BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-048P04.T7 (MSMg01no048_p04.b1) | MSMg01-048P04.TJ (MSMg01no048_p04.g1) |
ACC | AG278574 | AG278575 |
length | 1,189 | 1,180 |
length of high quality (start - end) | 682 (76 - 757) | 606 (127 - 732) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no048_p04.b1 PHD_FILE: MSMg01no048_p04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:10:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no048_p04.g1 PHD_FILE: MSMg01no048_p04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:10:26 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TATGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTCACC
TGAGGAATGCCCAATGACAGACCAGCACCTGAAAAAAATGTTCAGCATCC
TTACTCATCAGGGAAATGCCCATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCAC
TCTAGTCAAAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGC
GAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCTTGGTGGGATTGCAAGCTTG
TACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCTGTTCCTTAGAAAATTGGACATA
GTACTACCAGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA
TGTTCTAACCGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCTTCCT
TATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAG
AAATGGATACAGAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACTCAGC
TATTAAAAAGAATGAATTCATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTAG
AGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACAATCACAAAGGAACTCACACAAT
ATGTACTCACTGATAAGTTGATATTAGCCCAAAACTTAGGATACACAAGA
TATAAGATACAATTTGCTAAACGCATCAAACTCAAGAAGAATGAAGACCA
AAGTGTGGACACTGTGCCCCTTTTTAGAATTGGGACCAAAACACCCATGG
AAGGAGTTACAGAGACAAAGTTAGGAGCTGAGACAAAAGGATGGACCTTT
AGAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCCCATAATCCGTTTCCAAATGCTG
ACACCATTGCATACCCTAGCAAGATTTTTGCTGAAAGGGCCCAGATATAG
CTGTCTCTTGTGAAACTATTGCGGGACCTACCAAACACAGAAGTGGAAGC
TCCCGGCCCGCTAATGGATGGATCCCGGGCCTCCCAATGGAGGAGCTTAG
GAAAGTACTCCAGGAACTCTAAGGTAATTTGCCACCCTATTCCCTGGAAA
ACCCTTTTTGTAACTTCCCGTATCCCCGGGAGTCTTTTGACTTTCAGCTC
ATTTTGGCTCTCACAAAAATGTCCAATACCGGTCCATCATGGGAAAAAGA
AGAGCCCTTGTGTGCCCCCCCCAATTTTTTATTTCCCCC
| NNCCAATCATGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXCCCATAAAGACCCCCGAAGCATGGNGGTAGGCA
GGTAGGCATCCTATAAAACTACTAGCTGAATGCTCACATTTTGATCCACC
AGCATGAAACATAGTGAACCAAACAAGAATGGCATGGAATTTTGATACCT
AAAAGTGTACCCTCCAGTGACACTCCTCCTCCAACAAGGCCCATGCCTCC
TACTCATTCTCAAACAGTTCCACCAACTGGCGACCAAATATCCAAACACA
CAAGCCCATTGGAGCCTGTGAGGAGCCAGACCAACCCAAGACTTTCTCAG
AGGCCCTGATGAAAGGGCAAAGAAAACTTTAGTTCTGTGATCAGGAATAG
ACTTCACAAATTGGTCTCATGCTGGAGCCAGTGGCTCAGAGGAGTCAAGG
TTGTGGATTTTGGGGACATGACTCTTCCCCTGGGCTGTGGTTATTAGTCC
TTAGGGAGTCCTTAGGGAGTTGTGTCTGAGATATCCTGTTTTCTGTCAAC
ATTGTCTGTTTAACTCTCTACCAACCTTGGCCATTTCCCCTCTTGCAAAT
AGTATAGAGGCCATTGTATTTCTTAATTAACTTGCTTGGTGTGATGGTTT
GTATATGCTCGACCCAGGGAGTGGCACTATTAGAAGGTGTGGCTTAGTTG
GAGTAGGGATGGCCTTGTTGGAGTAGGTATGGCTGTGGGCTTGAAGACCC
TCATTCTAGATGCCTGGAAGCCAATATTCTGCTAGCCACCTTCAAATGAA
GATGTACTCTCAGCTCCTCCTGTACCATCTCAGCCTGAATGCTGCCATGT
TCCCACCCCTGATGACCCTGGACTGAAACTCTGAACTTGTAAACTCTAAA
CCAGCCCCAATTAAATGATGTCCTTTATAAAATTTGCCTTGGGACATGGT
GCCTGTTCCCCTCTGCAAACCCCTAAAACCCTTTGCATAAATCATCACCT
TATGCAGGAACCCATGTCTTTGTTGTTCCCAAATTTCCCCAAACCCTTTC
CCTCAACCATTCCAAACCCTTTATTCTTTTAGTCCCCACGTCATAGGGCC
CTTTCTCCTTTTCCATCCACCCCAAGAACCCTCCCTGTTGTAGGGTACTT
ATTATTTATCCTCCCTGCTACCCCTAACTC
|
quality values | Open.Hide. 7 7 8 8 11 17 19 24 18 10 8 8 8 8 10 12 16 20 22 24 28 33 36 36 36 36 50 47 47 47 43 43 43 43 43 47 48 57 48 42 43 43 43 57 57 57 48 47 47 36
47 44 44 39 37 42 41 39 23 19 9 9 9 9 9 11 9 11 11 12 10 10 10 9 11 15 23 30 36 36 50 50 53 57 59 59 59 57 57 57 50 53 53 57 57 57 59 57 57 43
29 19 12 12 12 12 19 24 25 22 30 28 37 37 37 37 30 30 18 17 15 16 21 25 26 41 47 59 59 59 59 47 47 50 47 47 50 57 48 48 48 57 48 47 48 48 57 57 57 68
68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 47 48 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 62 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68
68 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 39 26 12 12 12 12 14 14 39
39 59 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 44 44 39 39 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 44 43 35 35 43 44 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 38 38 14 14 14 38 38 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 57 57 57 57 57 68 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52
57 57 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 59 59 50 54 54 59 59 59 48 48 48 48 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 40 40 28 37 37 43 43 59 59 59 59 43 35 35 35 43 43 39 35 35 39 39 48 48 48
53 50 48 42 42 42 39 39 39 39 31 31 39 43 59 59 59 59 47 25 27 11 12 12 25 23 31 20 24 19 39 43 37 37 41 39 36 34 39 34 23 27 15 11 11 23 27 34 34 24
30 17 19 16 10 10 12 16 24 37 41 39 41 39 39 33 30 26 38 39 39 59 43 36 37 41 32 31 31 31 30 32 37 33 30 24 24 27 37 37 37 32 32 22 22 24 20 23 22 20
29 28 37 39 25 16 10 10 10 10 11 13 20 15 19 19 13 15 13 13 18 30 24 28 22 22 22 22 25 25 14 10 10 10 17 19 16 22 14 30 28 19 11 9 12 8 8 12 19 19
12 14 20 28 26 28 24 17 18 14 13 12 12 10 10 16 16 18 20 22 17 16 15 18 14 12 13 17 19 11 11 11 12 17 8 8 8 9 10 11 13 10 17 17 28 30 30 30 28 25
17 12 10 10 9 9 8 11 13 10 14 10 16 9 9 9 9 12 12 17 19 19 32 37 23 23 37 33 33 24 30 14 12 12 13 14 8 9 9 9 15 14 14 15 8 13 8 8 8 8
9 18 14 15 14 14 9 14 16 9 9 8 10 10 11 15 13 9 9 6 10 8 8 8 8 10 16 18 13 10 10 10 9 11 14 10 15 13 11 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 9
10 10 12 10 10 9 9 10 11 12 12 10 13 11 10 11 13 13 13 10 14 9 10 10 9 9 9 11 11 9 8 7 8 8 10 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 12 11 11 11 10
10 13 19 22 25 9 9 9 9 9 9 12 11 8 10 8 8 6 6 6 8 10 10 9 10 10 13 15 12 14 9 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 13 12
13 12 9 15 14 17 10 9 8 8 8 10 15 16 17 17 15 22 12 11 9 9 9 12 14 17 11 11 10 11 10 10 11 11 11 13 16 12 12 11 11 10 10 10 10 10 10 15 12 11
12 12 9 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 11 7 6 6 6 6 8 10 8 8 11 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 11 12 12 12 10 9 9 8 8 8
8 10 8 8 8 21 12 12 9 9 9 8 8 8 8 10 12 15 13 8 8 6 6 8 8 11 11 21 8 8 8 8 10 10 15 16 22 26 20 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 6 6 6 7 6 6 8 6 8 6 6 6 7 12 13 15 8 8 8 8 8 10 12 21 22 19 19 14 19 19 33 26 36 29 30 35 36 33 34 34 36 37
37 36 36 36 36 36 53 53 59 59 59 59 59 47 29 23 9 9 8 6 6 6 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 21 25 41 39 25 25 3 0 3 21 21 33 33 37 59 39
33 33 33 33 33 25 19 8 6 6 6 6 6 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 22 24 30 34 44 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 57
46 54 54 54 54 68 68 54 57 54 59 48 48 48 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 38 38 16 15 15 38 38 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 57 59 59 59 68 68 68 68 57 57 48 57 44 44 43 46 46 48 59 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 54 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57 48 59 59 34 34 11 11 12 29 29 59 48 48 48 34 25 16 11
11 15 15 15 11 11 11 15 24 32 34 41 41 29 29 11 15 15 41 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 47 44 48 43 43 46 46 54 54 54 48 47 43 43 39
39 43 37 42 39 37 37 44 48 57 68 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 48 59 57 59 59
59 59 48 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 48 57 32 44 32 37 32 44 44 59 59 57 57 54 57 54 54 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 54
54 48 59 59 57 57 59 59 59 59 50 50 53 53 53 50 57 59 59 59 59 59 59 59 47 59 59 59 39 37 32 32 37 37 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 28 24 24
30 34 59 59 34 34 11 11 12 34 34 68 68 68 68 68 57 57 57 59 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 59
48 48 57 59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 43 48 47 39 36 39 37 39 39 32 27 32 28 28 37 41 27 34 23 22 22 34 34 37 37 37 37 31 31 37 34 34 23 23 24 32 34
41 41 39 39 39 23 23 12 12 22 28 30 36 37 43 59 59 40 39 31 31 35 37 37 39 39 40 41 59 27 19 9 9 9 14 18 23 19 19 12 25 24 26 26 21 15 15 21 19 33
33 37 37 37 37 21 21 12 13 12 20 22 30 22 21 15 14 13 12 10 10 11 12 12 11 11 12 22 22 30 37 23 30 20 8 8 6 6 8 8 10 10 17 16 20 20 28 25 16 12
9 9 11 10 10 10 13 13 15 14 9 9 9 10 12 9 9 8 8 8 8 11 13 22 25 25 25 22 17 14 13 9 10 12 23 23 9 9 9 14 15 31 20 19 16 10 10 11 11 11
11 21 17 19 12 13 9 9 9 9 10 11 11 13 9 9 9 10 18 21 13 13 18 18 24 22 26 18 18 12 12 10 13 8 8 8 10 13 13 13 12 19 8 8 8 8 8 8 18 10
10 8 8 8 8 8 9 19 22 23 11 13 9 8 10 8 9 9 9 9 10 10 16 25 24 26 19 19 21 19 15 10 10 10 15 15 15 11 9 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8
8 8 8 8 9 10 11 13 13 9 8 10 8 9 9 10 13 15 11 11 15 15 12 12 11 11 22 10 9 9 10 14 14 13 10 9 9 10 15 12 10 9 8 8 8 8 10 10 10 9
8 8 6 6 8 8 8 8 10 17 19 15 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 10 12 16 10 12 12 16 21 18 18 12 10 10 13 16 12 12 12 12 12 11 10 10 8 6
6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 10 10 8 9 9 12 11 14 14 11 10 10 8 8 6 6 10 8 10 9 9 9 9 10 10 10 9 9 9 9 11 11 11 12 12 11 10 10 10
10 8 8 8 8 8 8 10 12 13 22 11 8 8 10 10 12 12 9 9 12 12 10 8 8 8 8 6 6 8 10 10 11 11 8 8 7 7 10 6 6 6 6 8 11 8 8 8 8 8
6 6 6 6 6 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 7 7 9 11 14 13 13 10 10 10 10 11 11 11 |