BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-312B11
Chromosome14 (Build37)
Map Location 102,790,304 - 102,905,501
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC669278
Upstream geneTbc1d4, Commd6, Uchl3, Lmo7, LOC100043795, LOC545567
Downstream geneKctd12, LOC668699, Irg1, Cln5, Fbxl3, LOC100043441, Phr1, LOC100043797
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-312B11.bB6Ng01-312B11.g
ACCGA103644GA103645
length968892
definitionB6Ng01-312B11.b B6Ng01-312B11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(102,904,532 - 102,905,501)(102,790,304 - 102,791,194)
sequence
gaattcacctctgactagccaaaagtttgctaacatctagaatctgaaaa
gaacagttgaagtggtgttaaaggaaagtgtggattcaatcaacaactga
aatcgggtattcctgcccagagtgtgatgcatccacgtagattagtctct
tgctgaataaagaattttagtgtttctcatgtgaaccacacagttctctt
gtggagacaaaccaagttgggacagacttgatttcattttccttagaaac
aagtacaaaagaaataatttgaggcctggataaaaatgtcttataaacat
acaattacattttggctttctgcagactcaactcattaagccatgagtga
ttgcagatgttgtggtcagattctcctggccaaagatttggctactcagg
ttatcctcaagggaaactggcaaacccaatggtggtatttttagaacaag
agggctgaaggagtcacccagggtagttcatgtgtttgtgtgtaataaga
atagcatcacactccaagctgtcatttaattcataaccaaatgcctgtga
atcaaatgatactttactatgtggagtcaagacagcagcaagaggtgttg
gatgtcggagaaagctgtagcaagcagagagtgttttacccatctgtgca
tgctctagtggggaagttaactgttttgtcacatgatatacttaatatag
tattgataacagaagcctaataaatagtttttgaaatatgtctcattatg
atggatctataagagatagttcacgaggaagtaacttaaaaatagaaaca
aagacatatgccatgggaatttatcttctagaaacagttgaaacttcaga
cttagtgtattcccagagggattcatagtgaaagccagaaagttaggcaa
aaatcttacaaaataatagttcagttttgttcaccaagtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtatgtatata
gaattcacaaaggacagagatttgtcatcaggttgagctggggatgggta
gaagaaaaaaacttattattgtggtaagctatgcctatggctctttcatc
aaacatcagcaaacatataacttctgtattgcttttgttaagaaatgctg
tatctcctacctttcaaacggggaaggaagattgatattgtgatttcttt
gcttgcaactcaattctcaaaaagtttccatatatatatagaactttgga
tttattgtgattgtttttgcgtggatttctaagtgaaacagaaattctgc
taagggcacagggagaaggtagttttcaaaagcactgcgcaaattgccga
ctgctccctcagccaactttggaaaaaggactctatttccctctgtactt
cattcaatttcctgactcataaatgaagtctgaaaatgatgacacctgct
gtccacatgtcacaaaatccagcctcagagcagctgtgtgactttatgct
aaaacgggatttatcttgaaaacctatggccaaatgttaaacaaataatc
tctggaaaagtttaagaccacagtgaacgacatctggtgactcaaactaa
gcttgtccctatgaatgagacccagaaccctagtggcaaggtgcagagcc
atcctggctgaaaacagcctgaccttttcagcattgctgggatcctgggg
acaagatgcacaaaatctccctctttctattacctttctcatcttctgtg
tcatcgtaacttaatgtcagagagtttgttaaaataaaaatgcatcaaac
agatatcttcacttttgggtatatcgttttatgagacttaaaattaaaat
aatacatactcctattaatatacttggtgtgtgtgtgtgtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_102904532_102905501
seq2: B6Ng01-312B11.b_43_1010 (reverse)

seq1  TATATACATACACACACACACACACACACACTTGGTGAAC-AAACTGAAC  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TATATACATACACACACACACACACACACACTTGGTGAACAAAACTGAAC  50

seq1  TATTTATTTTGTAAGATTTTTGCCTAACTTTCTGGCTTTCACTATTGAAT  99
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TA-TTATTTTGTAAGATTTTTGCCTAACTTTCTGGCTTTCACTA-TGAAT  98

seq1  CCCTCTGGGAATACACTAAGTCTGAAGTTTCAACTGTTTCTAGAAGATAA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGGGAATACACTAAGTCTGAAGTTTCAACTGTTTCTAGAAGATAA  148

seq1  ATTCCCATGGCATATGTCTTTGTTTTCTATTTTTAAGTTACTTCCTCCTA  199
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | 
seq2  ATTCCCATGGCATATGTCTTTG-TTTCTATTTTTAAGTTACTTCCTCGTG  197

seq1  AACTATCTCTTATAGATCCATCATAATGAGACATATTTCAAAAACTATTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATCTCTTATAGATCCATCATAATGAGACATATTTCAAAAACTATTT  247

seq1  ATTAGGCTTCTGTTATCAATACTATATTAAGTATATCATGTGACAAAACA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGCTTCTGTTATCAATACTATATTAAGTATATCATGTGACAAAACA  297

seq1  GTTAACTTCCCCACTAGAGCATGCACAGATGGGTAAAACACTCTCTGCTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACTTCCCCACTAGAGCATGCACAGATGGGTAAAACACTCTCTGCTT  347

seq1  GCTACAGCTTTCTCCGACATCCAACACCTCTTGCTGCTGTCTTGACTCCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACAGCTTTCTCCGACATCCAACACCTCTTGCTGCTGTCTTGACTCCA  397

seq1  CATAGTAAAGTATCATTTGATTCACAGGCATTTGGTTATGAATTAAATGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTAAAGTATCATTTGATTCACAGGCATTTGGTTATGAATTAAATGA  447

seq1  CAGCTTGGAGTGTGATGCTATTCTTATTACACACAAACACATGAACTACC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTGGAGTGTGATGCTATTCTTATTACACACAAACACATGAACTACC  497

seq1  CTGGGTGACTCCTTCAGCCCTCTTGTTCTAAAAATACCACCATTGGGTTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTGACTCCTTCAGCCCTCTTGTTCTAAAAATACCACCATTGGGTTT  547

seq1  GCCAGTTTCCCTTGAGGATAACCTGAGTAGCCAAATCTTTGGCCAGGAGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTTTCCCTTGAGGATAACCTGAGTAGCCAAATCTTTGGCCAGGAGA  597

seq1  ATCTGACCACAACATCTGCAATCACTCATGGCTTAATGAGTTGAGTCTGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGACCACAACATCTGCAATCACTCATGGCTTAATGAGTTGAGTCTGC  647

seq1  AGAAAGCCAAAATGTAATTGTATGTTTATAAGACATTTTTATCCAGGCCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGCCAAAATGTAATTGTATGTTTATAAGACATTTTTATCCAGGCCT  697

seq1  CAAATTATTTCTTTTGTACTTGTTTCTAAGGAAAATGAAATCAAGTCTGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTATTTCTTTTGTACTTGTTTCTAAGGAAAATGAAATCAAGTCTGT  747

seq1  CCCAACTTGGTTTGTCTCCACAAGAGAACTGTGTGGTTCACATGAGAAAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACTTGGTTTGTCTCCACAAGAGAACTGTGTGGTTCACATGAGAAAC  797

seq1  ACTAAAATTCTTTATTCAGCAAGAGACTAATCTACGTGGATGCATCACAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAATTCTTTATTCAGCAAGAGACTAATCTACGTGGATGCATCACAC  847

seq1  TCTGGGCAGGAATACCCGATTTCAGTTGTTGATTGAATCCACACTTTCCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGCAGGAATACCCGATTTCAGTTGTTGATTGAATCCACACTTTCCT  897

seq1  TTAACACCACTTCAACTGTTCTTTTCAGATTCTAGATGTTAGCAAACTTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACACCACTTCAACTGTTCTTTTCAGATTCTAGATGTTAGCAAACTTT  947

seq1  TGGCTAGTCAGAGGTGAATTC  970
      |||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTAGTCAGAGGTGAATTC  968

seq1: chr14_102790304_102791194
seq2: B6Ng01-312B11.g_68_958

seq1  GAATTCACAAAGGACAGAGATTTGTCATCAGGTTGAGCTGGGGATGGGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAAAGGACAGAGATTTGTCATCAGGTTGAGCTGGGGATGGGTA  50

seq1  GAAGAAAAAAACTTATTATTGTGGTAAGCTATGCCTATGGCTCTTTCATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAAAAAACTTATTATTGTGGTAAGCTATGCCTATGGCTCTTTCATC  100

seq1  AAACATCAGCAAACATATAACTTCTGTATTGCTTTTGTTAAGAAATGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATCAGCAAACATATAACTTCTGTATTGCTTTTGTTAAGAAATGCTG  150

seq1  TATCTCCTACCTTTCAAACGGGGAAGGAAGATTGATATTGTGATTTCTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCCTACCTTTCAAACGGGGAAGGAAGATTGATATTGTGATTTCTTT  200

seq1  GCTTGCAACTCAATTCTCAGAAAGTTTCCATATATATATAGAACTTTGGA  250
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCAACTCAATTCTCAAAAAGTTTCCATATATATATAGAACTTTGGA  250

seq1  TTTATTGTGATTGTTTTTGCGTGGATTTCTAAGTGAAACAGAAATTCTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTGTGATTGTTTTTGCGTGGATTTCTAAGTGAAACAGAAATTCTGC  300

seq1  TAAGGGCACAGGGAGAAGGTAGTTTTCAAAAGCACTGCGCAAATTGCCGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGGCACAGGGAGAAGGTAGTTTTCAAAAGCACTGCGCAAATTGCCGA  350

seq1  CTGCTCCCTCAGCCAACTTTGGAAAAAGGACTCTATTTCCCTCTGTACTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCCCTCAGCCAACTTTGGAAAAAGGACTCTATTTCCCTCTGTACTT  400

seq1  CATTCAATTTCCTGACTCAGAAATGAAGTCTGAAAATGATGACACCTGCT  450
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCAATTTCCTGACTCATAAATGAAGTCTGAAAATGATGACACCTGCT  450

seq1  GTCCACATGTCACAAAATCCAGCCTCAGAGCAGCTGTGTGACTTTATGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCACATGTCACAAAATCCAGCCTCAGAGCAGCTGTGTGACTTTATGCT  500

seq1  AAAACGGGATTTATCTTGAAAACCTATGGCCAAATGTTAAACAAATAATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACGGGATTTATCTTGAAAACCTATGGCCAAATGTTAAACAAATAATC  550

seq1  TCTGGAAAAGTTTAAGACCACAGTGAACGACATCTGGTGACTCAAACTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAAAAGTTTAAGACCACAGTGAACGACATCTGGTGACTCAAACTAA  600

seq1  GCTTGTCCCTATGAATGAGACCCAGAACCCTAGTGGCAAGGTGCAGAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTCCCTATGAATGAGACCCAGAACCCTAGTGGCAAGGTGCAGAGCC  650

seq1  ATCCTGGCTGAAAACAGCCTGACCTTTTCAGCATTGCTGGGATCCTGGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGGCTGAAAACAGCCTGACCTTTTCAGCATTGCTGGGATCCTGGGG  700

seq1  ACAAGATGCACAAAATCTCCCTCTTTCTATTACCTTTCTCATCTTCTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGATGCACAAAATCTCCCTCTTTCTATTACCTTTCTCATCTTCTGTG  750

seq1  TCATCGTAACTTAATGTCAGAGAGTTTGTTAAAATAAAAATGCATCAAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCGTAACTTAATGTCAGAGAGTTTGTTAAAATAAAAATGCATCAAAC  800

seq1  AGATATCTTCACTTTTGGGTATATCGTTTTATGAGACTTAAAATTAAAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATCTTCACTTTTGGGTATATCGTTTTATGAGACTTAAAATTAAAAT  850

seq1  AATACATACTCCTATTAATATACTTGGTGTGTGTGTGTGTG  891
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACATACTCCTATTAATATACTTGGTGTGTGTGTGTGTG  891