BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-103L05.T7 (MSMg01no103_l05.b1) | MSMg01-103L05.TJ (MSMg01no103_l05.g1) |
ACC | AG318503 | AG318504 |
length | 720 | 698 |
length of high quality (start - end) | 308 (51 - 358) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no103_l05.b1 PHD_FILE: MSMg01no103_l05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:02:42 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no103_l05.g1 PHD_FILE: MSMg01no103_l05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:02:42 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCCCTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCATGGGCTTTTCTAGATCTTCAAAGCAGAGGTGAGAGAGCT
GAGTTGATCAGAACAAACTTTAGGGAGGAAGGAAGTCCTAAGAACTTTTA
ACTATGGTGAATAGACACCATCAGCACCATCTTGTTCTCCTGTGGTTCAG
CCACGGAGACTCCTATACAACTCTTGGGTCAACTCTGGTCTATATGACCA
GTTCTATCCTAGGGTTGTGGCAAAAAGCAATGTTTCAGAACTAAGTTAGG
GGTGGGGGAAAATCCTGTTATATTCTCTTTTCCCCCCTTGCTATGAAGGT
TATATGTTCTGGATGTTGTTTCCCTCCCCACCCTGCAGGTTATTGGTGGC
TTTACAGCTTACGTTTTTATGCGACGATTATTAGGAGGGCTCCTGCTGAC
CTGCGATGTATATCCCCACAACCTGCATTATATTAGCCCTCGCCTTATGC
CCCTTTGATTTATGCACCATCTGCTCCTGCTTCTTATCCCCCCCCCTTCT
TTCCCCCCCACCTATATTCCTTTACCGTGTATTACCACTTACCACCCTAT
ATTATTATTAAAATTATACTCCATACAACAATTCCACTCCGATAACCCCT
GTGTATGCCTCTATTACTCACTGTTTTACCCCCCACTTTTATCCCCCCCA
CTTTTTTCCTATCCCTTCTA
| CTCATGAAGCGAGAGGCCCGGNGGCGCCTGGTTTCTAAGCCCGCNGAACN
ANAGAAGGATTTCGGCACGCAGGGNGGNNAAANNGAGGGNNNNNCNNNGN
NNNGNNNNGNNNNGCNCCGCCCNACCAACNNCAAANAAACAGGACAGCAC
GAAGAGCAAAACAGAGCCCAGCAAGACCAGCACGACACCACCAAGGCCAC
CGAACAGGCACGCCAANAACCACACACAAAGAACGAACCGGACGGACAAG
ATTTCAACGGGCGGGCCGGACCACCCGGGCNGGCCAGGACCACCAGGGCC
GGGCAACCACCCGACATTTTTTTTATTCCGGCCAAGACCAGCTCCTACAC
ACAGAAAAAAATATCCCCCCCCCCCCTGCTAATGAACATTTACAGAATAA
TTTTCAACCACTAACTCTCTTGTGTAACACTACACATTTCCACCTTAACT
CTATTATCGACACCCCTTTGTGCCTCCTACTCTCACACACTACACCTATC
TCCTATACCCATGCACGCCCCAACCGTCCTACCTATGAACACACCAACAT
AAAACGACGTTCCAAACACACAATACCCTAAAAAACAACCCGAAACAATC
ATACCCACCAGTTTTAACACCCCACAAAAACACCTTCTAACCTTCTTTTT
TCGCCTATTTTTTTTTCTCACTTTCCCCTTAACAACCATTACAATTTA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 17 15 11 11 11 15 18 25 30 37 30 25 25 23 16 19 8 8 8 19 19 33 43 39 28 26 22 22 16 15 11 6 6 6 6 6 6 11 14 16 16 17 16 14
19 25 33 41 53 53 44 44 50 33 33 31 21 11 8 7 8 6 6 6 6 6 6 12 15 26 32 30 30 33 30 30 35 36 36 36 36 36 36 43 43 43 50 57 43 43 42 42 42 42
42 43 43 48 48 48 41 42 36 23 23 36 37 48 48 48 47 48 48 44 44 43 43 39 44 36 37 41 41 43 43 59 57 57 57 57 57 57 47 42 35 37 42 47 57 57 57 57 57 54
54 57 57 57 43 43 35 37 37 50 50 50 47 47 47 41 46 47 50 52 57 52 43 43 52 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 43 43 43 52 43 44 44 38 38 35 47 43 43 42 43
57 57 50 37 37 37 43 43 52 44 44 43 43 43 57 44 43 35 35 42 43 52 57 57 50 43 35 35 35 43 43 43 43 43 43 43 43 43 44 35 43 43 50 50 32 32 17 17 14 24
14 28 28 44 44 57 57 57 57 59 43 43 37 37 32 32 30 24 19 14 13 13 15 19 18 23 11 11 11 23 22 37 36 31 22 22 16 22 22 39 39 43 42 35 35 30 32 32 32 32
30 30 35 37 37 37 35 35 35 39 39 39 37 37 24 24 18 18 18 30 30 27 28 12 15 12 12 12 16 20 18 28 28 35 39 39 48 43 43 43 39 37 36 34 33 30 25 28 28 35
35 43 37 32 22 10 10 14 16 21 16 19 19 15 15 16 15 15 14 18 18 15 12 15 13 14 14 14 12 12 12 18 15 15 15 11 12 12 15 12 12 21 24 30 21 24 23 20 18 11
11 9 9 10 10 16 19 13 13 15 13 13 15 19 14 14 9 10 10 10 15 13 15 13 14 15 13 17 21 17 13 13 10 10 13 12 12 13 18 14 19 13 14 11 11 11 10 10 10 8
8 8 8 11 11 10 10 12 8 8 7 9 11 11 13 13 11 10 8 10 10 10 8 8 6 9 10 10 11 11 11 10 10 13 13 16 21 21 12 12 10 10 12 12 15 10 10 16 13 12
12 11 9 10 10 10 10 10 8 8 10 8 9 9 9 9 9 9 10 10 14 9 9 9 10 10 13 23 19 15 8 10 8 8 8 8 10 9 9 11 10 19 11 11 9 9 9 10 17 18
18 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 12 9 10 9 10 10 10 10 11 11 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 9 10 10
10 8 8 10 8 10 12 12 18 20 29 15 17 11 11 9 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 10 10 10 9 9 9 9 10 8 9 12 18 15
15 10 10 10 10 10 9 8 9 12 12 12 9 9 11 10 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 8 6 6 6 8 10 12 14 14 14 10 10 14 13 13 8 8 6
6 8 8 12 16 17 22 22 13 13 12 11 11 11 8 8 8 10 8 8 | Open.Hide. 7 7 7 10 8 8 8 8 6 8 7 7 9 11 11 14 28 18 12 19 3 0 3 8 8 10 10 27 23 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 3 0 3 15 14 3 0
3 0 3 23 23 23 9 9 9 6 7 6 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 9 3 0 3 3 0 0 3 18 3 0 0 3 23 27 25 3 0 0 0 0 0 3 0 0 0 3 0
0 0 0 3 0 0 0 0 3 0 0 0 0 3 3 0 3 7 9 9 12 3 0 3 8 6 6 8 3 0 0 3 9 9 3 0 3 9 8 8 9 7 7 6 8 8 10 8 8 6
6 7 11 8 9 10 13 9 8 6 6 6 6 8 8 11 11 11 11 12 13 12 14 13 18 23 11 9 9 9 15 8 6 6 8 8 10 6 6 6 6 6 6 6 15 12 12 10 22 15
21 20 20 18 28 28 23 19 16 11 11 12 25 23 13 3 0 3 7 7 8 8 8 10 11 10 18 17 26 17 15 11 9 9 9 7 8 10 15 13 15 8 6 6 8 8 16 16 11 9
9 12 10 10 9 9 9 9 8 13 8 11 11 17 17 9 9 9 12 12 30 27 25 12 10 10 13 13 9 3 0 3 12 12 9 9 9 12 12 21 17 17 10 10 11 11 11 11 10 9
8 8 6 6 8 6 8 11 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 15 18 24 12 10 8 8 10 9 12 9 9 12 9 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 16 15 19 15 21 15 8 6
6 6 6 8 8 12 12 12 12 12 14 14 14 17 10 11 10 14 11 9 12 11 17 10 10 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 10 10 12 10 9 9 9 13 11 11 11 11 12 8 8
8 9 9 10 10 12 14 13 13 10 8 8 8 10 8 8 8 11 12 15 11 11 9 11 9 11 11 10 9 9 8 6 6 6 8 8 10 14 8 6 6 6 8 8 9 9 9 9 10 10
10 11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 7 9 10 10 10 10 18 16 10 10 6 6 8 10 10 8 7 7 9
17 20 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 11 11 11 13
14 11 11 12 11 11 11 11 11 11 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 16 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 10 10 9 9 9 8 10 10 8 8 7 7 8
8 8 8 10 10 9 9 13 9 11 12 18 12 10 9 9 8 7 7 7 6 8 6 6 8 10 11 11 11 6 13 6 6 8 8 8 8 10 10 12 12 10 10 8 8 8 8 9 8 10
8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 13 13 19 15 12 12 11 11 10 10 8 10 10 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6 7 7 7 8 8 6 |