BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-334I08
Chromosome14 (Build37)
Map Location 22,925,120 - 23,144,755
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700112E06Rik
Upstream geneAdk, Myst4, EG435391, Dusp13, Samd8, Vdac2, Comtd1, Zfp503, EG665075
Downstream geneEG435392, LOC665068, Kcnma1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-334I08.bB6Ng01-334I08.g
ACCGA120005GA120006
length1,1611,124
definitionB6Ng01-334I08.b B6Ng01-334I08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,143,588 - 23,144,755)(22,925,120 - 22,926,258)
sequence
gaattcttcgaggatcacttctataatgaaggagaatgtattagcattgt
agtcccagttctatcttttcccataatgcttttctcactgtggaacatct
cagtagcactgactagataagcccctccatgtctgaatagctgtctaagt
tctgaagagctgcttccctgcttctccttgggttttagaggagctgacca
cataggtagcaaagggaaagaagccagtgtggccgcagatcagagtcatc
ttgtgcttgcatctctacagggtgttcatggctagtgcagcatccatcat
tctgtggggctgatagaatctgtaagaatatgctcgccactctattcttc
tatttaagcacacaacatggaaggctaaacttgtcctcttcgcaccgtat
acataatctctggagttcatggaaagtaagtccattgaaggcagccagca
atctgctaccataaattatgccaaagacctagggtagggacataaggaca
actttctagagccaccaagagctttccatggagcagctcaagagaagaat
gtccagggctgcttcccttcctctttgtgtatactgctcacaaatggtag
ggaaactagaaagatcttacaggctgtggttaaggccccacatgggatag
atatcatgacttgttgtgtctatgactggaagattttcctgattcctgag
ggtgggacaccctcacgacatgatgagttgttgcttgtgtctttgaagac
taaaaatgttaacaacttgaaagaggaatatcactggtgtttgttcagga
taatctgaaagaattataggagctccgcctttcaattttctataaaagta
atacgaagagtggctaggaagtcagtcccaacagggaagagctggcctca
caggtgaaaggaaccgactttgcaccccagaactaatgcaaaaaggcaga
cacggtagaacacacttgcaaaaaagcaaagtgatgtagacaggcagagc
cctgagctctctagaaagtagccttgtctccttggtaatccccagggcag
tgatgatcgtgaattttgtttgttttgttttgttttcttatgaatggtaa
cctgagaaatgaacattgatcccggtcttttggtattccactatgccatg
ctggactcatg
gaattcaaagacagaaatggtcagagcaccttggatcagttgacagtgac
aggatgcctgtgagttcttcccagagcgcagggacctgtgttttgcactg
ctgaccccagtgttgactcatctctggtggcttgtagctgtgaaaggagt
ccccccatccccaccctggttactgtgtcacattgtgtactcaggttctt
tagagccatgcctcataaatcagcctgccttccttctccgaggtgggaac
ggcttctcgcattccctcacacagacccttggtttcaggtaataacccat
tgaaactagaaagtgacacaaggccaggaacaactcagctcaacattcct
gagcactgtttttgaaacagaacctaaggatggaattggggactggaatc
tctggaagtctcttctggcatgtaacccccttgtgcccttatgtcttagc
tgcctcaccatgggtgaacactggacattttggagataaatagttcagta
ttcatggtctctggcagactctatgctttatcaagtgagatggagccata
ccttatctttggccatccaacagtcttgtggtgaggcattcattttgcat
cacaccgagaggaccaaagcttagcaaggtcccttcttcctcggacatga
tcacctgtctgtgtgtgttagtcttgggatcacagagaaggacaggatag
ctgctggctctaacttcatggagcttggttgtgggatgagcacacatacc
catgggaaggcacaacactgcaagaaaagttcagagggggagaggggaga
aaagcgcagtcagggaaccagcaaaacgtactggactttagtcccaaagg
aggagcagcttcacccaagagagcggacaggttgtgacaatccgagttaa
agtttctcttctttcacagactcatggtaaagatactttaaaggggttgt
gaaatgcctgaggtgtgtcacagcagtcctgctaacccagttgtgcccct
tgcattgctgataacagcatgcaagttgagcagtgctcaaggtggatgat
gctggtctgttctgtccgaaagcccagtcctcagcctgcaggtaagacag
tcacgttgaactattttctgtgac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_23143588_23144755
seq2: B6Ng01-334I08.b_52_1212 (reverse)

seq1  CATGAGT-CAGCATGTGCAT-GTGGAA-ATCAAAAGA-CGGTATCAAGTG  46
      ||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||| ||| |||||   
seq2  CATGAGTCCAGCATG-GCATAGTGGAATACCAAAAGACCGGGATCAATGT  49

seq1  TCATTTCTCAGG-TACCATCCATTAAGAAAAACAAAACAAAAACAAAAAC  95
      |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||   | ||||
seq2  TCATTTCTCAGGTTACCATTCA-TAAG-AAAACAAAACAAA---ACAAAC  94

seq1  AAAATTCACGATCATTCACTGGCCTGGGGATTACCAAGGAGACAAGGCTA  145
      |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AAAATTCACGATCA-TCACTGCCCTGGGGATTACCAAGGAGACAAGGCT-  142

seq1  ACTTTCTAGAGAGCTCCAGGGCTCTGCCTGTCTCCATCACCTTTGCTTTT  195
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||
seq2  ACTTTCTAGAGAGCT-CAGGGCTCTGCCTGTCTACATCA-CTTTGC-TTT  189

seq1  TTTGCAAGTGTGTTCTACCGTGTCTGCCTTTTTTGCATTAGTTCTGGGGT  245
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAAGTGTGTTCTACCGTGTCTGCC-TTTTTGCATTAGTTCTGGGGT  238

seq1  GCAAAGTCGGTTCCTTTCACCTGTGAGGCCAGCTCTTCCCTGTTGGGACT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGTCGGTTCCTTTCACCTGTGAGGCCAGCTCTTCCCTGTTGGGACT  288

seq1  GACTTCCTAGCCACTCTTCGTATTACTTTTATAGAAAATTGAAAGGCGGA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCCTAGCCACTCTTCGTATTACTTTTATAGAAAATTGAAAGGCGGA  338

seq1  GCTCCTATAATTCTTTCAGATTATCCTGAACAAACACCAGTGATATTCCT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTATAATTCTTTCAGATTATCCTGAACAAACACCAGTGATATTCCT  388

seq1  CTTTCAAGTTGTTAACATTTTTAGTCTTCAAAGACACAAGCAACAACTCA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAAGTTGTTAACATTTTTAGTCTTCAAAGACACAAGCAACAACTCA  438

seq1  TCATGTCGTGAGGGTGTCCCACCCTCAGGAATCAGGAAAATCTTCCAGTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTCGTGAGGGTGTCCCACCCTCAGGAATCAGGAAAATCTTCCAGTC  488

seq1  ATAGACACAACAAGTCATGATATCTATCCCATGTGGGGCCTTAACCACAG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACACAACAAGTCATGATATCTATCCCATGTGGGGCCTTAACCACAG  538

seq1  CCTGTAAGATCTTTCTAGTTTCCCTACCATTTGTGAGCAGTATACACAAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTAAGATCTTTCTAGTTTCCCTACCATTTGTGAGCAGTATACACAAA  588

seq1  GAGGAAGGGAAGCAGCCCTGGACATTCTTCTCTTGAGCTGCTCCATGGAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAGGGAAGCAGCCCTGGACATTCTTCTCTTGAGCTGCTCCATGGAA  638

seq1  AGCTCTTGGTGGCTCTAGAAAGTTGTCCTTATGTCCCTACCCTAGGTCTT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTTGGTGGCTCTAGAAAGTTGTCCTTATGTCCCTACCCTAGGTCTT  688

seq1  TGGCATAATTTATGGTAGCAGATTGCTGGCTGCCTTCAATGGACTTACTT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATAATTTATGGTAGCAGATTGCTGGCTGCCTTCAATGGACTTACTT  738

seq1  TCCATGAACTCCAGAGATTATGTATACGGTGCGAAGAGGACAAGTTTAGC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGAACTCCAGAGATTATGTATACGGTGCGAAGAGGACAAGTTTAGC  788

seq1  CTTCCATGTTGTGTGCTTAAATAGAAGAATAGAGTGGCGAGCATATTCTT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCATGTTGTGTGCTTAAATAGAAGAATAGAGTGGCGAGCATATTCTT  838

seq1  ACAGATTCTATCAGCCCCACAGAATGATGGATGCTGCACTAGCCATGAAC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATTCTATCAGCCCCACAGAATGATGGATGCTGCACTAGCCATGAAC  888

seq1  ACCCTGTAGAGATGCAAGCACAAGATGACTCTGATCTGCGGCCACACTGG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGTAGAGATGCAAGCACAAGATGACTCTGATCTGCGGCCACACTGG  938

seq1  CTTCTTTCCCTTTGCTACCTATGTGGTCAGCTCCTCTAAAACCCAAGGAG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTTCCCTTTGCTACCTATGTGGTCAGCTCCTCTAAAACCCAAGGAG  988

seq1  AAGCAGGGAAGCAGCTCTTCAGAACTTAGACAGCTATTCAGACATGGAGG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGGAAGCAGCTCTTCAGAACTTAGACAGCTATTCAGACATGGAGG  1038

seq1  GGCTTATCTAGTCAGTGCTACTGAGATGTTCCACAGTGAGAAAAGCATTA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTATCTAGTCAGTGCTACTGAGATGTTCCACAGTGAGAAAAGCATTA  1088

seq1  TGGGAAAAGATAGAACTGGGACTACAATGCTAATACATTCTCCTTCATTA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAAAGATAGAACTGGGACTACAATGCTAATACATTCTCCTTCATTA  1138

seq1  TAGAAGTGATCCTCGAAGAATTC  1168
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGTGATCCTCGAAGAATTC  1161

seq1: chr14_22925120_22926258
seq2: B6Ng01-334I08.g_63_1186

seq1  GAATTCAAAGACAGAAATGGTCAGAGCACCTTGGATCAGTTGACAGTGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGACAGAAATGGTCAGAGCACCTTGGATCAGTTGACAGTGAC  50

seq1  AGGATGCCTGTGAGTTCTTCCCAGAGCGCAGGGACCTGTGTTTTGCACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGCCTGTGAGTTCTTCCCAGAGCGCAGGGACCTGTGTTTTGCACTG  100

seq1  CTGACCCCAGTGTTGACTCATCTCTGGTGGCTTGTAGCTGTGAAAGGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCCCAGTGTTGACTCATCTCTGGTGGCTTGTAGCTGTGAAAGGAGT  150

seq1  CCCCCCATCCCCACCCTGGTTACTGTGTCACATTGTGTACTCAGGTTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCATCCCCACCCTGGTTACTGTGTCACATTGTGTACTCAGGTTCTT  200

seq1  TAGAGCCATGCCTCATAAATCAGCCTGCCTTCCTTCTCCGAGGTGGGAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCCATGCCTCATAAATCAGCCTGCCTTCCTTCTCCGAGGTGGGAAC  250

seq1  GGCTTCTCGCATTCCCTCACACAGACCCTTGGTTTCAGGTAATAACCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCTCGCATTCCCTCACACAGACCCTTGGTTTCAGGTAATAACCCAT  300

seq1  TGAAACTAGAAAGTGACACAAGGCCAGGAACAACTCAGCTCAACATTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACTAGAAAGTGACACAAGGCCAGGAACAACTCAGCTCAACATTCCT  350

seq1  GAGCACTGTTTTTGAAACAGAACCTAAGGATGGAATTGGGGACTGGAATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACTGTTTTTGAAACAGAACCTAAGGATGGAATTGGGGACTGGAATC  400

seq1  TCTGGAAGTCTCTTCTGGCATGTAACCCCCTTGTGCCCTTATGTCTTAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAAGTCTCTTCTGGCATGTAACCCCCTTGTGCCCTTATGTCTTAGC  450

seq1  TGCCTCACCATGGGTGAACACTGGACATTTTGGAGATAAATAGTTCAGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCACCATGGGTGAACACTGGACATTTTGGAGATAAATAGTTCAGTA  500

seq1  TTCATGGTCTCTGGCAGACTCTATGCTTTATCAAGTGAGATGGAGCCATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGGTCTCTGGCAGACTCTATGCTTTATCAAGTGAGATGGAGCCATA  550

seq1  CCTTATCTTTGGCCATCCAACAGTCTTGTGGTGAGGCATTCATTTTGCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATCTTTGGCCATCCAACAGTCTTGTGGTGAGGCATTCATTTTGCAT  600

seq1  CACACCGAGAGGACCAAAGCTTAGCAAGGTCCCTTCTTCCTCGGACATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCGAGAGGACCAAAGCTTAGCAAGGTCCCTTCTTCCTCGGACATGA  650

seq1  TCACCTGTCTGTGTGTGTTAGTCTTGGGATCACAGAGAAGGACAGGATAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTGTCTGTGTGTGTTAGTCTTGGGATCACAGAGAAGGACAGGATAG  700

seq1  CTGCTGGCTCTAACTTCATGGAGCTTGGTTGTGGGATGAGCACACATACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGGCTCTAACTTCATGGAGCTTGGTTGTGGGATGAGCACACATACC  750

seq1  CATGGGAAGGCACAACACTGCAAGAAAAGTTCAGAGGGGGAGAGGGGAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGAAGGCACAACACTGCAAGAAAAGTTCAGAGGGGGAGAGGGGAGA  800

seq1  AAAGCGCAGTCAGGGAACCAGCAAAACGTACTGGACTTTAGTCCCAAAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCGCAGTCAGGGAACCAGCAAAACGTACTGGACTTTAGTCCCAAAGG  850

seq1  AGGAGCAGCTTCACCCAAGAGAGCGGACAGGTTGTGACAATCCGAGTTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCAGCTTCACCCAAGAGAGCGGACAGGTTGTGACAATCCGAGTTAA  900

seq1  AGTTTCTCTTCTTTCACAGACTCATGGTAAAGATACTTTAAAGGGGTTGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCTCTTCTTTCACAGACTCATGGTAAAGATACTTTAAAGGGGTTGT  950

seq1  GAAAATGCCTGAGGTGTGTCACAGCCAGTCCTGCCTTAACCCCAGTGTGC  1000
      | |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||   |||||
seq2  G-AAATGCCTGAGGTGTGTCACAG-CAGTCCTGC--TAACCCAGTTGTGC  996

seq1  CCCTTGCATTGCTGTATACAGCAATGCAAGTTGAGCAAGTGGCTCAAAGG  1050
      ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||
seq2  CCCTTGCATTGCTGATAACAGC-ATGCAAGTTGAGC-AGT-GCTC-AAGG  1042

seq1  TGGAATGATTGCTGGTCTGTTCTGT-CGAAAGCCCAGTCCTCAGCACTGC  1099
      ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGG-ATGA-TGCTGGTCTGTTCTGTCCGAAAGCCCAGTCCTCAGC-CTGC  1089

seq1  AGGGGTAAAGACAGGTCACGGTTGAACTATTTTCTGTGAC  1139
      |||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AGG---TAAGACA-GTCAC-GTTGAACTATTTTCTGTGAC  1124