BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-305O18
Chromosome14 (Build37)
Map Location 107,242,330 - 107,415,435
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043469, Spry2, EG621364, LOC212084, Trim52, LOC100043807, LOC100043476, LOC100043809, LOC668736, EG668738, EG668739, LOC621487, EG668743, LOC100043811, LOC621499, LOC100043814, EG668742, LOC668748
Downstream geneLOC668752, EG668754
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-305O18.bB6Ng01-305O18.g
ACCGA099090GA099091
length6741,123
definitionB6Ng01-305O18.b B6Ng01-305O18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(107,414,762 - 107,415,435)(107,242,330 - 107,243,461)
sequence
gaattccacagtctaaatgtaccaaattttctgtattcattctttggttg
aaggacaactgggttgtttccagcttctgacgattacaaataagaacatg
gagagattataggtctagatgctgatttctggttttgtgtgtgttggata
gatgttttcattcttgggttatatttctgatctagtcttttggcttgagt
tgcagatggtagaattgaggatgtctggcagagttgggggctggatgttt
gatgtcctagatggcctctggtccaataggggtttgctacccaaattgag
agctggagttctagtgatatgatatgagtagcccccgttctaacttggaa
tactctggggttcaggatgctggcatggcttctagtggagtaagaggctt
tcgccagaggtgttgattggaatatggttatttttatatcttaagtcaaa
acaatcgtcatagtggcagaatagatggtttactaggtagatattcctgg
tataaagcactacaattctgattcaatctctagtacacacttggttgact
gtgagagttctctgacctccactcattgccatgggatacacacacacaaa
ctcacacatgaaatatatatagatatagagatatagagatatagatatag
atatagatagatagatagatagat

gaattctcacctgaggaataccgaaatgatgtatttttgttaaccaaaag
ttccatcattctcagctttagaaaattgatcccagtcaggtgtctcatag
ctctggaatgcattataacttactctggcatacctctatgctctgctgcc
tccaaaacaaaggcaattcaagaacaaaggagtatctagctggatagtca
gggagcaggggcaacatgggataccatctcacctaacattttttataaat
gtattattagcaattagaacaatgttagttccaaagaggtaatgaagaga
tgggagatatattgtgcaagtatctaaagtcagagcagaattaaaataca
tgtgtaggagtttctcagatacagtgaatctcccagacaaatgtcccaag
acagggatatgtctgccatcattcagaacatgtgtaccataatagaagag
aaaaaatttttattagaaccaaggaaaacccagtaaaagaaaagagtttg
actttgcaggatattagaaaaactccactgattactctgatgatatgtgg
gagctacagtggtgttgtagccaaggaattaaatcgtctgattgcatagt
tcaaaaattatttcaagtgcaaagagcctggatatgatccttaatgaagg
agtataatcactttccttaaaagtaagggaacacttaatacactggtagt
taggaagcctgtcatccagacatgggagttattatgactttgttatccat
gatcattagctaattatagcaggatagtttcttctctgttaatggattta
gcagccttaaagattagagtgttgaaataatgggtcagagcaacctcctt
gctataaggaatcacatcacactgccaaaattacaacagtcatttaaatc
ctgtttctctctttaattaatgcttctttaaggatgatattatgtatcaa
tgggcctattcaagaccttgaatcaagttcctctttttttttcagtctca
cagctgcagaacaattcctggcaaatctggtctctgtcttgtctgcagta
cttctatagctaataccgatacttatatcacagataaaaaaaacctttta
tttttgcaataaaatccaaataa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_107414762_107415435
seq2: B6Ng01-305O18.b_50_723 (reverse)

seq1  ATCTATCTATCTATCTATCTATATCTATATCTATATCTCTATATCTCTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCTATCTATCTATCTATATCTATATCTATATCTCTATATCTCTAT  50

seq1  ATCTATATATATTTCATGTGTGAGTTTGTGTGTGTGTATCCCATGGCAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATATATATTTCATGTGTGAGTTTGTGTGTGTGTATCCCATGGCAAT  100

seq1  GAGTGGAGGTCAGAGAACTCTCACAGTCAACCAAGTGTGTACTAGAGATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGAGGTCAGAGAACTCTCACAGTCAACCAAGTGTGTACTAGAGATT  150

seq1  GAATCAGAATTGTAGTGCTTTATACCAGGAATATCTACCTAGTAAACCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCAGAATTGTAGTGCTTTATACCAGGAATATCTACCTAGTAAACCAT  200

seq1  CTATTCTGCCACTATGACGATTGTTTTGACTTAAGATATAAAAATAACCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCTGCCACTATGACGATTGTTTTGACTTAAGATATAAAAATAACCA  250

seq1  TATTCCAATCAACACCTCTGGCGAAAGCCTCTTACTCCACTAGAAGCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCCAATCAACACCTCTGGCGAAAGCCTCTTACTCCACTAGAAGCCAT  300

seq1  GCCAGCATCCTGAACCCCAGAGTATTCCAAGTTAGAACGGGGGCTACTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCATCCTGAACCCCAGAGTATTCCAAGTTAGAACGGGGGCTACTCA  350

seq1  TATCATATCACTAGAACTCCAGCTCTCAATTTGGGTAGCAAACCCCTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATATCACTAGAACTCCAGCTCTCAATTTGGGTAGCAAACCCCTATT  400

seq1  GGACCAGAGGCCATCTAGGACATCAAACATCCAGCCCCCAACTCTGCCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCAGAGGCCATCTAGGACATCAAACATCCAGCCCCCAACTCTGCCAG  450

seq1  ACATCCTCAATTCTACCATCTGCAACTCAAGCCAAAAGACTAGATCAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCTCAATTCTACCATCTGCAACTCAAGCCAAAAGACTAGATCAGAA  500

seq1  ATATAACCCAAGAATGAAAACATCTATCCAACACACACAAAACCAGAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAACCCAAGAATGAAAACATCTATCCAACACACACAAAACCAGAAAT  550

seq1  CAGCATCTAGACCTATAATCTCTCCATGTTCTTATTTGTAATCGTCAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATCTAGACCTATAATCTCTCCATGTTCTTATTTGTAATCGTCAGAA  600

seq1  GCTGGAAACAACCCAGTTGTCCTTCAACCAAAGAATGAATACAGAAAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAAACAACCCAGTTGTCCTTCAACCAAAGAATGAATACAGAAAATT  650

seq1  TGGTACATTTAGACTGTGGAATTC  674
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTACATTTAGACTGTGGAATTC  674


seq1: chr14_107242330_107243461
seq2: B6Ng01-305O18.g_68_1190

seq1  GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAAATGATGTATTTTTGTTAACCAAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAAATGATGTATTTTTGTTAACCAAAAG  50

seq1  TTCCATCATTCTCAGCTTTAGAAAATTGATCCCAGTCAGGTGTCTCATAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATCATTCTCAGCTTTAGAAAATTGATCCCAGTCAGGTGTCTCATAG  100

seq1  CTCTGGAATGCATTATAACTTACTCTGGCATACCTCTATGCTCTGCTGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGAATGCATTATAACTTACTCTGGCATACCTCTATGCTCTGCTGCC  150

seq1  TCCAAAACAAAGGCAATTCAAGAACAAAGGAGTATCTAGCTGGATAGTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAACAAAGGCAATTCAAGAACAAAGGAGTATCTAGCTGGATAGTCA  200

seq1  GGGAGCAGGGGCAACATGGGATACCATCTCACCTAACATTTTTTATAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCAGGGGCAACATGGGATACCATCTCACCTAACATTTTTTATAAAT  250

seq1  GTATTATTAGCAATTAGAACAATGTTAGTTCCAAAGAGGTAATGAAGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTATTAGCAATTAGAACAATGTTAGTTCCAAAGAGGTAATGAAGAGA  300

seq1  TGGGAGATATATTGTGCAAGTATCTAAAGTCAGAGCAGAATTAAAATACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGATATATTGTGCAAGTATCTAAAGTCAGAGCAGAATTAAAATACA  350

seq1  TGTGTAGGAGTTTCTCAGATACAGTGAATCTCCCAGACAAATGTCCCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAGGAGTTTCTCAGATACAGTGAATCTCCCAGACAAATGTCCCAAG  400

seq1  ACAGGGATATGTCTGCCATCATTCAGAACATGTGTACCATAATAGAAGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGATATGTCTGCCATCATTCAGAACATGTGTACCATAATAGAAGAG  450

seq1  AAAAAATTTTTATTAGAACCAAGGAAAACCCAGTAAAAGAAAAGAGTTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATTTTTATTAGAACCAAGGAAAACCCAGTAAAAGAAAAGAGTTTG  500

seq1  ACTTTGCAGGATATTAGAAAAACTCCACTGATTACTCTGATGATATGTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGCAGGATATTAGAAAAACTCCACTGATTACTCTGATGATATGTGG  550

seq1  GAGCTACAGTGGTGTTGTAGCCAAGGAATTAAATCGTCTGATTGCATAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTACAGTGGTGTTGTAGCCAAGGAATTAAATCGTCTGATTGCATAGT  600

seq1  TCAAAAATTATTTCAAGTGCAAAGAGCCTGGATATGATCCTTAATGAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAATTATTTCAAGTGCAAAGAGCCTGGATATGATCCTTAATGAAGG  650

seq1  AGTATAATCACTTTCCTTAAAAGTAAGGGAACACTTAATACACTGGTAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATAATCACTTTCCTTAAAAGTAAGGGAACACTTAATACACTGGTAGT  700

seq1  TAGGAAGCCTGTCATCCAGACATGGGAGTTATTATGACTTTGTTATCCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAGCCTGTCATCCAGACATGGGAGTTATTATGACTTTGTTATCCAT  750

seq1  GATCATTAGCTAATTATAGCAGGATAGTTTCTTCTCTGTTAATGGATTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATTAGCTAATTATAGCAGGATAGTTTCTTCTCTGTTAATGGATTTA  800

seq1  GCAGCCTTAAAGATTAGAGTGTTGAAATAATGGGTCAGAGCAACCTCCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCTTAAAGATTAGAGTGTTGAAATAATGGGTCAGAGCAACCTCCTT  850

seq1  GCTATAAGGAATCACATCACACTGCCAAAATTACAACAGTCATTTAAATC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATAAGGAATCACATCACACTGCCAAAATTACAACAGTCATTTAAATC  900

seq1  CTGTTTCTCTCTTTAATTAATGCTTCTTTAAGGATGATATTATGTATCAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTCTCTCTTTAATTAATGCTTCTTTAAGGATGATATTATGTATCAA  950

seq1  T-GGCCTATTCAAGACCTTGAATCAAGTTCCTC-TTTTTTTTCAGGTTCT  998
      | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||
seq2  TGGGCCTATTCAAGACCTTGAATCAAGTTCCTCTTTTTTTTTCAG--TCT  998

seq1  CACAGCTGCAG-ACAAATCCTGGCAAATCCTGGTCTCTGTTCCTTGTTCT  1047
      ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||
seq2  CACAGCTGCAGAACAATTCCTGGCAAAT-CTGGTCTCTGT--CTTG-TCT  1044

seq1  GCAGTAACTTCTATAGTTAATACCGATTAACCTTATATCACAGATAAAAA  1097
      ||||| |||||||||| ||||||||||    |||||||||||||| ||||
seq2  GCAGT-ACTTCTATAGCTAATACCGAT---ACTTATATCACAGAT-AAAA  1089

seq1  AAAAACTTTTATTTTTGCAATAAAAATCAAAATAA  1132
      |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||
seq2  AAAACCTTTTATTTTTGCAAT-AAAATCCAAATAA  1123


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |