BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-122H22.T7 (MSMg01no122_h22.b1) | MSMg01-122H22.TJ (MSMg01no122_h22.g1) |
ACC | AG332343 | AG332344 |
length | 1,184 | 1,207 |
length of high quality (start - end) | --- | 660 (86 - 745) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no122_h22.b1 PHD_FILE: MSMg01no122_h22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:31:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no122_h22.g1 PHD_FILE: MSMg01no122_h22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:31:00 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CGTTTTTNNNCNAACATTGGGCGCTATAGACTACTATGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCTTTGTTTNNAGNTTCAGTCAGGGTTCCCANGAGGNNANNNGA
NNNNCNGGAGCTCTTTAAAAAAGGCCCNNNNNANANANANNGGANANNGG
NCCCCNANCGGAANNAGGGNAGANAAAGANCCNCCCCCAAGCGGGNGGCG
GNCNNNNNNNCNGGNNGANGGNGNCNNNAGCCNAGCAGAAGCNNGGCAAC
NNNAAGAGGNCCCANNGANCGANNCNGGANCNNACGGNACAAGCCANGGC
GGNNCNANNCAGGAANNNNNCCCCGGGACCCANANCNNCAAGGCCNNNNC
CAACNNNCNCCNCNANAAGNANCAGGGNCNCGGGNNNNAAGCGGATTTTT
TTAATCCACNNAGANNNGACNCNAGNACAAGGAGAAAGGAACACCCCAAT
TCACACCCCCCCACAGGAAAACCGCCAGNGGAGAAAAAAAGAGGGGGNGA
AAACGCCGGNCANNNNNCCACCGGAAGCAAAAAGCCCCCNGGGCGAAAAA
CAAGCGACCACAGGCGCGGGGGCCCACAACAGGGACCACACAACAACACC
AAAAGCCAACAGGCCGGCCACNACACCAGAACCAAGCAGCNAACAACACA
ACCGCCCAGCTAAACAGCCANAGGCCAGGCACGGAGACCCCACCAGAGGC
ACCACANCCACANAAACACCAACACAACAGGAAAGGGCACCGGCCCACAA
CAAAAAAACAGTATATTATAGCAGCCACCCCAAGGCAACTAGCAACACCA
GAAGAATAAGGCGAATCGGTCGATTCCTCATCCGTTGAAAAATTTTGTAT
TGGTAACATTTGTATCGGTCGACTGCACGGAACTTTGCACATTGGTATAT
CGGTCATAAAAGGCACTTTCTTATCACATGGTGGAATAGCGGTCCAATCA
ATCGGAAATATTGTTCGGTACTAATTCCCTTCACTATACGAAAATTCTCT
CTAGCATATATACCTACTTTGTTGCAAATATTATCATTTCTCTTTTAATT
CTGCAGTTTCCGTCCTTTCATATCCTCCTATTGTATGCTGACGACGACTC
TTTTATAACTATCTTATTACCCTACTATCACCTTGTTTCTAGTTTGATAA
GTGAGTTTGTGACACTGTACACCTCTGGTCTTTT
| ATTTCTCCNTAAAAGAATGCGAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAGTATCTTTTTAGAAAGTATAT
AAGCATAAAAACTAACTTTAATGTTTGTAGTTCTTAAAAATGCCAAGAAG
AGTAATAATACTAAATATAGTGAAATATGTGAGTTTCAGATAAGACAGCA
TTTCCACAGCAATTGCACTGCCTCATTTATAATGTAGTAAAGTAAAAGTA
TTTAACTGGTATATTCTCTTATAAAGTTAAAAGAGACTGGCTATAAAAAT
TACATGTAATCAATATAAATGCAACCATAAAAGTCACCACATATGGTGCC
TTGCAATTTAATTTTATCTTCATAATTACTACTGATACCAGTTTTATATT
TAGAATACACAAATAAGTGAATACTTTGATATTTCACTTTATTGTGATTT
TAATAAAGGATATAATTTCTCATGTCAGCGTGTTTCAGTAAATACATTTA
TCTTTGAGAAAGTAAGGTAATAATTACTTTGTGATATGACATTTAGAAAC
TTGTATTTGCTCCCTCACAAGAAGCACAGTTTGGAAATCATCTGTGATTT
TTTTTTGAAAATAAATTAATAAAAATGCAGTCCTAAAAACGGTTTGGTTT
GTGTGAGTGGTCATTCTCAGTGTGCATTTGAATTAAAAAGTCATTTTGTG
TGCAACTTTGAATCTATGTGATGTTTTATCCAACAATTATATGTCAAAAA
ACCCTGGAAATTAATTATAAGTATATATGCCTTTTGAAAAAGATGATATA
GCACTCTCATCTACTTTACATACTTCAATTCCGAGTGATTAATTTACTTT
CATCCCCTCCCCTGAAAAAAAAAAACAGCGTGCTTATGCCGGAACCTTAC
GAAAAAAAAAATCCCCTCACTAGGATGCCCCCCCTAATTTCTATTAACCT
GCTTAAGTGCTTTTTTAAACCATGGCATATAAACCTTACCCCCCCCCTTT
GCTAAATCTGGTTAAATTTTGCTTTTTAATTAAAAGGGTACCCTTCGTGA
ATGCCCCAGGGTTTGGCACTCCCCCCCCTTAGCCCCGCACACAGCCCAAT
TTTATTGGAATCTTCCCTTTCTCCCCCCTCCTGGTACACAGGGCTCTTTC
TTAATGCAATACTGATATTGTTGGCCCTCCCCCCCCACTTCTTTGGCTCT
CCCTCAA
|
quality values | Open.Hide.12 12 12 12 16 22 3 0 0 0 3 0 3 9 9 9 8 10 11 11 11 13 10 8 8 8 8 8 8 21 9 9 8 11 8 10 8 8 23 23 33 37 37 36 34 34 39 43 47 48
47 47 47 53 36 33 50 50 33 28 25 20 10 10 3 0 0 3 3 0 3 7 7 3 3 3 6 6 6 6 6 8 10 8 9 9 3 0 3 21 21 3 0 0 3 0 0 0 3 3
0 0 0 0 3 0 3 27 23 19 9 9 9 8 12 9 9 9 12 12 11 8 8 8 8 9 3 0 0 0 0 0 3 0 3 0 3 0 3 0 0 3 27 3 0 3 0 0 3 3
0 3 27 27 3 0 3 0 3 7 7 7 3 0 0 3 25 25 3 0 3 27 3 0 3 29 29 29 3 0 3 3 0 3 9 9 12 9 10 9 10 6 6 6 3 0 3 8 6 6
3 0 3 0 0 0 0 0 0 0 3 0 3 3 0 0 3 3 0 3 3 0 3 0 3 0 0 0 3 8 17 3 0 3 6 14 19 59 59 25 23 3 0 0 3 7 7 14 27 3
0 0 0 3 6 6 17 17 3 0 3 25 25 3 0 0 3 3 0 3 27 3 0 0 3 0 3 7 3 0 3 0 0 3 7 7 3 0 3 27 23 37 37 27 17 3 0 3 7 7
7 3 0 0 3 0 3 0 0 3 27 27 27 27 3 0 0 0 0 0 3 17 9 6 6 7 6 6 6 9 9 3 0 3 0 3 0 0 3 27 25 25 23 9 3 0 0 0 0 3
8 7 10 3 0 0 0 3 0 3 3 0 3 0 3 0 3 23 3 0 3 0 3 14 7 7 3 0 3 0 3 7 7 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 7 9 17 18 19 15
8 7 7 7 9 20 20 27 3 0 0 3 23 3 0 0 0 3 25 3 0 3 0 3 3 0 3 11 11 21 22 26 18 18 11 11 11 23 23 24 12 11 11 11 11 11 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 8 15 8 9 9 9 9 9 22 24 59 39 37 22 18 3 0 3 7 6 6 8 9 11 14 10 12 6 6 6 8 7 7 7 3 0 3 15
23 27 9 9 9 6 6 6 3 0 3 3 0 0 0 0 0 3 21 19 8 7 7 15 9 9 9 10 10 9 9 9 12 23 9 9 9 21 3 0 3 7 7 9 16 19 21 15 6 6
6 10 11 9 9 9 24 23 23 9 9 9 15 8 8 6 6 6 7 7 7 10 9 9 9 21 7 6 6 6 8 8 13 9 9 7 8 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 15
7 9 9 9 9 6 6 7 7 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 23 3 0 3 7 7 17 19 22 9 9 11 21 17 16 12 12 13 17 8 3 0 3 6 6 6 7 9 14 14 13
8 8 7 7 8 8 9 9 6 6 6 6 6 6 13 17 15 9 9 3 0 3 18 11 11 11 23 18 13 9 9 9 8 8 8 8 7 9 9 11 15 21 25 19 25 28 15 17 10 10
7 7 8 8 6 3 0 3 9 11 11 3 0 3 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9
10 12 12 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 8 8 6 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 10 10 10 10 10 9 9 9 9 7 7 8 8 10 12 13 17 20 22 10 10
10 10 15 14 10 10 8 8 10 6 6 8 8 8 12 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 11 15 19 18 9 9 8 6 8
8 7 6 8 8 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 6 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 10 12 13 12 10 10 10 9 9 8 8 6 6 8 8 8 7 8 8 8 8 9 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6
8 6 6 8 8 9 9 10 10 11 8 8 10 12 9 9 8 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 13 15 11 9 8 8 8 8 8
12 8 8 10 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 7 6 6 8 12 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 8 8 8 10 8 8 8 8 11
13 10 11 9 9 9 9 12 10 10 9 9 9 9 10 8 8 7 10 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 9 6 6 6 6 6
6 10 10 8 8 6 6 8 6 6 6 6 10 10 9 8 8 7 6 8 8 8 10 8 8 8 13 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 8 6 6 8 15 15 12
11 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 10 10 11 9 11 11 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 6 7 3 0 3 11 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 9 6 10 7 6 6 6 8 9 13 15 9 8 8 3 0 3 13 15 15 15 9 10 9 21 21 28 35 28
35 29 35 33 33 28 34 29 29 33 36 38 53 53 50 50 41 41 40 39 22 18 9 9 10 8 9 8 8 8 8 16 20 15 23 23 19 21 29 36 36 36 57 47 50 50 50 53 53 57
48 37 37 28 28 28 37 37 50 59 37 30 26 12 9 9 9 9 9 23 24 37 33 33 28 28 23 28 32 37 47 47 42 38 38 43 44 53 57 57 48 39 39 35 32 32 42 59 59 68
54 54 54 46 46 43 43 43 40 40 28 28 22 36 44 54 48 48 47 47 47 47 57 47 48 48 57 57 47 57 57 47 47 48 44 32 24 17 17 32 32 57 57 42 42 42 42 37 35 35
42 44 44 44 33 33 28 32 24 32 32 32 43 44 43 23 23 23 43 28 43 28 36 32 32 32 44 43 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 59 57 57 57
59 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 52 52 43 43 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 52 52 52 62 62 62 43 43 39 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 39 43 31 31 31 44 44 62 62 62 52 52 52 52 52 52 52 52 52 62 44 43 43 31 31 43 43
62 62 43 39 43 43 52 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62
44 39 29 29 43 43 43 31 31 31 43 43 62 62 43 39 41 43 43 44 43 45 45 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 43 62 52
52 52 62 62 52 52 52 52 62 52 52 52 52 45 45 45 52 62 52 52 52 44 43 31 31 39 39 44 31 39 39 39 39 39 39 28 14 14 39 39 43 43 62 62 52 52 52 62 62 62
62 62 62 62 43 43 23 43 43 38 38 35 35 31 43 43 43 43 35 43 43 62 44 44 35 38 43 62 43 62 52 52 62 43 43 52 52 43 43 39 39 39 38 38 41 36 36 34 34 45
62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 43 43 35 43 43 57 57 57 59 59 59 47 43 38 43 22 22 22 43 43 43 43 43 34 35 35 35 35 44 44 43 43 35 43 43 52 52
52 57 57 57 57 57 52 43 43 35 35 42 42 43 35 35 43 43 43 32 32 27 31 43 43 50 44 35 33 32 16 16 26 35 35 27 27 8 8 8 8 8 14 19 32 20 27 27 33 42
33 35 33 35 35 35 35 32 33 32 22 22 32 32 42 42 42 42 30 30 36 28 25 25 25 25 30 37 37 39 32 32 29 37 36 27 27 23 37 36 28 28 28 28 42 31 31 22 19 19
21 24 17 19 19 28 29 31 24 15 15 18 15 15 16 33 37 39 37 30 33 33 31 31 23 28 28 30 17 16 14 12 12 10 13 13 24 22 22 28 30 37 17 17 11 9 9 10 10 12
17 18 15 12 14 10 11 10 17 17 15 17 16 22 22 16 15 12 21 16 22 23 23 22 22 17 15 15 16 15 18 24 23 24 16 10 12 9 10 14 9 10 10 10 8 10 10 15 15 12
14 10 10 10 19 18 18 12 12 15 19 13 11 11 13 19 19 26 16 12 12 19 13 9 9 9 9 9 15 9 10 9 10 15 21 22 24 20 20 16 16 21 14 10 12 10 12 9 8 10
8 8 11 8 9 9 8 11 8 14 18 13 13 13 15 15 16 12 23 23 30 16 16 13 10 10 9 11 11 11 15 10 8 8 10 15 10 9 9 11 11 12 10 9 10 8 8 8 8 8
8 8 8 12 13 18 21 15 16 8 8 8 8 8 11 12 9 9 12 10 15 12 12 11 9 12 12 16 16 14 11 11 8 9 10 11 10 10 11 11 11 11 11 9 8 8 10 8 8 8
8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 8 10 21 13 12 8 8 8 8 10 10 13 10 9 9 12 10 10 10 15 12 14 13 12 8 8 8 10 10 13 14 18 18 17 19 13 9 8 8 11
8 8 8 9 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 12 11 12 9 9 10 9 8 8 13 6 7 6 7 8 6 8 10 10 10 6 8 6 6 8 8 8 11 10 8 8 10 10 7
7 7 6 10 8 10 10 11 11 10 9 9 9 10 9 7 7 7 8 11 11 12 19 22 23 9 9 8 7 8 8 11 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 11 8 8 6 6 8 8
10 12 10 10 10 10 13 13 13 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 6 6 6 6 10 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 12 11 11 21 17 17 18 11
11 12 12 10 9 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 13 8 9 9 10 12 14 11 13 8 6 6 6 6 7 6 6 8 8 10 10 10 11 11 8 8
8 7 8 7 6 8 6 |