BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-446H22.T7 (MSMg01no446_h22.b1) | MSMg01-446H22.TJ (MSMg01no446_h22.g1) |
ACC | AG535175 | AG535176 |
length | 767 | 763 |
length of high quality (start - end) | 279 (33 - 311) | 244 (85 - 328) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no446_h22.b1 PHD_FILE: MSMg01no446_h22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:15:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no446_h22.g1 PHD_FILE: MSMg01no446_h22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:15:02 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGCGCGGAATTCTCACCTGAT
GACTACCGAATGGCAGAGAAGCACTTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAAT
CATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAG
CCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGTGGA
TGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGAGTGCAGGCTTGT
ACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGACATCG
TACTACCGTTGTTTTCTAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGA
TGCCCCAACAGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCT
TATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCTAGATGCCCCTCAACAGAG
GAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGC
TATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGG
AGGTCATCATCCTGAGCGAGGTAACACATTTCCCAAGAAACTCCCCCACA
TGTATTCCCTGATAAGCGGAAATTACCCCCTAACCTAGGGAACCCAACGA
TTTTATATTTACTTTGCTCACCACTTGATAACTCCCCAAGAAAGGAAACT
CTGTGCGTGGGCCACTAATGCCTCTTTCTCTAAATTTGTGAACCACACCC
CCCCTGGTATGATGTTC
| CCCAACCCCACAATGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTTAACACCAAAAGC
TCCCCGAGCGCCACACAAAGCAAATGCTATACTCCATTAGGCTGAAATGT
GTAAGCAGAGTTCAAACCCAAACCGAGCTGTCCTTCGCAGCAGGCTGGGC
TGCATCAGGGCTTATGCGCTTGTACACTGATCCTCTCACATGCCTGCAAC
TCCCTGCTTCATCTGTTCATAATCAGCTCCAGATTCTCTATGGCTCCCAC
AGTGTGAGCCGTGGAGCTTCGGATTTGGTTTTTTTTCTGTTGAAGGGTAT
GGAAGTACACAGGAAATCTGAATAGAAATACACTCCCAACTGAAGTTACG
GTCCCTATCCCTGAGAAGGGACGAATGGACAACATAACTTGGAAGCTAAC
TAGTTCATCCCAAGAGACTGTTAGAGCACGGATGTGTACAAGGATGGGAT
GTATAAATGGATGGGATAGGTATTGACCCTCGCCACCACCACTCAGATTT
TTACTGTTCTCCCTTTCCCCTTTTTTCTTTCACAACCCCCCCTCTTTTCC
CCCCCTTTATTCCCTTTCCCCCCCCCTCTTTCACCCCTCCCCCACCACCT
CTTCCCTTGAACTCCTCTTTTTTTTTACTCACACAGTCCCCCTCCTCCGC
CTACTCTTCATTTTTAACACCACACCGTCCGTACCCTTTCCCCTCTCCCT
TCATTCTTGTTCG
|
quality values | Open.Hide.11 11 21 13 9 9 14 15 29 29 37 26 13 11 11 14 19 21 9 9 9 11 9 9 9 11 10 10 9 9 9 9 10 25 25 33 33 33 33 33 33 37 37 37 23 23 11 9 9 7
7 7 7 7 7 16 18 23 34 30 34 37 37 37 48 48 48 57 57 57 57 57 53 53 53 57 57 57 57 57 47 37 37 40 40 40 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53
48 43 32 26 16 16 15 17 24 24 24 27 27 29 44 57 57 57 46 37 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 51 51 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 48 48
52 52 52 50 50 51 50 50 47 52 52 57 41 41 50 50 50 50 57 68 68 57 57 57 52 52 59 57 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 26 29 24 16 16 14 16 16 41 41 59 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 43 43 43 59 59 68 59 57 57 48 43 43 43 57 57 57 57 50 50 50 53 50 50 50 53 59
59 59 59 41 30 30 12 16 8 6 6 6 7 6 6 6 6 8 8 15 32 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 47 59 35 37 37 59 59 59 59 59 43 39 34 24 18 12 12
25 18 25 19 23 19 17 24 22 36 36 36 41 47 43 43 48 47 46 54 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 57 54 54 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 68
68 68 68 59 57 54 54 54 46 48 43 43 37 43 43 46 47 43 43 43 48 43 48 43 48 43 39 42 42 42 37 34 31 23 23 34 34 48 48 48 37 34 28 23 23 23 28 28 34 34
32 29 29 37 29 29 37 34 34 32 30 30 37 33 30 25 19 12 12 17 17 22 22 19 23 20 24 21 22 10 13 10 12 19 19 32 37 41 39 34 34 31 31 36 31 31 24 20 15 15
12 19 19 21 13 14 20 17 30 22 20 23 19 18 18 30 22 20 22 22 23 32 29 37 26 26 19 19 11 11 10 12 12 15 15 15 17 19 19 19 24 24 19 20 24 28 18 15 9 9
10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 22 16 19 13 12 10 10 10 15 20 19 20 18 19 24 20 18 13 10 10 10 8 7 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 13 13 13 10 10 11 9
8 8 8 8 8 10 9 13 11 19 10 10 13 15 10 12 14 16 11 12 12 10 15 15 14 14 12 15 9 9 8 10 12 10 8 8 9 10 8 12 11 8 8 9 9 6 6 6 6 6
6 7 7 6 6 6 6 8 14 9 9 9 9 14 15 12 9 9 9 9 10 11 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 12 11 10 10 10 11 11 11 9 8 8 6 6 6
6 7 6 8 8 8 8 12 12 12 12 11 9 9 9 14 9 14 13 10 6 6 6 6 6 6 9 8 6 7 6 8 6 12 9 9 10 10 9 8 6 6 6 8 6 6 8 8 18 19
32 11 8 6 6 8 7 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 8 10 9 9 9 12 11 12 9 8 8 8 6 7 9 11 19 17 15 12 33 14 23 23 3 0 3 3 0 3 27 23 33 21 21 9 9 6 6 8 8 8 8 9
9 9 10 11 20 21 21 28 29 29 31 53 44 59 50 50 42 25 25 12 9 9 9 14 14 17 12 13 11 12 19 15 22 19 28 26 36 43 37 47 47 53 53 53 53 53 53 59 59 59
59 59 59 57 57 57 57 57 68 50 50 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 47 48 27 27 12 10 10 12 17 10 10 10 21 21 32 32 42 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 57 59 52
52 52 54 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 59 59 57 52 52 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 59 54 57 57 59 59 68 68
68 57 57 57 57 54 57 57 48 42 25 24 11 11 11 16 27 44 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 59
59 48 48 48 59 57 57 57 57 57 48 48 57 57 57 57 57 59 48 48 48 40 41 41 39 28 17 13 9 7 8 8 9 9 8 10 10 10 16 17 28 34 37 37 37 37 35 35 35 39
39 59 59 39 35 35 39 39 43 43 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 37 30 22 13 13 12 15 15 21 28 13 13 13 19 19 30 24 30 30 37 37 43 43 43 39 39 30 39 28 31
20 37 34 43 43 57 57 57 57 57 57 37 37 25 28 28 34 24 32 20 20 20 28 28 34 25 28 24 26 19 19 22 32 34 37 37 37 31 31 35 28 28 37 37 41 41 39 39 32 30
22 24 13 13 13 30 30 48 37 39 30 30 30 40 25 28 23 26 24 23 16 20 11 12 20 25 18 22 17 17 17 26 21 20 20 32 24 28 20 19 19 29 28 34 15 10 10 10 12 15
10 9 9 9 11 15 14 28 19 22 12 11 11 12 12 11 12 11 16 10 8 8 8 8 8 8 13 13 16 15 12 13 12 12 12 12 11 11 8 8 6 6 8 10 10 10 10 10 11 10
12 8 8 8 9 11 11 11 9 9 8 8 10 15 17 12 12 13 13 15 15 15 13 15 10 14 16 17 12 15 8 8 7 7 6 6 13 11 11 10 13 13 9 12 10 10 10 11 12 12
9 10 10 11 13 8 8 8 8 10 14 15 15 10 8 8 8 10 10 11 16 25 24 21 21 19 15 15 11 13 11 12 12 12 14 19 25 27 27 20 13 13 8 6 6 7 7 9 15 16
15 11 12 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 13 21 27 22 20 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 15 11 12 13 15 13 14 10 13 12 11 10 15
19 8 8 8 8 8 8 14 12 12 10 17 14 14 12 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 15 10 6 8 6 6 12 12 12 15 8 8 8 8 10 10
10 6 6 6 8 8 11 12 12 12 18 10 10 |