BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-346P10.T7 (MSMg01no346_p10.b1) | MSMg01-346P10.TJ (MSMg01no346_p10.g1) |
ACC | AG459424 | AG459425 |
length | 731 | 727 |
length of high quality (start - end) | 351 (39 - 389) | 450 (68 - 517) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no346_p10.b1 PHD_FILE: MSMg01no346_p10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:37:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no346_p10.g1 PHD_FILE: MSMg01no346_p10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:37:47 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCAA
GGCCCATACCTAAACATGATAAAAGCAATCTACAGCAAACCAGTAGCCAA
CATAAAAGTAAATGGGGAGAAGCTGGAAGCAATCCCACTAAAATCAGAGA
CTAGACAAGGCTGTCCACTTTCTCCCTATCTATTCAACATTGTACTTGAA
GTCCTTGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAAT
TTGAAAGGAAGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTAT
ATATAAGTGACCCTAAAAATTTCACCAGAGAACTCCTAAACCTGATAAAC
AGCTTCGATGAAGTAGCTGGATATAAAATCAACTCAAACAAGTCAATGGT
CTTTCTGCACACAAAGAACATACAGGCCGATAAAGAAATTACGGACACAA
TACCCTTCTCAATAGTCACAAATAATATAAAACCACCTTGGTGTGACTCT
AACTAAGGAAGTGAAAGATATGTATGACAAGAACTTCAAGTCTCTGAATA
ATGAATTCATAGAAGATCTCCTAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGG
ATTGTTTGTTATCCACATTGTCCAAACGGCTACCTTGTCATAAGTAACCT
ACCCATTCCTATGCATCTCTACTCATTTTCCTACTCATTTCTCTTTTTAA
CTCCATTGGCCCTTTTGGCAGATTCCCTTCG
| TGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXCTCCTAGTGATCAAGCAGCATAGAGAGCCAGGG
AAGTCCTGGGTCAATGTATGTGGGTGACATAAGCAAATCCATCATCAGGT
CTGAATATGAATATTGACAGAGTGTGTGCAGAAAATGGAAAATGCCCACC
GTGCCTTCCTTCCCCAACTACCACCATGTTTATAGCTTGAAGACTACTCC
CCTACAGAAACTGCCTCTACCAAACTAAACCTGCCTCCTTGTTTACCTGT
TTGGAATAACCTACTTCCTCATTCAGTTACATCTAATAACCCCGATTCCC
CATTTGACTGTACATAATAAATACTCTCAGCTTCCAGGGCCCTGCGGCTT
CACCATCTGAGAGCCCAAACCACCCAACCCCAGCTTTTCTGTGTTTGTGT
GTCTGTCTGCCCTTTCTTCCTTCCCTTGATGCCTTGGTTAGGTCAGTCCC
TGGCGTCATGCAAGGATTTAGAAAGGTAGGTAAGGTCACATGCCTGTTAA
GAACAGACACCATAAAATGCATGTGTATAGAGGTGTTGTTTCATATAACC
ATTAATATATTTGTTCAACAAGATATTATCACATATTACAGATACGTAAC
TTTAAATGCCCGATTATCTAGACTTCTATTATCTGTATCCTGTAGCTAGT
ATTGAGCTTTCCCTTAGCCCGACTTAG
|
quality values | Open.Hide.22 25 22 22 12 13 12 11 14 9 8 8 11 18 23 22 34 23 14 14 16 13 12 9 15 12 10 12 12 16 23 32 26 25 22 24 24 30 30 34 34 34 23 18 16 15 19 18 24 22
13 23 19 20 20 20 23 28 32 34 36 43 34 34 34 34 36 37 48 48 48 48 48 48 39 39 33 42 33 39 39 39 39 39 36 37 37 46 46 46 43 43 37 44 47 54 54 44 43 47
47 47 57 47 48 48 48 48 48 54 47 57 43 43 37 47 47 43 43 44 47 47 48 48 57 57 57 48 44 44 37 37 41 50 50 47 48 50 57 57 57 57 57 50 50 37 37 37 43 43
44 44 35 35 35 50 50 57 57 52 52 52 52 57 57 68 68 57 57 59 59 57 59 57 59 57 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 57 57 57 52 52 52 59 57 57 52 43 43 43 43 43 62 62 62 43 43 39 39 43 57 47 39 35 35 35 35 35 35 35 35 39 39 45 57 42 39 39 42 43 43
52 52 52 43 43 43 43 43 43 43 43 52 57 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 35 35 37 43 43 57 57 50 43 43 35 32 44 43 43 35 50
50 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 47 50 50 43 35 33 33 42 44 47 47 39 39 35 37 35 35 35 35 32 42 42 57 46 57 57 36 36 25 25 30 42 39 43 43 44 43 36 32
20 20 20 30 34 41 25 23 28 28 28 20 15 22 19 11 11 15 23 32 43 43 43 33 33 18 17 13 13 13 15 25 29 32 25 16 16 15 15 12 14 14 21 21 17 17 18 18 14 13
13 24 24 31 28 15 15 10 10 10 11 12 12 11 11 12 15 11 11 9 11 11 12 12 9 8 8 8 8 8 8 10 12 21 28 23 28 28 19 25 13 15 11 12 11 11 11 19 21 19
13 11 13 18 21 29 33 33 28 28 28 23 23 23 23 20 14 12 12 12 18 14 30 32 32 28 22 22 18 10 10 10 10 9 10 17 17 20 12 11 11 15 15 17 15 19 17 14 14 14
19 19 26 24 15 12 11 11 15 12 13 13 19 21 25 24 25 32 33 33 27 28 20 20 15 15 13 11 10 13 13 13 13 13 13 19 13 11 13 9 9 9 9 15 22 21 15 14 8 12
6 6 8 10 10 10 8 8 10 10 10 12 12 12 10 10 13 10 10 10 9 10 10 11 11 12 23 15 15 14 14 10 8 8 8 8 11 8 20 28 21 19 12 12 12 16 16 17 19 18
10 10 10 10 10 10 10 10 10 12 15 10 9 10 10 10 14 13 12 10 8 8 8 8 11 11 13 13 12 27 11 11 11 11 11 11 8 10 8 8 8 8 10 10 10 10 11 18 26 23
19 10 10 9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 13 10 8 8 9 9 6 6 6 6 8 8 11 11 16 15 9 8 8 8 10 15 9 9 9 9 10 11 8 8 8 8 13 14 14 13 13
10 10 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 9 10 10 15 15 15 15 12 12 11 11 11 | Open.Hide. 7 7 7 7 7 8 8 14 19 29 32 39 39 39 30 36 32 30 34 17 17 9 9 9 9 9 9 11 17 14 9 13 13 25 19 28 22 24 26 27 29 37 32 35 32 37 32 25 23 9
9 9 9 10 10 11 18 23 25 39 34 32 22 29 24 36 33 48 48 48 34 43 43 43 43 39 39 47 47 48 48 48 48 48 48 48 43 43 43 46 46 57 59 54 50 68 68 47 47 68
50 50 48 48 43 43 43 43 43 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57
57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 42 37 37 57 57 57 57 57 43 52 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 62 62 45 52 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 52 62 62 43 43 35 43 47 62 62
62 52 52 62 57 57 57 43 43 26 27 13 13 13 18 38 38 44 35 39 39 43 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 52 52 57 59 59 57 57 57 57 57
57 57 57 57 52 54 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 57 50 50 38 38 38 50 44 57 57 57 57 44 47 35 35 35 43 43 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57
34 32 17 17 17 32 34 44 57 32 26 13 12 12 13 32 32 26 21 10 10 10 17 21 24 21 12 11 10 10 10 10 12 12 31 27 25 25 37 37 46 40 40 22 25 17 22 18 27 12
17 15 28 25 21 18 14 15 15 31 25 24 12 12 12 26 28 43 43 23 23 11 11 8 8 8 8 8 11 11 15 19 19 21 23 23 15 14 15 15 18 11 11 11 22 19 14 14 14 14
14 12 21 11 11 11 11 11 10 10 13 16 10 10 10 10 9 11 11 12 13 11 12 16 18 21 18 17 11 11 12 16 16 13 15 14 13 20 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9
15 15 12 12 15 17 15 20 19 18 19 16 16 10 9 7 6 8 8 8 9 13 15 10 9 9 9 12 10 12 8 8 8 10 8 8 10 8 11 12 11 11 11 12 12 12 10 8 6 8
8 8 8 11 8 8 8 8 10 11 11 7 6 8 8 8 8 8 11 10 11 16 10 11 8 7 7 |