| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-107F04.T7 (MSMg01no107_f04.b1) | MSMg01-107F04.TJ (MSMg01no107_f04.g1) |
|---|
| ACC | AG321166 | AG321167 |
|---|
| length | 1,386 | 1,310 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 274 (138 - 411) | 339 (131 - 469) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_f04.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_f04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:09:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_f04.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_f04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:09:03 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (11,823,756 - 11,824,029) | (11,688,119 - 11,688,457) |
|---|
| sequence | NNCCCGGTATTGGNNNNCGGCATTGCGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGA
GGATCCGCGGAATTCCCTAAATCTCCTTGACCTATTAAGGAAGGCATCTT
AAAACATTTCAGAGAAGAGCACCCTTTCACATTTGCATTATTGGAAGAGT
AACAGCAGGAGAGGCAGACTGGTGTGTGCAGTTAACATGTCCCTTCTTGG
TTTTTTCAACTTGTGGGCACAGCTGGAATTGGAGCCCTGAAGACACAACC
TCTTTACTTTATTATGCTTTGGGAGAGCTGAACAAGGAATCAGGGTTACT
GCAAATTAGCTCCATTTCGTTCCCTGCCGCACAGTTCTGAGCACTGGATA
TTCACTGAGGTCCATATTTTTTTCATCTTTTCTGGGCAGAGGAAGGTGGA
TCTTCCTCAGATTTTTTTCCTGAGCTGGGAGGCAGCAGAGTTCTGCGGGC
AGTCTCCTCCTTTTCCTGTTTTCCCCCCCCGGCACTCAGATTGCTCTTCT
CAGAAGAGTGTTCTGGGCGCCATGTGTTTGTACCAAGGAAACTTTCTCAT
TCCTTTCCTTGACAGCTAGGAGGGAAAAGCCCTCCAATTCATCACTTTTA
TAGCTGTCTTGGTTCTTTGTTGGCTCCTTACGACTTATGCCGTCTAATCA
AGCACTCTAAATTGTCAATATGATTAGGTCTACCCTGAATGTCCTTCTTG
TAATATTTCTTATCTTACTTTACTTGCATTTTCTTTGTTTATTAATTTCC
ATAAATTTATTATGTCATTGTTAGCTCTCTACTTACATCAATCCTATTAT
ACCTTCCTCCTTTCACTACCGGTTAATTTTTTTATCTATCGTCTCTCCAT
TTTATTTTTCATTCTTATTTCATAATACTTATCTTTTTTTTTTCCTCTTA
TTTATTAAACCTGTCTTTTTTTCCAGATTTGATTCTCCTCCCTCCTACTT
TTTTCCCCTTACTTCTCTTACTTTTTAACGTTTTTTCCCATTTAAATCTC
TTCTTATACCTTCTTCATACTTTCTTCATTTTACATCTCTTATTTTATAC
TCTTTTCACATCTCTCTCTCTTTCTGTCCCTTCTCTCTTCACCTCTCTTC
TTCCTTCTTTCCCTCCTATCTTCTTAGCTTTCTATCTACATCAACCTTTT
CTCCTTATTTCTTACTATCCTACTCCAATCTATCTATCTTTCTCTCTAAC
CAATTACACCGCTTTTTCTTTTCTAAATACATCTCTTACAAACCGATTTC
TTGCAACTTCACTTACATCCCCTTCATTATCTCTTCTCCTCATTCTCTCC
TTGTCTCCTACCATTTATCTCTACACTCATTCTCTCTACTCTCTCTCATA
TCCTCTCTACCACATCTACCTTCTCTCATCTACTTA
| NCCAAATTAAATNNNAATCATGCGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTAAAGAGTGCCTATTCTCTTG
CTTGACATCACTCAGCTCCCTTCCATTAAAACAAGAATGAAAACACACAT
CTGCTGATGTCCAAGGACCTCCATCACTCCATTACATGAGCATGACATTG
ACATCTAGCTGAAGAGTGTGGGGTTTGTTGTTATTTTTGTTTGCAACAGT
GTCTTGTTATTTAGCCTGGCTGGCATGAGGCTCTCTGTGTAACCAAGGCT
AGCTTCAAAATACAGCATTCCTTCTGCCACCATAACCTGTGCGCCGAGCT
TCTAGGCATGCCTCACCAAACCCAGCCTGAAAGACTTGCAAGATGATAGA
AGTGGTGTTTAAAGTCATGGGTGATAGGTTTGGTCTTCTGTAATAAGCAC
TATAGGGCTCTTTCATATAACCAAACAACGCGCTCAGCTTGAATGGTGTA
AATAAGATTCTGGTTTTATCTACCTATGTTACACAAGGCAACTGACTCAT
GGCCACAAATCAGGATCTCAACACATCATGAAAATGGGGAGAAGAAAACA
GAATTGTGCAGTCTCCCATGGGATACCTGATACTATGGTGTCACGAACCA
ACCCCTAATGGTATATGCAGTCTGACTGATGTAGTACGACTTTGCGTATT
GCTCCAGACCTAATACAGCCTCATTGCCCTTGAATGCCCAAAACAGTATC
GTTAAAGGTTCATCACAACATGCTATCTCATACTAATGCCCACTGTAACT
TATAAAATAATCCTCAGCTAAAAGCCTGTTTCCTTATCATACTGATTGCA
TATTATAATATCCTCACCTTATAATATCACTTTCTTTGCTACCCAAATCA
TATACTCATAATTCCTCGTTAATACTTTTATTTTCCTCGATTACTTTAAT
CATTTTTATTCCACTTTGTTTCCCCTTATAAAAAACATTTTTTTCTAATC
CATGTCTTAACCTTAATTACTATCTATTTCACTCTTCCCCCACACTGTCT
TTCTTTGCTTCAATAATCTTATCACACTTTTTAAATTCCCTCTTCCTGTT
CTTCCCCGCCTATTGTTCACCCTTTATTAAATCTCCCTTCACCTTTAATT
AACNCCATTATTCTTATAACTGTACTTTATCTCTCCCTTCTCCGACTTAT
CCTATCTGATCCCTCATCTTTATCTCAATCTCCACTACACAACACATACT
AATTTACCTTATTTACACATTCACAACTCTCTGTGGTACATCCCTCTTCT
TCTTTAACTA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 11 9 9 9 9 11 3 0 0 0 0 3 9 6 6 7 7 11 8 8 8 8 10 10 9 6 6 6 8 19 19 8 8 8 15 15 20 24 24 36 36 36 36 36
37 37 37 47 42 42 37 33 33 39 47 23 22 15 15 15 26 25 35 32 36 36 39 37 37 21 19 10 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 11 11 11 11 12 12 19 19 29 28 28
28 39 43 42 47 47 53 53 53 50 47 47 48 48 42 47 46 47 39 25 23 12 14 15 11 11 10 10 8 8 8 8 10 13 9 9 9 10 21 32 33 33 33 37 28 30 30 28 43 43
43 39 39 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 48 48 48 57 46 48 48 47 46 46 37 41 39 41 46 48 48 47 47 47 47 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 44 42 42 30 42
42 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 57 44 48 48 57 59 57 50 43 43 44 50 50 54 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 50 43 43 50 52 52 52 52 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 52 52 52 52 59 52 52 52 52 52 50 50 43 42 42 42 41 43 42 37 37 50 50 57 50
43 37 43 43 43 43 43 32 32 35 42 44 43 44 44 57 57 48 48 48 57 59 59 59 59 54 48 48 57 42 42 42 42 35 44 44 57 57 44 29 22 18 20 21 32 28 43 43 46 46
48 57 57 57 48 34 34 23 23 23 34 34 46 46 46 59 59 59 48 48 48 47 59 47 48 48 48 48 59 47 37 35 32 33 32 36 20 17 8 8 8 14 14 32 32 30 28 28 32 33
43 47 48 48 48 40 37 34 22 16 11 15 12 14 24 29 23 13 13 12 22 23 32 28 28 37 31 30 30 37 30 29 33 23 23 20 20 20 24 32 32 30 33 39 37 32 32 26 28 28
28 30 30 30 30 30 37 37 39 36 36 30 25 12 11 11 10 10 10 14 9 10 9 15 13 9 8 10 10 10 11 12 12 15 15 15 21 18 21 15 25 22 22 18 17 25 25 37 19 15
10 10 10 10 11 11 11 12 12 11 12 12 19 24 20 21 18 11 11 12 15 15 21 15 13 11 13 16 24 27 32 32 25 26 17 15 15 26 16 15 15 20 24 31 34 34 30 30 30 28
18 14 14 21 27 37 39 32 24 19 12 12 12 12 12 21 21 15 14 14 14 15 15 15 12 9 9 9 9 9 11 12 12 11 17 13 13 11 15 11 12 18 15 10 12 16 16 20 20 19
16 12 12 19 21 19 19 12 12 16 11 11 11 16 18 31 23 29 26 21 20 15 19 12 10 14 18 17 15 8 10 11 9 10 9 9 9 18 15 10 10 10 10 10 9 9 9 9 14 9
9 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 15 15 19 15 13 13 13 13 12 10 10 10 10 10 10 10 11 11 10 9 9 10 9 10 11 12 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 12 10 10 10 8 8 8 9 9 8 12 11 11 13 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 10 15 12 25 18 9 13 9 9 8 8 10 8 8 8 17 15 8 8 8
8 8 11 16 13 15 15 10 10 10 10 11 15 15 12 12 11 11 12 8 8 8 8 6 6 8 8 9 12 11 12 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 11 11 12 12 9
9 9 9 9 9 10 9 9 9 9 13 10 11 10 8 8 8 8 8 10 11 11 9 8 8 6 7 10 8 10 8 10 9 9 9 10 10 10 10 9 9 8 8 6 7 8 8 9 10 13
13 19 17 24 12 12 11 10 19 9 9 8 8 8 10 7 9 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 11 11 13 22 15 11 11 11 12 12 10 9 9 8
8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 20 18 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 6 6 8 8 11 11 9 9 9 11 9 9 9 9 10
11 12 12 15 12 12 12 10 13 11 14 11 13 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 10 10
10 11 10 10 10 10 10 10 11 6 8 6 7 13 11 11 10 10 10 8 8 8 8 7 6 8 8 8 10 10 8 6 6 8 6 8 8 8 6 6 8 8 13 12 12 8 8 8 8 8
8 8 8 7 9 12 8 8 8 6 6 8 8 10 8 10 7 6 8 8 11 12 11 11 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 12 6 6 8 8 10 13 10 10 8 8 8
9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 8
6 7 10 8 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 7 7 8 10 8 8 8 8 6 6 7 10 11 10 12 10 8 8 8 8 8 8 8
8 9 8 8 6 6 6 6 7 8 8 8 8 10 12 12 11 11 11 12 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
19 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 10 9 9 13 12 12 6 6 8 8 6 6 8 7 7 7 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 12
12 11 8 8 7 6 6 6 8 8 10 10 9 9 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 7 7 10 12 11 8 8 6 7 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 10 8 8 8 11 8 7 8 8 8 8 8 6 6 7 7 8 8 10 8 8 8 10 10 12 9 9 9 9 9 10 8 10 8 8 | Open.Hide. 0 3 7 8 10 11 11 11 11 9 12 3 0 0 0 3 7 7 7 8 10 9 9 9 9 9 7 6 6 6 8 8 8 8 13 8 8 9 9 9 8 15 19 15 8 9 9 10 10 9
8 15 15 19 9 12 12 26 23 29 30 35 38 36 44 37 48 48 40 41 41 28 27 12 9 9 10 10 14 14 12 11 9 8 8 8 10 10 13 17 17 30 30 33 33 33 33 47 53 53
38 42 42 38 38 36 36 33 31 31 29 33 30 21 23 9 11 12 14 18 12 11 11 11 10 14 14 11 15 17 17 21 28 32 43 48 57 48 48 59 59 59 48 48 48 57 42 42 42 47
54 54 54 54 57 57 57 50 50 48 48 48 57 54 54 54 48 57 54 54 54 54 57 57 57 57 48 47 47 47 47 47 57 57 57 57 57 57 44 37 23 36 37 44 46 47 57 57 57 57
57 57 48 48 43 44 43 50 50 50 44 43 43 43 43 57 50 54 52 47 43 35 35 43 59 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 59 59 57 52 52 57 59 52 54 54 59 57 52 52 57
57 37 37 43 57 39 45 52 57 57 44 44 33 33 33 44 44 35 33 33 36 36 39 43 43 34 43 23 36 32 42 42 57 44 43 32 20 20 38 36 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52
43 43 52 52 57 52 52 52 52 57 57 57 52 52 43 43 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 59 59 48 48 48 57 57 57
59 48 48 44 44 43 43 37 39 39 43 48 48 48 54 54 54 48 48 48 48 54 59 47 43 35 37 39 43 39 43 36 36 43 43 43 43 43 43 36 37 37 37 43 37 37 37 34 34 25
30 30 25 25 17 12 12 10 12 12 12 15 12 18 21 34 32 32 24 20 20 23 24 37 37 43 43 37 37 32 32 28 34 28 30 34 47 39 43 43 43 43 36 33 33 32 32 39 47 47
48 41 37 25 25 25 30 30 41 47 44 34 28 20 20 21 15 12 12 12 12 13 15 15 18 18 14 8 8 8 12 8 17 17 24 24 20 13 13 19 32 31 32 32 17 15 15 13 19 21
43 43 43 43 35 35 32 38 38 32 32 41 41 41 38 38 32 35 42 43 50 52 52 52 52 52 47 25 25 11 11 11 27 27 38 35 35 35 35 35 37 43 52 43 42 42 37 42 36 43
32 24 24 32 43 35 35 35 35 26 32 14 14 14 23 21 12 12 10 19 24 32 24 15 11 11 11 17 24 32 35 35 35 37 26 21 12 13 12 12 15 15 12 13 12 19 19 21 24 12
8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 17 17 21 26 29 33 28 29 19 15 11 11 10 13 13 10 10 11 22 18 25 28 32 28 22 20 11 11 11 8 8 7 7 8 8 13 11 12 12 15
15 16 24 24 25 12 12 9 9 10 10 12 13 13 12 13 12 13 10 8 8 8 8 13 13 17 14 14 16 12 11 9 9 9 9 11 11 10 11 11 12 10 10 9 9 9 9 9 12 12
11 13 12 15 13 12 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 13 8 8 8 8 8 12 11 10 11 12 12 15 13 13 9 9 9 10 10 14 10 10 9 8 11 8 10 10 11 11 11 11
15 9 10 9 9 9 10 10 11 11 11 12 8 8 8 8 8 8 8 12 12 10 8 8 7 7 8 10 8 8 8 8 8 10 10 12 12 11 10 12 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8
8 8 10 10 8 8 8 8 11 6 6 8 8 8 13 10 10 10 10 10 11 9 9 8 8 8 10 10 10 11 13 13 8 8 6 6 6 8 15 12 14 19 21 17 17 17 12 12 8 8
8 7 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 10 11 11 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 9 10 10 10 13 15 13 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 12 11 11 11 8
8 8 8 8 8 9 9 9 9 12 10 10 10 8 8 8 10 8 10 6 6 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8
8 9 16 12 13 12 15 12 14 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 13 8 11 9 8 8 8 8 8 8 10 9 10 10 10 11 15 11 8 8 9 9 7 10 8 8 8 8
8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 11 8 10 8 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 7 7 8 10 10 9 9 9 8 10 7 6 6 6 6 6 8 8 9 10 10 10 11 10 8 8 12 8 8 8 10 8 9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 9 9 12 12 12 8 8 8 8 8 8 6 7 8 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 8 3 0 3 11 11 11 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9
9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 12 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 6 6 8 8 6
6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 11 10 11 7 7 7 8 7 9 12 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 9 12 10 10 8 8 8 9 9 8
6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 |
|---|
