BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-398I12.T7 (MSMg01no398_i12.b1) | MSMg01-398I12.TJ (MSMg01no398_i12.g1) |
ACC | AG498611 | AG498612 |
length | 754 | 864 |
length of high quality (start - end) | 239 (72 - 310) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no398_i12.b1 PHD_FILE: MSMg01no398_i12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:11:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no398_i12.g1 PHD_FILE: MSMg01no398_i12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:11:17 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATGCGAGAACACCGCGGAATTC
CCATCATCCCAGAAACATTCCCAATATCCCGAAAGGAATTTGTTCGATTT
CTGCTGGCCACTCCAACCAAGTCAGAGCTGCGCTGCCAGGTAACTGAAGC
AGACCGTTCGCTGCATGGCCTGTGTGCATCCGCAAATCTAGAGCAGTGCC
ACTTCCTTCGAGGGCTTTTGTTTTGCCTTATTTCTCTTTGTTTAATGTAA
GATACAATTTAATTATAAGCCAAGGCTTTGATTGAATTTAAAGTGGCTAG
TGCACATGAGATGTTTTAGCCTTTTTTACTGTCTAATTGTGCTTTATGTA
GCGGTTCTTGAGTAACATATGGAAATTACAGCAGTTTCTTTAAAAAGTTT
ATGTTCTCATATGTGTGTGGCTGGTCAGTGGCAGAAACTTTTGTGTGTTA
TCACAGGTTTTGAGAACACCACAATATTTATCTTTTTTCCCCTTAATTAA
GATGATTGGATTTTAGAATTAATAAAATAATAGCTATGCAATTGATCATG
GCTATTATCATGCATGTGACTAACTGTGATCCCTCTTTAAGCAGCTCACC
TGTCAGTGTAGCGTAGCCATCTCTGTCTTATTATATAGAGGCGCCATTTC
CTTTATGAGAACCCATGACAGTCTCGGACGTCGTGCACTTCCCGTTCCCT
TTGTTTAAGCTGATATTCATTCCTTTTTATGCGCACGTCCCTGTTTTCCG
ATAC
| ATAAACCGCCAACCCCCGGNGGNCGCCCGGTTGCACCACCCCGGNGANAN
NANAGAATTTTTCGNACACCACCAAGAAGNGNCCACAAACGGCCGCTAAG
GGGACAGGAGATCATGCCCCAGCAATAGAAGGGAAGGCTGCATTGCTATT
TTATGTTTTTATCCTGGCGCGCACGCATGTATGTTTCCATGCGTGCATGC
GGACACAACAGGTCAACTTGTTCTCTCTCTGTCCCCCATGCGCCTCCTCT
TTACAAAACTCATGTAATCAGGCTTGATGCTAAGCATGTTTACCCTCTGA
GCCCCACAACGCCTTTTTTTTTCTTCCGAGCACCCCCCAAAGGCTGGACG
CCCACCCTCGTTTTTACTTCTCACCCCCGATCTATTTGAATACTCCCTGC
TCTCATTAATGGCACTCTCGCCCCCCCCTTGACACCCACCCGCATTCTCC
CTCCCGCCCTGCATTAGCCACACTCCCACTCCCCTGCTCCGCACCCCTCT
GCCCCCCCACCTCCCCCCCTACGCTTTTTATCTCCTCTTCTCTTGCTCAC
CTCTTTTCTCCCCTTCTCCCCCCTCCTCCCCCTTTCTCCCCTCCACCCTC
CTCTCTCTTCCCTTTTACAACACCCACCCTCTCCCCTCTCTATCCTCCTT
TCCATCACTCCTCTTCCACGCTAATGTTTTCCCGCCACCACCATTCTCCC
TCCTCTACATTATATCCTTCTTCTCCCTCTTACACCTTCCCTCTTCCCCT
CCTCATCGTATCCTTATCATATATCTCATCTACCTCCTCTTATCACTCTC
CTCTCTCTTCACCCTCCTCTCTCTCCCATCTACCTTTTCTCATCTCCTCT
AACAATATCCCTCG
|
quality values | Open.Hide.18 20 20 20 17 26 30 29 29 25 22 22 28 23 19 11 9 9 19 20 37 27 24 20 20 15 15 6 6 6 6 6 6 9 9 9 7 8 8 8 10 13 27 30 29 23 23 28 29 22
12 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 14 14 15 13 10 10 22 22 33 31 50 53 53 57 57 59 53 53 53 57 42 40 40 40 40 42 59 59 59 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 48 33 33 25 25 37 42 37 41 41 48 57 57 47 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 47 48
43 44 35 43 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 59 57 68 57 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 54 54 54 57 57 57 57 47 47 54 54
54 57 57 57 57 48 48 57 59 59 59 57 57 57 57 48 46 43 43 43 46 46 48 48 48 59 59 59 48 48 42 42 42 48 57 57 57 57 57 59 47 47 43 39 39 39 39 39 39 30
30 30 39 41 48 47 36 33 19 11 11 12 12 12 11 10 10 10 10 17 29 41 59 59 59 50 53 53 57 57 48 59 48 59 59 59 59 57 48 48 48 57 48 48 48 48 48 37 39 32
35 32 42 42 42 42 42 42 46 46 43 43 43 43 43 46 47 54 59 59 54 54 57 57 57 57 57 46 43 43 44 43 43 43 59 59 68 68 68 59 59 44 43 43 44 57 57 57 57 57
57 57 50 50 50 43 44 33 33 33 33 43 38 50 50 52 43 42 42 38 38 43 43 27 31 31 43 42 42 43 43 42 38 24 24 18 18 28 43 43 42 43 43 43 43 37 37 37 46 41
41 24 27 24 29 29 43 43 54 54 50 57 44 44 43 50 43 50 37 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 48 48 57 57 57 57 57 59 47 46 43 43 43 36 37 32
28 32 36 36 43 42 37 28 28 20 25 25 32 32 24 18 17 27 27 29 28 28 35 35 32 22 22 22 28 23 26 30 33 28 33 37 36 34 25 25 28 33 37 39 33 34 25 25 28 34
32 30 31 35 28 20 15 11 10 10 10 8 8 8 12 10 14 14 26 26 35 31 31 25 25 12 11 11 22 22 32 22 22 27 30 31 35 34 34 28 19 19 13 13 13 13 19 23 25 24
30 20 17 17 21 21 17 19 19 9 9 9 10 12 10 8 8 8 10 8 9 9 19 23 36 36 32 29 29 32 24 24 15 13 12 15 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 9 12 15 10
10 8 10 8 8 11 11 9 10 10 13 13 20 19 20 10 11 8 8 8 8 9 10 11 11 11 11 10 8 8 8 8 12 13 12 10 10 10 10 10 9 12 8 10 8 8 8 9 11 13
13 11 11 10 10 10 10 10 10 18 21 12 8 8 10 10 12 15 11 8 12 12 8 8 15 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 10 6 8 8 8 10 11 12 14 18 11 11 11
11 11 9 9 | Open.Hide. 8 10 8 8 8 8 10 10 10 12 8 10 10 10 11 16 17 17 3 0 3 3 0 3 17 23 17 13 9 6 6 6 6 6 6 6 8 8 9 8 7 8 7 3 0 3 3 0 3 0
0 3 0 3 21 10 13 9 12 7 7 7 6 3 0 3 6 6 9 8 8 8 8 10 17 15 8 8 3 0 3 0 3 18 18 27 16 9 9 9 20 18 20 11 11 20 23 24 18 18
18 18 18 22 29 34 34 32 18 14 14 11 10 9 11 10 9 9 10 9 9 9 9 17 17 18 11 11 11 21 18 13 13 13 21 23 13 16 13 15 14 17 18 24 19 25 25 28 28 20
20 14 23 24 29 28 28 28 16 13 13 10 8 8 9 10 9 11 13 13 8 12 8 8 8 8 10 12 12 12 12 15 12 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 10
8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 11 12 12 15 10 14 9 9 8 10 12 15 17 17 17 17 30 26 24 24 14 13 12 12 14 13 15 12 12 12 12 11 8 8 6 7 7
8 10 13 9 9 12 19 13 14 15 21 11 11 11 12 18 18 16 11 9 9 9 10 13 13 19 10 8 8 7 6 8 8 12 11 10 8 8 8 10 10 15 24 28 15 15 14 12 12 14
9 9 10 19 12 24 24 28 24 17 15 10 9 9 10 12 25 30 32 10 10 6 6 6 7 8 18 9 9 9 15 13 18 18 9 9 7 6 8 9 8 6 6 6 15 8 9 9 9 9
10 10 11 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 11 6 6 8 8 9 8 8 6 6 6 11 15 8 9 9 10 10 10 8 8 10 10 10 9 10 9 9 9 11 11 11 12 10 16 19 17
12 10 10 9 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 10 12 8 8 8 8 12 15 23 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 6 6 8 8 16 13 24 26 28 28
32 32 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 13 13 10 11 11 11 11 10 10 7 6 8 8 8 8 6 6
8 8 10 12 10 8 12 11 8 9 9 9 9 10 10 16 19 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13 12 9 7 7 8 8 8 8 8 10 12 12 13 12 10 10 10 10 10 8 8 10 10
8 8 13 10 10 10 8 8 11 8 10 8 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 7 6 8 8 11 14 11 14 14 18 17 14 11 10 8 8 8 9 9 10 6 8 6 6
8 8 8 10 8 8 8 9 9 8 10 8 10 8 9 10 10 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 15 9 9 9 14 14 10 9 9 10 12 11 11 11 18 17 13 10 10 10 10
13 13 10 8 8 7 7 12 10 12 6 6 8 8 11 16 11 8 8 6 8 8 8 8 9 9 9 10 10 11 12 12 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 12 12 8 10 10
8 8 8 8 10 10 8 8 10 15 8 8 11 15 8 8 12 11 9 9 12 13 7 6 8 8 9 10 10 9 9 10 10 13 17 11 9 11 11 8 8 15 19 10 10 13 15 15 11 11
9 12 11 13 9 9 9 6 8 6 8 11 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 9 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 10 8 10 6 7 10 10 8 8
11 19 10 10 9 7 7 6 6 6 6 8 8 13 10 14 12 17 13 10 10 8 8 6 6 10 6 6 6 6 6 6 9 10 10 10 11 12 12 10 9 9 9 9 10 12 11 13 8 8
8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 |