BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-387C03.T7 (MSMg01no387_c03.b1) | MSMg01-387C03.TJ (MSMg01no387_c03.g1) |
ACC | AG489938 | AG489939 |
length | 779 | 764 |
length of high quality (start - end) | 218 (66 - 283) | 420 (84 - 503) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no387_c03.b1 PHD_FILE: MSMg01no387_c03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:30:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no387_c03.g1 PHD_FILE: MSMg01no387_c03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:30:06 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (100,196,261 - 100,196,478) | (99,992,721 - 99,993,140) |
---|
sequence | ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAGAGAATCCGCGGAAT
TCAACCACATTATCAGGGTGGAGAATTTATTGTGGGGGCGATTAAAAATT
ACATCAGAGAAATAATGATCCGTCCTTTAATGACTCTCCTTTGTAGTGAG
CTTAGATCAATATCAACTGTTTGTTTTATTTGAGCTCTTCGATTTTTCCC
TCTTAAAGAAGATATTGCGTGACCATGCAAGCTCAAGAACTAGGGGAAAC
TCACAAGTGTTTGGCAGGAAAGGGGAAAGTAGGCGATAAAATTGTGCCAC
ACGTTTGGTCCTTGCAAAGAAATACTTGCAATGCAAACCACCCAACCAAC
CACCAAGAATGGAAACTGAAATCAGATTCTCCTTTGTCTAATTCTTACAA
AAGCATGGTAAACTCATATAAAGAGGCCAAGGAAATAGAAAAGCTTGAGG
TTGTGAACCAGATTATGTTAAATGAATTTCCTTAGCGTCCCTTTTGAGGG
CAGCCCTTCCGCGAAGTGACTTAATTACTACCACTTTTAACCTTCCCCCG
AGTTCTCCATGGTTAGCGGCAGCATTTTTACTACTACCGCCGTCCCACTT
TCCTGCCCCACAAACTGCCCCCTCGCTCACTGCCCCTTTAAACCCCAAGG
ATGCCCCTGGACCTAAACCCCCCTTTCCCGTCCCCCCCCCCTTCTGAAAT
ATATCTTTCTACCCCCACCCCCCACCCTCTTTCCTTATGTCTGTTTCTTC
ACCCCCCCCCTTCCCCTGTTTTCTCCCGN
| CCCCCTTCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGGACTGAGGAGAAGA
TGGTGAGGTCACTTCTAGGTTTGCATTTCTGTGACAATTCATGTTCAGGA
AGATGTTTGCATGCACGAATTCAGACCCTGTTCATTATCAGTGTGAAGAT
TACTTCAGGAACCCCTGAGTTCCAGGGCAAATTCTGCTTGCAGCCCTGTG
ACTTATGACATGTGACTTGCTCATTGCCTCAGTATCTCAAGTTCCTTATA
TAATGTGATGTAAAATAACAGAGAGAGCCAAGTATTCTCTAAGATCTTTA
GTATACTTAAAAAATCTGTTTCAGAGTGGAACACCACACTATTAACTGTC
TAAATAATCACACTCCCTTCCTCCCAAAAAGCAAAGCAAAACAAAAAAAC
CAACAGATACAGAAGCAACTCTGTTGTCGGGGACAGAGCCTGTATTATCT
TCCAGAACAGACATACTTTGCCTGAGGAGGGGATCTGACATCTGGTACCC
ACCGCCTGCCGTCGTCGTTTCTTGTAGAACTGCTCGCTTCTCTGAGCTGT
CCGCTCACGCTCCTCCTCGATTTCGCTATCATCGCTTTCTGCTGCTCCTA
TTTCTGCTGATTCTTCCCGTACTCCTTTGTTCTACTACCCCTACTCATTC
TACAATTCCTTCTCCCCCTCTCCTTCCTCCCTTACCTGCTATTTTTCCCC
TCCCCCTCTCTTTC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 8 17 34 23 18 18 11 15 8 11 11 8 8 8 19 15 20 20 14 21 14 10 10 10 15 9 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 11 10 16 18 18 15 13 23 29 30
33 33 31 21 19 12 15 13 12 8 8 8 10 10 10 10 22 26 35 35 39 47 33 36 36 36 42 42 42 37 37 34 39 39 43 43 28 34 11 15 21 30 30 54 59 43 43 46 46 42
42 31 24 19 15 11 11 27 34 42 42 37 47 41 41 42 41 41 29 27 13 14 14 32 32 46 47 57 41 41 41 57 48 44 44 44 37 41 57 57 57 57 42 59 50 43 43 43 57 50
57 59 57 41 37 37 50 50 50 52 50 38 38 24 24 24 43 44 52 52 52 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 43 44 35 35 35 43 43 57 59 59 68 59 59
59 57 57 59 59 59 68 68 59 57 41 41 50 50 50 57 57 44 44 35 35 39 42 44 44 30 32 17 17 17 22 26 36 32 32 31 30 30 42 42 37 28 37 41 41 37 31 36 36 39
40 37 37 43 43 43 48 59 57 43 43 32 23 19 24 16 15 14 21 18 18 21 14 14 18 18 37 37 37 37 21 18 12 14 14 17 23 28 23 20 20 22 29 30 37 29 27 13 13 11
25 22 21 20 23 23 18 14 30 41 47 47 39 44 30 28 24 19 15 13 18 12 12 11 22 23 32 39 39 35 39 37 37 37 37 37 37 39 37 41 32 34 41 41 41 41 41 41 33 33
24 30 28 31 28 30 37 37 44 43 41 43 43 34 34 22 15 24 14 30 34 34 34 23 23 23 41 41 59 59 59 59 54 48 48 32 32 12 15 15 28 28 43 47 47 44 44 32 32 14
18 18 41 44 59 59 57 40 44 25 28 28 42 42 47 28 28 13 13 12 26 23 20 20 20 16 18 11 11 12 15 15 17 17 18 20 11 15 23 20 16 14 18 18 31 30 34 24 28 31
31 32 35 35 29 28 17 13 10 10 10 9 12 12 25 25 34 23 23 20 30 18 18 21 21 19 24 19 23 23 28 22 18 11 11 11 13 13 21 30 39 44 59 59 59 47 41 41 41 59
37 35 25 16 13 15 15 15 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 13 9 12 13 11 11 10 10 10 10 9 9 9 9 9 10 11 17 21 17 9 9 9 9 9 9 24 19 21 18 13 15
18 11 12 10 13 10 8 8 8 9 9 10 10 13 10 11 9 9 9 9 12 12 15 12 15 11 15 10 9 8 8 9 8 8 8 8 8 13 10 10 11 11 11 11 11 10 10 15 15 10
8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 18 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 7 22 12 19 12 8 8 8 8 12 13 12 10 10 8 8
8 10 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 9 10 12 17 23 18 14 14 19 10 8 8 8 13 8 8 8 8 11 17 12 18 16 17 15 17 20 20 18 17 11 11 11 19 13 10
6 6 6 8 7 6 8 8 8 10 10 10 17 19 14 12 12 12 12 14 13 12 10 12 8 8 11 12 13 9 9 9 10 10 14 13 10 10 8 8 8 8 10 8 15 16 16 13 16 10
10 9 15 15 10 10 10 12 12 6 6 10 11 16 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 | Open.Hide. 8 8 8 8 6 8 6 6 7 8 10 8 9 9 9 8 8 9 9 9 15 13 22 26 30 34 44 39 39 39 39 39 37 37 41 41 41 27 23 9 9 9 11 12 9 10 10 13 13 30
25 41 39 43 48 48 36 50 38 38 47 47 59 48 46 41 32 23 14 9 13 9 9 9 12 12 23 18 33 33 33 33 33 33 28 28 35 42 50 50 50 50 50 50 53 57 57 48 48 42
48 42 42 57 57 57 57 54 57 57 54 50 50 57 57 57 57 59 59 68 68 54 54 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 51 51 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57
48 48 41 42 41 48 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 50 50 50 50 57 57 57 57 57 59 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 68 68 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 57 44 59 43 52 52 57 59 59
68 59 59 52 45 45 52 57 57 52 52 52 52 52 57 59 59 57 57 43 43 35 35 35 43 43 59 43 38 27 16 32 32 32 43 57 43 43 38 38 38 57 52 52 50 59 47 43 28 18
14 32 28 50 50 57 57 57 52 43 43 43 52 44 57 44 44 43 43 50 38 26 13 13 13 20 20 22 22 33 36 42 43 44 42 42 31 31 31 42 42 44 42 35 35 37 42 42 44 44
59 57 46 43 43 46 57 57 48 48 48 48 46 48 48 54 54 59 57 57 57 57 46 43 43 43 43 43 43 43 41 39 35 32 34 28 28 28 28 39 43 29 28 28 28 32 26 28 24 24
20 31 32 30 30 28 31 26 26 13 13 13 24 15 18 18 24 22 28 28 37 37 43 34 32 23 23 18 24 15 16 26 32 37 39 39 35 43 39 28 30 13 13 13 22 26 31 32 28 28
19 15 13 16 15 13 12 12 12 12 11 12 12 24 25 37 28 28 28 24 24 18 16 16 11 11 12 18 21 13 13 11 11 16 16 23 23 15 11 13 11 18 16 13 15 15 13 13 8 11
7 7 10 10 16 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 8 9 12 15 15 8 10 8 10 10 8 10 8 8 8 8 10 11 10 10 8 10 8 8
8 8 8 8 8 7 7 10 10 9 9 8 10 8 8 8 8 7 7 13 15 13 10 8 10 8 8 8 8 6 8 8 8 10 23 16 16 14 9 9 9 9 8 11 7 9 12 15 8 8
8 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 9 10 15 10 9 12 13 13 8 8 8 10 8 6 6 8 8
9 9 9 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 13 13 9 9 9 9 14 12 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 6 7 8 10 8 12 9 9 10 10 11 9 9
10 10 14 17 16 13 8 8 8 8 9 9 9 9 |