BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-297I10
Chromosome14 (Build37)
Map Location 71,904,046 - 72,019,738
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043136
Upstream geneBmp1, Sftpc, Lgi3, Reep4, Hr, Nudt18, Rai16, Epb4.9, Fgf17, Npm2, Xpo7, LOC668443, Dok2, Gfra2, LOC100043132
Downstream geneLOC668477, LOC668482, LOC675957, Fndc3a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-297I10.bB6Ng01-297I10.g
ACCGA092862GA092863
length1,106942
definitionB6Ng01-297I10.b B6Ng01-297I10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,018,628 - 72,019,738)(71,904,046 - 71,904,864)
sequence
gaattctctgcagttgaaaataagataaacaagaagcaggatgagatcta
gttcgtatgtaatgatactgtaatttggggaaggtaatttaaattccact
catttgttgtaatcagaatgtgaaggctgggttttctttcggggctcatt
ctggtcagtgggtttgccagcgagtcatccaattcctgaagattttaaat
gtataacatacctttgaaaaatatatctttttgaattttaagaacaatgg
ttgaaatctcatgaacatgtttatatttaaccccaccacttactatttat
tatgcctagctgtttcaagtggccctctacttttcatttctattaatttt
tactttctcagtcactgattcctgttctgccattattgtttctaaatccc
aatttttatgacttttcattcatcttcattcttaaattgttagtttttaa
ctcattttatcttaggaagagattctgatgtacatatttaccattactcc
acaggagttggaaataaattgttcataaaaaatgtacttcagggaattca
tcaaagctttcatttttgaccttggccatgatcaattttttatgtatata
tcatggtattttgaagagaaatatattaccttagactacacattttgaca
tacatatgtaaaattaatcgctcttgttaatattcagtcatcactttcac
tatttatttgagtcaatttgatctataaagtgatattttaaagtttcatt
ctttgggtgatgcaattattcatacattctgaagtcattttaggatattt
aaaagagaaaatttaatgaccattatatctttatcatgaagactgacccc
attaaccctgctaaaagcttgttttgaaatctccttttctgctattaatg
accattccctcactgcattgccttgatgtatcagacatgcaatctcattt
taaaattttgtgagtgaattggttgtagttacatcttacaaatggtccat
ggggagatttcttcggtttatgcttgcttggttctagagtttagatcatt
gtgctttaatataaaatttaccttgtcatatttttttttaaccacagact
ttattt
gaattcatcttccttaaatcatgatgggtggtctgcaccagacatagaac
caagacccatgttccttaattgaaaatgtgaacatacaagaggctgagtc
tatgttgactatttaggtctatttgttctctttcctctccctgtagtcat
agtgctgttttctaattctacccatctatgtattctgctacatatgttcc
ttgagcacagcacaaaggaagggtgactgtactggtagctcaatagtcta
tggggaatcaaaccttgttggtatgcttaataactgagtatgttccttag
aaccctgtatgtcttttcaacatcttgctttgaagtgtagattttattgt
tattgagatacagcaaggcagtgtagtcaaccagatgatgtactcacaga
tctctagagaagagggcacagaatgcaacaagatccacaaggagaagtat
tgatgttggctagaagacaaagggatagtggaagattgtgaactggagtc
atcattgtatttccttagaaaagaagagacaaggaaaggaaaacaaatgt
aagattagctgataaataattttgacagggtttagagagtgtgagctatc
cttggttgtctgatatctagatctgaggtgattagaattggaaaataatg
ttcctaagtgtaatatcctataaaggggatgtcttctggtatgtgttctg
tgccctaaattggctggatttcatttgaaagatgctttcatatgtgttat
ttctaggaaccaccctatcctgagagagcatgtcctctggtctcaatatg
accctgtacatcaagcttttataatgaagaaattaggaatgggaatgtag
ctcatttgggacagtgtgctgggttcagttgagaattattccccatggac
tcatatatttgaatacttgggttactagggagttggcacttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_72018628_72019738
seq2: B6Ng01-297I10.b_47_1152 (reverse)

seq1  AAATAAATGTCTGTG--TTAAAAAAAATATGACAAGGTAAATATTTATAT  48
      ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AAATAAA-GTCTGTGGTTAAAAAAAAATATGACAAGGTAAAT-TTTATAT  48

seq1  TAAAGCACAATGGATCTTAAACTCTTAGAACCCAAGCAAGCATAAACCGA  98
      ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| 
seq2  TAAAGCACAAT-GATC-TAAACTC-TAGAA-CCAAGCAAGCATAAACCG-  93

seq1  AAGAAATCTCCCCATGGACCATTTGTAAGATGTAACTACAACCAATTCAC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATCTCCCCATGGACCATTTGTAAGATGTAACTACAACCAATTCAC  143

seq1  TCACAAAATTTTAAAATGAGATTGCATGTCCTGATACATCAAGGCAATGC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TCACAAAATTTTAAAATGAGATTGCATGT-CTGATACATCAAGGCAATGC  192

seq1  AGTGA-GGAATGGTCATTAATAGCAGAAAAGGAGATTTCAAAACAAGCTT  247
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGGGAATGGTCATTAATAGCAGAAAAGGAGATTTCAAAACAAGCTT  242

seq1  TTAGCAGGGTTAATGGGGTCAGTCTTCATGATAAAGATATAATGGTCATT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCAGGGTTAATGGGGTCAGTCTTCATGATAAAGATATAATGGTCATT  292

seq1  AAATTTTCTCTTTTAAATATCCTAAAATGACTTCAGAATGTATGAATAAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTCTCTTTTAAATATCCTAAAATGACTTCAGAATGTATGAATAAT  342

seq1  TGCATCACCCAAAGAATGAAACTTTAAAATATCACTTTATAGATCAAATT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCACCCAAAGAATGAAACTTTAAAATATCACTTTATAGATCAAATT  392

seq1  GACTCAAATAAATAGTGAAAGTGATGACTGAATATTAACAAGAGCGATTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCAAATAAATAGTGAAAGTGATGACTGAATATTAACAAGAGCGATTA  442

seq1  ATTTTACATATGTATGTCAAAATGTGTAGTCTAAGGTAATATATTTCTCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTACATATGTATGTCAAAATGTGTAGTCTAAGGTAATATATTTCTCT  492

seq1  TCAAAATACCATGATATATACATAAAAAATTGATCATGGCCAAGGTCAAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAATACCATGATATATACATAAAAAATTGATCATGGCCAAGGTCAAA  542

seq1  AATGAAAGCTTTGATGAATTCCCTGAAGTACATTTTTTATGAACAATTTA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAAGCTTTGATGAATTCCCTGAAGTACATTTTTTATGAACAATTTA  592

seq1  TTTCCAACTCCTGTGGAGTAATGGTAAATATGTACATCAGAATCTCTTCC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAACTCCTGTGGAGTAATGGTAAATATGTACATCAGAATCTCTTCC  642

seq1  TAAGATAAAATGAGTTAAAAACTAACAATTTAAGAATGAAGATGAATGAA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATAAAATGAGTTAAAAACTAACAATTTAAGAATGAAGATGAATGAA  692

seq1  AAGTCATAAAAATTGGGATTTAGAAACAATAATGGCAGAACAGGAATCAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCATAAAAATTGGGATTTAGAAACAATAATGGCAGAACAGGAATCAG  742

seq1  TGACTGAGAAAGTAAAAATTAATAGAAATGAAAAGTAGAGGGCCACTTGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGAGAAAGTAAAAATTAATAGAAATGAAAAGTAGAGGGCCACTTGA  792

seq1  AACAGCTAGGCATAATAAATAGTAAGTGGTGGGGTTAAATATAAACATGT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCTAGGCATAATAAATAGTAAGTGGTGGGGTTAAATATAAACATGT  842

seq1  TCATGAGATTTCAACCATTGTTCTTAAAATTCAAAAAGATATATTTTTCA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAGATTTCAACCATTGTTCTTAAAATTCAAAAAGATATATTTTTCA  892

seq1  AAGGTATGTTATACATTTAAAATCTTCAGGAATTGGATGACTCGCTGGCA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTATGTTATACATTTAAAATCTTCAGGAATTGGATGACTCGCTGGCA  942

seq1  AACCCACTGACCAGAATGAGCCCCGAAAGAAAACCCAGCCTTCACATTCT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCACTGACCAGAATGAGCCCCGAAAGAAAACCCAGCCTTCACATTCT  992

seq1  GATTACAACAAATGAGTGGAATTTAAATTACCTTCCCCAAATTACAGTAT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTACAACAAATGAGTGGAATTTAAATTACCTTCCCCAAATTACAGTAT  1042

seq1  CATTACATACGAACTAGATCTCATCCTGCTTCTTGTTTATCTTATTTTCA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTACATACGAACTAGATCTCATCCTGCTTCTTGTTTATCTTATTTTCA  1092

seq1  ACTGCAGAGAATTC  1111
      ||||||||||||||
seq2  ACTGCAGAGAATTC  1106

seq1: chr14_71904046_71904864
seq2: B6Ng01-297I10.g_70_888

seq1  GAATTCATCTTCCTTAAATCATGATGGGTGGTCTGCACCAGACATAGAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTTCCTTAAATCATGATGGGTGGTCTGCACCAGACATAGAAC  50

seq1  CAAGACCCATGTTCCTTAATTGAAAATGTGAACATACAAGAGGCTGAGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACCCATGTTCCTTAATTGAAAATGTGAACATACAAGAGGCTGAGTC  100

seq1  TATGTTGACTATTTAGGTCTATTTGTTCTCTTTCCTCTCCCTGTAGTCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTGACTATTTAGGTCTATTTGTTCTCTTTCCTCTCCCTGTAGTCAT  150

seq1  AGTGCTGTTTTCTAATTCTACCCATCTATGTATTCTGCTACATATGTTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTGTTTTCTAATTCTACCCATCTATGTATTCTGCTACATATGTTCC  200

seq1  TTGAGCACAGCACAAAGGAAGGGTGACTGTACTGGTAGCTCAATAGTCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCACAGCACAAAGGAAGGGTGACTGTACTGGTAGCTCAATAGTCTA  250

seq1  TGGGGAATCAAACCTTGTTGGTATGCTTAATAACTGAGTATGTTCCTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGAATCAAACCTTGTTGGTATGCTTAATAACTGAGTATGTTCCTTAG  300

seq1  AACCCTGTATGTCTTTTCAACATCTTGCTTTGAAGTGTAGATTTTATTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTGTATGTCTTTTCAACATCTTGCTTTGAAGTGTAGATTTTATTGT  350

seq1  TATTGAGATACAGCAAGGCAGTGTAGTCAACCAGATGATGTACTCACAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAGATACAGCAAGGCAGTGTAGTCAACCAGATGATGTACTCACAGA  400

seq1  TCTCTAGAGAAGAGGGCACAGAATGCAACAAGATCCACAAGGAGAAGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAGAGAAGAGGGCACAGAATGCAACAAGATCCACAAGGAGAAGTAT  450

seq1  TGATGTTGGCTAGAAGACAAAGGGATAGTGGAAGATTGTGAACTGGAGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTTGGCTAGAAGACAAAGGGATAGTGGAAGATTGTGAACTGGAGTC  500

seq1  ATCATTGTATTTCCTTAGAAAAGAAGAGACAAGGAAAGGAAAACAAATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTGTATTTCCTTAGAAAAGAAGAGACAAGGAAAGGAAAACAAATGT  550

seq1  AAGATTAGCTGATAAATAATTTTGACAGGGTTTAGAGAGTGTGAGCTATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTAGCTGATAAATAATTTTGACAGGGTTTAGAGAGTGTGAGCTATC  600

seq1  CTTGGTTGTCTGATATCTAGATCTGAGGTGATTAGAATTGGAAAATAATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTTGTCTGATATCTAGATCTGAGGTGATTAGAATTGGAAAATAATG  650

seq1  TTCCTAAGTGTAATATCCTATAAAGGGGATGTCTTCTGGTATGTGTTCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTAAGTGTAATATCCTATAAAGGGGATGTCTTCTGGTATGTGTTCTG  700

seq1  TGCCCTAAATTGGCTGGATTTCATTTGAAAGATGCTTTCATATGTGTTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTAAATTGGCTGGATTTCATTTGAAAGATGCTTTCATATGTGTTAT  750

seq1  TTCTAGGAACCACCCTATCCTGAGAGAGCATGTCCTCTGGTCTCAATATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGGAACCACCCTATCCTGAGAGAGCATGTCCTCTGGTCTCAATATG  800

seq1  ACCCTGTACATCAAGCTTT  819
      |||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGTACATCAAGCTTT  819