BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-283F07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 10,773,083 - 10,894,179
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFhit
Upstream geneLOC100041948, LOC100042415
Downstream geneLOC100041974
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-283F07.bB6Ng01-283F07.g
ACCGA082321GA082322
length1,1311,116
definitionB6Ng01-283F07.b B6Ng01-283F07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,893,036 - 10,894,179)(10,773,083 - 10,774,201)
sequence
gaattcacattttaatttgccacacataacagtacccatttctctactgc
ctaccaaaagtagatatttccaatttttttagacctggagctctaaggac
caactcttggtttggttcccttctgctaagttggatagtcttttaattcc
ttggtgctctttaactttttaaatttatttttaacatgcctcttcatctt
tttatgcatttctttctctagtgttggtatttagcgtttacactattgtt
tgatactttatgcacgttaactttttcatgaccttttattttattttttt
tttttatgttttgtccaggattcctctctaaccctcactgtcttggaact
cagcatatagaccaggctggcctcaaacccatagagatccacatgcctct
gcttcctaagtgctgtgattaaaggtgtgtgccaccatgccctgctattt
tgcaaatgaaatgttgagaccaacttgcctaggaaattctaatctacatg
tatgtttatatattccttgtacatctttttgcacataaagacagaggctg
agcaggtaggtgggtgtcacgtgcataaatacccaggaataagcatatag
aagtacaagcacacttttaaagttactcgcaacaggactgctagttgaca
ggaaatctttcaatgattaaaatactaaatgttgatatgattgtggggta
acaaagccacctcaggtccttttaaatgtttttgaaggatgtaacccttg
tctcctaggagtcattatgggtgacttccatgtccttgccaaaagttatt
aattttattatcatagcaaatattttttgaatgaaagatattgatggaga
tgaggtctctcttactataaagaggctggacttttccagttgtattttgt
atctcattttttaggttatgatttccctgactctttttaaattttcattt
cttgacaccattcttaagtcaagaatagtgaaacaaaaacacactgagca
aacacacagcaccaaaagccaaacacagggacatgacatacattacacat
gctctatgtagggtctgcatccatattatagtagtacatatcaaaattca
gtaagagaccttacaggtgtttactcgactg

gaattccacattcacaaacgatcatctcaaggaaactatggacattatca
ttaggttttctttggatgagatgatttattttctaaggccactggactta
gcttctcagagtacttgacacccttccacaaacagcactgaatataagac
aggaaggaacaaaaatagtggatgaccattcctggaaacttcagtgacca
aaattcattgtggttacatttatggattaagattaggccaacatgattgc
cagtctgagtatttctgggcatcattttgaatgtcacctatggaagaaca
aacccttactacgattgagaagtaaagcagctttgaccagaaataggtaa
aagtttagtttttggatctaggacacaaagcattcttaatctggtctaag
aggacttgtgtaaagcagaaacacacttgctaggaaagtcaagagataaa
aaacttactcggtgcaaagtgaggggaatatcgtcaaagtccatgtgaca
ttctttacagtaaaaacaagtgactaatgctctgcccatgatccacgggt
acaaagcccaggagaaatcacagggaaaacaagactcaccaacttacttt
gcaagtattagttattccacctgtctaagctaaggttttattgctgtgaa
gagatatgaccacagtacctcttataaaggaaaatacttaattagggctg
ccttacagtttcaggggtttattccattatcatcattgtagtaaatatag
tggcatgcaggagacttggtgctggagatgaagctaagagttctacatct
tgatctgcaggcagtagaaagagactgttttccacactggacagaacaag
tgcatacgaaacttcaaagaccactactacactgaacacttcctctaaca
agaccacagctactccaagaagaccacaactcctaataatgccactacct
ataggtcaagcattcaaacacacaagtctatggggatcatttctattcaa
accactacatacacccacctaaaaaaataatataattgaatttttatgaa
accattacattactctagctgtcaagtgcttgttagaatgctattttcta
aaaagcagttgttgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_10893036_10894179
seq2: B6Ng01-283F07.b_45_1175 (reverse)

seq1  CAGTCTGAGTAAACA-CTGTAAAGTCTCTTTACTG-ATTTTGATATGTAC  48
      ||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||
seq2  CAGTC-GAGTAAACACCTGTAAGGTCTC-TTACTGAATTTTGATATGTAC  48

seq1  TACTATTATTATATGATGCAAGACCCTAACATTAGAAGGCCATGTGTAAT  98
      ||||| || |||  ||||| ||||||| ||||    ||  ||||||||||
seq2  TACTA-TAATAT-GGATGC-AGACCCT-ACAT----AGAGCATGTGTAAT  90

seq1  GTATGTCATGTCCCTGTGTTTGGCTTTTGTTGCTGTTGTTGTTTGCTCAG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||
seq2  GTATGTCATGTCCCTGTGTTTGGCTTTTGGTGCTGT--GTGTTTGCTCAG  138

seq1  TTGTTGTTTTTGTTTCACTATTCTTTGACTTAAGAATGGTGTCAAGAAAT  198
      |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  T--GTGTTTTTGTTTCACTATTC-TTGACTTAAGAATGGTGTCAAGAAAT  185

seq1  GAAAATTTAAAAAGAGTCAGGGAAATCATAACCTAAAAAATGAGATACAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATTTAAAAAGAGTCAGGGAAATCATAACCTAAAAAATGAGATACAA  235

seq1  AATACAACTGGAAAAGTCCAGCCTCTTTATAGTAAGAGAGACCTCATCTC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAACTGGAAAAGTCCAGCCTCTTTATAGTAAGAGAGACCTCATCTC  285

seq1  CATCAATATCTTTCATTCAAAAAATATTTGCTATGATAATAAAATTAATA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAATATCTTTCATTCAAAAAATATTTGCTATGATAATAAAATTAATA  335

seq1  ACTTTTGGCAAGGACATGGAAGTCACCCATAATGACTCCTAGGAGACAAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTGGCAAGGACATGGAAGTCACCCATAATGACTCCTAGGAGACAAG  385

seq1  GGTTACATCCTTCAAAAACATTTAAAAGGACCTGAGGTGGCTTTGTTACC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTACATCCTTCAAAAACATTTAAAAGGACCTGAGGTGGCTTTGTTACC  435

seq1  CCACAATCATATCAACATTTAGTATTTTAATCATTGAAAGATTTCCTGTC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAATCATATCAACATTTAGTATTTTAATCATTGAAAGATTTCCTGTC  485

seq1  AACTAGCAGTCCTGTTGCGAGTAACTTTAAAAGTGTGCTTGTACTTCTAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGCAGTCCTGTTGCGAGTAACTTTAAAAGTGTGCTTGTACTTCTAT  535

seq1  ATGCTTATTCCTGGGTATTTATGCACGTGACACCCACCTACCTGCTCAGC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTATTCCTGGGTATTTATGCACGTGACACCCACCTACCTGCTCAGC  585

seq1  CTCTGTCTTTATGTGCAAAAAGATGTACAAGGAATATATAAACATACATG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTCTTTATGTGCAAAAAGATGTACAAGGAATATATAAACATACATG  635

seq1  TAGATTAGAATTTCCTAGGCAAGTTGGTCTCAACATTTCATTTGCAAAAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTAGAATTTCCTAGGCAAGTTGGTCTCAACATTTCATTTGCAAAAT  685

seq1  AGCAGGGCATGGTGGCACACACCTTTAATCACAGCACTTAGGAAGCAGAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGGCATGGTGGCACACACCTTTAATCACAGCACTTAGGAAGCAGAG  735

seq1  GCATGTGGATCTCTATGGGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTATATGCTGAGTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTGGATCTCTATGGGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTATATGCTGAGTT  785

seq1  CCAAGACAGTGAGGGTTAGAGAGGAATCCTGGACAAAACATAAAAAAAAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGACAGTGAGGGTTAGAGAGGAATCCTGGACAAAACATAAAAAAAAA  835

seq1  AAATAAAATAAAAGGTCATGAAAAAGTTAACGTGCATAAAGTATCAAACA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAATAAAAGGTCATGAAAAAGTTAACGTGCATAAAGTATCAAACA  885

seq1  ATAGTGTAAACGCTAAATACCAACACTAGAGAAAGAAATGCATAAAAAGA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGTAAACGCTAAATACCAACACTAGAGAAAGAAATGCATAAAAAGA  935

seq1  TGAAGAGGCATGTTAAAAATAAATTTAAAAAGTTAAAGAGCACCAAGGAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAGGCATGTTAAAAATAAATTTAAAAAGTTAAAGAGCACCAAGGAA  985

seq1  TTAAAAGACTATCCAACTTAGCAGAAGGGAACCAAACCAAGAGTTGGTCC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAGACTATCCAACTTAGCAGAAGGGAACCAAACCAAGAGTTGGTCC  1035

seq1  TTAGAGCTCCAGGTCTAAAAAAATTGGAAATATCTACTTTTGGTAGGCAG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGCTCCAGGTCTAAAAAAATTGGAAATATCTACTTTTGGTAGGCAG  1085

seq1  TAGAGAAATGGGTACTGTTATGTGTGGCAAATTAAAATGTGAATTC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAAATGGGTACTGTTATGTGTGGCAAATTAAAATGTGAATTC  1131


seq1: chr14_10773083_10774201
seq2: B6Ng01-283F07.g_65_1180

seq1  GAATTCCACATTCACAAACGATCATCTCAAGGAAACTATGGACATTATCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACATTCACAAACGATCATCTCAAGGAAACTATGGACATTATCA  50

seq1  TTAGGTTTTCTTTGGATGAGATGATTTATTTTCTAAGGCCACTGGACTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTTTTCTTTGGATGAGATGATTTATTTTCTAAGGCCACTGGACTTA  100

seq1  GCTTCTCAGAGTACTTGACACCCTTCCACAAACAGCACTGAATATAAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTCAGAGTACTTGACACCCTTCCACAAACAGCACTGAATATAAGAC  150

seq1  AGGAAGGAACAAAAATAGTGGATGACCATTCCTGGAAACTTCAGTGACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGAACAAAAATAGTGGATGACCATTCCTGGAAACTTCAGTGACCA  200

seq1  AAATTCATTGTGGTTACATTTATGGATTAAGATTAGGCCAACATGATTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCATTGTGGTTACATTTATGGATTAAGATTAGGCCAACATGATTGC  250

seq1  CAGTCTGAGTATTTCTGGGCATCATTTTGAATGTCACCTATGGAAGAACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTGAGTATTTCTGGGCATCATTTTGAATGTCACCTATGGAAGAACA  300

seq1  AACCCTTACTACGATTGAGAAGTAAAGCAGCTTTGACCAGAAATAGGTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTACTACGATTGAGAAGTAAAGCAGCTTTGACCAGAAATAGGTAA  350

seq1  AAGTTTAGTTTTTGGATCTAGGACACAAAGCATTCTTAATCTGGTCTAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTAGTTTTTGGATCTAGGACACAAAGCATTCTTAATCTGGTCTAAG  400

seq1  AGGACTTGTGTAAAGCAGAAACACACTTGCTAGGAAAGTCAAGAGATAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTTGTGTAAAGCAGAAACACACTTGCTAGGAAAGTCAAGAGATAAA  450

seq1  AAACTTACTCGGTGCAAAGTGAGGGGAATATCGTCAAAGTCCATGTGACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTACTCGGTGCAAAGTGAGGGGAATATCGTCAAAGTCCATGTGACA  500

seq1  TTCTTTACAGTAAAAACAAGTGACTAATGCTCTGCCCATGATCCACGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTACAGTAAAAACAAGTGACTAATGCTCTGCCCATGATCCACGGGT  550

seq1  ACAAAGCCCAGGAGAAATCACAGGGAAAACAAGACTCACCAACTTACTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGCCCAGGAGAAATCACAGGGAAAACAAGACTCACCAACTTACTTT  600

seq1  GCAAGTATTAGTTATTCCACCTGTCTAAGCTAAGGTTTTATTGCTGTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGTATTAGTTATTCCACCTGTCTAAGCTAAGGTTTTATTGCTGTGAA  650

seq1  GAGATATGACCACAGTACCTCTTATAAAGGAAAATACTTAATTAGGGCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATATGACCACAGTACCTCTTATAAAGGAAAATACTTAATTAGGGCTG  700

seq1  CCTTACAGTTTCAGGGGTTTATTCCATTATCATCATTGTAGTAAATATAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACAGTTTCAGGGGTTTATTCCATTATCATCATTGTAGTAAATATAG  750

seq1  TGGCATGCAGGAGACTTGGTGCTGGAGATGAAGCTAAGAGTTCTACATCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATGCAGGAGACTTGGTGCTGGAGATGAAGCTAAGAGTTCTACATCT  800

seq1  TGATCTGCAGGCAGTAGAAAGAGACTGTTTTCCACACTGGACAGAACAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTGCAGGCAGTAGAAAGAGACTGTTTTCCACACTGGACAGAACAAG  850

seq1  TGCATACGAAACTTCAAAGACCACTACTACACTGAACACTTCCTCTAACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATACGAAACTTCAAAGACCACTACTACACTGAACACTTCCTCTAACA  900

seq1  AGACCACAGCTACTCCAAGAAGACCACAACTCCTAATAATGCCACTACCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCACAGCTACTCCAAGAAGACCACAACTCCTAATAATGCCACTACCT  950

seq1  ATAGGTCAAGCATTCAAACACACAAGTCTATGGGGATCATTTCTATTCAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGTCAAGCATTCAAACACACAAGTCTATGGGGATCATTTCTATTCAA  1000

seq1  ACCACTACATACA-CCACCTAAAAAAATAATATAATTGAA-TTTTATGAA  1048
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACCACTACATACACCCACCTAAAAAAATAATATAATTGAATTTTTATGAA  1050

seq1  ACCATTTACATTTAACTCTTAGTTGTTCAAGTGGTTTGTTTAGAATGGTA  1098
      |||| |||||||  |||| ||| || ||||||| ||   |||||||| ||
seq2  ACCA-TTACATT--ACTC-TAGCTG-TCAAGTGCTT--GTTAGAATGCTA  1093

seq1  -TTTCT-AAAAGCAGTGGTTGAA  1119
       ||||| ||||||||| ||||||
seq2  TTTTCTAAAAAGCAGTTGTTGAA  1116


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |