BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-330A05
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,792,092 - 22,925,038
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp503, 1700112E06Rik, EG665075
Upstream geneVcl, Ap3m1, Adk, Myst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1
Downstream geneEG435392, LOC665068
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-330A05.bB6Ng01-330A05.g
ACCGA116812GA116813
length1,0371,162
definitionB6Ng01-330A05.b B6Ng01-330A05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,792,092 - 22,793,128)(22,923,854 - 22,925,038)
sequence
gaattcttgctgtagtgggcagaggtacaaagtcagagatgtatattgtc
acactgccccttcctctacctcccctaggctatttgctggatgcatccag
aaggtgcagaaactggcactcagaacttggtagaaggcagggagaggctg
ggttaaatcagatctgatcagtctatatcaataggctagggtccagtgtc
aggggcacagaataggcagaatataggactttcatgtagctgagggctcc
ccatatgagctgggctgcctggaacacgcaatggtatgtttgttgtagtg
taaagaatctaaaatgggtgacacaaggggtaccacagtagggtcaaagc
agaggctacacaccccctaaatggtcactcatcaagttcctggcagcaga
catgttccttcctcattagcagggaggtgacttctgcttccatggaatag
ccccatggcaagctggtaaatgtccagaaaattgctctctgggaaataag
tgctttcagtttctattacagtgtttgacaattgccttagtgtaaatatt
cctagcttgatcatgctaccaatataacagtactgagtgaggtatgggga
aaaatgtgcccaattggtgtttgggccagcaaagctgattctggcatacc
actgggtggggactgaccttggggtcttggggaacagaggaatatgtggc
ctcctcataactagaaggaaaggccaatgtgctgcacattgaagtacaga
aacagcagcctcaatgtaagtcctagctctgtgtcctcttggctgtgtgg
ccttgaacgagtcattccatctctgccatgtgttcgttttttcatctgaa
aaatggggctatcacagttctgagggtcagtgatagtgaatcctgctctg
tgggttgacccagacatcacacatttactgtttaccacatggaagatttg
tgatgtcttcatggtcatttagaaaggaaaacctgacagtccttagggga
ttgtcttaaccagcttgtttcatgttgaaatcttgga
gaattctcacgcaactttcccatcggtcaagacattgttattgttatttt
tcaaactaaaaaaaacaaaaaaacaaaacaaaaaacagacaagtatattt
tcactgtagaacattgagaaaatataaaatccactaagaggaagagataa
atactcagaatcatgctatcaggatcccccaaaaaatgtttttaaggagt
ttctttatttttaactatggatatgtatatctatgcatgaatgtacatga
gtgcaggtacctatggaggacagaagccttgggtccttggagctggggtt
acaagcagttatgagctgccatgtgggtactgggagcctttgcaagaaag
gcaaatgctcttaactctaagccatctcatcagctcaccacagtccattc
ttataacttccatcaaatgatgttactcatcttgtaatcttttcacttca
gggcttcaaggcaacagaaggctcgtggactctacccagccactcttact
tcaaagtctgtctgcatattatttaaaattcggaaatcaaccaataattc
actatggggattaaaacaataaaaagcactggaaagcaaaccctaccatc
caggctcatagtgtgaagttaggatttaaaattcatacttatatgcatac
atatataatgcatagttgtacttggtatatatcatattatgtacagtagc
atagaaaagaagagacaaccacactgtgcaatgagtagttgtggtcaggc
agtgcaggacatgaacatcaaaagaaatggatatagctgtggaaattata
aaaggcttttggaataaacacagctgagtgaggcaggccctaaaaaggag
gattagtccagcaagttgggtcgagaatgagataaacacaagaaaacaca
aatacatttaggccaggattgggagaccagctgggcaagtttatagtaac
ttatactacagggaggaaagtggtctggggtcacatggcgaggggccgat
ttccctctaataagctcaaatgcagttacactaaccccacaggcacatca
tgcagactgatcctaccacctgagcattcactttctctagatcaggtcaa
tcatgtagtgcaaattctgatactctgcaaatatcagcttggaccaagcc
cccactcctgcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_22792092_22793128
seq2: B6Ng01-330A05.b_49_1085

seq1  GAATTCTTGCTGTAGTGGGCAGAGGTACAAAGTCAGAGATGTATATTGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGCTGTAGTGGGCAGAGGTACAAAGTCAGAGATGTATATTGTC  50

seq1  ACACTGCCCCTTCCTCTACCTCCCCTAGGCTATTTGCTGGATGCATCCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGCCCCTTCCTCTACCTCCCCTAGGCTATTTGCTGGATGCATCCAG  100

seq1  AAGGTGCAGAAACTGGCACTCAGAACTTGGTAGAAGGCAGGGAGAGGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGCAGAAACTGGCACTCAGAACTTGGTAGAAGGCAGGGAGAGGCTG  150

seq1  GGTTAAATCAGATCTGATCAGTCTATATCAATAGGCTAGGGTCCAGTGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAAATCAGATCTGATCAGTCTATATCAATAGGCTAGGGTCCAGTGTC  200

seq1  AGGGGCACAGAATAGGCAGAATATAGGACTTTCATGTAGCTGAGGGCTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGCACAGAATAGGCAGAATATAGGACTTTCATGTAGCTGAGGGCTCC  250

seq1  CCATATGAGCTGGGCTGCCTGGAACACGCAATGGTATGTTTGTTGTAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATGAGCTGGGCTGCCTGGAACACGCAATGGTATGTTTGTTGTAGTG  300

seq1  TAAAGAATCTAAAATGGGTGACACAAGGGGTACCACAGTAGGGTCAAAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAATCTAAAATGGGTGACACAAGGGGTACCACAGTAGGGTCAAAGC  350

seq1  AGAGGCTACACACCCCCTAAATGGTCACTCATCAAGTTCCTGGCAGCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCTACACACCCCCTAAATGGTCACTCATCAAGTTCCTGGCAGCAGA  400

seq1  CATGTTCCTTCCTCATTAGCAGGGAGGTGACTTCTGCTTCCATGGAATAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTCCTTCCTCATTAGCAGGGAGGTGACTTCTGCTTCCATGGAATAG  450

seq1  CCCCATGGCAAGCTGGTAAATGTCCAGAAAATTGCTCTCTGGGAAATAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATGGCAAGCTGGTAAATGTCCAGAAAATTGCTCTCTGGGAAATAAG  500

seq1  TGCTTTCAGTTTCTATTACAGTGTTTGACAATTGCCTTAGTGTAAATATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTCAGTTTCTATTACAGTGTTTGACAATTGCCTTAGTGTAAATATT  550

seq1  CCTAGCTTGATCATGCTACCAATATAACAGTACTGAGTGAGGTATGGGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGCTTGATCATGCTACCAATATAACAGTACTGAGTGAGGTATGGGGA  600

seq1  AAAATGTGCCCAATTGGTGTTTGGGCCAGCAAAGCTGATTCTGGCATACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGTGCCCAATTGGTGTTTGGGCCAGCAAAGCTGATTCTGGCATACC  650

seq1  ACTGGGTGGGGACTGACCTTGGGGTCTTGGGGAACAGAGGAATATGTGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGTGGGGACTGACCTTGGGGTCTTGGGGAACAGAGGAATATGTGGC  700

seq1  CTCCTCATAACTAGAAGGAAAGGCCAATGTGCTGCACATTGAAGTACAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCATAACTAGAAGGAAAGGCCAATGTGCTGCACATTGAAGTACAGA  750

seq1  AACAGCAGCCTCAATGTAAGTCCTAGCTCTGTGTCCTCTTGGCTGTGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCAGCCTCAATGTAAGTCCTAGCTCTGTGTCCTCTTGGCTGTGTGG  800

seq1  CCTTGAACGAGTCATTCCATCTCTGCCATGTG-TCGTTTTTTCATCTGAA  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CCTTGAACGAGTCATTCCATCTCTGCCATGTGTTCGTTTTTTCATCTGAA  850

seq1  AAATGGGGCTATCACAGTTCTGAGGGTCAGGTGATAGTGAATCCTGCTCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGGGCTATCACAGTTCTGAGGGTCA-GTGATAGTGAATCCTGCTCT  899

seq1  GTGGGTTGACCCAGACATCACACA-TTACTGTTAACCACATGGAAGATTT  948
      |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
seq2  GTGGGTTGACCCAGACATCACACATTTACTGTTTACCACATGGAAGATTT  949

seq1  GGAATGTCTTCATGGTCATTTAGAAAGGAAAACCTGACAGTCCTTAGGGG  998
      |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GTGATGTCTTCATGGTCATTTAGAAAGGAAAACCTGACAGTCCTTA-GGG  998

seq1  GATTGTCTAGACCAGCTTGTTTCATGTTGAAATCTTGGA  1037
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGTCTTAACCAGCTTGTTTCATGTTGAAATCTTGGA  1037

seq1: chr14_22923854_22925038
seq2: B6Ng01-330A05.g_71_1232 (reverse)

seq1  GGCAGGAGT-GGGGCTTGGGCTCAAGCCTGATATTTTGCAGATGATCAGA  49
      ||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||  ||||||
seq2  GGCAGGAGTGGGGGCTTGGTC-CAAG-CTGATA-TTTGCAGAGTATCAGA  47

seq1  ATCTGCACTACCATGGTTTGGGCCCTTGATCTAGAGATAAAGGTGAAAAT  99
      || ||||||| |||| ||   | || ||||||||||   || |||  |||
seq2  ATTTGCACTA-CATGATT---GACC-TGATCTAGAG---AAAGTG--AAT  87

seq1  GCTCAGGTGGTTAGGGATCAGTCTGGCACTGATGGTGCCTGGTGGGGTTA  149
      |||||||||||   |||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||
seq2  GCTCAGGTGGT--AGGATCAGTCT-GCA-TGAT-GTGCCT-GTGGGGTTA  131

seq1  GTGTAACTGCATTTTGAAGCCTTTATAGAAGGGAAAATCGGCCCCTCGCC  199
      ||||||||||| |||||   |||  ||||  || ||||||||||||||||
seq2  GTGTAACTGCA-TTTGA--GCTTATTAGA--GGGAAATCGGCCCCTCGCC  176

seq1  ATGTGACCCCAGACCACTTTTCCTCCCTGTAGTATAAGTTACTATAAACT  249
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGACCCCAGACCAC-TTTCCTCCCTGTAGTATAAGTTACTATAAACT  225

seq1  TGCCCAGCTGGTCTCCCAATCCTGGCCTAAATGTATTTGTGTTTTCTTGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGCTGGTCTCCCAATCCTGGCCTAAATGTATTTGTGTTTTCTTGT  275

seq1  GTTTATCTCATTCTCGACCCAACTTGCTGGACTAATCCTCCTTTTTAGGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATCTCATTCTCGACCCAACTTGCTGGACTAATCCTCCTTTTTAGGG  325

seq1  CCTGCCTCACTCAGCTGTGTTTATTCC-AAAGCCTTTTATAATTTCCACA  398
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCTCACTCAGCTGTGTTTATTCCAAAAGCCTTTTATAATTTCCACA  375

seq1  GCTATATCCATTTCTTTTGATGTTCATGTCCTGCACTGCCTGACCACAAC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATATCCATTTCTTTTGATGTTCATGTCCTGCACTGCCTGACCACAAC  425

seq1  TACTCATTGCACAGTGTGGTTGTCTCTTCTTTTCTATGCTACTGTACATA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCATTGCACAGTGTGGTTGTCTCTTCTTTTCTATGCTACTGTACATA  475

seq1  ATATGATATATACCAAGTACAACTATGCATTATATATGTATGCATATAAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGATATATACCAAGTACAACTATGCATTATATATGTATGCATATAAG  525

seq1  TATGAATTTTAAATCCTAACTTCACACTATGAGCCTGGATGGTAGGGTTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAATTTTAAATCCTAACTTCACACTATGAGCCTGGATGGTAGGGTTT  575

seq1  GCTTTCCAGTGCTTTTTATTGTTTTAATCCCCATAGTGAATTATTGGTTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCCAGTGCTTTTTATTGTTTTAATCCCCATAGTGAATTATTGGTTG  625

seq1  ATTTCCGAATTTTAAATAATATGCAGACAGACTTTGAAGTAAGAGTGGCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCGAATTTTAAATAATATGCAGACAGACTTTGAAGTAAGAGTGGCT  675

seq1  GGGTAGAGTCCACGAGCCTTCTGTTGCCTTGAAGCCCTGAAGTGAAAAGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGAGTCCACGAGCCTTCTGTTGCCTTGAAGCCCTGAAGTGAAAAGA  725

seq1  TTACAAGATGAGTAACATCATTTGATGGAAGTTATAAGAATGGACTGTGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAGATGAGTAACATCATTTGATGGAAGTTATAAGAATGGACTGTGG  775

seq1  TGAGCTGATGAGATGGCTTAGAGTTAAGAGCATTTGCCTTTCTTGCAAAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTGATGAGATGGCTTAGAGTTAAGAGCATTTGCCTTTCTTGCAAAG  825

seq1  GCTCCCAGTACCCACATGGCAGCTCATAACTGCTTGTAACCCCAGCTCCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCAGTACCCACATGGCAGCTCATAACTGCTTGTAACCCCAGCTCCA  875

seq1  AGGACCCAAGGCTTCTGTCCTCCATAGGTACCTGCACTCATGTACATTCA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACCCAAGGCTTCTGTCCTCCATAGGTACCTGCACTCATGTACATTCA  925

seq1  TGCATAGATATACATATCCATAGTTAAAAATAAAGAAACTCCTTAAAAAC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATAGATATACATATCCATAGTTAAAAATAAAGAAACTCCTTAAAAAC  975

seq1  ATTTTTTGGGGGATCCTGATAGCATGATTCTGAGTATTTATCTCTTCCTC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTGGGGGATCCTGATAGCATGATTCTGAGTATTTATCTCTTCCTC  1025

seq1  TTAGTGGATTTTATATTTTCTCAATGTTCTACAGTGAAAATATACTTGTC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGGATTTTATATTTTCTCAATGTTCTACAGTGAAAATATACTTGTC  1075

seq1  TGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTAGTTTGAAAAATAACAATAA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTTAGTTTGAAAAATAACAATAA  1125

seq1  CAATGTCTTGACCGATGGGAAAGTTGCGTGAGAATTC  1185
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTCTTGACCGATGGGAAAGTTGCGTGAGAATTC  1162