BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-300G19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 43,946,874 - 44,100,758
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041143, EG666485, 1700049E17Rik, LOC666492, 1700001F09Rik, LOC673380, LOC100042326, EG666502
Upstream geneEG666239, LOC100040759, LOC100040771, EG666253, EG666264, LOC100040787, EG666280, EG666285, LOC666298, LOC100042031, EG666318, EG546249, LOC100040863, LOC100040875, LOC100040890, LOC100042055, LOC635209, 1700091H14Rik, EG666415, LOC100040976, LOC100040983, LOC100042114, LOC666370, EG666376, LOC100041025, EG666396, LOC100041046, LOC100042130, LOC624893, LOC100041069, EG666420, LOC666436, EG638353, LOC666454, LOC100041106, EG638262, EG640992, EG666471, LOC666481
Downstream geneLOC545039, LOC100041227, LOC100041235, LOC100042342, LOC666322, EG666556, EG666561, LOC676304, Rbmxrtp, LOC673132, LOC100041300, LOC624717, LOC672977, EG666590, LOC100041327, EG623592, Ear1, Ear-ps12, Ear-ps9, Ear-ps8, Ang-ps3, Ear10, EG666451, LOC672161, Ang3, Ear-ps7, Ear-ps10, EG630952, EG666621, LOC100041356, LOC100041364, LOC100041371, LOC100041376, Ear-ps2, Ang-ps1, Ear2, LOC100041393, LOC100041422, EG666638, 4930503E14Rik, EG666647, EG624862, EG666660, EG666667, EG546250, EG666675, LOC100041494, LOC100041497, EG666678, LOC676402
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-300G19.bB6Ng01-300G19.g
ACCGA095006GA095007
length1,197780
definitionB6Ng01-300G19.b B6Ng01-300G19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(43,946,874 - 43,948,056)(44,100,058 - 44,100,758)
sequence
gaattctatgcagtgattgtacaaggctaagattaagataaaggggaatt
atgctttagtatgaagagcttccacaggctattgagatgtttctatcaca
gcctacatcaggcaatccctaatttcaaatggcaggaacccaggaggaat
gtgtctcctgcttctcaagaccacagacaccatccttttttacaagtagc
tgctgcaggctgctgagaggtttccattttgacctgtagtgggcagtccc
tctaattgcatgctctctccatcacccttgaaatgtaaaaatgcagataa
ccaatgccaaacattaggctgtggtcagagtcttgtggaagtgttggtgg
aagggttgtagtagccagaagggttaggaagccacaagaggacctacagt
caactaatctgggttcttggagttcacagagacggaacaatgagccaaca
ccatgtaggggcttgaactaggactgttacataaatgaaacagatgtaca
tcttggtcttcatgtgggtgactaacaattggagtgggtgctgcctcgga
tttagactctgttacctgcctttggatctcttttccctagctgggctgcc
ctgtctgggctcagtgagagagaatgcacttattcctgatgcaacttgat
atgccacctgggtcatttaaaagtgatcttctggtacacataacaggaaa
gtaggaccatatccctgtcatgtgagtgtccagagaacaaggtggtacat
gattaatccatgtgggctgaaaagagaaggagaatgttctacagaggaat
gaactacagctatggctgtttctgtttgatcttgagccaactccactgtg
tatattcagaagaggaagcaattgtctcagcagcaatttcacaagacagt
gactttcattactctccttatgctgcctagagcacagatccaagaccttc
tagtggtgggaataccttctacctggaaaactgtcagacactcttgtact
aggcctctgcctgcacctcacaattccactgtcaacctcccaggtcaatt
taattgtttcatagccttcctgtttgtcagcctggcatatgcctcccttc
ttagggtcttcgtaactttgccaacctgggtgtctggcttaacctagaga
gtgctatgacactgtaagtctatttcacctctggtgtcacgtgataa
gaattcaattttcaacgcttgttaagcttatataactttcaggaatattc
agttattgcagttgttgcgaagtgcggtgatggtgttgtactgttatcca
gtttatactgggggtgggggtggggtcggtcaacagcgattttgtggaat
ctgatagtgtttctggtaaaagataccagactcgaaagattacatagagc
gtgacattcagtagggcatgtacagagttatgttaaaatatttatgtaaa
aaaccctctccaatctctggcacaattagatatgatgcactaatcagtgt
agtatgagatctcccagatgtcagctacttcaggcttctctagaaaactc
ctcaaaatagatgccttattttcatctctccaattctatgtaattccccc
ttcatctgcttttccttttccagatttaaaaagctaacacactattatat
ttcactgtatagccgtgtcatggagctctgagcactcaactgtctcttat
tctatggaccattacaaactggtgctatggatatctattaatcattgtct
actgtaagggaattttctctgatgatgtgaaaggtgtactcctctttata
tctaaaggtaaaactaagagacagttttatgctatctccatatagcagga
tgttactagtaagaactcctttaggtccctgtgctcggagccattcatgg
gtatttggttcaatcaatagtgccagtcatgagtctttgtcagactttat
attccagtgagaaagtggttgggtgtgctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_43946874_43948056
seq2: B6Ng01-300G19.b_44_1240

seq1  GAATTCTATGCAGTGATTGTACAAGGCTAAGATTAAGATAAAGGGGAATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATGCAGTGATTGTACAAGGCTAAGATTAAGATAAAGGGGAATT  50

seq1  ATGCTTTAGTATGAAGAGCTTCCACAGGCTATTGAGATGTTTCTATCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTAGTATGAAGAGCTTCCACAGGCTATTGAGATGTTTCTATCACA  100

seq1  GCCTACATCAGGCAATCCCTAATTTCAAATGGCAGGAACCCAGGAGGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTACATCAGGCAATCCCTAATTTCAAATGGCAGGAACCCAGGAGGAAT  150

seq1  GTGTCTCCTGCTTCTCAAGACCACAGACACCATCCTTTTTTACAAGTAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTCCTGCTTCTCAAGACCACAGACACCATCCTTTTTTACAAGTAGC  200

seq1  TGCTGCAGGCTGCTGAGAGGTTTCCATTTTGACCTGTAGTGGGCAGTCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCAGGCTGCTGAGAGGTTTCCATTTTGACCTGTAGTGGGCAGTCCC  250

seq1  TCTAATTGCATGCTCTCTCCATCACCCTTGAAATGTAAAAATGCAGATAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATTGCATGCTCTCTCCATCACCCTTGAAATGTAAAAATGCAGATAA  300

seq1  CCAATGCCAAACATTAGGCTGTGGTCAGAGTCTTGTGGAAGTGTTGGTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGCCAAACATTAGGCTGTGGTCAGAGTCTTGTGGAAGTGTTGGTGG  350

seq1  AAGGGTTGTAGTAGCCAGAAGGGTTAGGAAGCCACAAGAGGACCTACAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTTGTAGTAGCCAGAAGGGTTAGGAAGCCACAAGAGGACCTACAGT  400

seq1  CAACTAATCTGGGTTCTTGGAGTTCACAGAGACGGAACAATGAGCCAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTAATCTGGGTTCTTGGAGTTCACAGAGACGGAACAATGAGCCAACA  450

seq1  CCATGTAGGGGCTTGAACTAGGACTGTTACATAAATGAAACAGATGTACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTAGGGGCTTGAACTAGGACTGTTACATAAATGAAACAGATGTACA  500

seq1  TCTTGGTCTTCATGTGGGTGACTAACAATTGGAGTGGGTGCTGCCTCGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTCTTCATGTGGGTGACTAACAATTGGAGTGGGTGCTGCCTCGGA  550

seq1  TTTAGACTCTGTTACCTGCCTTTGGATCTCTTTTCCCTAGCTGGGCTGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGACTCTGTTACCTGCCTTTGGATCTCTTTTCCCTAGCTGGGCTGCC  600

seq1  CTGTCTGGGCTCAGTGAGAGAGAATGCACTTATTCCTGATGCAACTTGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTGGGCTCAGTGAGAGAGAATGCACTTATTCCTGATGCAACTTGAT  650

seq1  ATGCCACCTGGGTCATTTAAAAGTGATCTTCTGGTACACATAACAGGAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCACCTGGGTCATTTAAAAGTGATCTTCTGGTACACATAACAGGAAA  700

seq1  GTAGGACCATATCCCTGTCATGTGAGTGTCCAGAGAACAAGGTGGTACAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGACCATATCCCTGTCATGTGAGTGTCCAGAGAACAAGGTGGTACAT  750

seq1  GATTAATCCATGTGGGCTGAAAAGAGAAGGAGAATGTTCTACAGAGGAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAATCCATGTGGGCTGAAAAGAGAAGGAGAATGTTCTACAGAGGAAT  800

seq1  GAACTACAGCTATGGCTGTTTCTGTTTGATCTTGAGCCAACTCCACTGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTACAGCTATGGCTGTTTCTGTTTGATCTTGAGCCAACTCCACTGTG  850

seq1  TATATTCAGAAGAGGAAGCAATTGTCTCAGCAGCAATTTCACAAGACAGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTCAGAAGAGGAAGCAATTGTCTCAGCAGCAATTTCACAAGACAGT  900

seq1  GACTTTCATTACTCTCCTTATGCTGCCTAGAGCACAGATCCAAAGACCTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GACTTTCATTACTCTCCTTATGCTGCCTAGAGCACAGATCC-AAGACCTT  949

seq1  CTAGTGGTGGGAATACCTTCTACCTGGAAAACTGTCAGACACTC-TGTAC  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CTAGTGGTGGGAATACCTTCTACCTGGAAAACTGTCAGACACTCTTGTAC  999

seq1  TAGGCCTCTGCCTGCACCTCAC-ATTCCACTGTCAA-CTCCCAGGTCAAT  1047
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TAGGCCTCTGCCTGCACCTCACAATTCCACTGTCAACCTCCCAGGTCAAT  1049

seq1  TTAATTGTTTCATAGCC-TACTG-TTGTCAGCCTGGGCATATGCCTCCC-  1094
      ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| 
seq2  TTAATTGTTTCATAGCCTTCCTGTTTGTCAGCCT-GGCATATGCCTCCCT  1098

seq1  TCTTAGGGTCCTTCGT-ACTTTG-CAAC--TGGTGTCTGCTTAAACCTAG  1140
      ||||||||| |||||| |||||| ||||   ||||||||  | |||||||
seq2  TCTTAGGGT-CTTCGTAACTTTGCCAACCTGGGTGTCTGGCTTAACCTAG  1147

seq1  -GAGTGCTA--GCACTGTAAGTC-ATTTCA-CTCT-GTGTCAC-TGATAA  1183
       ||||||||   ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||
seq2  AGAGTGCTATGACACTGTAAGTCTATTTCACCTCTGGTGTCACGTGATAA  1197

seq1: chr14_44100058_44100758
seq2: B6Ng01-300G19.g_66_768 (reverse)

seq1  TACCCATGAAT-GCTCCGAGCACA-GGACCTAAAGGAGTTCTTACTAGTA  48
      ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCATGAATGGCTCCGAGCACAGGGACCTAAAGGAGTTCTTACTAGTA  50

seq1  ACATCCTGCTATATGGAGATAGCATAAAACTGTCTCTTAGTTTTACCTTT  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCTGCTATATGGAGATAGCATAAAACTGTCTCTTAGTTTTACCTTT  100

seq1  AGATATAAAGAGGAGTACACCTTTCACATCATCAGAGAAAATTCCCTTAC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATAAAGAGGAGTACACCTTTCACATCATCAGAGAAAATTCCCTTAC  150

seq1  AGTAGACAATGATTAATAGATATCCATAGCACCAGTTTTTAATGGTCCAT  198
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGTAGACAATGATTAATAGATATCCATAGCACCAGTTTGTAATGGTCCAT  200

seq1  AGAATAAGAGACAGTTGAGTGCTCAGAGCTCCATGACACGGCTATACAGT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAAGAGACAGTTGAGTGCTCAGAGCTCCATGACACGGCTATACAGT  250

seq1  GAAATATAATAGTGTGTTAGCTTTTTAAATCTGGAAAAGGAAAAGCAGAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATATAATAGTGTGTTAGCTTTTTAAATCTGGAAAAGGAAAAGCAGAT  300

seq1  GAAGGGGGAATTACATAGAATTGGAGAGATGAAAATAAGGCATCTATTTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGGGAATTACATAGAATTGGAGAGATGAAAATAAGGCATCTATTTT  350

seq1  GAGGAGTTTTCTAGAGAAGCCTGAAGTAGCTGACATCTGGGAGATCTCAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGTTTTCTAGAGAAGCCTGAAGTAGCTGACATCTGGGAGATCTCAT  400

seq1  ACTACACTGATTAGTGCATCATATCTAATTGTGCCAGAGATTGGAGAGGG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACACTGATTAGTGCATCATATCTAATTGTGCCAGAGATTGGAGAGGG  450

seq1  TTTTTTACATAAATATTTTAACATAACTCTGTACATGCCCTACTGAATGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTACATAAATATTTTAACATAACTCTGTACATGCCCTACTGAATGT  500

seq1  CACGCTCTATGTAATCTTTCGAGTCTGGTATCTTTTACCAGAAACACTAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGCTCTATGTAATCTTTCGAGTCTGGTATCTTTTACCAGAAACACTAT  550

seq1  CAGATTCCACAAAATCGCTGTTGACCGACCCCACCCCCACCCCCAGTATA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTCCACAAAATCGCTGTTGACCGACCCCACCCCCACCCCCAGTATA  600

seq1  AACTGGATAACAGTACAACACCATCACCGCACTTCGCAACAACTGCAATA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGATAACAGTACAACACCATCACCGCACTTCGCAACAACTGCAATA  650

seq1  CCTGAATATTCCTGAAAGTTATATAAGCTTAACAAGCGTTGAAAATTGAA  698
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAATATTCCTGAAAGTTATATAAGCTTAACAAGCGTTGAAAATTGAA  700

seq1  TTC  701
      |||
seq2  TTC  703