BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-069M22.T7 (MSMg01no069_m22.b1) | MSMg01-069M22.TJ (MSMg01no069_m22.g1) |
ACC | AG293978 | AG293979 |
length | 730 | 699 |
length of high quality (start - end) | 251 (71 - 321) | 104 (55 - 158) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no069_m22.b1 PHD_FILE: MSMg01no069_m22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:16:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no069_m22.g1 PHD_FILE: MSMg01no069_m22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:16:39 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCGAGGATCCGCGGAAT
TCCTGCACCTTTCCACAGGATATATCCCTGATGATTCTCTCTGGGCAGCT
AACTAGACCCCAAGGAGGAACACTTTCAACTCATTTACAATGGCAGTTTG
GAAGGATTCACAATATCTGATCACCAATCTCACTGACTGATCCCAGCATG
GACTCTTGTGTGGTCTCAGCACAGTCTCATGTCGTGGACATGATCTGCAC
ACATGACCGAGAGTCCCCCCATCCCCGCTGCCATCATGTTAGAATTTGGT
AAGAACTCACACATGAACTTTCTACATGGCCTCCTGCTGTGATATGACAC
ATGATCTATTTTAATTTCCCTACTTGCAGGTCTGATTCGCGTTGAGGTCT
TCATCTTTACCACAGTCACCATGTGGGTCTTCCTTCGCAGCTACTCAAGC
TTCAGCATGTCAATTATTTCTTCTGCTCCTGCCGTTTGGCCGCTTTGTCG
CTCGTGGCCATAATCCCCTTAGTCATTCACTATTCCGTTCGACCTACCTC
TCCCTTTGACCTGTGCCTTACACCCCTTCTCGATGCCGCATTTTCACGTC
CTTTTGGCTTTTGTGCATATTCCGTATTATAATTCCCGGTATTTCCATTT
ATCCCTTTGTTCCAGTCATAATAGTTATTCTTAACAACCTTTATCTTAAC
TTATTTTTTCCACCTTTTCGAATTTTACTT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXAGGTTGTCAGGTTTGCACACCCATCTCATTGTTCCCTTGTAAAAGTA
CACATCTAGGTATTTGTGTATGTGTGCACTGTATATACGTATGTTACATG
TGTGTGTGTGTATGCACACATGTGGGTGTGAATGTTTGCACTTGTGAATG
CCCATGCAGACACCAAAAGATGTCATTAACTGTCCCCTCCATCACTCTCT
GCCTATTCCTTTGATACAAGTCTCTCCCAGAAACCAAGCCTTCAATCTTC
TCTTTTTTACAAGTACTCATCCAGATCCCCGAACCATCTTATTTAATGGT
TTCCCGATACAAAACCCTATAATTTATAACAGATAGCCAGTGTCGTTCTC
CCCTTAAAAACTATTTAAAATGTTGGGGTGGGGTGTTCCTCACACCCCGC
CCTTCCCCATTCCTATCCCTATCACCTATCATATTATACCAGATATTAAA
CCTAAACCTTCTCTCTATTCAATAAATCCAAATTTATATCTCATCAAAAC
CCTCCTCCAATTATTTATACCTTTTTCTTTTCCCTTCTCCTTTCTTCCCT
CCTCCCTTCTTTATTTAACTGCATTCCGCCTTTTTTCTATCCCCTTTACC
TTTCTTATACAAATTCTAAAATTCATTCAATATTTATTTTTACCTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 11 16 30 30 30 22 19 18 16 15 17 10 9 9 15 15 29 24 22 19 10 10 10 19 22 30 16 10 9 9 9 9 10 8 10 10 15 16 20 28 32 34 30 30 29 36
31 31 39 31 23 22 8 8 10 10 12 18 14 9 9 9 11 11 11 11 12 28 26 33 33 47 47 57 47 50 53 36 42 37 37 40 40 57 57 48 42 27 21 13 13 28 28 32 37 43
43 43 42 42 36 30 30 42 32 42 32 32 21 28 25 25 25 32 19 21 12 15 15 32 23 40 40 46 46 46 50 50 50 50 57 40 37 28 22 22 36 23 32 32 39 42 44 43 43 35
42 42 43 37 41 50 50 42 42 35 35 38 47 50 57 41 47 41 50 50 50 47 47 52 57 52 52 52 43 43 32 32 32 43 43 52 52 41 50 57 36 35 32 37 44 44 57 43 43 34
19 17 24 24 44 44 57 57 44 38 27 20 20 34 36 34 34 18 20 23 43 38 39 39 43 43 43 39 39 32 36 27 20 16 21 16 16 16 32 38 52 43 43 37 32 26 15 13 13 13
13 17 32 32 43 23 23 18 21 12 11 11 15 26 38 43 43 43 38 36 16 16 15 34 30 35 35 43 43 33 29 29 28 32 32 32 32 32 32 32 20 20 20 32 32 32 24 12 12 12
12 11 12 24 32 31 37 30 39 37 39 39 37 31 32 20 20 20 19 29 18 15 15 21 16 17 17 14 14 28 28 40 43 33 24 14 14 9 10 11 12 12 27 27 39 33 28 25 25 25
31 19 19 10 10 10 17 12 13 12 14 12 17 20 24 27 24 35 31 28 28 25 25 25 25 22 15 11 8 8 8 8 14 15 39 28 25 20 12 11 11 23 20 13 9 8 10 10 16 19
36 39 43 36 43 37 37 33 30 14 13 8 8 8 10 8 8 12 12 37 30 26 22 16 11 11 11 11 18 22 23 17 15 14 13 14 21 18 22 24 24 23 21 14 14 14 21 26 30 16
13 11 11 9 12 11 11 11 9 9 9 11 13 13 14 15 12 14 10 10 10 10 10 19 19 15 10 8 8 13 10 10 18 13 20 17 16 11 10 15 8 9 9 9 11 11 7 6 8 6
10 10 10 10 11 11 11 11 12 12 12 12 12 11 16 8 8 8 8 11 6 6 6 8 8 11 9 11 11 16 11 11 10 10 8 10 7 7 6 6 8 8 10 9 9 9 9 10 10 11
10 6 6 6 6 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 10 10 8 8 8 9 9 10 10 10 16 13 10 10 9 9 8 10 10 10 19 15 13 13 13 10 9 9 9 8 8 8 9 10
11 11 11 10 10 10 8 8 8 8 9 8 10 8 6 6 7 6 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 9 11 11 11 10 16 12 12 12 9 8 8 10 8 13 9 9 9 9 6 8 8
10 10 9 8 10 10 12 8 8 11 8 8 8 6 6 6 8 8 10 11 11 8 8 8 8 17 10 18 16 16 16 18 19 14 13 11 6 8 6 6 10 8 17 10 10 10 10 11 11 11
12 11 11 11 19 15 19 19 12 9 9 8 8 8 8 8 7 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 7 10 6 6 6 10 16 30 23 26 13 19 11 13 16 21 10 10 10 10 19 19 23 14 14 10 14 8 8 10 20 21 31 26 16 16 15 17 24 30 33 31 31 25 19 19 13 11 13 24
24 19 18 12 16 16 28 32 35 25 29 30 29 29 28 36 33 28 30 42 42 43 37 37 37 41 41 47 47 47 47 47 41 41 44 57 47 50 50 27 30 12 12 12 32 19 30 32 30 19
14 9 9 9 9 9 11 18 18 25 22 28 36 43 43 28 24 24 28 32 43 21 21 15 15 15 32 36 32 32 24 24 24 28 24 32 32 15 19 19 22 19 21 19 19 22 32 32 37 37
30 35 28 21 21 14 16 19 24 18 21 22 21 21 12 13 18 20 18 20 28 37 30 21 12 11 11 17 15 9 9 9 10 13 13 25 25 28 28 28 37 30 30 28 25 24 28 28 25 25
25 28 28 30 32 30 24 25 21 24 20 15 15 24 24 24 24 15 9 9 9 9 13 15 15 11 11 11 12 12 15 21 23 12 15 19 15 15 16 16 20 21 29 26 35 35 40 42 28 28
20 19 19 19 16 18 16 24 24 24 25 18 16 11 10 10 10 12 11 12 12 21 19 21 25 25 18 18 12 12 11 18 13 9 8 8 10 10 8 13 12 16 12 14 14 22 23 30 28 14
10 9 8 8 8 11 11 8 10 10 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 17 18 15 15 17 15 10 10 9 11 9 8 8 8 6 6 6
8 11 12 12 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 12 12 10 10 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 9 10 12 9 9 9 9 11 13 8 10 8 15 12 10 9 15 14 18 19 19
14 14 10 9 9 9 13 10 9 8 7 7 7 9 10 10 10 17 15 11 10 11 11 11 10 10 9 9 11 11 11 13 16 13 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 10 9 9 8
8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 12 10 10 10 10 6 8 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 18 12 11 11 15 19 10 9 11 11 9 9 9 10 9 9 9 9 11 10
9 9 9 9 9 11 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 9 9 13 12 12 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 10 10 9 10 12 8 8 6 6 6 6 6 12 8 8 8 8 8 8 10 13 10 11 8 8 8 8 8 8 8 11 10 11 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 10 14 14 10 10
11 10 12 16 12 11 10 10 10 8 10 8 10 10 12 7 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 6 8 10 13 9 9 11 10 10 10 10 15 15 21 21 21 23 10 8 6 6 8 8
8 8 9 10 10 11 9 9 9 9 10 10 12 12 12 11 10 10 10 10 10 9 12 10 10 8 8 6 6 10 8 9 9 11 10 10 10 8 10 10 10 10 9 11 16 15 15 10 10 |