BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305O08.T7 (MSMg01no305_o08.b1) | MSMg01-305O08.TJ (MSMg01no305_o08.g1) |
ACC | AG430716 | AG430717 |
length | 1,293 | 1,332 |
length of high quality (start - end) | 409 (43 - 451) | 299 (101 - 399) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_o08.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_o08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:24 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_o08.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_o08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:24 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGCAACACTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTGGAACTCAGAAATCTGCCTGTCTCTG
CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCGAC
AGGTAGCTTTCTTTTTTTTTTTTTTAAAGATTTATTTATTTATTATATGT
AAGTACGCTGTAGCTGTCTTCAGACACTCCAGAAGAGGGCGTCAGATCTT
GTTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCCGG
ACCTTCGGAAGAGCAGTCAGGTGCTCTTACCCACTGAGCCATCTCACCAG
CCCTTGCTTGGTATTTTTTTCCTTTTTTTTTAATTAATTAGGTATTTTTT
TTTTTTACATTTCCAATGCTACCCCATAAGTCCCCCAAACCCTCCCCCGT
TTTTTTTTTCCCCCCCCCCNGGGNNNTGGTGTTCCCCTCAAAAGAGGGGG
GGGGNGNTNGCNNGANCNNTGGGCCTCTCTTTCCACTGATGGCNCCCTAG
GTCATCTTCTGATACATATGCAGCTAGAGACACGAGCTCCGGGGGTACTG
GTTAGTTCATATTGTTGTTCCATCTATAGGGCTGCAGACCCCTTTAGCTC
CTTGGGTACTTTCTCCAGCTCCTCCATTGGGGGCCCTGTGATCCATCCAA
TAGCTGACTGTGAGACTCCACTCATGTGTTTGCCAGGCCCCTGCATAGCC
TCTCAAGAGACAACTAAATCCTTTTCCTTTCAGCAACATCTTGCTAGTGT
GTGCAATGTTGCCCATTTTTTGGGGGCCAGATTATGGCAAGGAATCCCCG
GGTATGTTCCTTCTCTATATGGATCACCCTTTTCTCTAATTTTCCAACTT
TGTTCTTGTATTCCCTTCATGGGTGTATTTTTTCCAATTCTAAGAAGGCA
CAAGTGCTCCCTCGTTCGATCTTTGTACTTCTTGAGTATTAGCAGTTTGT
CAAATGAATTTGGGATCTTGGGAATTTCTAACCTTTTGCCAAATTAACCT
TATCTAGGATATATTTCTGTGGATTTCTTTTTGAATTGTGTATGTTCCCC
CTTAAAGTGATCTACTACTTCTCCCCTTGCCTTCAATTTCATACATCTCT
TTCCTTCTAACTCTAAATAAATCCCTGTTATCTCTCAATTTTATATTTCT
CTCTATTTCTTGCACCTCGATCCCCCCTCCATCCTCTTATTACATAACAC
GATAATCTACCTGATCTAATGTATCTCTTGCTTATCTCCTATG
| NNNCCCGAGAGTGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCATCTGTTGCTAGGGTCGCCTTCTGGC
AGTACATCTTCAGAGGTGTGCTGGAGGAGGAGCTCGCAGTGCTGATAAAT
GAATCAGAGAGACAGGAGGGAAGCTGGCAGGGTCCCTGCAGGCAATGATG
GGGGCCCGGATCACATGCTCGAGCCAGCCTCCTGCCTCTTACCTGTGGGG
GACTGAGCCTGGTCTCTGGGCCTTAATGCTCAGGGGTAAATCTCCATTTG
CAAGCTGTGCAATGGGGGTGGGCAATGTGAGGGAGAAGAGAGAAGGACCA
GGAAGAACATGGGAGGAGGGAGAAAAAGAGACAAAGATATCTGTCTGGTT
TTTGTTGAAGGGCCAGCAAAACCTCTTTAACTCGGGCTCCGTAAGNCGAG
ATTTTTTTTTTCCCCCTCCCCAAGAGAAANCTGACCCTCAAAAAAAAGAG
GGGAGTGGCCTATATTGATCTGAGAGCCCTAGATGTATTGAAATATTCAT
GGCTGGATGTATGTGTTCAGAGGAGACGCTGGGGGTGGGGCCTGGCTCTG
AGAGCGGGAGGTGGGTAGGTAGATTTCTAAGTAAAAGCTGTTCGCATTTT
CATTAAAAATACATTAATTCTATTAGTTGGACTAAAACCTCACACTTAAA
AGGAAATGAGCTTGTTTGTCAGGAAAACAAGCCACTGGCAAATTTAGAAG
AAGAAAGAAAGAAAAAAACCCCTACTTTTATTTATTGCTATTTAATAGCA
GAAGAGCCAGGGGGAGTTGATAAAATTAGCACTGTGTCCCCAGGGGGTGG
GCAGGGGGCCTGCTTTGTTTGCAAAGCCCAATTTGGTCACCACAGCTTTG
ATCTTCACTTTGAACCTTTGAACAGGGATGACTATTGCTCATTTCACAGG
AAAATTGGGATTCAAGTTTCCCCCACAATCTAAAAAGTGAATCATTAAAG
GGGGGTTGTCTGCCGGTAATCTCCAGATCGGAATACCCTGAAAACCAATT
TGAAATGATACTTTCCCCCCAAAGGGGGCCACCTGAAAAGAAACCCAGGG
CCCAGGAAACCCTGTCCCTGCTTGGAAAAATTTAACATTGGTATTTCCAC
CCCCCCTGGAGAAAGGGGTGGGAGAAAGGGTTCTATATTTAAACTCTCCG
ACAATAAATGCAAAATGGTCACACATTTTTTAATAATATCTGTCGGGGAT
GTTACACACCACCATATGGAGACTGTGTCCTAAATACGAGGCCAAAGATA
AATTAGTGTGTCGGGAGCCCCTTCTTACTCTC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 9 9 9 9 9 14 15 18 11 11 8 8 8 8 12 13 8 8 8 13 13 14 24 24 37 36 33 37 33 36 42 42 42 42 50 48 50 50 47 47 51 47
53 42 47 47 50 50 41 40 36 29 29 48 48 68 50 48 48 47 47 47 47 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 38 43 19 21 15 19 24 38 50 50 50
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 46 48 41 41 41 47 57 52 57 50 50 50 51 51 50 57 54 59 57 57 57 57 57 54 54 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 59
57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 47 45 45 45 52 52 62 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 57 57 57 43 52 52 52 52 52 59 59 59 57 57 44 44 35 35 43 59 57 57 57
57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 54 52 52 52 52 52 52 52 57 57 54 52 59 57 57 57 57 59 57 57 54 52 52 57 57
57 57 57 57 57 43 59 59 59 57 57 43 43 43 37 37 37 47 47 57 57 57 24 25 12 24 24 32 31 41 42 42 47 48 43 43 44 39 40 44 57 48 57 57 57 57 57 57 54 54
47 48 48 48 48 57 57 48 44 41 30 30 30 43 43 68 59 59 54 54 48 48 48 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 47 47 39 35 35 39 25 27 15 16 19
25 23 21 24 25 30 47 43 39 39 47 59 59 48 59 48 48 48 48 48 48 48 48 59 48 48 59 59 43 43 39 39 34 36 33 39 32 32 23 28 28 37 37 47 47 28 27 11 11 11
11 15 14 14 14 17 14 10 10 19 19 24 34 37 39 32 18 18 3 0 3 9 3 0 0 0 3 11 9 9 11 9 12 12 21 18 13 12 10 10 9 11 9 8 9 8 11 12 9 9
8 8 8 3 0 3 0 3 0 3 3 0 0 3 3 0 3 0 0 3 22 23 37 47 47 59 59 48 48 59 48 48 43 37 39 30 28 34 33 31 22 8 3 0 3 6 8 18 22 32
30 30 17 25 25 47 47 48 48 39 39 35 24 24 26 26 36 43 43 40 40 25 25 25 43 43 48 39 31 32 18 18 12 12 12 24 24 36 44 44 44 42 32 41 19 19 12 18 16 16
17 18 20 20 19 20 13 21 18 23 23 25 25 23 23 37 37 28 26 24 17 13 25 15 15 15 28 26 28 15 14 14 21 17 17 14 14 14 28 28 39 39 37 26 25 14 14 14 24 28
37 37 32 24 24 17 17 11 12 12 22 28 33 28 34 30 28 18 18 12 19 19 28 32 34 37 37 33 24 20 32 20 15 14 13 19 15 10 10 14 16 17 15 17 28 34 32 28 22 22
27 30 30 21 28 26 28 21 22 12 10 10 10 10 10 13 15 12 12 11 11 11 16 16 16 16 12 10 13 17 17 11 11 11 11 11 16 18 22 33 29 23 12 10 10 10 10 10 11 10
17 11 11 11 10 17 13 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 11 22 21 21 17 11 10 9 9 9 9 17 9 12 11 16 10 10 11 10 10 8 11 11
11 16 15 15 18 6 8 6 6 8 8 8 11 8 8 8 8 8 12 15 15 14 12 14 12 10 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 9 10
10 10 10 8 8 9 9 8 8 8 10 8 8 9 10 14 10 12 10 10 10 9 10 10 13 8 8 8 10 12 14 15 12 8 8 8 6 8 6 6 7 6 8 10 11 8 8 8 10 11
11 9 6 8 8 8 8 8 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 10 8 8 8
10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 9 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 15 16 22 12 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 8 8 8
8 13 10 11 10 11 11 8 9 9 9 9 9 11 10 10 10 10 13 8 9 8 8 6 7 12 11 10 8 11 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 10 11 11 11 10 10 9 9 6 6
6 7 11 8 10 10 10 11 8 10 6 6 8 8 10 10 10 8 8 9 10 17 10 10 10 12 9 9 13 12 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 9 12 12 13 12 16
8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 9 11 12 10 10 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 11 8 8 11 11 11 8 10 7 6 8 8 8 8 11 8 8 8 8
8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 10 11 15 14 11 11 12 15 18 15 13 13 11 8 8 6 6 6 6 8 9 8 8 6 7 12 11 12 7 6 8 8 11 8 8 8
8 8 8 8 8 10 8 8 9 8 6 6 6 8 8 10 13 10 10 10 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 10 12 12 11 21 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 10 10 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 15 8 8 8 8 9 9 10 13 13 10 11 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 6 6 6 6 8 6 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 7 6 6 6 7 7 7 8 8 8 6 6 6 8 8 10 17 12 8 9 3 0 3 17 19 22 22 11 13 13 30 27 36 30 35 30 25 21 13 13 17 26
21 47 47 47 47 48 48 57 57 68 68 68 53 57 57 43 39 36 36 43 43 43 48 48 47 47 42 38 36 36 36 31 33 33 33 30 30 19 19 11 11 11 15 12 12 16 17 19 11 11
11 23 25 38 38 36 35 42 34 34 32 36 39 39 43 43 47 47 47 47 51 51 50 50 54 54 54 57 59 59 57 50 50 50 50 48 48 47 50 50 50 50 57 50 47 57 57 54 54 48
59 48 48 39 42 37 43 43 57 57 57 57 54 57 57 57 68 68 68 68 59 57 48 54 50 57 57 59 59 50 37 35 35 37 50 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 52 52 54 57 57
57 54 54 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 38 38 39 57 57 52 45 45 52 52 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 57 57
57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 34 34 27 28 33 35 28 32 32 48 57 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 57 57 57 57 47 48
48 54 54 54 54 57 57 54 54 48 48 48 48 48 48 48 57 57 54 54 48 57 57 57 59 59 57 57 48 48 48 48 48 43 59 46 48 48 48 48 59 59 59 41 30 24 19 18 16 12
13 11 9 9 9 18 18 17 30 30 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 59 48 57 57 59 59 59 43 43 40 40 43 43 39 47 37 39 39 34 34 34 37 23 23 3 0 3 25 25 22
12 12 16 21 28 37 41 28 28 18 18 16 24 7 7 6 6 6 6 9 9 9 9 9 23 25 25 25 3 0 3 16 11 11 11 16 12 13 14 14 14 16 17 19 14 14 9 8 8 8
8 9 9 9 9 9 9 10 19 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 43 43 43 43 43 59 59 57 57 57 57 57 54 54 57 59 59 59 57 57
57 54 54 68 54 54 54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 47 47 47 57 47 54 57 48 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 54 50 57 43 50 32 32
32 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 47 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 48 48 48 59 57 57 57 59 59 59 59 59
54 54 54 59 54 59 59 59 59 59 59 57 48 48 57 57 57 57 57 57 57 50 48 48 48 48 41 46 37 37 37 37 25 15 15 11 11 11 24 28 30 30 30 37 37 41 39 39 37 37
32 31 27 31 32 33 32 33 36 36 26 28 21 15 15 21 24 28 23 32 31 31 31 39 34 39 28 28 28 33 30 37 41 41 32 30 22 22 24 17 23 28 30 30 30 39 32 27 29 32
29 26 32 31 31 17 15 11 10 14 9 9 9 9 18 23 22 11 10 9 10 10 10 10 12 10 9 19 14 25 24 26 25 30 24 19 22 22 31 30 23 19 15 10 8 10 11 17 23 14
8 8 8 8 8 10 13 12 12 11 23 18 17 19 19 20 20 25 25 22 15 9 6 8 8 6 6 11 14 9 10 10 13 10 14 17 15 15 11 15 10 10 11 18 19 21 19 15 13 11
16 10 10 10 15 15 14 16 11 10 10 12 12 12 16 11 13 12 14 8 8 8 8 8 16 30 18 13 11 10 10 10 13 12 14 11 11 11 9 7 6 6 6 8 8 10 8 10 8 8
13 13 13 11 13 10 10 10 17 11 12 10 8 9 8 8 8 11 27 32 27 14 12 11 10 10 9 9 9 18 16 10 10 6 6 8 8 13 10 12 12 9 9 15 12 12 12 19 13 18
19 14 11 10 10 10 8 8 8 12 21 19 13 8 8 8 15 10 13 22 18 16 10 11 10 12 10 11 14 16 16 20 16 21 21 13 11 10 6 6 6 6 8 8 9 18 11 12 15 11
14 16 9 7 7 8 8 8 8 8 10 10 13 10 11 11 10 12 9 9 9 8 8 8 9 9 8 10 10 10 10 13 16 15 22 18 12 11 8 6 6 6 10 10 8 8 8 22 23 17
17 11 12 12 11 9 13 10 8 8 8 8 8 11 11 11 17 19 28 19 15 11 11 11 11 11 11 8 8 10 8 8 8 10 6 6 6 8 6 6 8 10 15 18 12 17 11 11 10 11
14 15 12 11 11 11 13 11 11 9 9 8 8 10 10 10 13 10 10 11 11 13 11 10 10 15 10 10 14 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 13 10 10 10 6 6 6
6 7 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 13 9 17 8 12 8 8 8 8 10 10 12 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 8 13 12 16 12 16 15 15 15 19 15 11 11 12 9 9
9 8 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 11 8 8 8 10 10 10 14 12 15 13 15 12 12 9 9 6 6 6 6 10 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10
9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 10 6 8 7 6 6 6 8 6 6 8 8 8 9 9 9 13 10
14 9 9 9 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 |