BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-187D08.T7 (MSMg01no187_d08.b1) | MSMg01-187D08.TJ (MSMg01no187_d08.g1) |
ACC | AG378640 | AG378641 |
length | 729 | 761 |
length of high quality (start - end) | 315 (47 - 361) | 287 (86 - 372) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no187_d08.b1 PHD_FILE: MSMg01no187_d08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:02:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no187_d08.g1 PHD_FILE: MSMg01no187_d08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:02:27 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCTTCCATGGGGTAGCACTTACTATCCTTTCCCAAGTCACATCCAT
GGGCTGTGATGAGCTCATTTGCTTATGTAGACTACTTATGTTTATTATAT
TGGGGAAGATGTGGCACATGCATAGAGGTCAGAGATCAACTTGTAGGGAA
CAGTTCTCTCCTTCTACCATGTCAATTCCAGGGACTGAAGTCAAATTGTT
GGACTTGGTAGCAAGTATCCTTCACGTTGAACCATCCGACTGACTCAATT
TATCTGTGTGTAGTCTATTTCCTTTTATATGCTTTTAATGATGGTAAGTG
GTAATGGCTGTTGACTTCCCTACCTTCANCCCTGATAAATGCTATCTAGT
TTGATCCTCACAACAGCCCCCCGAAGTAGATACAGACAGTTGCTTACTTG
TTAAGGTGAGGACACTGAGTCTCATAGAGGTTAAGTAACATGGAGTATGA
ATATATGAGTCTCACGCCCTGAGCATACTGATGGTTGGCCGACTGTTCCC
TCTAGCCTTCCATGGAATCCATAATCAGCCTCCTTTTCAGAAGCACCCAC
TATGGGGGTCCCTCAGTGAAGTGGTCTACAGAGCGAACTAATAACTGATT
TCTTCTGCCGGCTTGTCGAGAGTCTTGCATCTCTTTCCTATACGAGTTCT
TACATGACTCTTTGATAGGTTTCCTCTTT
| TTTATTTCTCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTCTTTATGTCCTC
TACCATCATCATGAGATATGCTTTTAAATCCAGGCCTACCTTTTCAGGTG
TGTTAGAGTGTCCTGGACTGGGCGAAGTGGGCGTTCTGGGTTCTGATGAT
GGTGAGTGGTCCTGGTTTCTGTTAGTAGGATTCTTACATTTACCTTTCGC
CATCTGGCAATCTCTGGAGTTAGTTGTTATAGTTGTCTTTGTTAAGAGAT
TGTTCCTCTGTTGATTTTGTTACCCTCAATCAGCAGGTGTGGGAGACAAG
CTCTCTCCTCTGAGTTTCAGTGTTCAGAGCAGTCTCTGCAGGCAAGCTCT
CCTCTTTCGGGGAAGGTGTACAGCCACCCGGTGTTTGGACCTCCCCCTGG
CTGAAGGTGAAGGCCCAAAACAGGATCTTTCCCAGAAGCTGTGTTGCTTT
GTTCAGTAAGGTGGCCGGTTGTCTGGAGTCGAAGATGTCGCCGCCTTACA
AGCTCTGCGGTTCTCGCCAGGCAGGTGTTCTGCCTTCTGGATTCGATCAT
GGTGCCTTTCTCTCAGCTTCTGTTATTCTCTCTCGTACCAGAAATGTTTG
GTCTCTGTATTCCCCTCGGTCACCCGTGCTTTCCGCCCCCTGTCGCGTCC
TGCAACCTCGAATGCTCTTTTCGCCGCCTGTGATCCTTTTCCTTTTCGCC
GTTCCCCTCCT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 10 10 9 9 10 27 37 37 37 29 28 28 22 22 30 37 37 37 37 41 37 41 48 48 35 35 32 34 34 35 44 47 47 48 48 48 48 57 57 37 37 34 36 36 42 43 57 57
41 41 47 47 50 50 68 50 50 50 50 50 50 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
50 57 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 43 43 43 57 57 43 52 52 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 41 57 57 57 57 57 57 57 54 52 50 50 37 37 43 50 57 52 52 52
52 52 52 57 57 52 52 43 43 43 43 52 52 52 57 57 59 50 57 57 57 57 42 42 32 32 33 59 44 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 43 43 43 46
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 43 43 57 59 59 68 68 68 68 59 59 43 43 22 22 18 22 22 40 40 48 48 43 43 43 43 43 59 48 48 48 48 48 48 59 57 59 47
43 39 39 43 39 47 36 34 30 23 23 9 6 6 6 6 6 6 6 6 9 11 12 12 9 8 6 3 0 3 8 7 7 9 11 16 20 28 32 39 39 48 48 59 59 59 59 46 43 39
39 39 39 30 39 39 53 59 57 48 48 32 27 19 14 14 17 24 22 9 9 9 9 9 9 11 11 9 12 9 9 9 11 11 11 11 12 12 26 30 28 24 22 19 12 9 9 9 10 13
23 28 28 28 32 32 28 28 28 25 24 32 20 25 25 30 30 15 15 15 27 25 32 25 25 20 20 23 32 24 28 23 23 22 28 18 14 14 21 21 25 24 24 15 14 10 21 15 15 10
15 24 32 20 20 23 34 31 36 31 32 28 23 23 28 32 39 40 36 33 26 26 26 15 15 12 16 19 32 32 37 34 31 28 22 10 12 7 7 8 13 19 26 25 20 20 24 32 41 43
43 32 26 19 17 17 30 30 21 21 14 21 15 19 10 10 10 10 10 13 13 13 10 11 13 18 17 23 30 30 33 33 33 37 30 22 17 11 11 11 12 12 12 11 11 11 11 11 11 12
23 23 21 15 12 12 13 11 11 15 15 24 26 15 10 9 9 10 12 10 11 11 16 10 10 9 9 12 10 10 8 8 8 10 8 8 10 16 11 11 11 16 10 10 10 19 19 20 24 13
15 8 8 8 8 9 10 8 6 6 8 8 10 10 8 8 10 10 8 9 14 21 15 13 8 8 8 8 8 10 15 15 8 8 8 10 8 8 8 9 9 10 10 10 13 16 9 8 8 12
10 8 9 10 10 12 15 19 19 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 8 8 8 12 17 24 19 16 12 12 | Open.Hide. 9 9 9 9 7 7 6 8 8 6 7 8 10 10 8 8 8 12 15 25 30 37 37 41 41 47 47 42 50 37 37 37 37 39 39 39 44 44 39 27 19 10 8 8 8 9 11 23 17 28
28 33 32 53 50 57 48 50 53 53 53 50 57 57 59 59 57 57 34 34 15 14 19 17 24 15 16 16 24 21 41 41 41 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 51 51 50 50 50 50 57 47 47 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 34 34 14 18 12 15 12 12 12 18 24 20 44 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 57 57 57 59 57 57 68 68 68 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 52 52 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 43 43 23 24 15 12 12 13 18 12 13 13 32 24 33 42 42 57 57 57 57 68 57
59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 46 37 30 22 13 13 11 12 11 12 12 21 21 28 23 23 28 36 41 37 33 30 31 31 35 47 47 59 59 59 59 59 43
48 48 48 48 48 44 43 37 32 30 30 32 32 59 59 59 59 59 46 37 32 24 13 11 10 11 11 12 12 19 17 22 22 32 31 34 25 23 23 28 28 37 39 39 43 43 32 32 20 20
20 32 32 20 20 25 25 31 34 39 26 26 14 14 12 16 12 12 12 21 21 24 23 28 28 39 39 48 46 41 39 34 32 28 25 16 13 11 11 11 25 27 40 39 39 35 35 35 28 16
9 9 9 9 14 13 13 11 10 10 13 9 9 9 14 15 13 17 17 19 16 17 13 18 18 21 28 21 18 12 12 11 11 11 11 22 22 28 18 13 13 19 19 18 15 10 8 8 6 6
10 8 11 16 19 15 12 12 12 13 19 23 28 22 11 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 6 6 8 8 10 10 16 18 11 10 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8
8 8 13 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 16 13 14 12 10 9 9 9 12 14 22 17 15 10 10 8 11 10 8 8 8 10 11 12 10 8 10 8 13 11 11 8
8 8 10 10 19 19 22 24 21 21 21 24 14 14 13 10 12 11 8 8 8 8 10 12 15 20 15 16 15 10 10 9 9 9 11 15 18 22 14 9 8 9 7 6 6 9 9 8 8 8
8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 10 14 12 14 14 12 16 9 9 9 9 8 10 11 13 10 8 8 8 8 10 10 14 14 10 10 13 13 17 17 15 10 10 10 8 8
8 8 13 17 12 15 12 10 9 9 9 |