGGCCAGTGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATGTTTAACTCAATCAATATCTTTTGCCCAATATCAGGCCAGTGAG  650

seq1  ATACTTTAATGGGTAAAGGCAATTGTTAAGCCTGATAACCTGTATTCAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTTAATGGGTAAAGGCAATTGTTAAGCCTGATAACCTGTATTCAAT  700

seq1  TCTAGAACCCATACGGCAGAAAAACTGACTCCTGAAAGATGCCCTCTGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAACCCATACGGCAGAAAAACTGACTCCTGAAAGATGCCCTCTGAC  750

seq1  CACGACACATGCAGTGCATGAGAGCATGTATGCACACACATTAAACAGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGACACATGCAGTGCATGAGAGCATGTATGCACACACATTAAACAGAC  800

seq1  AGACAGTCAGACAGAGAGACAGATTGTGATTAAACATAACACAGGGCTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGTCAGACAGAGAGACAGATTGTGATTAAACATAACACAGGGCTGA  850

seq1  GTGTGGTGGGGCACACCTTCAATACCAGCATGTATTGAAACTGATAAAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGTGGGGCACACCTTCAATACCAGCATGTATTGAAACTGATAAAGA  900

seq1  ACCTCAAATTTTAAATATTATTAAAGCAAATCATTCACTCAAAATACAGG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACCTCAAATTTTAAATATTATTAAAGCAAATCATTCACTC-AAATACAGG  949

seq1  TTAATGAA-CCAACTAAACACAGTTCTCAGAAAAAGATATACATAGGAGC  999
      |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TTAATGAACCCAACTAAACACAGTTCTCAG-AAAAGATATACATAGGAGC  998

seq1  ACTAAAAATTTGAAATGGGGAAATGCAACTTAAAACTGCTTTGAGATTCC  1049
      |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |
seq2  ACTAAAAATTTGAAATGGGGAAATGC-ACTT-AAACTGC-TTGAGATT-C  1044

seq1  ATTCTGCCCAAGTCAGCATGGCTAACATCAAAACAACAAATGTTAGCTGG  1099
      ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||   ||||||| |||||| 
seq2  ATTCTGCCC-AGTCAGCAT-GCT-ACATCAAA--CACAAATG-TAGCTGC  1088

seq1  CAAAAATGTGGGAAAAGAGAGCCTTATATACTGTTGGTAGTAAGGTAGAG  1149
      |  ||  |||||||| || || |||||||||   |||||||| |||| ||
seq2  C--AATGGTGGGAAAGGA-AGGCTTATATACCTGTGGTAGTAGGGTA-AG  1134

seq1  TAGGGCAAACACCATGCAAGTCAGTGTGAGGTTACATAAAAC  1191
      |||| ||  | | |||| ||||||||||||  ||||||||||
seq2  TAGGTCACTC-CAATGCCAGTCAGTGTGAG--TACATAAAAC  1173

seq1: chr14_73873156_73874245
seq2: B6Ng01-271H04.g_64_1155 (reverse)

seq1  GTTCCTAACAGCTTTTCTTTTAGAGGGCCCAAGAACCCACAGCGTG-TCA  49
      |||| |||| |||||  ||||||| || ||||||||||  |||||| |||
seq2  GTTCATAACTGCTTT--TTTTAGA-GGACCAAGAACCCCAAGCGTGTTCA  47

seq1  CACAGCT--ATCTACAACACCAATTCCAGGAAA-CCCAAATA-CATACAG  95
      | |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||
seq2  C-CAGCTTATTCTACAAC-CCAATTCCAGGAAAGCCCAAATACCATACAG  95

seq1  TGCACAAACATATGTAAGCAAAATACCCATGCTCATAAAATTAAAAAT-G  144
      ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGCACAACCATTAGTAAGCAAAATACCCATGCTCATAAAATTAAAAATGG  145

seq1  AATAAATGAAATGGAATATAAGTGAATTTAAAACAACAATAACAAACAAA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATGAAATGGAATATAAGTGAATTTAAAACAACAATAACAAACAAA  195

seq1  ATAAAAAA-TTTCTGGGCCTTAGGAGATGGCTCAATGTGTAGAAATGTTC  243
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAAATTTTCTGGGCCTTAGGAGATGGCTCAATGTGTAGAAATGTTC  245

seq1  ACTATGCAAGTCTGGGGACCCAAGTTCAAATCCCCAGCACTCATATTAAA  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGCAAGTCTGGGGACCCAAGTTCAAATCCCCAGCACTCATATTAAA  295

seq1  GTCCAGACAGGTAGTAGGAGCAGTTGAAATCCTGGTGTTCCCACAGGAAA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGACAGGTAGTAGGAGCAGTTGAAATCCTGGTGTTCCCACAGGAAA  345

seq1  ATGGGAGGTGGAGACAGAGGACTCCCTCGAAGCTGGAGAGTTCCTGTTTC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGAGGTGGAGACAGAGGACTCCCTCGAAGCTGGAGAGTTCCTGTTTC  395

seq1  AAACAAGGTGAAAGGTGAAGACACACTGACCCAGGAAGTTGTCTTCTGAC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGGTGAAAGGTGAAGACACACTGACCCAGGAAGTTGTCTTCTGAC  445

seq1  CTCCAGTGTGTGTGTCATGACACTCTCTTATCTACATTCACTTACATGAG  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGTGTGTGTGTCATGACACTCTCTTATCTACATTCACTTACATGAG  495

seq1  TGTGTGTACGTGCACAGCACACACACAGTTCAGATGTCAGGGCTGTGCTG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTACGTGCACAGCACACACACAGTTCAGATGTCAGGGCTGTGCTG  545

seq1  CTGTTGGCCTGTAATACCAGAGACTCGGGAGACAGAGGCAGGAACTGCAG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGGCCTGTAATACCAGAGACTCGGGAGACAGAGGCAGGAACTGCAG  595

seq1  AGTACTGTGTGACTTAACCAGACAGTCCCAAAGCTAAAAAGGAAATTAAA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTGTGTGACTTAACCAGACAGTCCCAAAGCTAAAAAGGAAATTAAA  645

seq1  AAGATGTAGCTTGGGGTAAAGTGTTTGCCTGGTTTACACAGAACCCCTGG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGTAGCTTGGGGTAAAGTGTTTGCCTGGTTTACACAGAACCCCTGG  695

seq1  TTTACTCTGCAGTACTGCCAATAAATAAACAAATATAAACAAATACATTA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTCTGCAGTACTGCCAATAAATAAACAAATATAAACAAATACATTA  745

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACTCCTCA  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACTCCTCA  795

seq1  TTGACTTGAAGTCTGCATTTGTTGGGCAAGTGACCTAATATCCCAAATTT  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTTGAAGTCTGCATTTGTTGGGCAAGTGACCTAATATCCCAAATTT  845

seq1  CTCAATAGAACAAAGTCTCCTTTTTTCAAAAGAAAGCATTTGGCCAACTC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATAGAACAAAGTCTCCTTTTTTCAAAAGAAAGCATTTGGCCAACTC  895

seq1  AAGCCAGCTCCCTGGGGCATCTCCCCTGGGCACCTTTCCAGGGCCTGGCT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAGCTCCCTGGGGCATCTCCCCTGGGCACCTTTCCAGGGCCTGGCT  945

seq1  TTCTAAACTTGGTATATTAATGGACTGAGACAGTCTCCCCAGCTGACTCT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAACTTGGTATATTAATGGACTGAGACAGTCTCCCCAGCTGACTCT  995

seq1  GGAAGCTGTCAGAATCTTGCTGGTAACTTCTAGACTTTTCTGGTTTCTCA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCTGTCAGAATCTTGCTGGTAACTTCTAGACTTTTCTGGTTTCTCA  1045

seq1  AGAGGCATCAACACTTTTCAGCTGTAAATCAGTTTCCATCAGAATTC  1090
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCATCAACACTTTTCAGCTGTAAATCAGTTTCCATCAGAATTC  1092