BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-271K10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,308,249 - 22,425,184
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyst4
Upstream geneZmynd17, Ppp3cb, Usp54, Myoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g, Plau, EG620119, Vcl, Ap3m1, Adk
Downstream geneEG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, 1700112E06Rik, EG665075, EG435392
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-271K10.bB6Ng01-271K10.g
ACCGA073676GA073677
length1,0691,088
definitionB6Ng01-271K10.b B6Ng01-271K10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,424,126 - 22,425,184)(22,308,249 - 22,309,339)
sequence
gaattctttattaaacaatgtccctggtctcttcaaaagatatacatgga
gactaaatataacccatgatccttggttggattagtggttttaaaaagag
attgatttatttatgtgtatgagggtttgtctgcatgtatgtatgtgtaa
cgtgtgtgtttggtgttttaaggctggaagagggtgctgggtgccctgca
actacagctacaggaagccgtgaggcagcacattactgctgagtaccaga
cctgagccctcagcaagtactcttaactgtgaggcatttatctagcaccc
taattcttgagtcacaataaaggatttttctgggataattaggtaacgtg
cactaaatacagagtaatacataagccagatgtcaacttaagtgaacata
ttatgatcatgttgagccatggccaacaagcaccgttttagagatatgag
caaatacttaaaaagtgtcatggtatgtccgtaactctcaaatgactctg
aaaacaccactacacctaaatccagtaaggtgtctggctatgcagcaaag
tgcccggctggccatcaacatgaaaggcacacacacacattccacatcac
tctgtccatttcctgccatttccaacattttcaagtctagaatcatcaac
atcttcacgtatgggggtggggagtattccactctcaaaagaagtccatt
gcaaagtattaaccacatgggttataagcatcagagaatagagtactata
aacaatccagtcactgatttcacaggaagtgttgaggacagacaaccgta
ctcatttaaagagagagaaagatagtaccaaaatcacagttggataaatg
atccacttttcttcaaaattaaattaacagggggcagaggaagcagtgag
caagaactgggaacttagaagactgaaagaaaaaccaggcactgtaatgg
tgtaagctccattagtcagactgtcctttatcttcttgtatatacctcaa
gttggcactaacctaactatccttcctgtctttgacctcccaagtgctaa
atatggaccacccctttga
gaattctttcagtaaggctctcattcacattctgccaagacatccgccac
ctattcttgagttcacacaaaaaaattaaaagcaaaacaagagtcctgct
aatttagcaacttgggagatgcagctgctgctccctgggcaccagaaagg
ctggcctcagccttcaggcctcagcctgagggaggtctcccaggagttat
attgtatcctgcagctcaaggcctcattgtgacagctgagtgacttagct
ggcactgtgggctggagaatgataaaggtacaaagaacaggcagcttggt
agttggggatggcactggatggtgggggcgggtacatggctggttttgcc
taggcctcctatgagcccctacttaggcagctgctgctgcccaaggcaca
gcagttctggccgttcactccaccctctttgtaaaacaatcctcgcatca
attaagtgtaaggcttttgtcgtccaaagaaagtggtaattcccatatcc
tttcagttggttgtgtgcctgtctgcctgtctgtccatgtctccagacct
atccatacctgacctatgactgttgtcttggtgactaccagtaacacctt
cttttttatgcattgtgtttcaggactccttccttctatccctagtatca
gttcaccctccctgggctctgatatctgatttcctggtgccagtttcctc
tcccactgatggcctatagtgtagtaagatcatgggctcctcagatctgc
atctgtcaataatctgctgctctcaaaagtgcagtcctaagctgggcgtg
gttgtacatgcctttaatcccagcactcgggaggcagaggcaggcagatt
tctgagttcaaggccagcctggtctacgaagtgagttccaggacagccag
ggctacacatagaaaccctgtctcaaaaaaccaaaaaaagaaaaaaaaaa
gtgcagttcctgaactccttgaatacctagagaaaggccactcttctgga
ggaatggcttcagccagccaaggttctgtagtcagcctccgagggtcaag
cagaggtatgctaaaagcctgcctaggatactgacctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22424126_22425184
seq2: B6Ng01-271K10.b_44_1112 (reverse)

seq1  TCAAA-GGGTGGTACATATTTAGCACTCTGGAGGTC-AAGGCAGG-AGGA  47
      ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||
seq2  TCAAAGGGGTGGTCCATATTTAGCACTTGGGAGGTCAAAGACAGGAAGGA  50

seq1  TAGTTAGTTTGGTGCCAACCTGAGCTATATACA--GAGTTTAAGGACAGT  95
      ||||||| || |||||||| |||| ||||||||   || | |||||||||
seq2  TAGTTAGGTTAGTGCCAACTTGAGGTATATACAAGAAGATAAAGGACAGT  100

seq1  CTGACATATGGAGCTTACA-CATTACAGTTGCCTGGTTTTTCTTTCAGTC  144
      |||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTAATGGAGCTTACACCATTACAG-TGCCTGGTTTTTCTTTCAGTC  149

seq1  TTCTAAGTTCCAAG-TCTTGCTCACCTGCTTCCTCTGCCCCCTGTTAATT  193
      ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGTTCCCAGTTCTTGCTCA-CTGCTTCCTCTGCCCCCTGTTAATT  198

seq1  TAATTTTGAAG-AAAGTGGATCATTTATCC-ACTGTGATTTTGGTACTAT  241
      ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTGAAGAAAAGTGGATCATTTATCCAACTGTGATTTTGGTACTAT  248

seq1  C-TTCTCTCTCTTTAAATGAGTACGGTTGTCTGTCCTCAACACTTCCTGT  290
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCTCTCTTTAAATGAGTACGGTTGTCTGTCCTCAACACTTCCTGT  298

seq1  G-AATCAGTGACTGGATTG-TTATAGTACTCTATTCTCTGATGCTTATAA  338
      | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCAGTGACTGGATTGTTTATAGTACTCTATTCTCTGATGCTTATAA  348

seq1  CCCATGTGGTTAATACTTTGCAATGGACTTCTTTTGAGAGTGGAATACTC  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGTGGTTAATACTTTGCAATGGACTTCTTTTGAGAGTGGAATACTC  398

seq1  CCCACCCCCATACGTGAAGATGTTGATGATTCTAGACTTGAAAATGTTGG  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCCCCATACGTGAAGATGTTGATGATTCTAGACTTGAAAATGTTGG  448

seq1  AAATGGCAGGAAATGGACAGAGTGATGTGGAATGTGTGTGTGTGCCTTTC  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGCAGGAAATGGACAGAGTGATGTGGAATGTGTGTGTGTGCCTTTC  498

seq1  ATGTTGATGGCCAGCCGGGCACTTTGCTGCATAGCCAGACACCTTACTGG  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGATGGCCAGCCGGGCACTTTGCTGCATAGCCAGACACCTTACTGG  548

seq1  ATTTAGGTGTAGTGGTGTTTTCAGAGTCATTTGAGAGTTACGGACATACC  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGGTGTAGTGGTGTTTTCAGAGTCATTTGAGAGTTACGGACATACC  598

seq1  ATGACACTTTTTAAGTATTTGCTCATATCTCTAAAACGGTGCTTGTTGGC  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACACTTTTTAAGTATTTGCTCATATCTCTAAAACGGTGCTTGTTGGC  648

seq1  CATGGCTCAACATGATCATAATATGTTCACTTAAGTTGACATCTGGCTTA  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCTCAACATGATCATAATATGTTCACTTAAGTTGACATCTGGCTTA  698

seq1  TGTATTACTCTGTATTTAGTGCACGTTACCTAATTATCCCAGAAAAATCC  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTACTCTGTATTTAGTGCACGTTACCTAATTATCCCAGAAAAATCC  748

seq1  TTTATTGTGACTCAAGAATTAGGGTGCTAGATAAATGCCTCACAGTTAAG  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTGTGACTCAAGAATTAGGGTGCTAGATAAATGCCTCACAGTTAAG  798

seq1  AGTACTTGCTGAGGGCTCAGGTCTGGTACTCAGCAGTAATGTGCTGCCTC  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTTGCTGAGGGCTCAGGTCTGGTACTCAGCAGTAATGTGCTGCCTC  848

seq1  ACGGCTTCCTGTAGCTGTAGTTGCAGGGCACCCAGCACCCTCTTCCAGCC  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGCTTCCTGTAGCTGTAGTTGCAGGGCACCCAGCACCCTCTTCCAGCC  898

seq1  TTAAAACACCAAACACACACGTTACACATACATACATGCAGACAAACCCT  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACACCAAACACACACGTTACACATACATACATGCAGACAAACCCT  948

seq1  CATACACATAAATAAATCAATCTCTTTTTAAAACCACTAATCCAACCAAG  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACACATAAATAAATCAATCTCTTTTTAAAACCACTAATCCAACCAAG  998

seq1  GATCATGGGTTATATTTAGTCTCCATGTATATCTTTTGAAGAGACCAGGG  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATGGGTTATATTTAGTCTCCATGTATATCTTTTGAAGAGACCAGGG  1048

seq1  ACATTGTTTAATAAAGAATTC  1059
      |||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGTTTAATAAAGAATTC  1069

seq1: chr14_22308249_22309339
seq2: B6Ng01-271K10.g_66_1153

seq1  GAATTCTTTCAGTAAGGCTCTCATTCACATTCTGCCAAGACATCCGCCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCAGTAAGGCTCTCATTCACATTCTGCCAAGACATCCGCCAC  50

seq1  CTATTCTTGAGTTCACACAAAAAAATTAAAAGCAAAACAAGAGTCCTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCTTGAGTTCACACAAAAAAATTAAAAGCAAAACAAGAGTCCTGCT  100

seq1  AATTTAGCAACTTGGGAGATGCAGCTGCTGCTCCCTGGGCACCAGAAAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAGCAACTTGGGAGATGCAGCTGCTGCTCCCTGGGCACCAGAAAGG  150

seq1  CTGGCCTCAGCCTTCAGGCCTCAGCCTGAGGGAGGTCTCCCAGGAGTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCTCAGCCTTCAGGCCTCAGCCTGAGGGAGGTCTCCCAGGAGTTAT  200

seq1  ATTGTATCCTGCAGCTCAAGGCCTCATTGTGACAGCTGAGTGACTTAGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTATCCTGCAGCTCAAGGCCTCATTGTGACAGCTGAGTGACTTAGCT  250

seq1  GGCACTGTGGGCTGGAGAATGATAAAGGTACAAAGAACAGGCAGCTTGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACTGTGGGCTGGAGAATGATAAAGGTACAAAGAACAGGCAGCTTGGT  300

seq1  AGTTGGGGATGGCACTGGATGGTGGGGGCGGGTACATGGCTGGTTTTGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGGGATGGCACTGGATGGTGGGGGCGGGTACATGGCTGGTTTTGCC  350

seq1  TAGGCCTCCTATGAGCCCCTACTTAGGCAGCTGCTGCTGCCCAAGGCACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCCTCCTATGAGCCCCTACTTAGGCAGCTGCTGCTGCCCAAGGCACA  400

seq1  GCAGTTCTGGCCGTTCACTCCACCCTCTTTGTAAAACAATCCTCGCATCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTCTGGCCGTTCACTCCACCCTCTTTGTAAAACAATCCTCGCATCA  450

seq1  ATTAAGTGTAAGGCTTTTGTCGTCCAAAGAAAGTGGTAATTCCCATATCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGTGTAAGGCTTTTGTCGTCCAAAGAAAGTGGTAATTCCCATATCC  500

seq1  TTTCAGTTGGTTGTGTGCCTGTCTGCCTGTCTGTCCATGTCTCCAGACCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGTTGGTTGTGTGCCTGTCTGCCTGTCTGTCCATGTCTCCAGACCT  550

seq1  ATCCATACCTGACCTATGACTGTTGTCTTGGTGACTACCAGTAACACCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATACCTGACCTATGACTGTTGTCTTGGTGACTACCAGTAACACCTT  600

seq1  CTTTTTTATGCATTGTGTTTCAGGACTCCTTCCTTCTATCCCTAGTATCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTATGCATTGTGTTTCAGGACTCCTTCCTTCTATCCCTAGTATCA  650

seq1  GTTCACCCTCCCTGGGCTCTGATATCTGATTTCCTGGTGCCAGTTTCCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCACCCTCCCTGGGCTCTGATATCTGATTTCCTGGTGCCAGTTTCCTC  700

seq1  TCCCACTGATGGCCTATAGTGTAGTAAGATCATGGGCTCCTCAGATCTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACTGATGGCCTATAGTGTAGTAAGATCATGGGCTCCTCAGATCTGC  750

seq1  ATCTGTCAATAATCTGCTGCTCTCAAAAGTGCAGTCCTAAGCTGGGCGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTCAATAATCTGCTGCTCTCAAAAGTGCAGTCCTAAGCTGGGCGTG  800

seq1  GTTGTACATGCCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTACATGCCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATT  850

seq1  TCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACGAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACGAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAG  900

seq1  GGCTACACATAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAAAAAAAGAAAAAAAAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACACATAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAAAAAAAGAAAAAAAAAA  950

seq1  GTGCAG-TCCTGAACTCC-TGAATACCTAGAG-AAGGCCACTCTTCTGGA  997
      |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GTGCAGTTCCTGAACTCCTTGAATACCTAGAGAAAGGCCACTCTTCTGGA  1000

seq1  GGAATGGCTTCAGCCAGCC-AGGTTCTGTAGTTCAGCCTCCCGGAGGGGC  1046
      ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |
seq2  GGAATGGCTTCAGCCAGCCAAGGTTCTGTAG-TCAGCCTCC--GAGGGTC  1047

seq1  AAGCAGAATGTAATGGTAAAAAGCCTGGCTAGGAATACTGACCTC  1091
      |||||||  |  ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||
seq2  AAGCAGA--GGTATGCT-AAAAGCCTGCCTAGG-ATACTGACCTC  1088