BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-313L15
Chromosome14 (Build37)
Map Location 26,094,985 - 26,236,799
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039335, E330034G19Rik, LOC669325, Polr3a, Rps24, LOC669315, LOC100039411
Downstream geneZmiz1, I920194n01, LOC100039007, 4931406H21Rik, Ppif, 2310047A01Rik, Anxa11, Plac9, D14Ertd449e, Cphx, 1110051B16Rik, LOC100039468, LOC100039484, LOC100039175, LOC100039192, LOC100039213, LOC100039227, LOC100039503, LOC100039246, LOC100039257, LOC100039280, LOC100039293, LOC100039527, LOC100039538, 4933413J09Rik, Slmap
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-313L15.bB6Ng01-313L15.g
ACCGA104857GA104858
length1,1311,147
definitionB6Ng01-313L15.b B6Ng01-313L15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,094,985 - 26,096,120)(26,235,664 - 26,236,799)
sequence
gaattcccattgacagggtagtcactgtagtcccctttaaacagtacagc
atgatggcagaagtcaggaactgacatgggagaacgcagtgcacagtggc
cctcactcggcctttaccagagtttatttacatgaatttgggcatcagtt
ggtgactggctctatcaggatctctagcatgtataggctgctgtagctgc
tacctcaaacaggattcagaactgtctggtcaccaggaaggaagtcctac
ttgccacccctccagagctataccttcctttaaacccttaagccctggcc
atctctagtgtgttctctactgccacaactgtgtcccttaaaggctgtta
cggatgcaggcaatcccagcactcttgatgaaactacgggaggataacaa
ggtccaggtcagcttggctacatagccagaccttgtctcaaagaaaaaag
gaaaggaggaagagggagagaagcgagcagtgagagagagagcaaggggg
gataaagagggaaagaagacataaaagacgaaaggaaagagagaccccct
tttcattatctagcatggcactctgctcagcatgctgctagtatcagtag
ctcactctttttgttgctgcatagtactccactgaatgagccccatagcc
atctatgatgtgtcaacggagcctttaaaaataacatgtgattagagttt
tatttaaggagtttttagaatcaattcattgaggagggaagactcacctt
aagtgtggaagtgtcaccattccaggatctgaaaaaaaaggaagagtgtc
agttgagccctgggattcctcagtgtcggcctcactgactgcagatacag
tgtaaccagatgtctcacactcccgctggcttcctgacccagataaactg
cactcccactatgaggcaagtcaaacccttccctctctaagtttctttgt
tggtatcttcttaaaacatgagaaaagtggttagtaggctgccccatgtc
catccaccccagagagctgcctgattggttctgatggtgcacaagggcac
caatattcagaactcagaaaacccagagctcctttctcagaagagaaagg
ccagacttctgactggaatgtatgtacattc
gaattcttgcagggaagcggcaccttccaggcatgaggctctgcttccat
gcagtcaagcggctccaggtctttatttgagaggaatgtatctggagctg
gctagcagattagctgaggtgggagtgggacaatgccatgcccttatgcc
cctcaggggtggaagggtgcgttcttactcccctgctgccctttcccaag
cctgggtaccaaatcgtgtccacaggcttgtcatgcagcagctgtttgaa
gccagttcttctgtagggacacatgaatgactcccagtgtggctagtgga
gcaccaagaagctcacttgtaactggaactgactagaaacctagtttcag
gtctgccccgatccccgagtccgaatctgctagaatctgtctacccatgt
tcataaagcttcttcttgtgttgagtggtttctacactgccctgctctca
agaaaaacatgatatttcccccaggagaatccaaggtggggaaagaaaga
aagaaagaaagaaagaaagagagagagagagagagagagagagagagaga
gagagagagagagagagaaagaaagaaaggaagaggtgggtatttccaat
gggatgggacctactgaagctattaacttgatgatcttaccagcaaccta
ccttcccacaaccatccatctacccatccacccacccacccatccatcca
cttatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccacatacc
tatccatttacttactcacacatttatctacccactcacctgttcatcca
ttaacccacccattcacccactcatccatatacccacatacccattcatt
catattcattcattcatatatacatacattcattctacctaatgcatata
tcaagccacccacctacccattcaatcatccatccatcccacatcattcc
attgcattgatggtttttcatctaatacatgaacaggatggtcctagcaa
ttggaattggataatcctcttattcccaagttttcttagaagtagccacc
atgtgtcggggagacatggaatttggggctccagggtgatttcttcgaac
cgactgtttggcatggtgtccaacaaggatgtaaaaagggtgaattt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_26094985_26096120
seq2: B6Ng01-313L15.b_48_1178

seq1  GAATTCCCATTGACAGGGTAGTCACTGTAGTCCCCTTTAAACAGTACAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCATTGACAGGGTAGTCACTGTAGTCCCCTTTAAACAGTACAGC  50

seq1  ATGATGGCAGAAGTCAGGAACTGACATGGGAGAACGCAGTGCACAGTGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGGCAGAAGTCAGGAACTGACATGGGAGAACGCAGTGCACAGTGGC  100

seq1  CCTCACTCGGCCTTTACCAGAGTTTATTTACATGAATTTGGGCATCAGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACTCGGCCTTTACCAGAGTTTATTTACATGAATTTGGGCATCAGTT  150

seq1  GGTGACTGGCTCTATCAGGATCTCTAGCATGTATAGGCTGCTGTAGCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGACTGGCTCTATCAGGATCTCTAGCATGTATAGGCTGCTGTAGCTGC  200

seq1  TACCTCAAACAGGATTCAGAACTGTCTGGTCACCAGGAAGGAAGTCCTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCAAACAGGATTCAGAACTGTCTGGTCACCAGGAAGGAAGTCCTAC  250

seq1  TTGCCACCCCTCCAGAGCTATACCTTCCTTTAAACCCTTAAGCCCTGGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCACCCCTCCAGAGCTATACCTTCCTTTAAACCCTTAAGCCCTGGCC  300

seq1  ATCTCTAGTGTGTTCTCTACTGCCACAACTGTGTCCCTTAAAGGCTGTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTAGTGTGTTCTCTACTGCCACAACTGTGTCCCTTAAAGGCTGTTA  350

seq1  CGGATGCAGGCAATCCCAGCACTCTTGATGAAACTACGGGAGGATAACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGATGCAGGCAATCCCAGCACTCTTGATGAAACTACGGGAGGATAACAA  400

seq1  GGTCCAGGTCAGCTTGGCTACATAGCCAGACCTTGTCTCAAAGAAAAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCAGGTCAGCTTGGCTACATAGCCAGACCTTGTCTCAAAGAAAAAAG  450

seq1  GAAAGGAGGAAGAGGGAGAGAAGCGAGCAGTGAGAGAGAGAGCAAGGGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGAGGAAGAGGGAGAGAAGCGAGCAGTGAGAGAGAGAGCAAGGGGG  500

seq1  GATAAAGAGGGAAAGAAGACATAAAAGACGAAAGGAAAGAGAGACCCCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAGAGGGAAAGAAGACATAAAAGACGAAAGGAAAGAGAGACCCCCT  550

seq1  TTTCATTATCTAGCATGGCACTCTGCTCAGCATGCTGCTAGTATCAGTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTATCTAGCATGGCACTCTGCTCAGCATGCTGCTAGTATCAGTAG  600

seq1  CTCACTCTTTTTGTTGCTGCATAGTACTCCACTGAATGAGCCCCATAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTCTTTTTGTTGCTGCATAGTACTCCACTGAATGAGCCCCATAGCC  650

seq1  ATCTATGATGTGTCAACGGAGCCTTTAAAAATAACATGTGATTAGAGTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATGATGTGTCAACGGAGCCTTTAAAAATAACATGTGATTAGAGTTT  700

seq1  TATTTAAGGAGTTTTTAGAATCAATTCATTGAGGAGGGAAGACTCACCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAAGGAGTTTTTAGAATCAATTCATTGAGGAGGGAAGACTCACCTT  750

seq1  AAGTGTGGAAGTGTCACCATTCCAGGATCTGAAAAAAAAGGAAGAGTGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTGGAAGTGTCACCATTCCAGGATCTGAAAAAAAAGGAAGAGTGTC  800

seq1  AGTTGAGCCCTGGGATTCCTCAGTGTCGGCCTCACTGACTGCAGATACAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGAGCCCTGGGATTCCTCAGTGTCGGCCTCACTGACTGCAGATACAG  850

seq1  TGTAACCAGATGTCTCACACTCCCGCTGGCTTCCTGACCCAGATAAACTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAACCAGATGTCTCACACTCCCGCTGGCTTCCTGACCCAGATAAACTG  900

seq1  CACTCCCACTATGAGGCAAGTCAAACCCTTCCCTCTCTAAGTTTCTTTTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CACTCCCACTATGAGGCAAGTCAAACCCTTCCCTCTCTAAGTTTC-TTTG  949

seq1  TTGGTATCTTCTTAAAACAATGAGAAAAGTGGTTAGTAGGCTGCCCCATG  1000
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTATCTTCTTAAAAC-ATGAGAAAAGTGGTTAGTAGGCTGCCCCATG  998

seq1  TCCCATCCACCCCAGAGAGCTGCCTGATTGGTTCTGATGGTGCACAAGGG  1050
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  T-CCATCCACCCCAGAGAGCTGCCTGATTGGTTCTGATGGTGCACAAGGG  1047

seq1  CACCAATATTTCAGGAACTCAGAAAACCCAGAGCTCC-TTCTCAGAAGAG  1099
      |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CACCAATA-TTCA-GAACTCAGAAAACCCAGAGCTCCTTTCTCAGAAGAG  1095

seq1  AAA-GCCAGACTTCTGACTGGAGTTGTATGGTACATTC  1136
      ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||
seq2  AAAGGCCAGACTTCTGACTGGA-ATGTAT-GTACATTC  1131

seq1: chr14_26235664_26236799
seq2: B6Ng01-313L15.g_71_1217 (reverse)

seq1  AAATTCACCCATTTTCCATCCTTGCTTGGACA-CATG-CAAACAGCTGGT  48
      |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||  |||
seq2  AAATTCACCCTTTTTACATCCTTG-TTGGACACCATGCCAAACAGTCGGT  49

seq1  CTGAAG-AATCACCAGGGAGCAC--AAATCCATGTCT-CCCGACACATGG  94
        |||| |||||||  ||||| |  || ||||||||| ||||||||||||
seq2  TCGAAGAAATCACCCTGGAGCCCCAAATTCCATGTCTCCCCGACACATGG  99

seq1  CTGCTACTTCTAGGAAAAC-TGGGGATAGAGGGATTTTCC-ATTTCAATT  142
        |||||||||| |||||| |||| |||   ||||| ||| ||| |||||
seq2  TGGCTACTTCTAAGAAAACTTGGGAATAAGAGGATTATCCAATTCCAATT  149

seq1  GCTAGGTACATCTTG-TCATGTATTAGATGAAAA--CATCCATGCAATGG  189
      ||||||  |||| || ||||||||||||||||||  |||| |||||||||
seq2  GCTAGGACCATCCTGTTCATGTATTAGATGAAAAACCATCAATGCAATGG  199

seq1  ATGGATGGTGGATGGATGGATGATTGAATGGGTAGGTGGGTGGCTGAATA  239
      |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
seq2  AATGATGTGGGATGGATGGATGATTGAATGGGTAGGTGGGTGGCTTGATA  249

seq1  TATGCA-TAGGTAGAATGAATGTATGTATATATGAATGAATGAATATGAA  288
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCATTAGGTAGAATGAATGTATGTATATATGAATGAATGAATATGAA  299

seq1  TGAATGGGTATGTGGGTATATGGATGAGTGGGTGAATGGGTGGGTTAATG  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGGGTATGTGGGTATATGGATGAGTGGGTGAATGGGTGGGTTAATG  349

seq1  GATGAACAGGTGAGTGGGTAGATAAATGTGTGAGTAAGTAAATGGATAGG  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAACAGGTGAGTGGGTAGATAAATGTGTGAGTAAGTAAATGGATAGG  399

seq1  TATGTGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATAAGTG  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATAAGTG  449

seq1  GATGGATGGGTGGGTGGGTGGATGGGTAGATGGATGGTTGTGGGAAGGTA  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGATGGGTGGGTGGGTGGATGGGTAGATGGATGGTTGTGGGAAGGTA  499

seq1  GGTTGCTGGTAAGATCATCAAGTTAATAGCTTCAGTAGGTCCCATCCCAT  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGCTGGTAAGATCATCAAGTTAATAGCTTCAGTAGGTCCCATCCCAT  549

seq1  TGGAAATACCCACCTCTTCCTTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAATACCCACCTCTTCCTTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  599

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC  649

seq1  TTTCTTTCCCCACCTTGGATTCTCCTGGGGGAAATATCATGTTTTTCTTG  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTCCCCACCTTGGATTCTCCTGGGGGAAATATCATGTTTTTCTTG  699

seq1  AGAGCAGGGCAGTGTAGAAACCACTCAACACAAGAAGAAGCTTTATGAAC  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAGGGCAGTGTAGAAACCACTCAACACAAGAAGAAGCTTTATGAAC  749

seq1  ATGGGTAGACAGATTCTAGCAGATTCGGACTCGGGGATCGGGGCAGACCT  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTAGACAGATTCTAGCAGATTCGGACTCGGGGATCGGGGCAGACCT  799

seq1  GAAACTAGGTTTCTAGTCAGTTCCAGTTACAAGTGAGCTTCTTGGTGCTC  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTAGGTTTCTAGTCAGTTCCAGTTACAAGTGAGCTTCTTGGTGCTC  849

seq1  CACTAGCCACACTGGGAGTCATTCATGTGTCCCTACAGAAGAACTGGCTT  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAGCCACACTGGGAGTCATTCATGTGTCCCTACAGAAGAACTGGCTT  899

seq1  CAAACAGCTGCTGCATGACAAGCCTGTGGACACGATTTGGTACCCAGGCT  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAGCTGCTGCATGACAAGCCTGTGGACACGATTTGGTACCCAGGCT  949

seq1  TGGGAAAGGGCAGCAGGGGAGTAAGAACGCACCCTTCCACCCCTGAGGGG  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAAGGGCAGCAGGGGAGTAAGAACGCACCCTTCCACCCCTGAGGGG  999

seq1  CATAAGGGCATGGCATTGTCCCACTCCCACCTCAGCTAATCTGCTAGCCA  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAGGGCATGGCATTGTCCCACTCCCACCTCAGCTAATCTGCTAGCCA  1049

seq1  GCTCCAGATACATTCCTCTCAAATAAAGACCTGGAGCCGCTTGACTGCAT  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCAGATACATTCCTCTCAAATAAAGACCTGGAGCCGCTTGACTGCAT  1099

seq1  GGAAGCAGAGCCTCATGCCTGGAAGGTGCCGCTTCCCTGCAAGAATTC  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCAGAGCCTCATGCCTGGAAGGTGCCGCTTCCCTGCAAGAATTC  1147