BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-375C04.T7 (MSMg01no375_c04.b1) | MSMg01-375C04.TJ (MSMg01no375_c04.g1) |
ACC | AG480764 | AG480765 |
length | 761 | 773 |
length of high quality (start - end) | 548 (53 - 600) | 504 (81 - 584) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no375_c04.b1 PHD_FILE: MSMg01no375_c04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:14:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no375_c04.g1 PHD_FILE: MSMg01no375_c04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:14:37 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NACCCTCTATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCCAGTAATATGCCTAATGTTAAATTATCAACAAAACATC
TCAAATGCTTGACTGTAATAGCCAGTTCCACTATCTGTTTTAACCTGATT
TGGAACACCAAGCATAAATAAAAAATAAAATTAATGCAGGAAATGACTAA
TTACATTTTTAATTGCTTCTCTTATTAAAGCAATTGCAACTAGAAAGCCT
GAAAAAGTGTCAAGTCACATGTACATACTTTAATTTTTCAAAATCAAAAG
TATGAGTAACATCCATTTGCCATAATTGATTAGGTATAAGTCCTTGAGGA
TTAACACCATTATGTGGTACAGTTAGAAACTGAGGGCATTGAGAACAAGT
CTTTACAATTTGACGTGCACATTCTCTTGAAATACCAAATTGCTGTCTCA
AGCTATTACTATTTTGATGATGTAAAGAATGAAATTGTTTGGCAAATTGT
TCCTGTGGAAGGCCTATAACCTTCCTGGTATGCAAATCTGCTGTGGCATT
GCCCTCACTAAGGGGTCCTGGCAATCCAGTATGAGTTCTTAAATGACCTA
CCAGATAAGGAACTGTACATTCTCTTAAATTGAGTTGTATTTGCATAAAT
AATTTCCAAATTTGAGAATTAACAGTATCTTAAAAAAAAGGGGACAATTT
CCAGTAATTGTAAACCTTGACCTTTATATTAAGCTCTCACTAAACAAATT
AAAAACCTTGG
| NNNCCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAAATATGAGCTTGTCAGTG
CTGGGGTTATGCACTGAGCGCTGAGATGACCTACTGAGTGCTGGACCTAC
CTACCAAGTGTTGGTATGACCCACTGAGGGCTGGGATGACCTACTGAGTG
CATAGGTTACCTACTGTGTGCTGGGATGACCCACTGAGAGTGAGGATTAC
GAGAGTGCAACAATGTCTAGTATTCCAGGTTCTTTTATTTTTAAAATCCA
TCAAACAAACCCCCACTGGTTCCGGGGATCTAACTCAGATCTTCTTGGTT
GCACTACGCCAACTGAGCTATCCTTCAGCTAAGATTACGTTTTATTCGTC
TCAAAACCCAAAGACAGTTTAAAATGATAGATTTACTAGAATGGATTGCC
CTCAAATAGCCATTTCTTTGGGGTTCGGAAGATTGGGGTAGAGACATACA
TGCTAGAGTATTGTGTCTGTGTGACCAGAGCTCACAGAGTCATCATAAGA
TCCCTTTTTGGTATTGAAACTTCCTTTCTGAATGTCTGAGAAGAATTACC
GTTCTTTGTGTCCTCCAGAGATATAACACCCAGGCCTTTCCTTCCCTGGG
TCCTCTTAATGAGCGCTCTTATTTTCATCCTTGGGCAATTGCAACTCCTT
TCTTTCCCTCGACAGCACCTTCTTGGATGTTGCTTTTTTCACATAGTGCT
ATCTTTATTGAAATTTTTCTTGG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 9 9 10 8 6 6 6 8 8 10 10 12 11 11 23 18 11 15 15 16 27 23 19 18 22 25 25 21 14 18 18 20 21 25 11 9 9 10 9 9 9 11 12 8 8 8
15 22 28 59 48 48 35 35 35 35 50 36 47 41 41 37 25 25 12 21 19 15 11 14 13 21 20 30 33 33 37 48 50 53 53 57 53 53 53 53 50 50 50 53 50 50 47 47 47 42
33 29 22 22 31 40 48 54 57 57 57 57 59 48 48 48 57 46 68 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 47 57 57 68 68 68 59 59 57 47 47 50 51 51
68 68 57 57 57 57 57 57 57 47 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 47 47 42 42 44 57 57 50 50 50 57 57 57 57 68 68 57
57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 59 59 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 62 62 62 62
62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 57 59 57 57 59 59 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 43 37 37 37 50 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 44 44 33 33 35 43 59 57 44 44 35 35 35 44 44 68 68 68 68
68 59 57 57 57 48 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 44 43 43 43 44 44 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 59 59 59 54
59 59 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 43 43 43 43 43 48 43 43 48 57 59 59 59 43 43 43 43 48 48 48 59 47 47 41 30 30 18 12 12 29 30 47 59 59 59 59 59
59 59 59 47 43 41 41 41 41 37 30 27 23 23 31 39 59 41 46 46 46 46 47 47 43 43 32 37 41 43 59 59 46 46 46 48 48 47 47 47 47 41 43 41 37 41 43 44 59 59
44 37 37 32 32 20 20 20 25 25 32 28 28 31 34 36 37 39 39 31 31 25 19 11 11 11 23 20 32 37 37 32 32 18 18 15 26 19 28 28 27 27 32 37 37 35 29 24 17 10
8 8 8 10 8 13 15 21 16 31 28 28 32 32 23 19 19 13 13 17 28 21 21 12 12 10 18 12 15 18 19 21 17 12 11 9 9 10 10 15 11 16 17 13 13 14 23 25 17 17
9 9 9 9 11 9 12 9 14 9 9 9 15 15 10 10 10 10 11 9 9 9 9 10 10 10 8 11 8 8 8 8 19 15 8 8 8 21 12 14 12 11 9 11 15 9 9 9 14 12
8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11 10 8 8 7 9 9 11 13 12 12 11 10 8 8 8 10 10 9 9 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 10 12 12 10
10 13 22 16 11 11 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 7 7 10 10 8 8 8 8 8 13 17 37 41 41 41 37 37 37 34 39 37 37 37 37 50 50 50 50 47 37 27 23 15 9 9 11 13 9 19 12 16 16 33 27 48 48
48 48 36 36 36 36 37 50 50 59 57 57 48 27 27 9 9 10 10 26 19 28 28 34 23 42 42 42 42 41 41 41 48 48 57 68 68 68 68 59 59 57 59 57 57 57 57 47 54 57
57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 48 50 50 50 51 50 57 57 57 57 50 50 41 50 50 50 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 52 52 59 59 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 52 52 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 57 59 57 43 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52
52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62
62 62 52 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 43 43 31 33 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 62 62 62 62 62 59 59 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 57 57
57 57 52 57 57 57 43 44 43 44 44 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 43 57 57 59 59 57 57 57 68 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52
44 44 43 43 57 59 59 59 43 43 44 44 59 59 59 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 43 37 37 57 43 57 47 48 48 48 48 48 59 40 42 37 43 43 47 47 47 47
57 57 57 57 36 36 16 17 17 42 42 42 37 37 40 40 47 59 47 54 54 36 30 24 21 20 18 23 30 34 43 44 43 43 34 37 36 28 24 24 34 34 35 37 37 37 39 46 43 41
43 43 41 41 44 59 59 59 39 28 28 28 28 28 28 30 37 37 40 37 37 30 35 35 37 37 30 30 21 18 15 18 14 14 13 16 16 16 11 12 12 15 10 8 8 8 8 12 8 9
8 9 9 19 19 25 21 12 11 12 12 11 11 17 11 11 10 9 9 9 9 11 11 11 11 11 11 11 9 10 9 9 10 10 10 21 11 11 12 11 11 11 11 11 16 16 16 17 13 19
13 20 10 13 10 8 8 8 8 8 9 11 13 14 14 10 15 10 13 16 19 30 23 18 15 10 10 9 10 10 12 13 13 14 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9
12 11 19 12 14 9 8 6 6 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8 9 13 13 13 10 9 9 8 8 6 6 8 8 10 19 15 18 18 18 10 8 6 6 8 6 6 8 8 9 9 9
9 9 9 8 11 10 10 10 8 8 8 8 9 8 10 17 9 8 8 8 8 8 8 |