BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-328O07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 23,565,973 - 23,705,257
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700112E06Rik, LOC665068
Upstream geneDusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, EG665075, EG435392
Downstream geneKcnma1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-328O07.bB6Ng01-328O07.g
ACCGA116030GA116031
length9601,070
definitionB6Ng01-328O07.b B6Ng01-328O07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,565,973 - 23,566,667)(23,704,175 - 23,705,257)
sequence
gaattctttccttgctactcatctggagaacagcatatttaaaagtgtga
cactgctaaataatagtagacatggtttgcaggtaagtgtacctttaact
gatacagtttaaaatgaccagaaaccaaaatgtaaaataaaataaaatga
tgatgatgatgatgacaatgatgatttatttagtgagtattgtcctaagc
agtactcagtttgttactgactcctcataacaacatcaaggaggttcatg
gaatgctctccattaaaaaaataaataaacaaatggtactactaataata
acaaaactaataataaataaacggaaaccaaggctcagagagaccaagaa
aattgcccaaggttgcacatctagtcaagtggcaggtgaaaacagaggga
atcttcgatcctttggtagtctataaagtcccagaagcctattcagatta
gtgatttataaatagaaaaataaaaatattatgagaaagcagaataatct
tcttaaatatcttgctatagagatatgtagggggtcagttttggtgatgt
gaacctttactcatagcagtcaggaggctgagacatgaggattgctgtgt
tcaagatcacctttggatatatagtgtgttccagtctagtctgggctatc
caatgagaccctgtattaaaggaggaggtgggggagagagggaagtactg
tgcctctatctcctaacctccaagtctcagagcgatggtgttctactcag
agggagatgcttgagccacggaggctgcacttctggcatcaagttaggat
gagaagtctgttgccatgactctataagacatcaggggctccaggtcccc
agataggcagtggggatgtctctggtgccaagtgacaatgggataaaggt
ccccattattcccttggtgaaagtgctatggttgtccttcttggtggcat
ctgtgggtga
gaattcaatccccaagacccacatgttataaagagaacagactcacacag
gcctccacatgcatgcgatgacacaagtttgcccctctcacacttaaatg
gatgcacgtaatttaaaaaaaaaaaaagaggagataataaatttcaaata
aaatgattactggatacaatacaagaggtttgaaacctgtaattctaaga
ctgacaccaaggttagggatcagtgcaaatcacaagtaccaggcaattaa
ggagaatgtgtttgttgactgcatcagagcaagccatgttcaggagcttt
ggagatccaactaagggtgtagctgataacaacagtgaatgtgcataata
caatttattttttttattttgtttttttattaggtatttatttcatttac
atttccaatgctatcccaaaagtcccccacccgctctcccacccactccc
ccacccacccactcctacttcttggccctggcattaccctgtactgaggc
agataaagtttgcacgaccaatgggcctctctttccactgatggccaact
agatcatcttctgatacatatgcagctagagacacaagctctggggggta
ctgggtagttcatattgttgttccacctattgggttgcagatccctttag
ctccttggttactttctctagctcctccattggggggtcctgtgattcat
ccaatagctgactgtgagcatccacttctctgtttgctaggccctggcat
agtctcacaagagacagctatatctgggtcctttcagcaaaatctgctag
tgtattcaatagcataataaaaagactattagtttaacataaaatatgaa
aatatgatctctaacgttatattattctattactttcacttattaacatc
atccgtagtagcaatcacatagggactaacgaataggggaaaatatacaa
atatttcaatgtacgatcctctgatcaacatttacctcttttgaagctgt
gagctgatgttaatgctgtagttgttagtctgtgtgagacctatatgaca
tactctgtgtacgtgtatga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_23565973_23566667
seq2: B6Ng01-328O07.b_48_742

seq1  GAATTCTTTCCTTGCTACTCATCTGGAGAACAGCATATTTAAAAGTGTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCCTTGCTACTCATCTGGAGAACAGCATATTTAAAAGTGTGA  50

seq1  CACTGCTAAATAATAGTAGACATGGTTTGCAGGTAAGTGTACCTTTAACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCTAAATAATAGTAGACATGGTTTGCAGGTAAGTGTACCTTTAACT  100

seq1  GATACAGTTTAAAATGACCAGAAACCAAAATGTAAAATAAAATAAAATGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAGTTTAAAATGACCAGAAACCAAAATGTAAAATAAAATAAAATGA  150

seq1  TGATGATGATGATGACAATGATGATTTATTTAGTGAGTATTGTCCTAAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATGATGATGACAATGATGATTTATTTAGTGAGTATTGTCCTAAGC  200

seq1  AGTACTCAGTTTGTTACTGACTCCTCATAACAACATCAAGGAGGTTCATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTCAGTTTGTTACTGACTCCTCATAACAACATCAAGGAGGTTCATG  250

seq1  GAATGCTCTCCATTAAAAAAATAAATAAACAAATGGTACTACTAATAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCTCTCCATTAAAAAAATAAATAAACAAATGGTACTACTAATAATA  300

seq1  ACAAAACTAATAATAAATAAACGGAAACCAAGGCTCAGAGAGACCAAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACTAATAATAAATAAACGGAAACCAAGGCTCAGAGAGACCAAGAA  350

seq1  AATTGCCCAAGGTTGCACATCTAGTCAAGTGGCAGGTGAAAACAGAGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCCCAAGGTTGCACATCTAGTCAAGTGGCAGGTGAAAACAGAGGGA  400

seq1  ATCTTCGATCCTTTGGTAGTCTATAAAGTCCCAGAAGCCTATTCAGATTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCGATCCTTTGGTAGTCTATAAAGTCCCAGAAGCCTATTCAGATTA  450

seq1  GTGATTTATAAATAGAAAAATAAAAATATTATGAGAAAGCAGAATAATCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTTATAAATAGAAAAATAAAAATATTATGAGAAAGCAGAATAATCT  500

seq1  TCTTAAATATCTTGCTATAGAGATATGTAGGGGGTCAGTTTTGGTGATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAATATCTTGCTATAGAGATATGTAGGGGGTCAGTTTTGGTGATGT  550

seq1  GAACCTTTACTCATAGCAGTCAGGAGGCTGAGACATGAGGATTGCTGTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTTTACTCATAGCAGTCAGGAGGCTGAGACATGAGGATTGCTGTGT  600

seq1  TCAAGATCACCTTTGGATATATAGTGTGTTCCAGTCTAGTCTGGGCTATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGATCACCTTTGGATATATAGTGTGTTCCAGTCTAGTCTGGGCTATC  650

seq1  CAATGAGACCCTGTATTAAAGGAGGAGGTGGGGGAGAGAGGGAAG  695
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAGACCCTGTATTAAAGGAGGAGGTGGGGGAGAGAGGGAAG  695

seq1: chr14_23704175_23705257
seq2: B6Ng01-328O07.g_67_1136 (reverse)

seq1  TCATACACAT-CACAGAGTAATGCAAAAAAGGCTCACACAGTAATAAAAA  49
      |||||||| | |||||||||   || | | | ||||||||| | ||| ||
seq2  TCATACACGTACACAGAGTATGTCATATAGGTCTCACACAG-ACTAACAA  49

seq1  CTACAGAATTTAAACATCAAGTCAACAGCTTCAAAAGAGTTAAAATGGTT  99
      |||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||| ||||   |||
seq2  CTACAGCATT--AACATCAGCTC-ACAGCTTCAAAAGAGGTAAA--TGTT  94

seq1  GATCAGAGGATAGTAACATTTGAAAATATTTGTATATTTTCACATATTTT  149
      ||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||| | || || 
seq2  GATCAGAGGATCGT-ACATT--GAAATATTTGTATATTTTCCCCTA-TTC  140

seq1  GTTAGTCCTTATATTAATTACTACTAACTGCTGATTTTAATAACTGAAAG  199
      |||||||| |||  | ||| ||||| || | |||| ||||||| ||||||
seq2  GTTAGTCCCTAT-GTGATTGCTACT-ACGGATGATGTTAATAAGTGAAAG  188

seq1  TAATAGAATAATATAACTTTAAGAGATCATATTTTCATATTTTATGTTAA  249
      ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGAATAATATAACGTT-AGAGATCATATTTTCATATTTTATGTTAA  237

seq1  ACTAATAGTCTTTTAATTATGTTATTGAATACACTAGCAAGATTTTGCTG  299
      |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ACTAATAGTCTTTTTATTATGCTATTGAATACACTAGC-AGATTTTGCTG  286

seq1  AAAGGACCCAGATATAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCCAGGGCCTAGCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGACCCAGATATAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCCAGGGCCTAGCA  336

seq1  AACAGAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGAATCACAGGACCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGAATCACAGGACCC  386

seq1  CCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAACCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAACCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAA  436

seq1  CCCAATAGGTGGAACAACAATATGAACTACCCAGTACCCCCCAGAGCTTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATAGGTGGAACAACAATATGAACTACCCAGTACCCCCCAGAGCTTG  486

seq1  TGTCTCTAGCTGCATATGTATCAGAAGATGATCTAGTTGGCCATCAGTGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTAGCTGCATATGTATCAGAAGATGATCTAGTTGGCCATCAGTGG  536

seq1  AAAGAGAGGCCCATTGGTCGTGCAAACTTTATCTGCCTCAGTACAGGGTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGAGGCCCATTGGTCGTGCAAACTTTATCTGCCTCAGTACAGGGTA  586

seq1  ATGCCAGGGCCAAGAAGTAGGAGTGGGTGGGTGGGGGAGTGGGTGGGAGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAGGGCCAAGAAGTAGGAGTGGGTGGGTGGGGGAGTGGGTGGGAGA  636

seq1  GCGGGTGGGGGACTTTTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAAATAAATA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGGTGGGGGACTTTTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAAATAAATA  686

seq1  CCTAATAAAAAAACAAAATAAAAAAAATAAATTGTATTATGCACATTCAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATAAAAAAACAAAATAAAAAAAATAAATTGTATTATGCACATTCAC  736

seq1  TGTTGTTATCAGCTACACCCTTAGTTGGATCTCCAAAGCTCCTGAACATG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTTATCAGCTACACCCTTAGTTGGATCTCCAAAGCTCCTGAACATG  786

seq1  GCTTGCTCTGATGCAGTCAACAAACACATTCTCCTTAATTGCCTGGTACT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCTCTGATGCAGTCAACAAACACATTCTCCTTAATTGCCTGGTACT  836

seq1  TGTGATTTGCACTGATCCCTAACCTTGGTGTCAGTCTTAGAATTACAGGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATTTGCACTGATCCCTAACCTTGGTGTCAGTCTTAGAATTACAGGT  886

seq1  TTCAAACCTCTTGTATTGTATCCAGTAATCATTTTATTTGAAATTTATTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAACCTCTTGTATTGTATCCAGTAATCATTTTATTTGAAATTTATTA  936

seq1  TCTCCTCTTTTTTTTTTTTTAAATTACGTGCATCCATTTAAGTGTGAGAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTCTTTTTTTTTTTTTAAATTACGTGCATCCATTTAAGTGTGAGAG  986

seq1  GGGCAAACTTGTGTCATCGCATGCATGTGGAGGCCTGTGTGAGTCTGTTC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAACTTGTGTCATCGCATGCATGTGGAGGCCTGTGTGAGTCTGTTC  1036

seq1  TCTTTATAACATGTGGGTCTTGGGGATTGAATTC  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATAACATGTGGGTCTTGGGGATTGAATTC  1070