BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-296K06
Chromosome14 (Build37)
Map Location 75,896,308 - 76,023,786
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm912, Spert
Upstream geneHtr2a, LOC668508, Esd, Lrch1, ENSMUSG00000075519, LOC100043169, 5031414D18Rik, 4921509B22Rik, LOC100043176, Lcp1, Cpb2, Zc3h13
Downstream gene4930564B18Rik, Cog3, Slc25a30, LOC100043189, Tpt1, LOC100038852, Gtf2f2, LOC668504, Kctd4, 1200011I18Rik, Nufip1, LOC100043752, 2900040C04Rik, Tsc22d1, 2810032E02Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-296K06.bB6Ng01-296K06.g
ACCGA092197GA092198
length1,0861,089
definitionB6Ng01-296K06.b B6Ng01-296K06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,896,308 - 75,897,404)(76,022,698 - 76,023,786)
sequence
gaattctttattgaattcgtgttttcagactcaacctccgctgtgagcta
accatcacgtaacagtctctgactaatgatgctctagtttaggaaggaca
tcatcatgttgcctgtgtagcttcaatgtcactgttggctggcatttccc
tgtatgttaacaagataaaagtgaagcaggaaagatacacaccagcttat
caccctgtcctgaatgacaaggataactcctgagctaactcagatgacag
ttttagatacagaaacaacctatcctccatcatttgtgctattcaacgcc
gcttcatctgagcacacagtgcacttttaagtattcctacaatgactaat
ttcaaattgccaatgtcacattgtggggcctgcagttcggaagcaatgct
tgacattatgtagcaacactgccatcagacacgacacagacttgtaagac
aactacaaatatttttaatgtactttgtccctgtgtttttaatataattt
gggtaattctaagtttatgtaattccattttaacaatggctatgtgcatg
aacggatacattgtagacaaatgtggatggatttggtagacatcctttct
tgttcctttcacttatccaaatgtgaatcatgccatttgtagacttttgt
aactgagtcctttcgcctaccatgggggttccaaagtttagtcatgttgt
agcaggtaataatggtgataatattgatatgtaaacattagcttacaaat
agtgatgagctcacataaaatataaagtggttctgtttttaatatataat
atgaaaaagcactctatttgtcagagttcccagcacagtttacttctcag
gaaatgtacttatctattctgcttttgttgaaaatagatttgtttcatac
aatatattctgattatggcttccccattctcagctcttcccagagtctcc
ccatcttccttcttgtccaaatccatactcctttctgttgttggaaaaca
ataggtttctaaagaatcacagtcaggtaaaacccaaacaagaacagaga
tgacaacaaacagaggagagcagaaaagcatgaaaa
gaattcagaggcagaaggacccgggaagtaatcgagtcccacctaccgta
ggatgtgctgattgacagcagcagctgatttggaagaacaatcattggca
gctgacatggatgtggaaaggaggaggagaccatttgggacaagggcagt
tttcaagagcatcctgtgatcccagcactcaggagatagaggcagaagga
acagaggggcaaggttatcctgagatactcaacgtgtttgagaacagtcc
aggatatatgagacccttgtttcaaaaaccaaaacaaaaataaaagaaca
acaataaaaaacgtttaaagacttaatcatttcttatttgtactgttcct
ctcatccgtttatcaagcaggcctaaccctgctcagcttccccgatcagg
cacagtcactgtagtacagctatgggattatctctaacaaagcataattt
gatttttcttataggcaggtaagagtcaggttgacatgactcctatagcg
gagttcacaggcttgtagtcttagatctctttcaaagtatttgggataat
ggtgggggtgtacccctaatttaaatgatggcttgaattgagcctagtct
tagaggaaggcaggtggtggttcctgagcatagaccaggggacagaagca
accaagagcagcatcttattaggctcacgctgggcatgagggaccgtcaa
tcaactagatgcctctcggttagcaaggctcgtactcacttcatgaggta
ctgcctctctctagcagccctcccgccattactcagtcatacagccctga
tctcgacagttctttcattagtcccctgagaagacttttctctggctcta
accatatagcaggaacaggagtctggctgttgattggggagggaagacgc
atataatcactcatgcttgtattagcccagagtggagtgacaagcctgca
gttcatgttcttacaagatgatgagctgtctcaatcagcaatttgggaaa
aaaagaaaaatctacatgactctaggagaatttgtcactgtcatttccct
tcctctttcctaagtgttatgcaaatttgcagtggagtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_75896308_75897404
seq2: B6Ng01-296K06.b_46_1131

seq1  GAATTCTTTATTGAATTCGTGTTTTCAGACTCAACCTCCGCTGTGAGCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTATTGAATTCGTGTTTTCAGACTCAACCTCCGCTGTGAGCTA  50

seq1  ACCATCACGTAACAGTCTCTGACTAATGATGCTCTAGTTTAGGAAGGACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATCACGTAACAGTCTCTGACTAATGATGCTCTAGTTTAGGAAGGACA  100

seq1  TCATCATGTTGCCTGTGTAGCTTCAATGTCACTGTTGGCTGGCATTTCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCATGTTGCCTGTGTAGCTTCAATGTCACTGTTGGCTGGCATTTCCC  150

seq1  TGTATGTTAACAAGATAAAAGTGAAGCAGGAAAGATACACACCAGCTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTTAACAAGATAAAAGTGAAGCAGGAAAGATACACACCAGCTTAT  200

seq1  CACCCTGTCCTGAATGACAAGGATAACTCCTGAGCTAACTCAGATGACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTGTCCTGAATGACAAGGATAACTCCTGAGCTAACTCAGATGACAG  250

seq1  TTTTAGATACAGAAACAACCTATCCTCCATCATTTGTGCTATTCAACGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGATACAGAAACAACCTATCCTCCATCATTTGTGCTATTCAACGCC  300

seq1  GCTTCATCTGAGCACACAGTGCACTTTTAAGTATTCCTACAATGACTAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCATCTGAGCACACAGTGCACTTTTAAGTATTCCTACAATGACTAAT  350

seq1  TTCAAATTGCCAATGTCACATTGTGGGGCCTGCAGTTCGGAAGCAATGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAATTGCCAATGTCACATTGTGGGGCCTGCAGTTCGGAAGCAATGCT  400

seq1  TGACATTATGTAGCAACACTGCCATCAGACACGACACAGACTTGTAAGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATTATGTAGCAACACTGCCATCAGACACGACACAGACTTGTAAGAC  450

seq1  AACTACAAATATTTTTAATGTACTTTGTCCCTGTGTTTTTAATATAATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACAAATATTTTTAATGTACTTTGTCCCTGTGTTTTTAATATAATTT  500

seq1  GGGTAATTCTAAGTTTATGTAATTCCATTTTAACAATGGCTATGTGCATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAATTCTAAGTTTATGTAATTCCATTTTAACAATGGCTATGTGCATG  550

seq1  AACGGATACATTGTAGACAAATGTGGATGGATTTGGTAGACATCCTTTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGGATACATTGTAGACAAATGTGGATGGATTTGGTAGACATCCTTTCT  600

seq1  TGTTCCTTTCACTTATCCAAATGTGAATCATGCCATTTGTAGACTTTTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCTTTCACTTATCCAAATGTGAATCATGCCATTTGTAGACTTTTGT  650

seq1  AACTGAGTCCTTTCGCCTACCATGGGGGTTCCAAAGTTTAGTCATGTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAGTCCTTTCGCCTACCATGGGGGTTCCAAAGTTTAGTCATGTTGT  700

seq1  AGCAGGTAATAATGGTGATAATATTGATATGTAAACATTAGCTTACAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGTAATAATGGTGATAATATTGATATGTAAACATTAGCTTACAAAT  750

seq1  AGTGATGAGCTCACATAAAATATAAAGTGGTTCTGTTTTTAATATATAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATGAGCTCACATAAAATATAAAGTGGTTCTGTTTTTAATATATAAT  800

seq1  ATGAAAAAGCACTCTATTTGTCAGAGTTCCCAGCACAGTTTACTTCTCAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAAAGCACTCTATTTGTCAGAGTTCCCAGCACAGTTTACTTCTCAG  850

seq1  GAAATGTACTTATCTATTCTGCTTTTGTTGAAAATAGATTTGTTTCATAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGTACTTATCTATTCTGCTTTTGTTGAAAATAGATTTGTTTCATAC  900

seq1  AATATATTCTGATTATGGCTTCCCCATTCTCAGCTCTTCCCAGAGTCTCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATTCTGATTATGGCTTCCCCATTCTCAGCTCTTCCCAGAGTCTCC  950

seq1  CCATCTTCCCTCCTGTCCAAATCCATACTCCTTTCTGTTGTTGGAAAACA  1000
      ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCATCTTCCTTCTTGTCCAAATCCATACTCCTTTCTGTTGTTGGAAAAC-  999

seq1  AATAGGTTTCTAAAGAATCACAGTCAGGTAAAACCAAAACAAAGAAACCA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||
seq2  AATAGGTTTCTAAAGAATCACAGTCAGGTAAAACCCAAAC-AAGAA--CA  1046

seq1  GAAGATGACAAACAAACAGAAGAAGAGCCAAAGAAAAAGCATGAAAA  1097
      | ||||||| ||||||||| || |||||   || |||||||||||||
seq2  G-AGATGAC-AACAAACAG-AGGAGAGC---AG-AAAAGCATGAAAA  1086

seq1: chr14_76022698_76023786
seq2: B6Ng01-296K06.g_71_1159 (reverse)

seq1  AACTCAACTGCAAATTTGCATTAACACTTAGGAAAGAGGAGGGGAATAGA  50
      ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||
seq2  AACTCCACTGCAAATTTGCA-TAACACTTAGGAAAGAGGAAGGGAAATGA  49

seq1  CAGTGACAAATTCTCTTGGAGTCTTGTAGATTTT--TTTTTTTTCCAAAT  98
      ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||
seq2  CAGTGACAAATTCTCCTAGAGTCATGTAGATTTTTCTTTTTTTCCCAAAT  99

seq1  TGCTGGTTTGAGACAGCTCATCATCTTTGTGAGAACATGAACTGCAGGCT  148
      |||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
seq2  TGCT-GATTGAGACAGCTCATCATC-TTGTAAGAACATGAACTGCAGGCT  147

seq1  TGTCACTCCACTCTGGGCTAATACAAGC-TGAGTGATTATATGCGTCTTC  197
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTCCACTCTGGGCTAATACAAGCATGAGTGATTATATGCGTCTTC  197

seq1  CCTCCCCAATCAACAGCCAGACTCCTGTTCCCTGCTATATGGTTAGAGCC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCCAATCAACAGCCAGACTCCTGTT-CCTGCTATATGGTTAGAGCC  246

seq1  AGAGAAAAGTCTTCTCAGGGGACTAATG-AAGAACTGTCGAGATCAGGGC  296
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAAGTCTTCTCAGGGGACTAATGAAAGAACTGTCGAGATCAGGGC  296

seq1  TGTATGACTGAGTAATGGCGGGAGGGCTGCTAGAGAGAGGCAGTACCTCA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGACTGAGTAATGGCGGGAGGGCTGCTAGAGAGAGGCAGTACCTCA  346

seq1  TGAAGTGAGTACGAGCCTTGCTAACCGAGAGGCATCTAGTTGATTGACGG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTGAGTACGAGCCTTGCTAACCGAGAGGCATCTAGTTGATTGACGG  396

seq1  TCCCTCATGCCCAGCGTGAGCCTAATAAGATGCTGCTCTTGGTTGCTTCT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCATGCCCAGCGTGAGCCTAATAAGATGCTGCTCTTGGTTGCTTCT  446

seq1  GTCCCCTGGTCTATGCTCAGGAACCACCACCTGCCTTCCTCTAAGACTAG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCCTGGTCTATGCTCAGGAACCACCACCTGCCTTCCTCTAAGACTAG  496

seq1  GCTCAATTCAAGCCATCATTTAAATTAGGGGTACACCCCCACCATTATCC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAATTCAAGCCATCATTTAAATTAGGGGTACACCCCCACCATTATCC  546

seq1  CAAATACTTTGAAAGAGATCTAAGACTACAAGCCTGTGAACTCCGCTATA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATACTTTGAAAGAGATCTAAGACTACAAGCCTGTGAACTCCGCTATA  596

seq1  GGAGTCATGTCAACCTGACTCTTACCTGCCTATAAGAAAAATCAAATTAT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCATGTCAACCTGACTCTTACCTGCCTATAAGAAAAATCAAATTAT  646

seq1  GCTTTGTTAGAGATAATCCCATAGCTGTACTACAGTGACTGTGCCTGATC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGTTAGAGATAATCCCATAGCTGTACTACAGTGACTGTGCCTGATC  696

seq1  GGGGAAGCTGAGCAGGGTTAGGCCTGCTTGATAAACGGATGAGAGGAACA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAGCTGAGCAGGGTTAGGCCTGCTTGATAAACGGATGAGAGGAACA  746

seq1  GTACAAATAAGAAATGATTAAGTCTTTAAACGTTTTTTATTGTTGTTCTT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAAATAAGAAATGATTAAGTCTTTAAACGTTTTTTATTGTTGTTCTT  796

seq1  TTATTTTTGTTTTGGTTTTTGAAACAAGGGTCTCATATATCCTGGACTGT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTGTTTTGGTTTTTGAAACAAGGGTCTCATATATCCTGGACTGT  846

seq1  TCTCAAACACGTTGAGTATCTCAGGATAACCTTGCCCCTCTGTTCCTTCT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAACACGTTGAGTATCTCAGGATAACCTTGCCCCTCTGTTCCTTCT  896

seq1  GCCTCTATCTCCTGAGTGCTGGGATCACAGGATGCTCTTGAAAACTGCCC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTATCTCCTGAGTGCTGGGATCACAGGATGCTCTTGAAAACTGCCC  946

seq1  TTGTCCCAAATGGTCTCCTCCTCCTTTCCACATCCATGTCAGCTGCCAAT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCCAAATGGTCTCCTCCTCCTTTCCACATCCATGTCAGCTGCCAAT  996

seq1  GATTGTTCTTCCAAATCAGCTGCTGCTGTCAATCAGCACATCCTACGGTA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGTTCTTCCAAATCAGCTGCTGCTGTCAATCAGCACATCCTACGGTA  1046

seq1  GGTGGGACTCGATTACTTCCCGGGTCCTTCTGCCTCTGAATTC  1089
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGACTCGATTACTTCCCGGGTCCTTCTGCCTCTGAATTC  1089