BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-285E03
Chromosome14 (Build37)
Map Location 26,256,896 - 26,385,824
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZmiz1, I920194n01, LOC100039007
Upstream genePolr3a, Rps24, LOC669315, LOC100039411
Downstream gene4931406H21Rik, Ppif, 2310047A01Rik, Anxa11, Plac9, D14Ertd449e, Cphx, 1110051B16Rik, LOC100039468, LOC100039484, LOC100039175, LOC100039192, LOC100039213, LOC100039227, LOC100039503, LOC100039246, LOC100039257, LOC100039280, LOC100039293, LOC100039527, LOC100039538, 4933413J09Rik, Slmap, LOC100039353, LOC665279
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-285E03.bB6Ng01-285E03.g
ACCGA083752GA083753
length1,1111,105
definitionB6Ng01-285E03.b B6Ng01-285E03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,256,896 - 26,258,001)(26,384,729 - 26,385,824)
sequence
gaattcactttgtataccaggctggcctcaaactcacagaaatctgtctg
cgtctgcctcctaagtaccaccatgcaaggcttgtccttgaatttttaat
gttcctgcctcagtcttccaagctggaattacaggtaggcaccatacctg
gctttagaaatcttaattattcatagactttgtacaactgatacatttta
gcaaagaaaactgaagcccagtgacaataaccagggtaacacaacaagtc
aaccgggacaggaaccctgcttcccagctcagaggagagcaaatctgact
acagccaagacagtgttcctgtttcctgtgtccacaccatagcagggccc
ccaaagaccagctccaaacactagaagtaggttaggaaaggaagaccctg
cccctcacccccaaatgggattggcctgaatatgagaaggtcaggccaga
ggcaccagtggtctacagccatttgatcctgaatatgcccaatctcagct
gatctcacaagatgaacaagttgagcctagttggtgttagaattgcaggt
gaagcacattatccctgggaaatcacccagtcccggtttccatgtgaccc
tgcttggggcttatccaaagcatgagagctgctacccagacacaaacaga
agcaggatcctctgtcctgtagcgtacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacactcaggttgagggcagattgatagagttgg
agtctcttggtaggtcagatcggaggcaagacatgctaggccagctagca
ctctatctagacagcagacatgaggtcctctgagtactacccaagggatg
aagcagttccaagcccccaggagttctgtgtcttacagcaaagccacctg
cctgagaccagccttgtctccattctaacaagacatctgtgtgccaacta
tcaagctaaattgcttaaacatcacttaggggccaagcaaagatgtagaa
gctttctcccatggcccaagcctggctagggtccagccatagctctgggc
tcttcctccaggttggcccttggtaaaaaacacccttgaaattacaggtt
gagggattaga
gaattccacactgcaaggtgcaaggacttgaaagctaagggtctagggcc
tgaggagaggttagcaccaggcaggaaaagggggtggggcatggaaggga
cagcctggcttctgtacacactgttttcactggctgcccagttccgaggc
aaagcctttgagagatgaagtgcaaggctgccagcggggctaagctagaa
acctctgcctttctagccattagcatgctgctctttccatgtccccccaa
gaccggtggccacagtctcctgcgtactcctatctcaagccatggctggg
tcccaaatgaagcccttgttccatcccattggtccaaagccagtggtttg
caaggccacccagaaccccatcacagcaccctgttgtcaggaagcggcaa
gccgttggcggccagcagaggtcgccccactgccacagaagcaccactca
gctgtgtttgcctccaggtgcctttagacaaaaccatcagtggaagcagc
tctagcacccaggcaggacctggctctctaccaaccaagaacctggtacc
aacctggtagccttttccagtctgctgccctctgattaagtgtggactca
atcaggaaacttttctgtggtcctgccatccctgtccttgtgtctttcta
gttagcctgggggggtctacagtgggtgggtacctgctctgctaccctcc
cactgtgtgaacagggcaagaagctgggcctcagtttgtatatctgtaaa
atgaaggcctgggctagccatcctctggcagcctgccaaacgccagaatc
caagggctccagctgcctggaaactccacctcagtaggagcagcacattc
aactttaaaatccaaaggttctgcccaagcggtggagcccgtagccctgg
aaaactcccggaaagcctcttccaccactccaccaaacccctgccagatg
gcccaacgccccaggcactgctctcttgaagctatgcctgaccagagacc
attacatgtatggaagtttttagcttggtgacattggttagtcagggctg
agttcttccgatttccaagggttggactcttgccttgggagaaggttctg
ttgac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_26256896_26258001
seq2: B6Ng01-285E03.b_45_1155

seq1  GAATTCACTTTGTATACCAGGCTGGCCTCAAACTCACAGAAATCTGTCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTTGTATACCAGGCTGGCCTCAAACTCACAGAAATCTGTCTG  50

seq1  CGTCTGCCTCCTAAGTACCACCATGCAAGGCTTGTCCTTGAATTTTTAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCTGCCTCCTAAGTACCACCATGCAAGGCTTGTCCTTGAATTTTTAAT  100

seq1  GTTCCTGCCTCAGTCTTCCAAGCTGGAATTACAGGTAGGCACCATACCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTGCCTCAGTCTTCCAAGCTGGAATTACAGGTAGGCACCATACCTG  150

seq1  GCTTTAGAAATCTTAATTATTCATAGACTTTGTACAACTGATACATTTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTAGAAATCTTAATTATTCATAGACTTTGTACAACTGATACATTTTA  200

seq1  GCAAAGAAAACTGAAGCCCAGTGACAATAACCAGGGTAACACAACAAGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGAAAACTGAAGCCCAGTGACAATAACCAGGGTAACACAACAAGTC  250

seq1  AACCGGGACAGGAACCCTGCTTCCCAGCTCAGAGGAGAGCAAATCTGACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCGGGACAGGAACCCTGCTTCCCAGCTCAGAGGAGAGCAAATCTGACT  300

seq1  ACAGCCAAGACAGTGTTCCTGTTTCCTGTGTCCACACCATAGCAGGGCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCAAGACAGTGTTCCTGTTTCCTGTGTCCACACCATAGCAGGGCCC  350

seq1  CCAAAGACCAGCTCCAAACACTAGAAGTAGGTTAGGAAAGGAAGACCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGACCAGCTCCAAACACTAGAAGTAGGTTAGGAAAGGAAGACCCTG  400

seq1  CCCCTCACCCCCAAATGGGATTGGCCTGAATATGAGAAGGTCAGGCCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTCACCCCCAAATGGGATTGGCCTGAATATGAGAAGGTCAGGCCAGA  450

seq1  GGCACCAGTGGTCTACAGCCATTTGATCCTGAATATGCCCAATCTCAGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCAGTGGTCTACAGCCATTTGATCCTGAATATGCCCAATCTCAGCT  500

seq1  GATCTCACAAGATGAACAAGTTGAGCCTAGTTGGTGTTAGAATTGCAGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCACAAGATGAACAAGTTGAGCCTAGTTGGTGTTAGAATTGCAGGT  550

seq1  GAAGCACATTATCCCTGGGAAATCACCCAGTCCCGGTTTCCATGTGACCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCACATTATCCCTGGGAAATCACCCAGTCCCGGTTTCCATGTGACCC  600

seq1  TGCTTGGGGCTTATCCAAAGCATGAGAGCTGCTACCCAGACACAAACAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGGGGCTTATCCAAAGCATGAGAGCTGCTACCCAGACACAAACAGA  650

seq1  AGCAGGATCCTCTGTCCTGTAGCGTACACACACACACACACACACACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGATCCTCTGTCCTGTAGCGTACACACACACACACACACACACACA  700

seq1  CACACACACACACACACACACTCAGGTTGAGGGCAGATTGATAGAGTTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACTCAGGTTGAGGGCAGATTGATAGAGTTGG  750

seq1  AGTCTCTTGGTAGGTCAGATCGGAGGCAAGACATGCTAGGCCAGCTAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCTTGGTAGGTCAGATCGGAGGCAAGACATGCTAGGCCAGCTAGCA  800

seq1  CTCTATCTAGACAGCAGACATGAGGTCCTCTGAGTACTACCCAAGGGATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATCTAGACAGCAGACATGAGGTCCTCTGAGTACTACCCAAGGGATG  850

seq1  AAGCAGTTCCAAGCCCCCAGGAGTTCTGTGTCTTACAGCAAAGCCACCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGTTCCAAGCCCCCAGGAGTTCTGTGTCTTACAGCAAAGCCACCTG  900

seq1  CCTGAGACCAGCCTTGTCTCCATTCTAACAAGACATCTGTGTGCCAACTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGACCAGCCTTGTCTCCATTCTAACAAGACATCTGTGTGCCAACTA  950

seq1  TCAAGCTAAATTGCTTAAACATCACTTAGGGGCCAAGCAAGGATGTAGAA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCAAGCTAAATTGCTTAAACATCACTTAGGGGCCAAGCAAAGATGTAGAA  1000

seq1  GCTTTCTCCATGGGCCCAAAGCTGGCTAGGGTCCAG-CATAGCTCT-GGC  1048
      |||||||||   |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||
seq2  GCTTTCTCCCATGGCCCAAGCCTGGCTAGGGTCCAGCCATAGCTCTGGGC  1050

seq1  TCTTCTTCCAGGTTGG-CCTTGGAAAAAAACA--CTAGAAATACAAGGTT  1095
      ||||| |||||||||| |||||| ||||||||  || |||||   |||||
seq2  TCTTCCTCCAGGTTGGCCCTTGGTAAAAAACACCCTTGAAATTACAGGTT  1100

seq1  GAGGGAGTAGA  1106
      |||||| ||||
seq2  GAGGGATTAGA  1111

seq1: chr14_26384729_26385824
seq2: B6Ng01-285E03.g_68_1172 (reverse)

seq1  GTCAACAGAAACTTCTCCCA--GCACGA---CCACCCCTGGAAATCGGGA  45
      |||||||||| |||||||||  ||| ||   | |||| |||||||||| |
seq2  GTCAACAGAACCTTCTCCCAAGGCAAGAGTCCAACCCTTGGAAATCGGAA  50

seq1  AGACTCAG-CCTGACTA--CCATGTCACC-AGCTAAAAACTTCCATACAT  91
        |||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCAGCCCTGACTAACCAATGTCACCAAGCTAAAAACTTCCATACAT  100

seq1  GTAATGGTCTCTGGTCAGGCATAGCTTCAAGAGAGGCAGTGCCTGGGGCG  141
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GTAATGGTCTCTGGTCAGGCATAGCTTCAAGAGA-GCAGTGCCTGGGGCG  149

seq1  TTGGGCCATCTGGCAGGGGGTTGGTGGAGTGGTGGAAGAGGCTTTCCGGG  191
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCCATCTGGCAGGGGTTTGGTGGAGTGGTGGAAGAGGCTTTCCGGG  199

seq1  AGTTTTCCA-GGCTACGGGCTCCACCGCTTGGGCAGAACCTTTGGATTTT  240
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTCCAGGGCTACGGGCTCCACCGCTTGGGCAGAACCTTTGGATTTT  249

seq1  AAAGTTGAATGTGCTGCTCCTACTGAGGTGGAGTTTCCAGGCAGCTGGAG  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTGAATGTGCTGCTCCTACTGAGGTGGAGTTTCCAGGCAGCTGGAG  299

seq1  CCCTTGGATTCTGGCGTTTGGCAGGCTGCCAGAGGATGGCTAGCCCAGGC  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGGATTCTGGCGTTTGGCAGGCTGCCAGAGGATGGCTAGCCCAGGC  349

seq1  CTTCATTTTACAGATATACAAACTGAGGCCCAGCTTCTTGCCCTGTTCAC  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATTTTACAGATATACAAACTGAGGCCCAGCTTCTTGCCCTGTTCAC  399

seq1  ACAGTGGGAGGGTAGCAGAGCAGGTACCCACCCACTGTAGACCCCCCCAG  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGGGAGGGTAGCAGAGCAGGTACCCACCCACTGTAGACCCCCCCAG  449

seq1  GCTAACTAGAAAGACACAAGGACAGGGATGGCAGGACCACAGAAAAGTTT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACTAGAAAGACACAAGGACAGGGATGGCAGGACCACAGAAAAGTTT  499

seq1  CCTGATTGAGTCCACACTTAATCAGAGGGCAGCAGACTGGAAAAGGCTAC  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATTGAGTCCACACTTAATCAGAGGGCAGCAGACTGGAAAAGGCTAC  549

seq1  CAGGTTGGTACCAGGTTCTTGGTTGGTAGAGAGCCAGGTCCTGCCTGGGT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTGGTACCAGGTTCTTGGTTGGTAGAGAGCCAGGTCCTGCCTGGGT  599

seq1  GCTAGAGCTGCTTCCACTGATGGTTTTGTCTAAAGGCACCTGGAGGCAAA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAGCTGCTTCCACTGATGGTTTTGTCTAAAGGCACCTGGAGGCAAA  649

seq1  CACAGCTGAGTGGTGCTTCTGTGGCAGTGGGGCGACCTCTGCTGGCCGCC  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCTGAGTGGTGCTTCTGTGGCAGTGGGGCGACCTCTGCTGGCCGCC  699

seq1  AACGGCTTGCCGCTTCCTGACAACAGGGTGCTGTGATGGGGTTCTGGGTG  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGGCTTGCCGCTTCCTGACAACAGGGTGCTGTGATGGGGTTCTGGGTG  749

seq1  GCCTTGCAAACCACTGGCTTTGGACCAATGGGATGGAACAAGGGCTTCAT  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGCAAACCACTGGCTTTGGACCAATGGGATGGAACAAGGGCTTCAT  799

seq1  TTGGGACCCAGCCATGGCTTGAGATAGGAGTACGCAGGAGACTGTGGCCA  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGACCCAGCCATGGCTTGAGATAGGAGTACGCAGGAGACTGTGGCCA  849

seq1  CCGGTCTTGGGGGGACATGGAAAGAGCAGCATGCTAATGGCTAGAAAGGC  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGTCTTGGGGGGACATGGAAAGAGCAGCATGCTAATGGCTAGAAAGGC  899

seq1  AGAGGTTTCTAGCTTAGCCCCGCTGGCAGCCTTGCACTTCATCTCTCAAA  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTTTCTAGCTTAGCCCCGCTGGCAGCCTTGCACTTCATCTCTCAAA  949

seq1  GGCTTTGCCTCGGAACTGGGCAGCCAGTGAAAACAGTGTGTACAGAAGCC  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTGCCTCGGAACTGGGCAGCCAGTGAAAACAGTGTGTACAGAAGCC  999

seq1  AGGCTGTCCCTTCCATGCCCCACCCCCTTTTCCTGCCTGGTGCTAACCTC  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGTCCCTTCCATGCCCCACCCCCTTTTCCTGCCTGGTGCTAACCTC  1049

seq1  TCCTCAGGCCCTAGACCCTTAGCTTTCAAGTCCTTGCACCTTGCAGTGTG  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCAGGCCCTAGACCCTTAGCTTTCAAGTCCTTGCACCTTGCAGTGTG  1099

seq1  GAATTC  1096
      ||||||
seq2  GAATTC  1105