BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-104G05.T7 (MSMg01no104_g05.b1) | MSMg01-104G05.TJ (MSMg01no104_g05.g1) |
ACC | AG319013 | AG319014 |
length | 909 | 681 |
length of high quality (start - end) | --- | 476 (81 - 556) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no104_g05.b1 PHD_FILE: MSMg01no104_g05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:03:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no104_g05.g1 PHD_FILE: MSMg01no104_g05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:03:38 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCCGAAGAATCCGG
TGGAATTCCACATTAAGTTTTCCTATAAACAACTCATATCTAACAATGAC
CGTTAACAACACATATTTCAAGAATTTATTAGTCTACGATTTCTCATCGC
CCTGTTACTCCTGAAAACTACTTTCAAATTGCATCTTTCTATACTTGTTA
TTACCTTCCTCCCTTACCTTCTATATAATCTCACTTCTTACCTCACACTC
ATGACTTCAAACTACTCGGCTCCGTATCGTAAAACTACCTACATATTACC
TTCGTACAAACTTCCATCTGTCTTACTCCGTATCTCTTTTCGTTCTAACA
GCATATCATTCACCATATTATATGACATCCACAATACTTGTTAATTCTTT
GCTATAATAAATACCCATTAATGCTATATCACATTACACTGCGTTACTCC
ACACCCCCCATCCTCCACACAACCTACCGTCTACACCTTTACATCTTTTC
CCCTACCCACTACATCACTTTTCGATACTATACATAAAACTCCTTTTCAT
GTACAAACACCGCCTTTTCCCATTTTCTTCCCATTTTATGCGTATTATAC
CTCAATCCCTTCAACATCTTATTCAACCAGTATTCTCATCCCTTATCCTA
TTCCGCTTTTTTCTCCCGAAGCATCATCCCTTTTTGTCTCTAACCGCTAC
CCCTCTCCTCCTAATATTACTAATCTCCACGTAACACCATATCTATTCTA
TCCTCCATCATTCCTCTCCTATCCCCTTATACCATCCCGCTCTTATACCT
ACCTCTCCTCTTCTCCCTATACCATAATTTCACCGTTCATATTCCTGCAC
AACACTTCCTTTTCTCATATATTTTAAACAACCTATGTCTATATTGTGAG
CCTTATGTG
| TTTTTCTCGATGAAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGGGAAATAAATTCATAGAG
CTAGATTTTGATAATCGGTCTTTATTTGTTGACATAATGTTTAGAGGCAA
AGCATTGCATCTGAATACTTCTGCTGTGGATCAGTTTTCTTTTGTGGACA
ATGTACAAAATCAGCTAAAACTCTGAGAGCTACAAATGGCCAAAACATAG
AAATCAAATTGAGCTTCTGTCCTTCCTTTCTCTATATGTAGAGAGTGGCC
TGTCTTCTTAACAGACACATTATGCAACATTAAATAAGGAGACCTGATGG
GTTTCAGTTTTTAATACATTCATATTTTCCAAACACTAAAAATATATTAG
TGGAATATAACCTAATGTGATTCCCGATTTTCTGATAAGAGGACATGTGC
ACCATTCTCTTACTTACACAAAGAAATAAAATTCTCTACACTCTAACCTA
ACTGACTATGAAAGTGCTTCTTTAATGGCCCACAACATTAACTTATAGTG
AACAGCAGCTGAGAGTAGAAGACAGTCTTGGTCAACAAGATATAATCCAG
GGACTTCCTGTCATCCTTTAATGTCTTGCATGGATAATACATGTGAGTAA
ACTCTTAGACGCTTTAAAAACAAAGTTAAAN
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 11 11 13 13 19 25 23 22 18 18 16 20 23 28 28 34 34 28 28 22 30 32 22 16 19 19 19 22 21 9 9 7 7 9 9 7 7 7 8 8 9 10 7 8 6 6 8
8 13 9 9 19 19 10 8 8 10 15 19 16 7 7 6 6 6 8 6 6 6 6 8 12 12 6 6 6 6 6 6 8 10 10 15 10 8 8 8 8 10 10 18 12 8 8 8 8 8
8 8 10 15 24 22 12 12 9 9 12 12 21 24 28 12 13 7 6 8 8 11 11 15 17 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 7 6 8 8 8 8 6 6 10
13 17 15 9 9 10 10 10 8 8 8 10 16 16 13 12 12 8 8 6 7 8 12 9 9 9 9 8 10 7 9 8 8 12 9 9 10 12 13 6 9 6 15 8 8 8 8 8 12 15
15 8 6 6 13 10 13 12 9 7 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 15 13 10 8 7 10 6 6 6 6 8 8 9 8 15 16 20 16 12 12 8 8 8 6 6 7 13 15 15
9 9 10 9 9 12 12 21 9 9 9 9 10 12 19 15 13 8 8 8 8 8 13 8 9 13 10 13 10 10 10 10 9 13 13 8 8 8 10 10 10 10 8 8 10 10 11 12 13 15
13 8 9 9 10 8 10 10 10 10 6 6 6 15 11 9 9 10 9 14 9 10 8 10 7 9 10 12 18 12 10 8 8 12 8 6 6 9 7 11 8 8 8 6 8 7 6 8 8 8
8 6 7 8 6 9 10 10 10 13 13 13 11 11 14 15 10 9 9 9 11 11 11 10 8 8 8 8 10 8 10 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8
8 8 7 6 8 12 6 9 11 10 8 8 8 8 8 12 11 11 13 15 12 8 10 10 8 8 12 20 12 13 8 8 8 8 12 6 9 9 6 10 8 12 8 8 8 13 8 9 9 13
13 8 8 8 8 10 15 13 11 10 10 12 10 10 11 8 8 8 9 11 10 11 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 6 6 6 7 7 11 14 9 8 8 8 8 8 8 16 15 17 19
19 16 16 12 12 10 10 9 9 9 10 10 9 9 9 12 8 8 8 16 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 11 8 9 8 10 15 8 6 6
6 6 6 8 8 8 11 9 12 10 12 10 10 12 16 13 10 12 8 13 8 10 10 12 11 9 18 15 12 8 8 8 8 8 15 12 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 19
12 11 7 7 8 8 12 11 12 11 13 8 8 8 12 7 7 10 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 13 8 8 6 6 8 6 8 9 9
10 20 10 9 8 8 8 8 10 10 14 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 7 8 8 8 6 6 6 6 7 11 10 13 9 9 9 9 9 9 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8
10 13 11 16 11 15 15 17 16 15 14 10 10 6 6 6 8 12 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 7 9 9 9 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 10 10 15 9 9 9 9
9 9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 11 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 9 11 12 14 10 9 8 8 8 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 12 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 13 13 19 18 16 17 12 13 8 8 8 8 6 6 9 9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 10 9 11 11 12 10 8 8 8 6 6 6
6 11 10 8 8 8 8 8 10 11 10 10 6 6 8 6 10 8 12 10 8 8 8 10 16 10 10 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 7 8 7 8 8 21 11 10 9 11 9 6
8 6 6 8 8 6 6 6 6 | Open.Hide. 9 15 9 9 7 6 6 6 8 8 8 10 10 9 9 21 12 9 9 10 19 27 42 33 33 33 33 33 33 41 42 41 47 32 29 17 13 12 9 6 6 6 3 0 3 10 10 17 19 22
30 37 37 33 36 36 36 33 33 33 26 17 9 8 10 10 8 7 9 9 25 25 41 41 33 33 33 33 31 36 32 35 32 34 30 34 37 43 43 43 50 37 37 36 36 37 36 48 48 48
48 54 48 48 48 48 48 48 54 54 54 50 50 50 48 48 43 48 41 41 42 48 54 54 57 48 48 48 50 50 50 50 50 50 50 48 47 47 47 50 42 42 39 43 47 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 50 50 50 54 54 50 57 57 57 57 57 57 57 54 54 50 50 50 50 50 41 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52
52 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 57 57 52 57 45 52 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 43
43 43 43 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 43 43 43 39 39 32 26 12 12 13 14 33 43 43 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 35 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 52
52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 54 52 62 62 62 44 44 35 35 35 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 62 43 39 39 57 57 57 57 52 52 43 44 42 42
39 43 43 52 52 57 57 43 43 39 39 39 44 43 43 43 39 39 39 43 57 57 57 52 52 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 43 43 32 32 35 43 43 52 52 52 43 43 43 43 42
43 35 43 43 52 57 57 52 52 52 57 52 54 54 50 50 50 50 50 37 37 43 43 43 50 47 44 43 57 57 57 47 57 57 57 57 57 32 32 13 13 19 32 32 35 35 35 47 42 43
43 43 47 57 43 43 43 57 57 46 43 43 37 28 24 20 24 24 36 36 43 43 46 48 43 43 41 41 35 35 39 42 42 34 30 26 26 23 30 36 43 31 23 21 11 11 19 23 31 24
24 28 24 28 23 25 17 17 17 21 21 11 11 11 18 21 28 28 28 24 24 28 34 28 23 23 20 28 25 22 19 32 32 32 33 33 33 33 33 37 40 37 29 29 20 19 18 21 28 28
30 33 33 33 33 33 43 43 33 26 26 15 15 16 30 26 32 24 30 17 13 10 10 10 12 17 17 28 28 19 19 12 12 11 16 16 23 22 18 12 10 10 10 11 13 10 12 14 16 24
28 43 37 40 22 19 11 11 10 10 9 9 10 19 13 19 13 13 12 15 16 13 14 14 23 19 17 10 10 3 0 |