BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-278N10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 48,632,922 - 48,812,908
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMap1lc3-ps2, Peli2
Upstream geneSamd4, Gch1, Wdhd1, Socs4, LOC670795, C130032J12Rik, Lgals3, Dlg7, LOC666895, Fbxo34, D14Ertd436e, EG625730, LOC100042787, Ktn1, 4930447J18Rik
Downstream geneEG624367, LOC100041831, 6720456H20Rik, 4930572G02Rik, Otx2, LOC100041864, LOC666972, Exoc5, 4932432K03Rik, LOC218997, Nat12
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-278N10.bB6Ng01-278N10.g
ACCGA078976GA078977
length1,103939
definitionB6Ng01-278N10.b B6Ng01-278N10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(48,811,805 - 48,812,908)(48,632,922 - 48,633,858)
sequence
gaattcagtgtgagcagaatggtgaggctaatttaaactgcaaggaaact
ctcactttacacaccatggcccacttgggaaggaatgcgccaaggtttgc
atcaatctagaacagtggttctcaaccttctgaatgctatgaccctttaa
tatcgttcctcctgttgtggggacctccagccataaagttgctttgatgc
tattccataactataattctgctactcttgtgaattataaatacttgaca
tgcaggataattgagatgtgaatttcaaaagagtcgtgacccacaggttg
agaactgctgatctagagtaacatacatgctccctttccttgaatgggga
acacggatggtatgcaaacccgtgtcctgatggagttgtctgcttttcct
tgatcagtctgagtaacaattcccagcagatttgttttgatgaagtattg
ggaaacaatctggacacaagcaagttctccagggcatcactcgttctaac
caggccaccttccttcctggtacaggtaccagtgcaggaagtgtgagctc
cagtgtccacctttgtaaaccacagcaagattgtgaatggacgatattcc
ttctgctggggacactgctggctgctgtttggcaggttatctgagtcctc
ttctgcattggaacgcttcctgactggtgcacaagaccctctgactctcc
aaccacaccttcaacacccatatggtacttagagcaaactcttatcccaa
ctacatttaacttgactgttaaatcccaactattttctaaccccagagct
agcacgcagcaagtacttaaaatgggtctctgtcagatgctccctgcaag
gtcaccacgccctcctggagtgacactgtacttggtaacaacattcacct
tcaatgctacctatccagggagctcactaaatgcttttactttcctcaat
aatcattttaattttctattgagtcactgtcctcccagctttcattctgc
ctttctttgaagtgagaaaagaaattctagctacgctgacaagttctggc
tgcttctagccactcctgtcttctggtgggattgccagtcgagtctctac
ttc
gaattccttgcacaaacagaagtctaagaatgaaagctaagagacagtga
aggctgtagacttgacagttctttaaccaagtggtcctaaggacaagacc
atctacaggcatgaggaacttttcaacacagtgatctttcccctcctcct
aagcattctctggtacaagagacatagcccatcttttcatgagcaagctg
gatgtcttaactttgattacctatgaggctacatgcctgctgagagccat
gaatgtctcagattgactgggcctcacatttacagactacctgggtgtgt
gtgcccttggactgtctgcttggagaaatgacctggctccctccaaatgc
ttgggcaggaggacaacctggctgtgacatctgtcagtctaatgatggcc
aagacagtctggcaacactaccttgtttcccaacccccaaatgcccccac
ccaaagactatctagcattctcatgtgaatagtggccatggaaagcacaa
acgattttctttgtaaaactaagctacttggtatgagaaggaaataagca
aataatagacaagagagagaaatacaatgtgcaagagtgttctgtagtat
tgtatcaaaccagactagtacaataactaaaaaagatcaaaaccctcttc
ctacctgtgtggagatgtcattattcaaatgacaaacatctctatctttt
aaattctaatatctatcttgccaaagcataaagaaaacacacacttaaga
atgcatgttactttctaagagctagagggacagattcctgccagcaggag
ttctgggtggatgaatcctagaggtgtggcccaagcagctgagaggctca
ccagctagaatcctgcagtacactgattcacatttgaactgccagcaggc
cctaccagcctcttcccttcccttcccttcccttacctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_48811805_48812908
seq2: B6Ng01-278N10.b_46_1148 (reverse)

seq1  GAAGTAGAGACTAGACTGGGCAATCCCA-CAGAAGACAGGAGTGGCTAGA  49
      |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAGAGACTCGACT-GGCAATCCCACCAGAAGACAGGAGTGGCTAGA  49

seq1  AGCCAGCCAGAACTGGCCAGCGTAGCCTAGAATT--CTTTCCCACTTGCA  97
      || ||||||||||| | |||||||| ||||||||   |||| |||||   
seq2  AG-CAGCCAGAACTTGTCAGCGTAG-CTAGAATTTCTTTTCTCACTT--C  95

seq1  AAAGAAAGGCAGAA-GAAAGCTGGGA-GACAGTGACTCAATAGAAAATTA  145
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAAGGCAGAATGAAAGCTGGGAGGACAGTGACTCAATAGAAAATTA  145

seq1  AAATGAATATTGAAGAAAGTAAAAGCATTTAGTGAGCTCCCTGGGATAGG  195
      |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AAATGATTATTGAGGAAAGTAAAAGCATTTAGTGAGCTCCCT-GGATAGG  194

seq1  TAGCATTGAAGGTGAATGTTGTTACCAAGTACAGTGTCACTCCAGGAGGG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATTGAAGGTGAATGTTGTTACCAAGTACAGTGTCACTCCAGGAGGG  244

seq1  CGTGGTGACCTTGCAGGGAGCCTCTGACAGAGACCCATTTTAAGTACTTG  295
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGTGACCTTGCAGGGAGCATCTGACAGAGACCCATTTTAAGTACTTG  294

seq1  CTGCGTGCTAGCTCTGGGGTTAGAAAATAGTTGGGATTTAACAGTCAAGT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCGTGCTAGCTCTGGGGTTAGAAAATAGTTGGGATTTAACAGTCAAGT  344

seq1  TAAATGTAGTTGGGATAAGAGTTTGCTCTAAGTACCATATGGGTGTTGAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGTAGTTGGGATAAGAGTTTGCTCTAAGTACCATATGGGTGTTGAA  394

seq1  GGTGTGGTTGGAGAGTCAGAGGGTCTTGTGCACCAGTCAGGAAGCGTTCC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGGTTGGAGAGTCAGAGGGTCTTGTGCACCAGTCAGGAAGCGTTCC  444

seq1  AATGCAGAAGAGGACTCAGATAACCTGCCAAACAGCAGCCAGCAGTGTCC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCAGAAGAGGACTCAGATAACCTGCCAAACAGCAGCCAGCAGTGTCC  494

seq1  CCAGCAGAAGGAATATCGTCCATTCACAATCTTGCTGTGGTTTACAAAGG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAGAAGGAATATCGTCCATTCACAATCTTGCTGTGGTTTACAAAGG  544

seq1  TGGACACTGGAGCTCACACTTCCTGCACTGGTACCTGTACCAGGAAGGAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACACTGGAGCTCACACTTCCTGCACTGGTACCTGTACCAGGAAGGAA  594

seq1  GGTGGCCTGGTTAGAACGAGTGATGCCCTGGAGAACTTGCTTGTGTCCAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCCTGGTTAGAACGAGTGATGCCCTGGAGAACTTGCTTGTGTCCAG  644

seq1  ATTGTTTCCCAATACTTCATCAAAACAAATCTGCTGGGAATTGTTACTCA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTTCCCAATACTTCATCAAAACAAATCTGCTGGGAATTGTTACTCA  694

seq1  GACTGATCAAGGAAAAGCAGACAACTCCATCAGGACACGGGTTTGCATAC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGATCAAGGAAAAGCAGACAACTCCATCAGGACACGGGTTTGCATAC  744

seq1  CATCCGTGTTCCCCATTCAAGGAAAGGGAGCATGTATGTTACTCTAGATC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCGTGTTCCCCATTCAAGGAAAGGGAGCATGTATGTTACTCTAGATC  794

seq1  AGCAGTTCTCAACCTGTGGGTCACGACTCTTTTGAAATTCACATCTCAAT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTCTCAACCTGTGGGTCACGACTCTTTTGAAATTCACATCTCAAT  844

seq1  TATCCTGCATGTCAAGTATTTATAATTCACAAGAGTAGCAGAATTATAGT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTGCATGTCAAGTATTTATAATTCACAAGAGTAGCAGAATTATAGT  894

seq1  TATGGAATAGCATCAAAGCAACTTTATGGCTGGAGGTCCCCACAACAGGA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAATAGCATCAAAGCAACTTTATGGCTGGAGGTCCCCACAACAGGA  944

seq1  GGAACGATATTAAAGGGTCATAGCATTCAGAAGGTTGAGAACCACTGTTC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACGATATTAAAGGGTCATAGCATTCAGAAGGTTGAGAACCACTGTTC  994

seq1  TAGATTGATGCAAACCTTGGCGCATTCCTTCCCAAGTGGGCCATGGTGTG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTGATGCAAACCTTGGCGCATTCCTTCCCAAGTGGGCCATGGTGTG  1044

seq1  TAAAGTGAGAGTTTCCTTGCAGTTTAAATTAGCCTCACCATTCTGCTCAC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTGAGAGTTTCCTTGCAGTTTAAATTAGCCTCACCATTCTGCTCAC  1094

seq1  ACTGAATTC  1104
      |||||||||
seq2  ACTGAATTC  1103

seq1: chr14_48632922_48633858
seq2: B6Ng01-278N10.g_65_1003

seq1  GAATTCCTTGCACAAACAGAAGTCTAAGAATGAAAGCTAAGAGACAGTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGCACAAACAGAAGTCTAAGAATGAAAGCTAAGAGACAGTGA  50

seq1  AGGCTGTAGACTTGACAGTTCTTTAACCAAGTGGTCCTAAGGACAAGACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGTAGACTTGACAGTTCTTTAACCAAGTGGTCCTAAGGACAAGACC  100

seq1  ATCTACAGGCATGAGGAACTTTTCAACACAGTGATCTTTCCCCTCCTCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTACAGGCATGAGGAACTTTTCAACACAGTGATCTTTCCCCTCCTCCT  150

seq1  AAGCATTCTCTGGTACAAGAGACATAGCCCATCTTTTCATGAGCAAGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATTCTCTGGTACAAGAGACATAGCCCATCTTTTCATGAGCAAGCTG  200

seq1  GATGTCTTAACTTTGATTACCTATGAGGCTACATGCCTGCTGAGAGCCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCTTAACTTTGATTACCTATGAGGCTACATGCCTGCTGAGAGCCAT  250

seq1  GAATGTCTCAGATTGACTGGGCCTCACATTTACAGACTACCTGGGTGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTCTCAGATTGACTGGGCCTCACATTTACAGACTACCTGGGTGTGT  300

seq1  GTGCCCTTGGACTGTCTGCTTGGAGAAATGACCTGGCTCCCTCCAAATGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCTTGGACTGTCTGCTTGGAGAAATGACCTGGCTCCCTCCAAATGC  350

seq1  TTGGGCAGGAGGACAACCTGGCTGTGACATCTGTCAGTCTAATGATGGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCAGGAGGACAACCTGGCTGTGACATCTGTCAGTCTAATGATGGCC  400

seq1  AAGACAGTCTGGCAACACTACCTTGTTTCCCAACCCCCAAATGCCCCCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAGTCTGGCAACACTACCTTGTTTCCCAACCCCCAAATGCCCCCAC  450

seq1  CCAAAGACTATCTAGCATTCTCATGTGAATAGTGGCCATGGAAAGCACAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGACTATCTAGCATTCTCATGTGAATAGTGGCCATGGAAAGCACAA  500

seq1  ACGATTTTCTTTGTAAAACTAAGCTACTTGGTATGAGAAGGAAATAAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGATTTTCTTTGTAAAACTAAGCTACTTGGTATGAGAAGGAAATAAGCA  550

seq1  AATAATAGACAAGAGAGAGAAATACAATGTGCAAGAGTGTTCTGTAGTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATAGACAAGAGAGAGAAATACAATGTGCAAGAGTGTTCTGTAGTAT  600

seq1  TGTATCAAACCAGACTAGTACAATAACTAAAAAAGATCAAAACCCTCTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCAAACCAGACTAGTACAATAACTAAAAAAGATCAAAACCCTCTTC  650

seq1  CTACCTGTGTGGAGATGTCATTATTCAAATGACAAACATCTCTATCTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTGTGTGGAGATGTCATTATTCAAATGACAAACATCTCTATCTTTT  700

seq1  AAATTCTAATATCTATCTTGCCAAAGCATAAAGAAAACACACACTTAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCTAATATCTATCTTGCCAAAGCATAAAGAAAACACACACTTAAGA  750

seq1  ATGCATGTTACTTTCTAAGAGCTAGAAGGACAGATTCCTGCCAGCAGGAG  800
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATGTTACTTTCTAAGAGCTAGAGGGACAGATTCCTGCCAGCAGGAG  800

seq1  TTCT-GGTGGATGAATCCTAGAGGTGTGGCCC-AGCAGCTGAGAGGCTCA  848
      |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTCTGGGTGGATGAATCCTAGAGGTGTGGCCCAAGCAGCTGAGAGGCTCA  850

seq1  CCAGCTAGAATCCTGCAGTACACTGATTCACATTTGAACTGCCAGCAGGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTAGAATCCTGCAGTACACTGATTCACATTTGAACTGCCAGCAGGC  900

seq1  CCTACCAGCCTCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTT  937
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CCTACCAGCCTCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTACCTT  939