BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-363P03.T7 (MSMg01no363_p03.b1) | MSMg01-363P03.TJ (MSMg01no363_p03.g1) |
ACC | AG472260 | AG472261 |
length | 1,457 | 769 |
length of high quality (start - end) | --- | 496 (79 - 574) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no363_p03.b1 PHD_FILE: MSMg01no363_p03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:59:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no363_p03.g1 PHD_FILE: MSMg01no363_p03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:59:50 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CACAGAGTAGCAGTTCGCAACGCTCTAGNAGCAGCACNCGTGTATCTCTC
GCCGAGAGGACACGTTGCTGTGGAGAGTCTACGTGCGAGTGTACTGTGCT
ATACCGACGTGTAGCACAGACTCGAGTCGCTAATACGACGCGTCTGAGTT
AGCGACGTAGCGTCCTGCGCGGTTCTTCGCACGCGTATGCAGGACATACT
ACAGTATCNTGGCGCGATGCATCGGCGATGTATCATGANAGCTCTCACCG
TAGCTATATAGCACGTACGGTCCGGCGACTTGCGTAGCGTTGATTTTATG
CTTGTACGCCTATTACTAGGTATACACGACACGTCTATGCTCCGNCACTC
TTCGCGATGATCCTGCTGCACATACTCTATCTTACGATACGTCTACATGG
TACTCTATCATCGTATACGCGACGCGCCATTAGTACTCTCTACCTGTCCG
CTCGCGCGACTTCGCACGCTCTTGTATGCGATACTCAGTAGTAATCAGAA
CTGCCGACATTCTCGTGTGATAAACCGCATTTCACACCATTATATACCAG
TCATTTCTTATGCAGTACGGCGTGTCTGTGGATCGCCGACCGCTCGCATT
ATGAGTCATTTGTCGGCATATCATTTCCCGGCCTGTATCCGTGCACCGAC
ACTCCTTTACACGTATTCACGCCTTGTCTACCACGAATGTGGTGCGCCAA
GTGTATCGCCGAGGACTATGTTCAGTGTTTAGCNGCGTCTGTCTCTACCC
TCTCTCACTCGACGTCATCTATCGACGTCGCCCGGTATGTGAGATGTATA
TCTGCGATGTAGTGACCGCACTTACGCATTTTGCTTTTCGACGCGGACTC
GCGTGTATGTGTTCAGTCTATGTATCGATTCATTACTTCGTCATATCGNC
CACGATTGTCTGATCGCCTGCCGTATCGACACATGCATGTATGTACATGG
CTCTGANTACGTAGTCGCGTCTTGACACACGCACGTCTATAATCGACTCG
ATATGTGCATCGTGTCTCGTCGTTCTACATGTNATCGTCTACGCACCCGC
CACACCACGCTACTAGAGAGTCATATATTANGTCACTACTGTCNGTCGAG
TGATACGCGCTAGTTAACTCTGAGATAGAGTGTCTACCATGCATCGATAT
GATATTTATAGTAATCTTACACCGCCACGTGTACACGATTGCGGACGCAG
TCACAGCGATTGTATGTTTAGTGTGAGATATTCGCCACATCAATATAGCG
ATACGCGTCAGCCATAGTGTATGCTGTGATGTAGTAGTGCCGATGCCGCC
GCGTCANTGTTATTCCTGCGTTCGTATATGTACACGACGCATTGGTCATT
ATACTATACTCGCCCGACCCACATCGCACGATCTAAATATTGTGTAGTAT
GACGCGTGTTTGTGTGCGCACGCAGTACACTACCGCGACAGTATTGTTCA
CTTTTCG
| CCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTGACCCCACTCTATGTGCCC
TGAATCTGGGTGTTTATTTTGTGCTACACAGTGGGATTTCACAAACAGTG
TGGGCTCCACTAACTCAAAGTCCAACTGCGTGGAAACTCAACTTGAGACT
CAGTAAGACTTCGGTGAGCCGACTTCTCTGCAGAGTGGGAGGTGAGACCT
CATGCATGCATGCAAGATCGTGTTCTTCATGGCTTCAAAGCAAAAGAATA
CGATGTATGTAAAGACTGAAGCTAGCTAAAGAAAGATACATCAAACAAGG
TGGAGTGTCCCTACACATTCACCACATCTACAAACGCTAACCCACAGATA
GCAGCTGGGACAGGGGGTGGCCGCAACAAGGTGCAATATGGCATCATCCT
GCACTGAGAAGTGCATTCTGGGACAGGCTAAGACAGTGTAAAATCAATGA
GAACTCACCGTGGCTCTCTTCCTTGTGCTTTGGGATATTTTTCTCTACAC
CAATGGTCCTGTTTCCCCTTTCAGAATAAGGCTGTTTGCTTCTTGACAGC
ATTTTGTTCCGNTGTTTAATCTTTGTGGTTTTGAGATACAAAATTTCCTA
CACATTAGATGAAAAACTATTTCTTTTGAGTAATTGGTCTGTGTAGGGTT
CAAAAAATTTTTTTGAAGTGGAAGGCTCTTGATGAACTTAACATCTCCAA
ACGCACAAAGTGAAAGGCN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 8 11 12 6 6 6 6 8 6 7 9 6 6 6 6 6 10 6 6 8 3 0 3 7 9 9 9 10 9 3 0 3 7 6 8 8 6 6 6 8 7 7 6
6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 11 11 11 11 12 12 9 9 9 10 8 8 10 12 9 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 7
6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 10 8 6 8 6 6 6 8 9 10 10 10 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6
6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 10 12 10 10 9 9 10 12 7 9 9 9 9 9 12 8 8 8 8 6 6 6 6 6
6 6 6 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 8 13 10 10 7 7 7 8 15 12 13 11 13 10 10 8 8 6 6 3 0 3 9 9 11 11 11 9 9 9 9 9
9 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 11 10 9 8 7 6 6 6 6 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 7 8 6 6 6 6
8 10 10 10 9 9 10 15 13 13 11 10 10 10 10 9 10 9 9 9 9 9 11 10 10 9 10 9 8 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 13 9 3 0 3 6 6 8 8
6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 11 12
12 12 14 9 8 8 6 6 6 8 8 8 8 9 8 8 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 7 6 6 6 6 6 10 10 10 19 16 16 10 8 8 8 8 8 8 8 10 6 9 9
10 8 8 8 6 6 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 10 10 8 10 11 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8
6 6 8 8 10 11 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 8 6 6 8 6 8 8 8 7 6 6 6 6 8 9 8 8 8 8 11 11 11 11 10 10 9 12 8 8 8 8 6
6 8 8 8 10 16 10 10 9 9 10 7 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 10 10 10 8 8 7 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 8 8 7 6 6 6 8 8 9 12 10 8 7 6 12 10 9 6 6 6 8 10 9 6 6 6 10 8 8 8 6 6 8 7 9 8 6 6 7 6 6 6 6 6
6 6 6 6 9 12 18 11 17 10 6 8 7 6 6 6 10 8 6 6 6 6 6 7 8 8 10 9 10 10 8 8 8 6 6 8 7 6 6 6 6 6 10 8 8 8 7 8 8 8
8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 8 8 8 10 13 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 3 0 3 11 11 9 9 8 8 8 10 13 13 8 6 6 10 6
8 8 8 10 8 8 8 11 12 11 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 10 12 10 12 10 10 12 12 9 8 9 10 8 8 6 6 6 6 8 8 7 7 6 6 6 6 8 6
8 8 8 11 8 6 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 8 9 12 9 9 13 8 8 8 8 8 8 7 6 7 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 9
8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 7 7 6 6 6 6 8 8 10 10 3 0 3
6 6 8 10 13 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 11 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7
9 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 12 9 9 9 11 9 9 7 7 8 8 8 8 11 10 8 8 6 6 8 6 8
8 8 11 6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 10 12 11 19 11 13 10 12 8 8 6 6 8 8 10 3 0 3 7 7 7 8 8 6 6 6 6 10 8 8 10 10 9 7
8 8 10 9 8 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 12 3 0 3 8 8 6 6 8 7 11 12 10 8 3 0 3 8 8 8 8 8
8 12 10 8 6 6 8 8 8 10 18 13 13 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 15 15 12 14 10 6 8 6 6 6 10 10 11
10 12 10 13 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 9 8 9 9 9 9 9 10 11 11 15 6 6 6 9 9 12 9 9 7 6 6 6 6 6 8 7 9
9 9 9 10 10 8 8 6 6 8 10 6 6 6 6 7 6 10 6 6 6 7 7 6 8 8 8 8 9 9 9 12 10 22 7 7 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 7 10
8 9 10 15 13 10 8 6 6 6 6 6 8 6 10 6 6 6 7 6 8 6 9 9 7 6 7 7 7 8 10 9 9 10 10 10 10 11 8 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 8
8 8 9 8 8 3 0 3 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 9 9 9 9 9 6 6 6
6 6 6 9 9 6 10 8 8 8 6 8 9 9 8 6 8 8 8 8 11 13 9 9 9 12 12 21 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 8 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 7 8 8 12 9 10 8 6 6 6 8 8 12 15 17 15 9 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 9 6 6 6 6 8 6 9
10 10 12 10 10 10 10 | Open.Hide. 6 6 7 11 15 8 8 8 8 8 17 3 0 3 23 18 28 30 37 30 34 34 34 34 37 39 39 34 41 41 25 25 11 11 9 10 10 13 10 15 10 18 18 33 26 48 48 48 50 50
36 36 36 33 33 33 59 47 43 25 18 11 9 9 9 9 10 19 17 32 32 41 30 31 35 36 38 36 42 30 32 43 43 43 42 48 48 48 57 48 48 48 59 57 68 59 59 48 48 57
57 41 47 50 43 48 48 46 46 43 43 43 59 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 68 50 50 46 48 48 48 47 47 57 57 57 57 57 57 47 47 47
57 59 57 50 50 46 57 50 54 54 57 59 52 52 52 52 52 57 57 59 54 54 57 57 57 54 57 52 59 52 52 52 57 50 50 50 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 52 59 59 68 57 57 52 57 57 57 43 43 44 42 45 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 52 57 57 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 62 62 44 44 35 35 38 38 31 31 31 44 44 62 62 68 68 68 68 62 62 62 52 52 52 52 45 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 59 59 52 52 52 57 57 59 59 57 52 52 52 57 59 57 52 52 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 59 57 57 57 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 68 68
68 59 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 59 59 59 48 48 48 57 50 54 57 57 59 57 57 59 59 59 59 59 54 57 57 59 59 54 57 48 57 47 47 43 42 44 43 47 47 57
47 57 57 54 44 44 44 44 44 59 39 47 47 59 59 59 48 48 47 47 43 48 48 54 54 54 57 57 57 57 43 47 43 47 47 59 59 59 59 59 57 47 43 43 36 36 43 35 57 43
43 39 47 47 46 46 46 39 39 41 41 31 34 43 35 39 39 46 46 47 48 48 59 47 35 35 39 47 59 48 47 46 43 43 43 43 43 57 57 59 59 47 47 41 39 37 37 37 40 40
39 39 36 26 19 13 28 28 28 28 36 39 39 43 43 48 48 40 46 46 32 32 20 16 17 14 16 19 24 19 25 19 14 9 9 9 15 24 41 47 47 46 46 47 47 39 35 35 39 37
46 46 46 46 43 41 41 34 17 17 3 0 3 15 15 24 28 19 22 25 25 30 22 25 12 12 11 11 15 22 28 21 23 10 10 10 13 15 27 20 22 26 25 18 21 21 17 15 16 21
12 12 12 24 22 19 10 10 10 12 12 16 18 16 16 18 23 23 28 34 27 30 20 16 16 20 17 17 9 9 9 15 19 28 18 13 11 10 10 10 10 10 11 12 12 14 10 7 8 8
8 8 9 9 15 10 9 12 9 17 19 19 9 9 10 11 14 11 10 8 8 8 9 10 15 11 11 12 16 12 12 10 12 8 6 6 8 8 8 10 17 13 12 11 11 8 8 8 8 9
8 8 8 11 8 8 8 8 8 9 8 10 11 14 12 15 15 3 0 |