BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-340H01.T7 (MSMg01no340_h01.b1) | MSMg01-340H01.TJ (MSMg01no340_h01.g1) |
ACC | AG454479 | AG454480 |
length | 731 | 736 |
length of high quality (start - end) | 653 (65 - 717) | 595 (76 - 670) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no340_h01.b1 PHD_FILE: MSMg01no340_h01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:29:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no340_h01.g1 PHD_FILE: MSMg01no340_h01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:29:27 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCACAACTGGCACCTATGATGGGTATATACTCATTGGATCAAACAAGAAC
AAAACTGCTACAGTTAAGGTTTAGGACACATTTTAGAGGGAGAGGATGAA
ATATTGTAAGACATAGAGCAATTGGACATATATTTGCTGTAAGATAGTAT
AAAAGGGTATACTATCTAATAGCAAATATAAACAGAGTATAACAGGAAGT
TTTAACCATGAAATCACAAAAATATGGTCACTGAAACAAGATCAACAAAT
TGACAGCATTATTTGATATGTAAGTCCATCTAAGGGAAGTAATAAAATGT
CCTGCAATTAGATGAAATAAAGAGTCAATTTGTGATTGCTAAGAGAGGAA
GACAAAGGCTCCTCAAGGGACAAGCCCTTTGATATGTTATCTAGGCCATG
TACTAAGAATACATACATAGAACTAACACTAATGGACTCACCAAGCTATG
ATCTACCCATTTATCTATTTGCCTGTGTATTTATTGGTCATCTATTTACC
CATCATATATCTATCCATCATTTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTAAT
TACCTACATACCTAATAGTTACATATAATAAATGACACATTAAGCAGATA
ACAGTAATGAAGAAGAATGGGTTATAATTTGAGATTCAGTCAGGGTAGCA
TATGAAAGGAACTGTAAGGAGGAATGATACT
| CAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAG
AGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAA
ATCAAAACACTGAGATTCCACTTCACTCCAGTCAGAATGGCTAAGATCAA
AAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCAAGGATGTGGAGAAAGGGGAACAC
TCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGGAATCA
GTCTGGCGATTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCCGC
AATACCTCTCCTGGGCAAATATCCAGAAGATGTCCCAACCGGTAAGAACA
CATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTGTTTATAATAGCCAGAAGCTGG
AAAAAAACCCAGATGCCCCTCAACAAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTA
CATTTACACAATGGAATACTACTCAGCTATTAAAGAAATGAATTTATGAA
ATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGTATCATCCTGAGTGAAGTAA
CCCAATCACAAAGGAACTCGCACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATAT
TAGCCCAGAAACTTAGGATACCTAAGATATAAGATACAATTTGCCAAACG
CATGAAATTCAAGAAGAACGAAGACCAAAGTGTGGA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 9 13 37 39 41 37 37 37 32 32 37 24 23 25 28 30 31 50 44 30 28 21 21 20 21 29 9 9 9 9 9 9 9 18 15 17 14 14 16 28 32 48 48 36 35 26 22
13 8 9 22 22 26 25 25 18 15 10 10 10 10 21 27 30 30 31 31 31 31 33 47 47 53 53 53 53 42 43 43 43 47 47 47 47 47 47 50 50 50 50 51 51 51 51 51 51 51
51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 46 46 46 48 50
50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 50 50 53 53 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 47 42 42 41 39 39 39 41 39 43 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57
48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 59 59 47 59 39 43 39 59 47 48 47 59 39 39 39 59 43 48 43 59 39 41 41 41 41 44 37
37 44 41 41 41 41 41 41 41 41 37 41 44 44 44 41 41 41 37 32 43 31 31 31 39 37 59 37 21 20 20 21 23 27 34 25 25 25 31 31 39 31 31 39 37 37 37 37 32 29
29 32 39 37 36 36 37 39 39 37 31 37 34 34 21 17 16 19 16 16 22 20 20 25 32 29 29 29 29 30 36 32 32 25 24 20 13 12 11 22 12 21 15 25 25 30 30 32 30 34
28 37 16 11 11 12 13 13 19 27 27 22 30 28 25 15 15 15 18 18 22 16 16 12 12 12 24 21 21 13 13 | Open.Hide.13 13 13 13 8 8 8 8 8 8 8 9 9 18 19 41 41 44 44 44 47 47 50 50 50 50 50 50 47 39 28 23 18 11 12 11 12 12 22 17 20 24 30 30 48 50 53 27 23 11
11 11 21 21 53 53 53 53 48 43 34 36 37 37 37 40 48 48 57 42 42 42 42 42 47 54 68 68 68 50 68 68 68 68 48 48 41 46 46 48 57 68 68 68 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 46 46 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 68 68 68 50 51 68 50 50 50 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59
57 57 68 68 57 68 68 68 59 59 54 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 48 57 57 48 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 47 47 59 59 44 39 39
44 44 44 47 59 59 59 59 59 59 59 59 44 44 39 39 39 39 44 47 47 44 39 39 37 37 39 39 39 41 46 46 59 59 59 59 59 53 47 41 37 37 37 40 43 59 59 37 32 31
30 30 32 41 37 41 36 36 36 47 43 44 41 39 37 37 44 44 41 41 41 41 41 48 48 48 39 39 30 30 30 34 34 39 39 36 43 43 40 39 37 43 30 30 22 30 22 25 30 29
29 36 35 23 24 18 20 20 25 28 35 41 37 28 22 13 12 15 8 8 9 11 15 18 16 20 11 15 15 23 25 25 23 11 12 12 20 14 26 31 31 39 29 25 19 19 19 29 30 37
41 37 16 9 9 9 9 9 14 30 22 24 23 25 18 15 13 16 19 13 13 14 14 14 10 10 11 9 13 8 11 13 13 13 21 21 |