BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-408B12.T7 (MSMg01no408_b12.b1) | MSMg01-408B12.TJ (MSMg01no408_b12.g1) |
ACC | AG505893 | AG505894 |
length | 839 | 795 |
length of high quality (start - end) | 38 (68 - 105) | 308 (72 - 379) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no408_b12.b1 PHD_FILE: MSMg01no408_b12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:23:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no408_b12.g1 PHD_FILE: MSMg01no408_b12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:23:57 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCAAAATTTGCGCCGCTAAACGACTCACAATCATACACACCGCGGAATTC
AAATGTTTACATAAACACCTTTTGCTTTCTCAGAAAGTTAGGACTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTCCTACNCCCACACACCACCTTTT
CCCACCACCCCATACCATAAACCCCCCCTCCCCCCTCCCTTACACATATA
TCTCTATTTATCCACCCACCCAACACACCCCCCAAATCCACACCCCCATT
TTTCCCTTACCCCCACACCCTCCACCCACCCCCAAAACCTTCCCAAACCC
ACCCACACCCCCCCTCTTAATAATTTCCACCCCACCCCCCAAAATCCCAT
CCTCCTATTTTTTCCCCCCCTACCCCACCCACACCCCCCACTCCCCACTC
TTTTTCTCCCTTTATCCCCCCCCCCCCTCACAAAAACTCCCAACAAAACC
CAACCAATATACACCCCACACACCATCCACACTATCAAAATACTCCACCA
CTACAACCCATCCATACCACTTAACCCCACTTTCAATACCCACAATACCA
ACCCCCTTCCATAACCCCCACTAACCCTCTACAACATCACTAACAATCAA
CACACACCAACACCTCCCACCCATTTTCCCAATCATTCATCAACAACAAA
ATCTCCCCCCACTACCCTCCCCACTACACACAATTCACCCCCACCCCCCA
TATACCTCCACTACTCTCATTCCACATCTCTCACTTCTTTCACTCATCCC
CTCCTCCTATCCCCAATCACTCACCCCCCTCTCCACCCACCACCCAAACT
CACTCAATATATTAATTATTCACACCCTTTCACCCACTT
| AATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCAGTGCCTGTGCCAACCTGAATTGAAGC
CAGCAGCCCTGCAGCCCATGTGGAGACCACCACACAAGCTAAAGAAGAAA
GCCACAGAGAAAATAGGGCCACTAGAGTCTCCTTTGACCTTTGTGGGAAT
TATTTCTCCCTAACCCCCAAGGAAGTCCAGTCTCCAACTCCAGAGCAGAC
CTAGTTACTGACCGAGCTGGTTGGTTGGTAGAAGGTAGGGTCTAAATGGG
AAGAGTAGTAACAATACTTACTGTCCCCGTGGCTCCTGTCCTCCAAGTCC
AGATGTGACCCTATATGAAGCAAGGGGAAATTCCAACATCTCAAGAGCCC
AGAGTGTTTTGTCCCACCAGTGTTACGTGTGTGTCTTCCTTTCCCCCTCC
TTTTTTTCTTCTCTTTTTACTGCTCTGCCCTCTCTTCTTCTTTTTTCACT
CCCCTCTCTCTCTCTCACTACGTTTCTTTCCCTCTCTCCCTTTTTTCTCT
TCTTCTCTATTATTTCCGACCCCCCCTCCCCTCTCCCTATTTTATCTCCT
TCTTCTCCGATTTTCGCCCCCCTTTTTTTTCAATATCCCTCTCCCCTTTT
TTTCTTTCTTTTTTCCCATTTTCCCATATCCTTCTTTTCCTTTTCCTCTT
CCGTCTCTTTCATATATCGTCCTTGCCGTTACCTCCTCCTCTCTTTCCCA
TCCTTCTTTACCCTCCTTTTCCTTCCTCTTTTTCTCCTTTTTTCC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 11 10 11 8 11 11 11 9 13 10 9 10 9 12 21 11 12 15 23 19 23 19 13 12 8 8 8 8 8 8 7 7 6 6 7 6 6 11 11 19 23 31 19 19 16 16 36 37
37 30 30 28 28 16 14 10 8 7 7 7 8 17 8 8 8 17 19 29 34 43 43 50 50 50 53 53 53 39 44 39 23 19 12 9 9 12 19 28 57 34 34 25 15 20 32 41 35 35
23 28 14 14 14 15 21 22 19 19 18 18 15 15 14 14 14 23 21 23 12 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 3 0 3 18 15 12 9 9 10 9 13 13 12 10 10 10 10 10 10
13 17 9 9 8 10 10 9 9 9 11 11 11 12 14 11 11 10 10 7 7 7 8 10 12 14 14 11 13 13 11 9 10 9 12 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 6 7 7 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 11 12 11 11 11 9 9 19 9 9 9 9 9 9
14 12 10 8 10 8 8 13 8 8 8 10 12 9 9 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 16 13 15 13 13 13 15 10 14 15 15 19 12 9 8 8 10 10 11
14 14 10 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 6 6 7 6 6 6 6 6 6 7 8 12 14 10 9 8 19 8 8 8 11 10 18 18 20 22 16 19 11 11 8 15 6 6 8
8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 13 18 15 12 10 10 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 19 26 19 8 8 6 6 8 8 12 10 10 8 8 8
8 10 10 9 8 8 10 10 8 8 11 8 8 8 8 8 10 12 9 8 9 9 12 11 8 8 8 8 6 6 6 6 11 8 11 10 8 8 10 10 10 9 9 10 19 13 16 14 15 17
13 11 8 8 6 7 8 8 10 10 13 8 12 9 12 9 10 10 10 8 6 6 7 8 8 10 10 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 12 15 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 6
6 6 10 12 11 14 13 11 8 8 8 8 11 10 9 9 11 11 12 9 9 9 9 9 8 21 13 8 8 8 8 8 15 9 9 9 12 10 10 8 8 8 6 6 8 8 10 19 19 23
8 10 11 12 12 6 8 8 10 13 14 12 10 8 9 10 9 12 9 8 8 8 6 6 7 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 11 10 18 13 11 11 11 22 11 10
9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 8 10 10 12 11 11 15 8 8 6 6 8 6 7 7 6 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 7 7 12 10
8 8 8 8 8 13 15 11 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 6 6 8 7 9 10 9 9 9 11 11 12 17 12 15
11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 8 8 8 8 15 19 8 6 7 10 6 6 8 10 11 10 8 8 8 8 8 10 10 9 11 11 11 10
10 8 8 10 10 13 12 8 8 8 10 8 9 9 9 9 13 8 8 7 8 8 10 16 10 13 18 19 11 13 6 6 8 8 10 10 12 12 13 8 8 10 9 7 12 13 13 12 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 10 7 8 8 10 8 10 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 9 9 12 9 10 10 10 21 14 15 10 10 13 16 28 37 39 36 32 25 30 23 20 16 24 28 25 27 17 10 6 6 6 8 8 11 11 11 26 22 39 41 37 23 22 10 10 10 23 23
50 50 50 53 34 28 17 14 19 19 29 29 33 33 43 29 37 36 36 36 42 42 42 42 42 42 57 68 68 57 57 54 54 57 57 54 54 54 57 57 41 43 43 50 48 48 57 54 57 57
57 57 47 47 48 48 48 57 59 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 46 46 50 50 50 50 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 59
59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 59 59 59 57 45 45 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 52 57 59 57 57 57 59 57 57 52 52
52 57 57 50 44 32 24 24 24 24 24 35 35 32 28 18 12 12 11 12 12 16 27 27 33 33 27 27 20 20 20 32 38 44 57 50 57 48 44 44 43 36 32 20 17 17 17 22 41 44
57 43 44 44 41 36 28 25 25 25 36 36 44 43 44 37 30 22 18 18 18 30 30 30 27 17 13 13 12 12 14 23 23 15 12 12 12 15 17 21 21 13 13 13 13 19 15 20 18 19
12 12 11 15 12 11 11 23 19 12 12 11 10 10 12 11 11 14 9 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 9 10 9 8 8 8 6 7 8 6 9 9 15 13 25 18 11 8 8 8
8 10 11 10 8 10 11 16 12 12 10 13 10 17 13 14 16 21 14 14 12 12 8 8 9 9 9 11 15 15 12 11 11 10 8 8 8 8 10 8 8 8 15 25 22 10 10 8 8 10
15 12 8 11 11 12 10 11 8 8 7 6 8 8 9 10 9 9 9 8 8 9 8 11 8 9 9 16 11 10 10 9 9 9 9 9 9 10 10 10 13 10 8 10 8 10 10 9 9 8
10 6 6 8 10 8 10 8 8 8 12 12 9 10 10 9 9 8 8 8 8 8 10 9 11 11 11 10 12 10 19 10 10 8 8 8 8 8 10 8 12 10 8 8 8 8 8 8 12 15
9 9 9 12 9 8 12 6 6 8 8 12 8 8 6 6 6 12 18 22 14 12 10 8 8 8 19 12 13 15 8 8 8 6 6 8 12 10 8 8 10 8 8 8 9 11 11 12 18 19
15 13 8 8 8 8 8 10 14 18 19 12 15 13 6 6 6 6 8 12 10 15 8 8 8 8 8 8 8 11 13 14 13 9 9 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9
10 9 9 10 10 12 12 12 12 12 13 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 6 8 8 8 10 8 10 11 17 20 21 21 16 16 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 11 12 14 11 10 18 18 18 18 13 12 8 8 8 8 8 8 12 12 9 9 13 12 13 8 8 10 8 9 10 12 12 17 26 15 13 8 8 8 |