BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-288O08
Chromosome14 (Build37)
Map Location 97,842,969 - 97,995,983
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneKlhl1, LOC100043366, LOC668654
Downstream geneEG668659, Dach1, LOC635593
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-288O08.bB6Ng01-288O08.g
ACCGA086442GA086443
length2801,081
definitionB6Ng01-288O08.b B6Ng01-288O08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,995,704 - 97,995,983)(97,842,969 - 97,844,038)
sequence
ctcctgttaattaaaactgagaaggaatcctcactggcatttttactttg
tattggaagaaaataattttttagttaatttgaaattattaggaagggta
aaacattatatgattcagttagttctagtaggtatataaaaatcatagat
attaccttttcttttgcaaaatggaggtacataagctttttcttataatt
atatatatatgtagatagatagatagatagatagatagatagatagatag
atagatagatagatagatagatagatcgat
gaattctcaaaaatttctttgaattaattgctgccttttttctaattggc
aaagtttctttaattaattaattaattaattaattaatgtgattcttggc
ttcggagaagaaatacaaagaacaatgcaaacagattgccgattagttaa
agcaacaggacatatatgtaatctaaaagttgtgcagtttccacgggtag
ttgtataatcgggaaaaatccttaattaaaagtcattattatgatattgt
cgtaaggatgtttataacaaagaacaaatcccaccaatctctgtaattgt
atgtatgtgtggtacctatttaaaatgtatatgccttagtctgattatgc
tcaggataaaaacttttttcatattactctaagaaaatacctgctaagct
aaaattattctttctagataaaacagaaaaatgtacaatagcccgtgacg
gacaagctggatcttatatccaacatccttcaccatttaggtgcacataa
aggaaacaaattcagctgttatcacagaaacagatggtggaagttacctg
ctgaccaaacaggatcagcagggtggaatcggggtgggtcagctcatctg
gaatggatgctcacaattgtcattacacacatcaattggttctgatacca
ctgtatgtcatgcagtgcctagggaccgtatggcattccttgaaacattt
accagggaactgctgaaacataattttggtctcacattccaaagtgagtt
gttaaattccccacaataaagcattaatgttgccagcattatattattta
aattaagcaggctcccctcctttaaagatgcaggagcccttgtttgatat
atttccaatttgcctgctaatttataaaagtaaaatgatactgtattatt
tgttgtaaagttaattcaaggcttttaatgggacagttatgttactaatc
aagaaatgtttcattatttttttcttactgtaatataatatgttcagtga
gctgattatacagtgtgacactgattttacttaattacaaagtattactg
tatcctctaatgggaatggaatttgatctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_97995704_97995983
seq2: B6Ng01-288O08.b_51_330 (reverse)

seq1  ATCGATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTAT  50

seq1  CTATCTATCTATCTATCTACATATATATATAATTATAAGAAAAAGCTTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTATCTATCTATCTACATATATATATAATTATAAGAAAAAGCTTAT  100

seq1  GTACCTCCATTTTGCAAAAGAAAAGGTAATATCTATGATTTTTATATACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTCCATTTTGCAAAAGAAAAGGTAATATCTATGATTTTTATATACC  150

seq1  TACTAGAACTAACTGAATCATATAATGTTTTACCCTTCCTAATAATTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAGAACTAACTGAATCATATAATGTTTTACCCTTCCTAATAATTTCA  200

seq1  AATTAACTAAAAAATTATTTTCTTCCAATACAAAGTAAAAATGCCAGTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAACTAAAAAATTATTTTCTTCCAATACAAAGTAAAAATGCCAGTGA  250

seq1  GGATTCCTTCTCAGTTTTAATTAACAGGAG  280
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTCCTTCTCAGTTTTAATTAACAGGAG  280

seq1: chr14_97842969_97844038
seq2: B6Ng01-288O08.g_70_1148

seq1  GAATTCTCAAAAATTTCTTTGAATTAATTGCTGCCTTTTTTCTAATTGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAAAAATTTCTTTGAATTAATTGCTGCCTTTTTTCTAATTGGC  50

seq1  AAAGTTTCTTTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATGTGATTCTTGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTTCTTTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATGTGATTCTTGGC  100

seq1  TTCGGAGAAGAAATACAAAGAACAATGCAAACAGATTGCCGATTAGTTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGGAGAAGAAATACAAAGAACAATGCAAACAGATTGCCGATTAGTTAA  150

seq1  AGCAACAGGACATATATGTAATCTAAAAGTTGTGCAGTTTCCACGGGTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACAGGACATATATGTAATCTAAAAGTTGTGCAGTTTCCACGGGTAG  200

seq1  TTGTATAATCGGGAAAAATCCTTAATTAAAAGTCATTATTATGATATTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATAATCGGGAAAAATCCTTAATTAAAAGTCATTATTATGATATTGT  250

seq1  CGTAAGGATGTTTATAACAAAGAACAAATCCCACCAATCTCTGTAATTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAAGGATGTTTATAACAAAGAACAAATCCCACCAATCTCTGTAATTGT  300

seq1  ATGTATGTGTGGTACCTATTTAAAATGTATATGCCTTAGTCTGATTATGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTGTGGTACCTATTTAAAATGTATATGCCTTAGTCTGATTATGC  350

seq1  TCAGGATAAAAACTTTTTTCATATTACTCTAAGAAAATACCTGCTAAGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGATAAAAACTTTTTTCATATTACTCTAAGAAAATACCTGCTAAGCT  400

seq1  AAAATTATTCTTTCTAGATAAAACAGAAAAATGTACAATAGCCCGTGACG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTATTCTTTCTAGATAAAACAGAAAAATGTACAATAGCCCGTGACG  450

seq1  GACAAGCTGGATCTTATATCCAACATCCTTCACCATTTAGGTGCACATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGCTGGATCTTATATCCAACATCCTTCACCATTTAGGTGCACATAA  500

seq1  AGGAAACAAATTCAGCTGTTATCACAGAAACAGATGGTGGAAGTTACCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAACAAATTCAGCTGTTATCACAGAAACAGATGGTGGAAGTTACCTG  550

seq1  CTGACCAAACAGGATCAGCAGGGTGGAATCGGGGTGGGTCAGCTCATCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCAAACAGGATCAGCAGGGTGGAATCGGGGTGGGTCAGCTCATCTG  600

seq1  GAATGGATGCTCACAATTGTCATTACACACATCAATTGGTTCTGATACCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGATGCTCACAATTGTCATTACACACATCAATTGGTTCTGATACCA  650

seq1  CTGTATGTCATGCAGTGCCTAGGGACCGTATGGCATTCCTTGAAACATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATGTCATGCAGTGCCTAGGGACCGTATGGCATTCCTTGAAACATTT  700

seq1  ACCAGGGAACTGCTGAAACATAATTTTGGTCTCACATTCCAAAGTGAGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGGAACTGCTGAAACATAATTTTGGTCTCACATTCCAAAGTGAGTT  750

seq1  GTTAAATTCCCCACAATAAAGCATTAATGTTGCCAGCATTATATTATTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAATTCCCCACAATAAAGCATTAATGTTGCCAGCATTATATTATTTA  800

seq1  AATTAAGCAGGCTCCCCTCCTTTAAAGATGCAGGAG-CCTTGTTTGATAT  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AATTAAGCAGGCTCCCCTCCTTTAAAGATGCAGGAGCCCTTGTTTGATAT  850

seq1  ATTTCCAATTTGCCTGCTAATTTATAAAAGTAAAATGATACTGTATTA-T  898
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ATTTCCAATTTGCCTGCTAATTTATAAAAGTAAAATGATACTGTATTATT  900

seq1  TGTTGTAAAGTTAA-TCAAGGC-TTTAATGGGACAGTTATGTTACT-ATC  945
      |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGTTGTAAAGTTAATTCAAGGCTTTTAATGGGACAGTTATGTTACTAATC  950

seq1  AAGAAATGTTTCATTA-TTTTTTCTTACTGTAATAT-ATATGTTCAGTGA  993
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AAGAAATGTTTCATTATTTTTTTCTTACTGTAATATAATATGTTCAGTGA  1000

seq1  GCTGATTATACAGTGTGACACTGATTTTAC-TAATTACAAAGTTATTACT  1042
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  GCTGATTATACAGTGTGACACTGATTTTACTTAATTACAAAG-TATTACT  1049

seq1  GTAT-CTCTAATGGG-ATGAAATTTGATCT  1070
      |||| |||||||||| ||| ||||||||||
seq2  GTATCCTCTAATGGGAATGGAATTTGATCT  1079