BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-333L16
Chromosome14 (Build37)
Map Location 23,234,886 - 23,388,209
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700112E06Rik, EG435392
Upstream geneAdk, Myst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, EG665075
Downstream geneLOC665068, Kcnma1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-333L16.bB6Ng01-333L16.g
ACCGA119428GA119429
length9951,077
definitionB6Ng01-333L16.b B6Ng01-333L16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,387,215 - 23,388,209)(23,234,886 - 23,235,959)
sequence
gaattccattaatgcagcccaccatatctgaataattaaatactacatgg
caattaaaaatattacagacagatatctaatgagccagtagaatttcatg
ctatatatttatgtacctaaaattaaattacaagaactgtggtacacaca
ccaatagctcatgcatggaaattaaaagctattcataggctctcctccat
tctccacacaaatgatatctgtgccaagtttctgtggatattttcttcca
tgtgaatgttaagaatcatcaaagtagtgcttgttaactgtttctttttt
tcttattgctgttaatatacaatttaacatagagagacttgttaattcag
aatatatatgtatactcaattaaaatcatatattagtgtatgcacacata
taatatatatgcatatatgtgtgtgcgtgtttgtgtgtgtgtgtgtatgt
gtgtgtgtgtacatcattgtctatgactatatccttcaaatacacatctt
aagccttatggtaattttcatttcacagtcttctccagttactatgtttt
ctattatgagtaagtacttcataatgaggaaaatctttagtaaatattac
tttgattttcattgcttgcttgcttgtttttgtgctggggacaaatttga
agctttgtgtattttaggcaagcaagcttcttagccctttaaaattctta
ttttttagacaggattttcattaagttaccccggctgcctgtgacctcac
tatttagcacaggctggtctataacttcaggtccttcctccctcagactc
gcatatagctgagatcatagccagtgccacgatattcagcattaactcta
aagcacggtgcctatgaatagagcgcagtacaatctactggcccctaagt
aactctgccagcattgtttttcggttctgggtggtagactcaattcaggc
acaacattcaagggtactgcccaacacaaggacaataaggaagcc
gaattcaggagatgagatcttctctttcctcagctctgaatatatccgtc
tatacccacacgctgtacagagacacttttcctatttgctacttttctgg
ttgctgtggccacatacaattagggagaaaggtttgttttgtcttccagc
tcaagagaatacagtccatgaaatacatgaatacatggccaggaaagtgt
ggctcaggggccttaggcagctggccccattgcatgtacagttaagaaga
agagcaaatgttgtgtgggcctaagtgtggccatggcagttcatcttagg
ggttgagagagatctccaagaaatctagcaaaattagctatattgagaag
ctgtcagtttgactgaaaaagcctgtttcagtaagtaaggtagacaagtg
gttagggctgagtcctaacatcaaccttgggccatgcataatccacatgc
atatacgtacatgcacatattcacttacacacatgcaaacatgcacatat
acacaccacatacatgtgataactgaaaaaaaaacagaagagacagagag
aagtgaatctaatgctcatctagctttatccttttttgtttgtttgtttg
tttgtttgtttttttgttttgttttgttttttcgagacagggtttctcta
tgtagccctggctgttctggaactcactctgtagaccaggctggcctcaa
actcagatatccgcttgcctctgcctcccaagtgctgggattaaaggtgt
gtgccaccacagcccggctagttttatcctttttatacaatctaggagtc
cagcctgtggaatggtaccacccatatttagcataggtctccctcctgca
attaacgaaatctacaaaatccctcacagccatgccctgagatttgtctc
catggtgattcaagatcctgtcaagttgacatcagactaaaagtaaacca
tggcatgtaccttggggatattgtgaaatgtctgcatccatcccagagat
gatagaaggttattttctgtagtccctctgtcaagcatggggagaagttg
cttgagcaaaccgctagtttgctgttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_23387215_23388209
seq2: B6Ng01-333L16.b_48_1042 (reverse)

seq1  GGCTTCC-TATTGTCCTTGTGTTGGGCAGTACCCTTGAATGCTGATGCCT  49
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
seq2  GGCTTCCTTATTGTCCTTGTGTTGGGCAGTACCCTTGAATGTTG-TGCCT  49

seq1  GAATTTGAGTCTACCACCCAGAACCGAAAAACAATTGCTGGCAGAGTTAC  99
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GAA-TTGAGTCTACCACCCAGAACCGAAAAACAA-TGCTGGCAGAGTTAC  97

seq1  TTAGGGGCCAGTAGATTGTACTGCGCTCTATTCATAGGCACCGTGCTTTA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGGGCCAGTAGATTGTACTGCGCTCTATTCATAGGCACCGTGCTTTA  147

seq1  GAGTTAATGCTGAATATCGTGGCACTTGGCTATGATCTCAGCTATATGCG  199
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTAATGCTGAATATCGTGGCAC-TGGCTATGATCTCAGCTATATGCG  196

seq1  AGTCTGAGGGAGG-AGGACCTGAAGTTATAGACCAGCCTGTGCTAAATAG  248
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGAGGGAGGAAGGACCTGAAGTTATAGACCAGCCTGTGCTAAATAG  246

seq1  TGAGGTCACAGGCAGCCGGGGTAACTTAATG-AAATCCTGTCT-AAAAAT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
seq2  TGAGGTCACAGGCAGCCGGGGTAACTTAATGAAAATCCTGTCTAAAAAAT  296

seq1  AAGAATTTTAAAGGGCTAAGAAGCTTGCTTGCCTAAAATACACAAAGCTT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATTTTAAAGGGCTAAGAAGCTTGCTTGCCTAAAATACACAAAGCTT  346

seq1  CAAATTTGTCCCCAGCACAAAAACAAGCAAGCAAGCAATGAAAATCAAAG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTGTCCCCAGCACAAAAACAAGCAAGCAAGCAATGAAAATCAAAG  396

seq1  TAATATTTACTAAAGATTTTCCTCATTATGAAGTACTTACTCATAATAGA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATTTACTAAAGATTTTCCTCATTATGAAGTACTTACTCATAATAGA  446

seq1  AAACATAGTAACTGGAGAAGACTGTGAAATGAAAATTACCATAAGGCTTA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATAGTAACTGGAGAAGACTGTGAAATGAAAATTACCATAAGGCTTA  496

seq1  AGATGTGTATTTGAAGGATATAGTCATAGACAATGATGTACACACACACA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGTATTTGAAGGATATAGTCATAGACAATGATGTACACACACACA  546

seq1  CATACACACACACACACAAACACGCACACACATATATGCATATATATTAT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACACACACACACACAAACACGCACACACATATATGCATATATATTAT  596

seq1  ATGTGTGCATACACTAATATATGATTTTAATTGAGTATACATATATATTC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTGCATACACTAATATATGATTTTAATTGAGTATACATATATATTC  646

seq1  TGAATTAACAAGTCTCTCTATGTTAAATTGTATATTAACAGCAATAAGAA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTAACAAGTCTCTCTATGTTAAATTGTATATTAACAGCAATAAGAA  696

seq1  AAAAAGAAACAGTTAACAAGCACTACTTTGATGATTCTTAACATTCACAT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGAAACAGTTAACAAGCACTACTTTGATGATTCTTAACATTCACAT  746

seq1  GGAAGAAAATATCCACAGAAACTTGGCACAGATATCATTTGTGTGGAGAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAAATATCCACAGAAACTTGGCACAGATATCATTTGTGTGGAGAA  796

seq1  TGGAGGAGAGCCTATGAATAGCTTTTAATTTCCATGCATGAGCTATTGGT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGAGAGCCTATGAATAGCTTTTAATTTCCATGCATGAGCTATTGGT  846

seq1  GTGTGTACCACAGTTCTTGTAATTTAATTTTAGGTACATAAATATATAGC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTACCACAGTTCTTGTAATTTAATTTTAGGTACATAAATATATAGC  896

seq1  ATGAAATTCTACTGGCTCATTAGATATCTGTCTGTAATATTTTTAATTGC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAATTCTACTGGCTCATTAGATATCTGTCTGTAATATTTTTAATTGC  946

seq1  CATGTAGTATTTAATTATTCAGATATGGTGGGCTGCATTAATGGAATTC  995
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTAGTATTTAATTATTCAGATATGGTGGGCTGCATTAATGGAATTC  995

seq1: chr14_23234886_23235959
seq2: B6Ng01-333L16.g_70_1146

seq1  GAATTCAGGAGATGAGATCTTCTCTTTCCTCAGCTCTGAATATATCCGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGAGATGAGATCTTCTCTTTCCTCAGCTCTGAATATATCCGTC  50

seq1  TATACCCACACGCTGTACAGAGACACTTTTCCTATTTGCTACTTTTCTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACCCACACGCTGTACAGAGACACTTTTCCTATTTGCTACTTTTCTGG  100

seq1  TTGCTGTGGCCACATACAATTAGGGAGAAAGGTTTGTTTTGTCTTCCAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTGGCCACATACAATTAGGGAGAAAGGTTTGTTTTGTCTTCCAGC  150

seq1  TCAAGAGAATACAGTCCATGAAATACATGAATACATGGCCAGGAAAGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAGAATACAGTCCATGAAATACATGAATACATGGCCAGGAAAGTGT  200

seq1  GGCTCAGGGGCCTTAGGCAGCTGGCCCCATTGCATGTACAGTTAAGAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAGGGGCCTTAGGCAGCTGGCCCCATTGCATGTACAGTTAAGAAGA  250

seq1  AGAGCAAATGTTGTGTGGGCCTAAGTGTGGCCATGGCAGTTCATCTTAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAAATGTTGTGTGGGCCTAAGTGTGGCCATGGCAGTTCATCTTAGG  300

seq1  GGTTGAGAGAGATCTCCAAGAAATCTAGCAAAATTAGCTATATTGAGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGAGAGAGATCTCCAAGAAATCTAGCAAAATTAGCTATATTGAGAAG  350

seq1  CTGTCAGTTTGACTGAAAAAGCCTGTTTCAGTAAGTAAGGTAGACAAGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCAGTTTGACTGAAAAAGCCTGTTTCAGTAAGTAAGGTAGACAAGTG  400

seq1  GTTAGGGCTGAGTCCTAACATCAACCTTGGGCCATGCATAATCCACATGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGGGCTGAGTCCTAACATCAACCTTGGGCCATGCATAATCCACATGC  450

seq1  ATATACGTACATGCACATATTCACTTACACACATGCAAACATGCACATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACGTACATGCACATATTCACTTACACACATGCAAACATGCACATAT  500

seq1  ACACACCACATACATGTGATAACTGAAAAAAAAACAGAAGAGACAGAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACCACATACATGTGATAACTGAAAAAAAAACAGAAGAGACAGAGAG  550

seq1  AAGTGAATCTAATGCTCATCTAGCTTTATCCTTTTTTGTTTGTTTGTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGAATCTAATGCTCATCTAGCTTTATCCTTTTTTGTTTGTTTGTTTG  600

seq1  TTTGTTTGTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTGTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTA  650

seq1  TGTAGCCCTGGCTGTTCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCCCTGGCTGTTCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAA  700

seq1  ACTCAGATATCCGCTTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGATATCCGCTTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGT  750

seq1  GTGCCACCACAGCCCGGCTAGTTTTATCCTTTTTATACAATCTAGGAGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCACCACAGCCCGGCTAGTTTTATCCTTTTTATACAATCTAGGAGTC  800

seq1  CAGCCTGTGGAATGGTACCACCCATATTTAGCATAGGTCTCCCTCCTGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTGTGGAATGGTACCACCCATATTTAGCATAGGTCTCCCTCCTGCA  850

seq1  ATTAACGAAATCTACAAAATCCCTCACAGCCATGCCCTGAGATTTGTCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAACGAAATCTACAAAATCCCTCACAGCCATGCCCTGAGATTTGTCTC  900

seq1  CATGGTGATTCAAGATCCTGTCAAGTTGACAATCAGACT-AAAGTAAACC  949
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
seq2  CATGGTGATTCAAGATCCTGTCAAGTTGAC-ATCAGACTAAAAGTAAACC  949

seq1  ATGGCATGTACCTT-GGGATATTGTGAAATGTCTGCATCCATCCCAGAGA  998
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCATGTACCTTGGGGATATTGTGAAATGTCTGCATCCATCCCAGAGA  999

seq1  TGATAGAAGGGTATTTTCTGTAGTCCCTCTGTCAAGCAT-GGGAG-AGTT  1046
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  TGATAGAAGGTTATTTTCTGTAGTCCCTCTGTCAAGCATGGGGAGAAGTT  1049

seq1  GCTTGAGCAAACCGCTAGTTTGCTGTTC  1074
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAGCAAACCGCTAGTTTGCTGTTC  1077