BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-107C08.T7 (MSMg01no107_c08.b1) | MSMg01-107C08.TJ (MSMg01no107_c08.g1) |
ACC | AG321041 | AG321042 |
length | 1,322 | 1,402 |
length of high quality (start - end) | 335 (131 - 465) | 277 (133 - 409) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_c08.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_c08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_c08.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_c08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:36 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (22,958,561 - 22,958,888) | (23,080,020 - 23,080,296) |
---|
sequence | CAATTTTTTGNNGATCATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCTTCATTTGTCCAGTACCCATTAGGATATCCTCCCCATCAT
CCACCTCACTGAGAGCCCGTTTAAAATGCCCTTTTGATTCTGAGAAACTC
AAAGGAGCTTATTGCTTTGAATGTGAACATTTGGCTCCTCCACAAACTTT
TCAGTCATGAGTTTCTATTTCTCCAGAGTTGTCACATGAGGCCTGGGTTG
TATAAAGATCATTATTTATGAAAAAACAAACAAGGGCAGATTTCAACGGT
CATACAACATTTTTATACTATTTCTTAACATGGATTTCAAATACCATGAC
TCATGGAGGCTTTGAGCTCTTGCTTCAGCCAGAGCCTCCAGAAGCAGCTT
GCTTCTTTCTTGTTTTTCCAGTCTGGTAGATAACTCCTTGTCATCCGCCC
AGCTCCCATCATTTTCCCCGACCCGTCCAGGTTAACGTAGCATTCATAAA
TCTAATCCTCTATCCTAGAAAGACCAAGAGATACATGATATATCCCTTGA
GGGATTAAACTACCAGACCATTGGCTGGTACGAGATCCAGTGCTCACATG
GATTCCTATGAGGTAGGCTTTGATTTTAGCTTCCTTAAAAATGTCCTTGG
AAACCTTTCTTTTTACTCTCAAGGTGTGTTCCTTACGTTTTTTAAGAGAA
GACAGTTTGTTAGCCAAGCTGAGTTGGAAATTATTTACTTCATTACAATC
TTCTGTGTTGTTGCAACTGTCTGAAAGTTGACTTCTTGTTTAATTATTGC
CCTAAAAAATATCATATCCTGATTGGGCCTGTGCCCTTGCTTCTCAACTA
TGCTGGCCTGTACTTAATCAATTTTCCTATTGCTTGTTCAAAAACTATGG
ATTATGTTCACTTGTTTTTATTTTTTAAATATTTATTTCTTCTCTTGTTT
TACTCTTTCACAGGTTTAACTCCTTTATCTCCCTTGTAACGTAAAATATT
AACATCCCTTCTTAATCAAAAAAGCCCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCATATATAATAAATATCGGGTGACCCTCTTGGCT
CCCTGAATACCCCTAAAATTCTCACCCTCATGGAAATATATTTCCTCCCA
CCCAAGAATCAATTTCTTATTTTGTTCAAAGGCTCCCTTTCTCTCCAAAT
CTCTCTCTTCAATTATTGTGCCCCTCTCCTAACCCCTATGAGTTGCACAT
CTCTTTATATTACAATCCATTCTCCTTGTAGTCATACATACTCCTCTCAG
TATTATCTATTCGGTATATTAT
| CCGGATATTTTNNCCAAGATGTGAGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTAAAGGAAGAGTGGGTTA
AAGAAGTCTTAGACCTGTCCCCTTTGAGGCTCAAATCCTCAGCTCCCTTA
ATGTATTCTAAGATGAGAAGAGACGCCCAAGCTCCCTAAGGCTCCAGGCC
TCTTTAACAGACTTACGATACTACAGCCCTTTCGACCACCGAAGCTCATG
TGACTTAAGTTAAAGATGAACTCAATTTGTAAACAACTCTTGCATTTGGA
AGTTTTATTACTACTGTTGTTGTTGATGTTGTTGTTGTCTTGGCTTCTCT
TCTGCAAACAAAACAAAGCTGGTACCTGTCCAAAAACTCTAACCTCTGGG
ATACCTCCAGATATTTTCTCTTTATACCTTTTGTTGCATGTATGAATTTT
GAGTGTTGGGGAAGTTTTGTGCCCGCCCCTGCTATAGTGCCTATATAGGT
CAAAAAAGGGGGTACGGAAGCCAGCTCTTTTCTTTTATCACATGGACCCT
GGGGACCAAACTCAGGTCATCATGTGCAGCAGCAAGCGCCGTTATCCATT
GACTCATCTCAGTGGTCCAGAGACTTATTCTTCATTTACAGGTAATTAAT
ATCCCTATACATGATTTACTTGTATGATTATCTCAGTCATTTACTAATAT
ATGGTATCACTTTCTATTACTATCCCATAGTTTTAATGTTTATAACGCAT
TACAATCTACCTAAATATCTTTTTCTTTTAACCCGGCATATCTTGTTTTT
ATTAACCGGCCATTCTGTATTATAAATTAGTCATTCTGTCATAATTCTGG
TATTGCTTCTTATAATTTCGCTAGTGCCTGCATTCAGTTTAAACTTATGC
TCTGCTCTCTTTTAATTTTTTCAAATTTTTACTCTTCATTTTCCTACCTA
ATAACTACTCGTGTTTCTTCACATTAAATCTATTCATTTAATGGCCATTT
TTTACACATCACTCATATCTTATTATATGATTATATAACTTATCGTATCC
TGCCTATTAACATGCTCCTCATCTAATCTTTCTACCCTTCTTACTTGAAA
TAGTGAGTCAACTTTTATCATCACTGATTAATACTCAGTGTATTTATCTT
TTTCGGACAAACTCNCTCATTGTCTACTCTTCTCTTCGACTAATCCTTTC
TTTCACACATCTGTATTCCTTTACTTATTATCATCTTTCACTCTACTTCA
TATATATAATTCTCTCCTATCTCATCATATCTTTACATCGCGCGATATAT
TNTATCTTTCATCTAATTCATGTATTAACTCGTACNTTGATCTACATTCT
CTCACTATTATATCTTCTACGTCGTGTGTATATCTCTATCATTATNCTAA
TA
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 8 8 8 9 9 3 0 0 3 7 8 7 6 6 7 6 7 7 10 13 15 9 6 6 6 8 19 15 8 8 8 8 8 10 17 26 36 28 17 22 22 37 37 43 47 43
47 47 47 42 42 42 43 43 43 43 42 42 42 47 47 30 30 28 29 28 28 28 21 20 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 13 13 12 16 23 27 33 33 33 36 38 38 42 42 47
47 47 35 35 35 35 35 31 31 28 28 24 25 18 23 10 10 10 10 8 8 11 10 8 8 9 9 13 13 15 15 24 25 34 36 59 41 41 43 46 34 46 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 57 42 42 42 48 48 48 48 48 42 48 48 48 47 54 54 48 48 47 47 47 48 54 54 54 48 46 43 43 36 39 39 57 57 57 57 47 47 43 47 47 57 48 48 57 48
46 39 39 39 44 44 57 57 44 42 37 35 37 50 50 57 54 57 57 57 43 43 43 44 44 50 52 52 52 52 52 57 57 57 57 54 50 44 43 35 35 43 43 43 29 29 43 38 44 43
35 35 43 43 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45 45 45 43 43 52 43 42 35 35 31 35 35 43 39 39 39 43 43 52 47 44 43 35 31 39 43 43 52 52
52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 57 52 52 52 57 52 52 54 54 54 57 57 57 57
57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 43 43 37 50 50 52 57 57 57 57 57 57 44 44 32 32 32 43 36 43 37 37 37 39 43 42 42 37 37 44 42 36 36 28 28 35 42 59
57 48 48 48 48 34 34 21 18 20 20 18 18 32 32 54 54 54 44 42 30 30 30 34 32 17 17 17 30 30 59 57 57 57 48 57 48 57 57 48 48 48 48 48 48 47 43 40 40 43
43 43 40 40 43 43 47 30 28 12 12 11 11 11 11 10 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 16 25 28 13 13 13 28 28 39 39 24 21 12 11 11 16 18 28 31 28 23 17 16 11
11 11 11 13 15 17 18 24 24 33 34 39 39 43 30 30 19 28 25 30 23 34 23 23 15 25 15 19 19 25 25 40 33 30 28 28 37 33 29 28 33 33 43 43 43 39 41 33 42 31
24 23 23 23 37 37 35 35 35 39 39 39 32 28 20 20 23 31 31 43 32 32 20 20 20 24 16 14 11 11 13 19 12 12 9 9 12 15 14 17 17 18 21 22 25 16 15 12 23 13
13 11 13 13 22 29 34 39 28 30 17 17 12 15 12 12 12 18 20 23 16 16 14 24 24 27 26 14 14 14 22 16 12 12 11 12 15 28 26 18 15 13 15 10 10 10 10 15 16 16
20 31 26 35 32 35 35 30 25 20 20 19 21 20 20 14 19 19 16 12 12 13 15 12 19 19 28 16 15 13 9 9 10 10 13 10 10 10 16 13 11 16 14 10 8 15 13 12 12 8
8 8 8 10 13 15 19 18 21 11 10 10 10 10 20 19 17 17 14 15 14 10 11 12 13 12 12 12 22 18 22 20 22 12 11 10 10 10 11 11 13 13 15 15 16 18 17 9 11 14
19 18 12 12 12 13 15 12 12 11 12 10 12 12 12 10 10 10 11 11 13 9 10 9 8 8 8 10 10 8 8 7 7 12 12 12 13 9 9 9 9 9 13 10 13 14 8 10 8 12
8 8 8 8 10 10 11 11 11 12 9 9 9 9 9 11 11 11 9 9 9 8 8 8 9 9 9 15 12 12 10 10 8 13 8 8 8 15 10 10 8 8 8 8 14 15 10 10 10 10
8 6 6 8 6 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 9 9 12 10 9 10 12 12 11 10 10 10 9 9 9 10 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 9 9
9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 7 10 8 8 8 12 10 10 13 11 11 11 11 10 10 10 13 10 12 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 14 14
13 13 12 11 11 10 10 9 9 9 9 8 9 9 10 9 8 8 8 8 8 9 11 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6
6 8 6 6 8 8 9 9 8 10 10 13 13 14 15 11 11 11 9 9 12 9 10 9 9 10 9 9 9 12 10 25 14 14 19 10 11 8 8 8 15 15 15 16 16 18 12 15 15 15
15 31 24 19 18 30 17 17 13 14 27 11 11 11 9 9 9 13 11 11 8 8 8 7 7 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 10 10 10 10 8 8 8 9 11 9 10
12 10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 15 8 7 8
8 8 8 11 10 7 7 9 9 9 9 11 16 19 15 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 10 10 11 10 10 9 6 8 7 7 10 12 10 12 8 8 8 8 8 6 6 10
6 7 8 8 6 6 7 7 6 6 8 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 6 10 10 13 12 7 7 7 7 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10
13 15 9 9 9 7 10 6 6 8 6 10 9 6 8 6 6 7 7 9 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 9 11 10 10 9 9 9 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 8 7 7 6 6 8 8 6 6 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 6 6 8 8 8 6 6 8 10 15 3 0 0 3 9 9 9 9 6 6 6 7 7 10 8 8 8 9 9 11 12 15 9 10 9 9 9 9 3 0 3 13 15 20 17 17 8 9 10 15
17 10 11 13 9 9 7 7 10 19 19 20 20 28 30 29 30 29 30 30 37 30 33 25 22 15 8 6 6 6 7 12 15 11 11 11 9 11 12 12 12 15 18 18 37 37 28 30 30 35
38 42 57 47 34 34 30 30 35 35 31 33 31 28 28 25 22 22 9 11 11 12 10 10 10 11 11 11 11 13 17 16 19 19 30 37 35 36 36 34 37 34 35 36 37 37 37 34 37 34
28 28 34 28 32 33 42 43 43 43 43 41 43 43 43 36 43 43 46 43 47 47 47 47 48 47 43 43 39 39 35 39 39 57 48 57 57 57 38 36 23 23 16 26 15 15 15 24 34 44
43 43 47 57 46 41 39 46 42 43 33 33 33 43 43 57 57 59 57 57 57 50 43 32 35 43 42 43 52 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 43 42 42 42 42 43 43 43 50
43 43 37 37 37 57 37 35 35 39 57 57 52 52 52 52 52 43 43 39 39 39 35 35 35 35 44 43 43 39 35 35 42 43 35 37 43 43 52 59 50 52 52 52 52 52 52 43 43 38
43 31 31 38 43 43 52 52 52 52 57 57 52 52 52 52 46 50 57 57 57 48 48 48 57 57 57 44 43 43 43 41 41 33 33 33 27 28 18 32 32 33 33 33 42 44 46 44 42 30
30 42 42 42 43 43 43 36 36 30 30 32 37 32 32 28 28 23 36 36 47 31 31 20 24 24 29 33 39 42 39 41 32 32 32 33 33 43 59 40 47 35 35 35 36 36 33 37 28 36
36 37 37 37 30 23 24 16 15 11 10 12 12 12 18 12 11 12 15 21 28 37 37 32 32 30 39 39 37 37 33 37 33 28 28 24 20 19 23 29 33 27 27 14 14 14 28 30 24 20
10 10 10 15 11 12 11 11 16 16 15 11 11 11 12 16 10 10 8 8 8 8 8 10 9 9 12 10 10 13 18 19 23 23 28 18 20 20 21 31 31 36 31 25 15 15 13 13 9 9
9 9 9 9 11 11 11 11 11 11 10 9 10 10 10 11 16 16 11 11 12 16 22 12 12 12 15 15 28 28 35 35 35 39 40 34 34 23 28 23 23 23 21 24 24 13 13 11 23 12
12 12 21 21 24 18 13 10 12 10 10 11 15 16 13 13 11 11 11 11 11 11 11 11 12 12 14 12 19 12 12 11 12 12 19 11 11 11 10 9 9 9 8 10 14 17 10 9 11 11
22 15 19 19 23 28 29 19 15 13 11 18 18 9 9 9 13 10 15 15 8 8 8 17 10 13 20 14 14 18 18 13 11 10 12 13 10 10 11 13 16 11 11 9 8 8 8 8 8 10
11 16 19 13 12 12 8 8 10 10 10 10 23 13 13 10 10 10 12 12 11 11 11 11 11 17 11 11 11 10 13 10 10 10 10 12 11 9 10 10 15 8 6 6 6 6 7 11 10 10
8 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 10 12 12 16 13 10 8 6 6 8 10 10 10 8 10 10 10 13 10 8 8 8 8 8 8 12 16 23 22 15 8 8 8 8 8 8 9 9
12 13 8 8 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 10 11 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 11 8 8 8 8 8 9 8 10 10 8 10 8 9 12 13 14 18 15 11 8 9 11
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 10 8 8 8 12 11 11 11 10 9 9 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 12 12 12 8 8 6 6 8 10
8 8 9 8 8 8 6 8 8 10 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 11 11 10 9 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 12 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 9 12 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 7 7 8 10 8 8 8 8 8 10 9 10 9
9 9 12 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 6 6 8 8
9 9 9 11 10 9 9 10 9 9 9 8 8 6 8 8 10 11 10 10 9 9 10 12 12 13 8 8 9 8 8 8 9 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8
8 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 13 12 12 11 11 12 16 12 12 12 11 16 16 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10
13 8 9 9 9 9 9 8 8 8 10 10 10 18 18 9 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 10 8 9 9 9 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10
8 9 9 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 11 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 11 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 10 8 7
6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 6 8 6 6 10 8 8 8 8 6 6 8 10 12 10 8 6 6 8 6 7 8 8 8 8 8
10 8 8 6 7 11 10 6 6 6 10 8 8 8 10 10 9 8 11 10 8 8 8 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 10 8
3 0 3 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 9 10 9 9 9 8 8 6 7 6
6 6 6 6 6 7 11 11 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 8 8 9 8 8 8 6 3 0 3 8 8 8
8 8 |