BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-347B24
Chromosome14 (Build37)
Map Location 69,757,837 - 69,888,596
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG545808, Nkx2-6, Nkx3-1, Slc25a37
Upstream geneAdam7, Adamdec1, Adam28, LOC641033, LOC100043082, Stc1
Downstream geneD930020E02Rik, Entpd4, Loxl2, R3hcc1, Chmp7, Tnfrsf10b, Rhobtb2, LOC100043701, 1700081D17Rik, LOC668397, Egr3, Bin3, 2610301G19Rik, 9930012K11Rik, Pdlim2, Sorbs3, Ppp3cc, LOC100043115, Slc39a14, EG668450, Piwil2, Polr3d, Phyhip, Bmp1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-347B24.bB6Ng01-347B24.g
ACCGA128825GA128826
length431822
definitionB6Ng01-347B24.b B6Ng01-347B24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,757,837 - 69,758,271)(69,887,775 - 69,888,596)
sequence
tccccttcaggcaatcagattttgctcctctgaagtcttggacttttatc
tatagtgaccacttcaaccttaaaccattccccaaagtaaataagatagc
tctgtgttaggtaggtagatagatagataaatagatgatagagatatgta
tgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtattagaaactggagcaaag
tacagttactacaccttccacagacagccagctcccaggattcatctgtt
gtgtggaatcaggattgtcccatccaagttgaaggccagcagccccagga
tcagctgttaggggggatacctgccattgtttgccttctcaacactgtct
gacatccccaagggtctttcactaaccacaatgcccatagtatctatcct
acctgagcaacctccacatgaaaagtttctt
gaattctctgtcagaccctggacatcaaaagttcttgcaaagctgggctg
ttctcaggagctactgtgcaattgagaacagatgtctgctctcagagcag
cttggatgaagggaccaggaagcactgggcagggctttttcatcctggag
ggagggacttcaaagaagcgaagagaagcctgtgtttacttgcaggtgca
aggtgaccagggatgcattgactgagcagcaagtatgacttgaactcatg
gcctctctgtgccttgggacactgtgacttctaggttctctgaatacact
tggccacaaatgtagacttctagccagagccattctacctcaagaagaaa
gctgggaggcaggactgcttgtagtgcattctgggaggggagccaactgc
tctcgtcccattttgggcctgccttgtccctgaattccaaagtgcccgcc
tcgaagttgcagtttattttgtccacttgaagtcacccttcacgattgca
gacccttcatttaagcctctcccagagtgttgaatgactctagccccgcc
ctggaaccaggggcagaaagtcccagaggtttctggatgggctctgttta
caactctctgactctttcctgcttggggacctttcataagttcatcacca
ggaagctgagtcatgcaggggtcagctggcgtgatcaaagatcaccccag
cgctgccggcaactcacatcggttgtctgggcatttgtggggagcagtgt
aggaatgacgaggtagatgagctcaaaggccctcttagcatcgcccctct
ggggtagggagagtggggaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_69757837_69758271
seq2: B6Ng01-347B24.b_47_482

seq1  GAATTCTCCCCTTCAGGCAATCAGATTTTGCTCCTCTGAAGTCTTGGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCCCTTCAGGCAATCAGATTTTGCTCCTCTGAAGTCTTGGACT  50

seq1  TTTATCTATAGTGACCACTTCAACCTTAAACCATTCCCCAAAGTAAATAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCTATAGTGACCACTTCAACCTTAAACCATTCCCCAAAGTAAATAA  100

seq1  GATAGCTCTGTGTTAGGTAGGTAGATAGATAGATAAATAGATGATAGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGCTCTGTGTTAGGTAGGTAGATAGATAGATAAATAGATGATAGAGA  150

seq1  TATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATTAGAAACTGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATTAGAAACTGGA  200

seq1  GCAAAGTACAGTTACTACACCTTCCACAGACAGCCAGCTCCCAGGATTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGTACAGTTACTACACCTTCCACAGACAGCCAGCTCCCAGGATTCA  250

seq1  TCTGTTGTGTGGAATCAGGATTGTCCCATCCAAGTTGAAGGCCAGCAGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTGTGTGGAATCAGGATTGTCCCATCCAAGTTGAAGGCCAGCAGCC  300

seq1  CCAGGATCAGCTGTTAGGGGGGATACCTGCCATTGTTTGCCTTCTCAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGATCAGCTGTTAGGGGGGATACCTGCCATTGTTTGCCTTCTCAACA  350

seq1  CTGTCTGACATCCCCAAGGGTC-TTCACTAACCACAATGCCCAGAGTATC  399
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTGTCTGACATCCCCAAGGGTCTTTCACTAACCACAATGCCCATAGTATC  400

seq1  TATCCTACCTGAGCAACCTCCACACGAAAAGTTTCT  435
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TATCCTACCTGAGCAACCTCCACATGAAAAGTTTCT  436

seq1: chr14_69887775_69888596
seq2: B6Ng01-347B24.g_68_889 (reverse)

seq1  CCCTCCCCACTCTCCCTACCCCAGAGGGGCGATGCTAAGAGGGCCTTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCCCACTCTCCCTACCCCAGAGGGGCGATGCTAAGAGGGCCTTTGA  50

seq1  GCTCATCTACCTCGTCATTCCTACACTGCTCCCCACAAATGCCCAGACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATCTACCTCGTCATTCCTACACTGCTCCCCACAAATGCCCAGACAA  100

seq1  CCGATGTGAGTTGCCGGCAGCGCTGGGGTGATCTTTGATCACGCCAGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGATGTGAGTTGCCGGCAGCGCTGGGGTGATCTTTGATCACGCCAGCTG  150

seq1  ACCCCTGCATGACTCAGCTTCCTGGTGATGAACTTATGAAAGGTCCCCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCTGCATGACTCAGCTTCCTGGTGATGAACTTATGAAAGGTCCCCAA  200

seq1  GCAGGAAAGAGTCAGAGAGTTGTAAACAGAGCCCATCCAGAAACCTCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAAAGAGTCAGAGAGTTGTAAACAGAGCCCATCCAGAAACCTCTGG  250

seq1  GACTTTCTGCCCCTGGTTCCAGGGCGGGGCTAGAGTCATTCAACACTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTCTGCCCCTGGTTCCAGGGCGGGGCTAGAGTCATTCAACACTCTG  300

seq1  GGAGAGGCTTAAATGAAGGGTCTGCAATCGTGAAGGGTGACTTCAAGTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGGCTTAAATGAAGGGTCTGCAATCGTGAAGGGTGACTTCAAGTGG  350

seq1  ACAAAATAAACTGCAACTTCGAGGCGGGCACTTTGGAATTCAGGGACAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAATAAACTGCAACTTCGAGGCGGGCACTTTGGAATTCAGGGACAAG  400

seq1  GCAGGCCCAAAATGGGACGAGAGCAGTTGGCTCCCCTCCCAGAATGCACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCCCAAAATGGGACGAGAGCAGTTGGCTCCCCTCCCAGAATGCACT  450

seq1  ACAAGCAGTCCTGCCTCCCAGCTTTCTTCTTGAGGTAGAATGGCTCTGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCAGTCCTGCCTCCCAGCTTTCTTCTTGAGGTAGAATGGCTCTGGC  500

seq1  TAGAAGTCTACATTTGTGGCCAAGTGTATTCAGAGAACCTAGAAGTCACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGTCTACATTTGTGGCCAAGTGTATTCAGAGAACCTAGAAGTCACA  550

seq1  GTGTCCCAAGGCACAGAGAGGCCATGAGTTCAAGTCATACTTGCTGCTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCCAAGGCACAGAGAGGCCATGAGTTCAAGTCATACTTGCTGCTCA  600

seq1  GTCAATGCATCCCTGGTCACCTTGCACCTGCAAGTAAACACAGGCTTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATGCATCCCTGGTCACCTTGCACCTGCAAGTAAACACAGGCTTCTC  650

seq1  TTCGCTTCTTTGAAGTCCCTCCCTCCAGGATGAAAAAGCCCTGCCCAGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGCTTCTTTGAAGTCCCTCCCTCCAGGATGAAAAAGCCCTGCCCAGTG  700

seq1  CTTCCTGGTCCCTTCATCCAAGCTGCTCTGAGAGCAGACATCTGTTCTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGGTCCCTTCATCCAAGCTGCTCTGAGAGCAGACATCTGTTCTCA  750

seq1  ATTGCACAGTAGCTCCTGAGAACAGCCCAGCTTTGCAAGAACTTTTGATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCACAGTAGCTCCTGAGAACAGCCCAGCTTTGCAAGAACTTTTGATG  800

seq1  TCCAGGGTCTGACAGAGAATTC  822
      ||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGTCTGACAGAGAATTC  822