BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-146H09.T7 (MSMg01no146_h09.b1) | MSMg01-146H09.TJ (MSMg01no146_h09.g1) |
ACC | AG349995 | AG349996 |
length | 1,237 | 1,272 |
length of high quality (start - end) | 593 (139 - 731) | 566 (88 - 653) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_h09.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_h09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:15 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_h09.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_h09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:16 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCCACTCTTTNNNGCCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCTCTGAGATTTCCCAGCCTTTATACCTCAGAGCAGAGTCA
CCATTGTATCCATCACTCCAACTGACTCTCTCACCCCCTTCAACTTGTAA
TTGAACTAACAGAAACGTTATCACATTGACACCCCATCTATTCAAATGTG
TTTCAAGAGTGTGGCAGAAAATGGCATGGACTGTGGTGTCTGGTCACTGT
GCTGGCTTATCCAAGCTGTAGGACCCAATATAGTATTGCCATGAAATGTT
CCCAAGATTGGAACTTTGGCATCTTTATGCACTTAAGAGTTGCTGAATGG
CTCAACAAAATCACCTCTCTCTGGCATTCAGTTTGCTGAAGAAAACCACT
GACCTTCTATTCTCCATGTCCTAGAAACCTTCAGTTCTTTTCCCTGGTAA
TGGTTTGTCAATCTGGTAAGAGAAGCTTTTCCTCTGGAGCATCCTTCAGG
CTTCCCTAACCTATCTCAGATTTCATGTCCCTTCCAGAGCTATATGTAAT
GGTAAAGACTCCAATTGCCAAGTCAGCAAGGATGGTGTGGAATGCTGCAC
GAGTCAGGTGCATGGGTGGTCTCCTTGGGTACAGATGCCTGCTACTTGAG
TTGCAGGTGTTCACATGTGTCTTTGTAGCTGAGAAAGGCTTATATGGAGT
CAGATGCTCTTTCATATTCTCCCTTCGGATTCAGAGGTGAACAGGTCCTC
CTTACAACCCTTTATCCTCAGCTGCCAGTTGCTCCATCCTCTGGCCTGTC
CACAGTGCCCTCTCAAGACAGGTGGTCTAGTATCAGTTTGTCACAAAATT
CTTGCCTGTGGATTGATTGTTCATGCTGAGGCATCTGGATGTCATCTTGG
TCTCCCAGCTGGACCCTCTGTTAATGGTTATTTGAAATTGTTGGCCTAAC
AAATCCTGTTTGTAAAATTGGTCATAATTTAGCTGTTTGCTGTTTTATCT
CCATTATTTTCTTCCAAAATGTCCCCTTTTGTTTTGAATTATTATATATT
TCAATAATCTTCCTGGCCTCTTTTAACCTTTCTGATTTAAAGGTTCCCCC
TTCTTTATTTAAAAATCTTCTTTTTTATTTCACTCCTTACTATTTCTAAA
AAAAACGTTTCTCTTCTACAAAATCATATTAATCCTCATTTTTGATACTA
ATTATTCTAATTCTATAATCACTCTCCTTATCGTCTT
| CTTCTTTTNTTTTTACGAGTGAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTTAAGATTTCATTTTTCTAACA
GTTGAGTTATATCCCCCTGTGTAAATGCACCACCCCTTTTTAATTCATTT
TTCTGTTAAGGGACATCCTACATGTGGTATAGGATTGGAGTTGGGAACAA
GAGTATGAATTCATTGTTGCTTTAATAACAGCATAAATGAGTGTATTTAG
AAATTATAGGTATATTTTGTGAGTCATTATTAGACCCACAGACACTCCCT
AGCTCTAATTTCTAAGAAAGATCAATACTAGTACTTATACCTGAGTAACA
GCAAGCACAGCCAGTACCTGTGTCTTCTCATCTAGTACCATGTGTAAAGA
TATATTTTAGCTCCTTGGTGAAATCACTGATATTAAGCTGGGGGCAAAGA
ACAAAGATCTCACAGTGCCAGAAAGCAAGGAAATGCAGGAAGAATAAAGA
GAATAAAAAAACATTGGAGCCAAGCAAAGGAGCTCTCAATAGCCAAAGCC
AAAAGACTGTGAATGAAGAAACCAAAGTGCAGCTTCTTACTTTGAAGAAT
AAAATATTCGTCAGTCTATATGAATGTAAATTAACAAAAAATGATAATGA
TCCTTAAAGAAGAATTCTAGATAAATCACATAGACCTTACTACCTCTGTG
AAGTGTAAGCTCTCAGCTCTCTAGGAAAACAGAACATAATGACTCATTAT
AAAAAATTAGGGTATAACAAATAGGACAAAGTAATTACATGTTGGAACAA
TCTGGTAAACACTGCCCTTATTCAAAAGAACATAGTTTACAGCATCCAAT
GGTTAATTAAGTCCTATTCCATAAACGTATGAATCTCTAATCTGATGGTT
TTGAAAATGGACCCTTTTTTTGTTTACCTTTTCTTCCTAATACTCATCCT
CCATTCTAAACTTGGAATATTGGTTACAAACTTTCCTAATGGAATCAATT
GTTCCATACTAATCATAATAATATACCAACTCCCTGGATTTTTAGGGTCT
TTGAAATACCATAGGAATTTTTAAAATGCTTATTTTTTACCTTTTTTTCC
CCATGTATAACTCAGTNATAATTGGGTTTTTATTGGTATCCAAAAATCTA
TTTTTTTGGTTTTACTCCTGATAACAATCCTTAATTAACTCTTATATCCG
TTTGTTATATCTTATTGTAAANTATACCTTGTCTTCTTTGTTTCCATATG
TTCTTCTTATTTCTTCTATATA
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 10 10 9 9 11 16 3 0 0 0 3 6 6 7 7 6 6 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 10 12 15 8 8 8 10 11 14 18 19 35 34 28 29 29 30 30 33 37
37 37 37 37 37 37 32 28 32 37 29 30 31 31 31 31 31 31 31 33 50 37 36 30 13 10 9 12 8 7 6 6 6 6 10 18 18 22 12 12 16 27 34 50 47 38 50 50 50 50
50 53 50 38 36 36 36 36 33 33 33 33 33 21 19 8 8 8 8 10 10 8 10 8 8 8 19 22 30 30 22 19 12 9 9 9 10 10 17 17 27 27 37 37 33 31 36 36 36 36
53 59 57 57 43 43 47 47 47 50 57 57 57 59 57 68 47 47 51 51 43 43 57 57 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
57 57 52 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 59 47 42 35 42 42 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 54 54 59 59 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 59 59 59 59 50 50
43 43 31 20 25 12 12 12 12 12 16 25 34 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 59 59 59 57 57 59 57 48 48 48 44 44
37 30 30 30 39 42 47 57 59 59 59 59 59 59 57 54 54 54 54 54 57 57 57 48 48 54 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 43 59 57
59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52
43 43 52 52 57 57 54 52 57 52 52 52 59 59 59 59 43 43 43 50 50 50 50 48 48 48 50 50 43 39 41 42 43 32 35 31 41 41 28 24 32 44 44 54 46 57 43 43 43 32
34 30 17 17 17 30 27 35 39 39 43 47 44 39 32 21 29 18 18 22 28 31 42 46 57 59 39 35 32 32 37 42 48 48 48 48 48 48 47 43 39 39 39 44 39 48 43 43 36 34
34 34 28 28 28 28 35 22 21 10 10 10 19 30 47 59 37 29 29 22 22 29 37 47 39 39 30 30 30 30 30 14 14 14 28 28 42 39 32 32 23 22 23 28 28 30 30 30 42 42
54 54 43 43 47 43 48 47 37 42 42 40 26 26 23 23 28 37 39 48 57 48 48 43 41 34 24 19 10 17 15 19 21 10 8 8 8 8 10 19 13 14 10 18 12 12 12 15 25 31
39 30 37 37 30 22 22 28 28 35 39 26 26 12 12 11 22 22 26 15 21 10 9 9 11 11 10 9 9 9 14 24 30 39 39 34 28 28 28 30 21 20 13 11 13 19 22 12 10 8
8 8 8 11 13 16 15 9 9 13 15 11 10 13 13 16 14 15 15 14 19 19 25 19 18 15 13 10 10 9 9 9 9 9 10 13 13 19 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 9 13 17 14 13 11 11 11 9 8 7 7 7 8 7 9 10 10 10 10 10 10 13 13 15 18 12 12 12 12 10 10 10 10 10 10 12 15 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8
11 11 12 12 12 17 13 10 8 8 8 9 9 10 10 8 10 8 8 8 8 9 10 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 15 13 11 13 10 10 10 11 6 8 6 6 8 10 12
8 8 8 8 8 8 10 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 11 10 9 10 9 9 9 9 11 11 11 7 7 7 7 8 8 10 13 9 8 8 10 8 7 7 8 8 10 12 10
9 8 10 8 10 10 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 10 9 9 6 8 8 8 8 8 13 13 19 15 10 10 10 15 15 12 9 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 22 16 16 15 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 10 11 10 10 10 10 12 9 9
9 9 10 10 10 10 9 9 10 10 12 10 10 8 8 7 6 8 8 9 9 13 13 8 8 6 6 8 13 15 13 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 8 10
10 13 13 13 10 10 10 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 12 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6
8 8 10 9 8 10 11 8 8 8 8 8 6 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 6 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 6 8 3 0 3 23 21 11 9 9 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 7 9 10 18 13 9 7 9 8 9 8 15 15 17 8 8 11 22 22 19 10 10
17 19 28 35 35 33 37 28 29 29 29 31 36 36 33 50 50 50 42 41 21 21 10 10 10 8 11 11 16 11 9 11 13 11 12 12 16 11 22 22 37 36 36 35 35 35 35 36 42 38
36 36 36 36 36 35 31 31 31 31 31 33 25 23 12 11 11 13 11 10 15 15 22 29 37 28 34 25 28 26 17 11 8 8 8 8 12 23 34 34 37 37 37 41 44 53 53 53 53 57
57 57 57 57 50 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 68 50 51 51 50 50 50 50 50 50 48 48 48 50 51 54 54 54 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 68 68
68 59 59 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 43 43 43 43 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52
52 52 54 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 68 68 57 57 48 47 44 37 37 35 37 39 42 57 57 57 54 54 54 57 57 57 68 68 68 57 57 48
48 48 48 48 54 54 54 48 59 59 48 48 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 43 43 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 38 36 36 33 33 37 30 23
11 10 8 8 8 8 8 8 10 13 16 32 39 39 59 59 59 59 59 59 47 47 47 47 47 42 48 48 57 57 57 57 59 43 43 36 36 36 43 43 43 43 43 43 41 41 39 39 39 37
36 36 37 37 43 46 47 43 44 43 43 43 43 42 41 41 41 41 40 43 43 43 44 25 21 11 11 13 18 32 36 42 42 34 28 20 20 27 30 35 35 35 37 43 43 33 29 33 33 43
43 43 44 44 23 23 23 43 43 35 33 33 33 44 44 43 43 33 35 35 33 43 43 41 41 39 43 43 43 43 35 35 37 37 43 43 38 33 33 33 33 28 23 23 23 43 32 32 32 28
35 43 43 43 43 35 35 35 33 33 43 43 47 48 57 43 43 32 20 19 19 20 30 30 39 43 44 42 33 36 27 23 23 28 44 59 57 59 48 47 47 47 47 47 47 47 47 54 57 57
57 54 54 54 57 57 57 44 43 32 32 22 28 12 17 17 32 32 57 54 48 48 48 48 48 48 47 43 43 43 37 40 35 39 39 39 36 36 36 39 43 47 39 39 35 35 35 39 39 37
18 18 15 11 12 12 18 11 12 15 12 12 12 14 18 17 16 18 19 16 28 22 17 12 17 19 24 24 35 28 30 17 17 17 30 30 43 43 37 29 22 21 28 21 28 16 19 9 9 9
19 26 29 29 17 14 10 14 13 14 15 26 25 20 11 7 7 7 10 13 15 34 23 22 18 18 21 21 21 24 31 22 14 14 14 23 20 19 14 14 13 20 10 10 10 12 9 10 13 15
15 16 20 19 28 28 31 30 19 17 17 19 30 27 27 10 8 8 8 8 11 10 12 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 12 16 21 11 9 9 9 8 8 8 11 11 18 13 15 8
8 7 10 8 9 10 10 10 10 8 9 8 8 8 8 11 11 10 14 10 10 10 10 11 9 9 9 11 11 12 10 10 10 10 10 11 11 10 10 10 11 10 11 9 10 14 9 9 9 8
8 9 10 10 8 10 10 11 18 10 11 8 8 8 8 8 8 10 10 11 13 11 10 11 10 10 10 10 12 9 16 11 7 10 6 6 8 17 15 7 6 8 8 10 10 10 8 8 8 10
10 16 12 11 10 10 10 10 12 10 10 10 10 10 10 32 32 37 24 20 33 28 28 28 30 32 37 32 24 13 8 8 8 8 8 8 10 8 10 7 6 8 6 8 8 8 9 9 8 8
8 8 8 8 7 7 13 7 8 10 10 12 10 10 10 9 9 9 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 13 12 12 10 11 11 12 12 11 10 10 6 6 6
6 8 8 8 10 9 9 10 9 9 8 8 8 9 9 9 17 10 10 9 11 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 8 6 6 6 6 6 8 8 8 9 8 9 9 10 12 14 10 12 8
8 7 7 8 10 6 6 6 6 6 8 6 7 8 8 10 10 11 26 14 12 12 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 10 10 11 12 11 11 8 8 8 8 8
10 11 11 11 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 3 0 3 8 8 10 8 10 10 10 10 10 15 22 15 15 10 8 10 8 8 8 10 10 10 10 12 15 13 8 8 8 6 6 6
6 15 22 25 18 12 9 9 12 15 12 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 7 7 8 6 10 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 10 8 8 8 8
10 13 9 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 8 7 3 0 3 10 9 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 7 7 7 8 12 8 8 8 8 6 7 10 12
15 12 14 9 10 10 15 11 12 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 6 |